Aula 8
Introduo Anlise Filogentica
Princpios de FilogeniaPensando sobre rvores filogenticas
Sim
No
Asas
Inferncia FilogenticaBuscas para recuperar padres relacionamento
entre os organismos. genticos histricos do
Inferncia FilogenticaPrincpios :Supem que caractersticas
similares so homlogas, at que se mostre o contrrio.
HomologiaCaractersticas (morfolgica, molecular, comportamental)
herdadas de um ancestral comum.
Homologias Estruturais
F&H Fig 2.1
Inferncias FilogenticasPrincpios: - Supem que caractersticas
similares so homlogas, at que se mostre o contrrio. - Usa
caractersticas compartilhadas e recm herdadas e no caractersticas
ancestrais(Hennig formalizou isso).Hennig
SinapomorfiaCompartilhado Derivado CaracterAustralopithecus
Homo
Caixa craniana grande
Autapomorfianico Derivado Caracter
Australopithecus
H. sapiens
Testa Alta
SymplesiomorphyCompartilhado Ancestral CaracterHomo
Australopithecus
Bpede
SinapomorfiaCompartilhado Derivado Caracter
Autapomorfianico Derivado Caracter
SimplesiomorfiaCompartilhado Ancestral Caracter
Inferncia FilogenticaPrincpios :. Supe que caractersticas
similares so homlogas, at que se mostre o contrrio. . Usa
caractersticas derivadas compartilhadas recm herdadas e no
caractersticas compartilhadas ancestrais (Hennig formalizou isso).
. Relaciona caractersticas marcadores de parentesco. derivadas
compartilhadas como
Inferncia FilogenticaPrincipios:. Supe que caractersticas
similares so homlogas, at que se mostre o contrrio. . Usa
caractersticas derivadas compartilhadas recm herdadas e no
caractersticas compartilhadas ancestrais (Hennig formalizou isso).
. Relaciona caractersticas derivadas compartilhadas como marcadores
de parentesco. . A mesma lgica usada para comparao morfolgica ou de
dados moleculares como DNA.
Linguagem de uma rvore filogenticaPonta ramo ramo N Ponta Ponta
Ponta
Um exemplo simplesCANRIO Esqueleto interno Asas 2 patas Penas
sangue quente SAPO Esqueleto interno Sem asas 4 patas Sem plo ou
penas sangue-frio GAMB Esqueleto interno Sem asas 4 patas Plo
sangue quente
ABELHA Esqueleto interno Asas 6 patas Plo sangue quente
Usando um caracter por vez....
Estado do Caracter
Externo (0)Esqueleto
Estado do Caracter Interno (1)
Caracter
Usando um carter por vez....
(1) (0) (1) (1) Externo Interno
Esqueleto
Sim
No
Asas
Mas.
Asas de pssaros so homlogas s patas frontais dos sapos e gambs.
E NO homlogas asas de abelhas.
Ento
Sim, mas convergente
No
Asas
2
4
6
PATAS
Mas.
As asas de pssaros so Homlogas as patas frontais de sapos e de
gambs ento Pssaros tem 4 patas!!
Ento
4
6
Realmente. Patas
Somente Pele
Penas
Plos
Revestimento do corpo Mas.
O plo do gamb e da abelha so realmente homlogos?Plo
Ns podemos testar se estes grupos compartilham um ancestral
comum usando outros caracteres...
rvores baseadas em caractersticas
Externo
Interno
Sim, mas convergente
No
Esqueleto
Asas
4
6
PatasPecilotrmico (sangue frio) Endotrmico (sangue quente)
Somente pele Penas
Plos
Metabolismo
Revestimento do corpo
Como podemos combinar as informaes dos caracteres diferentes
para inferir uma filogenia total?
Externo
Interno
Sim, mas convergente No
Esqueleto
Asas
4
6
Patas
Pecilotrmicos (sangue frio)
Endotrmicos (sangue quente)
Somente pele
Penas
Plos
Metabolismo
Revestimento do corpo
Como podemos combinar as informaes dos caracteres diferentes
para inferir uma filogenia total?
Quando tiver poucos caracteres, voc pode fazer isto em sua
cabea, mas...
Quando bioinformtica.
tiver
muitos
caracteres,
ns
utilizamos
a
Comparao de MtodosNeighbor-joining Usa somente pairwise
distncias Minimiza a distncia entre os vizinhos mais prximos Muito
rpido Problemas com o local optima Maximum parsimony Usa somente
caractersticas derivadas compartilhadas Minimiza a distncia total
Lento Falha das suposies quando a evoluo for rpida Maximum
likelihood Usa todos os dados (Verossemelhana) Maximiza a
probabilidade de ter rvore certa dentro do modelo de evoluo
escolhido. Muito lento Altamente dependente do modelo suposto da
evoluo
Bom para sries de dados Bom para gerar rvores Melhor opo quando
muito pequenas e para rvores preliminares e escolher tiver menos
que 30 taxa e construdas testando outros rpido entre vrias rvores.
homoplasia rara. mtodosTony Weisstein,
http://bioquest.org:16080/bedrock/terre_haute_03_04/phylogenetics_1.0.ppt
