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BIOINFORMÁTICA

HIGGINS, D.; TAYLOR, W. Bioinformatics: sequence,structure and databanks. New York: Oxford UniversityPress, c2000. 438p.

Trata-se de obracom abordagem práticasobre os princípios e asaplicações da Bioinfor-mática em estudos de es-trutura e evolução mole-cular de ácidos nucléicose de proteínas. Está estru-turada em dez capítulos euma lista de protocolos.Os capítulos 1 e 2 tratamde métodos de prediçãoda estrutura e comparaçãode estruturas tridimen-sionais de proteínas. Oscapítulos 3 e 4 abordam

métodos e bancos de dados utilizados nas análises estrutu-rais, funcionais e filogenéticas de seqüências homólogas.Os capítulos 5 a 8 tratam da metodologia utilizada nadetecção e análise de famílias de proteínas. Nos capítulos 9e 10 são apresentados métodos de acesso aos bancos dedados e de análise integrada de dados através de redes de in-formações. É uma rica fonte de consulta para pesquisado-res e estudantes da área de Bioquímica e BiologiaMolecular interessados em ampliar seus conhecimentos emconceitos e aplicações práticas da Bioinformática.

Profa. Rosário Dominguez Crespo HirataFCF/USP

CONTROLE DE QUALIDADE

WILLIAMS, K. L. Endotoxins. Pyrogens, LAL testing,and despyrogenation. New York: Marcel Dekker, c.2001.372p

As endotoxinas são complexos de alto pesomolecular, associado à membrana externa de bactériasGram-negativas e constituem a mais significativa fonte depirogênio para a indústria farmacêutica. As endotoxinaspodem conter lipídeos, carboidratos e proteínas, porémquando purificadas são denominadas de lipopolissacarídeos(LPS), para enfatizar a sua natureza química. Por isso, comonos produtos farmacêuticos podem ser encontradas unida-des não purificadas nas fases de processo ou nos produtosterminados, prefere-se a terminologia de endotoxinas. Naedição atualizada do livro é abordado de forma clara o con-ceito de pirogênio, em que se considera que todas as

endotoxinas são pirogê-nios, mas nem todos ospirogênios são endoto-xinas. Os pirogênios in-cluem qualquer substân-cia capaz de provocar aresposta febril provenien-te de um injetável, que seencontra em não-confor-midade ou de uma infec-ção por Gram-negativo. Oconceito também da piro-genicidade é apresentadocomo uma resposta sis-têmica do hospedeiro edescritas as interações queocorrem na forma celulare molecular. O livro trata

da endotoxina proveniente de produtos parenterais no as-pecto: estrutura e função biológica, propriedades, presençano meio ambiente e detecção; o refinamento e automa-tização dos ensaios de LAL (“Limulus amebocyte lysate”),incluindo o desenvolvimento e a validação dos testes; abor-dagem clínica de septicemia, além da produção e aspectosregulatórios da industria farmacêutica americana. Os capí-tulos são organizados de forma cronológica e apresenta-sebem ilustrado, tornando fácil a compreensão do texto. Oprimeiro capítulo detalha o histórico do conhecimento dafebre, do pirogênio e da endotoxina. No segundo capítulosão apresentadas descrição geral, conceito e classificação depirogênio, de endotoxina e da febre. A estrutura, funçãobiológica e atividade da endotoxina são descritas detalha-damente no capítulo três. No capítulo quatro é focada a res-posta do hospedeiro frente à endotoxina. No quinto capítuloabordam-se pirogênios microbianos, diferentes deendotoxina, os quais são provenientes de constituintes debactérias, fungos, vírus e outros, mas que, no entanto, sãocapazes de provocar a febre no hospedeiro. No sexto capí-tulo, o assunto anterior é expandido e inclue-se fármacosque alteram os mecanismos termo-regulatórios. A filosofiae a prática de prevenção da contaminação nos processos deprodução de produtos parenterais são discutidas no capítulosete. O oitavo capítulo apresenta o capítulo contexto histó-rico do desenvolvimento da endotoxina como padrão, inclu-indo discussão ampla sobre o assunto e limitações do pa-drão. No nono capítulo, apresenta-se a atualização do tes-te de pirogênio “in vivo”. O décimo capítulo descreve o his-tórico da descoberta do teste LAL, seu mecanismo e suaaplicação, dando ênfase à diversidade de testes que estãosendo pesquisados. No capítulo 11 são descritos o desenvol-vimento do teste de LAL, sua validação e aspectosregulatórios. Nesse capítulo é detalhado teste de endotoxinabacteriana, segundo os órgãos oficiais, como a FarmacopéiaAmericana (USP) e a FDA ( Food Drug Administration), easpectos da harmonização. O capítulo décimo segundo

