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Bioinformática Básica Tutorial de acesso ao NCBI e Blast
Rafael Dias Mesquita
Laboratório de Bioinformática
Departamento de Bioquímica Instituto de Química - UFRJ
NCBI
NCBI
NCBI - Exemplo
NCBI - Exemplo
NCBI - Exemplo
NCBI - Exemplo
NCBI - Exemplo
Que título é esse?
NCBI - Exemplo
Não é BRCA1 sozinha, é uma região genômica contendo BRCA1
NCBI - Recomeçando
NCBI – escolhendo um dos variantes
NCBI – baixando a proteína
NCBI – indo para o CDS
NCBI – baixando o CDS
NCBI – Voltando para o registro da proteína
NCBI – Entrando no registro do gene
NCBI – indo para a região genomica
NCBI – baixando a região genômica
NCBI –voltando para o gene e seguindo para os ESTs
NCBI – baixando os ESTs
NCBI – Voltando para a proteína, escolhendo BLAST
NCBI – Rodando Blast
NCBI – Resultado do BLAST
NCBI – Resultado do BLAST
NCBI – Resultado do BLAST
NCBI – Resultado do BLAST
NCBI – Resultado do BLAST
NCBI – Resultado Taxonômico do BLAST
Escolher a melhor sequência dos 5 organismos mais próximos taxonomicamente e baixar PTN, cDNA, região genômica, ESTs de todas.