Para fazer nova camada com traços ou áreas Escolha line para linha

Para fazer nova Para fazer nova camada com traços camada com traços ou áreasou áreas

Escolha “line” para linhaEscolha “line” para linha

Crie um nome para o arquivo que Crie um nome para o arquivo que será uma camada (um “shape”) será uma camada (um “shape”) no futurono futuro

Repare no quadrado Repare no quadrado tracejado, isso indica tracejado, isso indica que a área está que a área está pronta para edição!pronta para edição!

Selecionar linha para Selecionar linha para desenhardesenhar

Você deve fechar o Você deve fechar o polígono!polígono!

Para fazer terminar a Para fazer terminar a edição da camada edição da camada novanova

Salve as Salve as modificações da modificações da nova camada!nova camada!

Selecione o “t” com Selecione o “t” com etiqueta para nomear etiqueta para nomear cada áreacada área

Selecione a etiqueta para Selecione a etiqueta para saber que espécie está saber que espécie está registrada naquele pontoregistrada naquele ponto

S. platensisárea 1 1área 2 1

MATRIZ PARA APE

1) Comando de busca “bandb”;1) Comando de busca “bandb”;2) “Savetrees file=teste.tre” para 2) “Savetrees file=teste.tre” para salvar as árvores*;salvar as árvores*;3) Se houver mais de uma árvore, 3) Se houver mais de uma árvore, digitar “contree /savetree digitar “contree /savetree file=tcon.tre”.file=tcon.tre”.

*o arquivo será salvo no mesmo lugar em que a matriz se encontra!

Primeiro, abrir a matriz de dados que você criou;Quando procurar o arquivo, que deve ser umamatriz feita conforme o exemplo “matriz.txt”(com extensão .txt), existirão duas opções (editar ouexecutar)... Execute. Se existir erro, o programa avisará!

DEPOISDEPOIS

-a interpretação será feita a partir do conjunto de etapas mostrado na figura.

Esse é o mapa final!!!!

As áreas hachuradas (que você construirá) foram baseadas na amplitude de distribuição das espécies agrupadas pelo cladograma da anãlise de parcimônia de endemismos

Abrir o arquivo de dados (sua matriz “matriz.txt”)

Essa é a tela que aparecerá com a matriz podendo ser visualizadacaso você clique na figura indicada

Para abrir a árvore, você deve ter carregado a matriz antes. Após carregá-la, vá no local indicado e clique em “Make new tree blocks from” e depois “Use trees from separate Nexus file”. Só então aparecerá a janela abaixo pedindo o arquivo “tcon.tre” ou “teste.tre”, caso seja só uma árvore.

Se forem muitas árvores, ele vai perguntar se você quer visualizar todas elas...

...e quantas você quer ignorar; no caso, nenhuma é claro!

Aqui, o programa pergunta se você quer colocar as árvores em uma janela separada. Clique em “Separate”.

Diga “yes”!

Voilà!

Se você usar a ferramenta indicada nos ramos da árvore, ela ficará toda arrumadinha assim!!!

Para visualizar as espécies na árvore, clique em “Analysis” e “Trace character history”. Aparecerá essa janela, selecione “Stored characters”

Escolha agora “Parsimony Ancestral States”

Pronto, agora você tem cada caráter, quer dizer espécie, traçada em sua árvore. Lembre-se que a presença dela é 1 e ausência dela é 0!

Aqui você pode passear pelos caracteres!

Para escolher as espécies “boas”, você deve olhar o CI. Ele tem que ser igual a 1.0. Para tanto, vá em “Analysis” e selecione “Values for current trees”; depois escolha “Consistency index for character”, “stored characters”. Aí aparecerá

essa janelinha verde. Pronto! Clique na pequenina seta do lado direito. Lá você poderá passar os caracteres!