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aborda a automação do teste de LAL e as considerações dedados cinéticos. A importância futura de métodos que po-derão substituir ou mesmo suplantar o teste de LAL são des-critas no capítulo 13. No penúltimo capítulo são descritas avalidação do processo de despirogenização, “pyroburden”e a remoção de endotoxinas nos processos de fabricação deprodutos farmacêuticos. O capítulo 14 discute as terapiasatuais frente à septicemia oriunda de bactérias Gram-nega-tivas. O livro é dirigido aos farmacêuticos, pesquisadores eprofissionais, que atuam no controle de qualidade. Pelaforma didática que é apresentado o assunto, essa publicaçãoé também adequada como introdução ao conhecimento paraalunos de graduação e pós-graduação.

Profa. Telma Mary KanekoFCF/USP

MICROBIOLOGIA

BURNS, D.L.; BARBIERI, J.T.; IGLEWSKI, B.H.;RAPPUOLI, R. Bacterial protein toxins. Washington:ASM Press, c2003. 348p.

Trata-se de umaobra com rica fonte de in-formações bastante úteisna área biológica, consti-tuindo-se em ferramentaimprescindível para alu-nos, professores e profis-sionais que necessitam dacompreensão sobre as to-xinas protéicas de origembacteriana. Há cinco itensem destaque, que versamsobre a genética e aregulação das toxinas, abiogênese dos sistemas deexportação das proteínas eos diferentes tipos de se-creção, o sistema de entre-ga das toxinas em células

eucarióticas e a ação propriamente dita das proteínas produ-zidas por diferentes bactérias Gram-positivas e negativas.Os vinte e três capítulos estão distribuídos entre os cincograndes itens. Todos apresentam ilustrações de excelentequalidade, como fotografias, que mostram as proteínas maisimportantes na quimiotaxia bacteriana, inúmeras figurascom modelos hipotéticos de secreção de sinais, figurastridimensionais dos cristais das diversas toxinas, esquemasgenéticos da sua funcionalidade, além das inúmeras tabelascom exemplos que facilitam a visualização geral da ativida-de biológica de cada toxina. Este livro é de excelente qua-lidade, seguindo os padrões da editora ASM, e apresenta ao

redor de 45 colaboradores especialistas de diversos países.Cada capítulo apresenta bibliografia pertinente e o índiceremissivo é encontrado nas últimas páginas.

Profa. Elsa Masae MamizukaFCF/USP

PATOLOGIA

JACOBSON, M.; McCARTHY, N. Apoptosis: themolecular biology of programmed cell death. New York:Oxford University Press, c2002. 321p.

O livro Apoptosis:the molecular biology ofprogrammed cell deathaborda uma área, relati-vamente recente da bio-logia celular, que é o pro-cesso celular de morteprogramada. O tema é re-levante, uma vez que ahomeostasia tecidual émantida por funçõesopostas: diferenciação,senescência, proliferaçãoe morte. A perda e,ou ocomprometimento decada uma dessas funçõespode resultar no desen-volvimento de patologi-

as. A presente publicação, com 321 páginas, apresenta demaneira concisa os mecanismos moleculares envolvidosno processo de morte celular programada. Embora os au-tores não abordem a associação apoptose-doença, dedi-cam um capítulo a neuropatologias associadas à apoptose.O livro está organizado em 11 capítulos: Why beinterested in death?; Programmed cell death in C. elegans:the genetic framework; Genetic and molecular analysis ofprogrammed cell death in Drosophila; The caspases:consequential cleavage; Regulation of apoptosis by thebcl-2 family of proteins; Mitochondria in apoptosis:Pandora’s Box; Apoptosis: lessons from cell-free systems;Death signalling by the CD95/TNFR family of deathdomain containing receptors; Survival signalling byphosphorylation:PI3K/AKt sets the stage; Virus andapoptosis; Cell death in the nervous system. A bibliogra-fia utilizada é atual, considerando que o livro foi editadoem 2002. A obra possibilita ao leitor obter os conhecimen-tos básicos essenciais para a compreensão das diversasvias de sinalização envolvidas no processo de apoptose.

Profa. Primavera BorelliFCF/USP