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Bioinformática Básica Tutorial de acesso ao NCBI e Blast Rafael Dias Mesquita [email protected] Laboratório de Bioinformática Departamento de Bioquímica Instituto de Química - UFRJ

Bioinformática Básica - Federal University of Rio de Janeiro · Bioinformática Básica Tutorial de acesso ao NCBI e Blast Rafael Dias Mesquita [email protected] Laboratório

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Bioinformática Básica Tutorial de acesso ao NCBI e Blast

Rafael Dias Mesquita

[email protected]

Laboratório de Bioinformática

Departamento de Bioquímica Instituto de Química - UFRJ

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NCBI

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NCBI

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NCBI - Exemplo

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NCBI - Exemplo

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NCBI - Exemplo

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NCBI - Exemplo

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NCBI - Exemplo

Que título é esse?

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NCBI - Exemplo

Não é BRCA1 sozinha, é uma região genômica contendo BRCA1

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NCBI - Recomeçando

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NCBI – escolhendo um dos variantes

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NCBI – baixando a proteína

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NCBI – indo para o CDS

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NCBI – baixando o CDS

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NCBI – Voltando para o registro da proteína

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NCBI – Entrando no registro do gene

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NCBI – indo para a região genomica

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NCBI – baixando a região genômica

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NCBI –voltando para o gene e seguindo para os ESTs

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NCBI – baixando os ESTs

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NCBI – Voltando para a proteína, escolhendo BLAST

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NCBI – Rodando Blast

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NCBI – Resultado do BLAST

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NCBI – Resultado do BLAST

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NCBI – Resultado do BLAST

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NCBI – Resultado do BLAST

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NCBI – Resultado do BLAST

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NCBI – Resultado Taxonômico do BLAST

Escolher a melhor sequência dos 5 organismos mais próximos taxonomicamente e baixar PTN, cDNA, região genômica, ESTs de todas.