PONTIFCIA UNIVERSIDADE CATLICA DE MINAS GERAIS

Curso de Cincia da Computao

Aline Rosa Carvalho Luana de Parolis Bianchini

GUIA DE CONFIGURAO DE UM CLUSTER BEOWULF

Debian Sarge / Debian Etch / Debian Lenny / Debian Squeeze / MPI - LAM

Prof. Dr. Joo Carlos de Moraes Morselli Jr.

Departamento de Cincia da Computao

PUC Minas campus Poos de Caldas

Poos de Caldas 2013

RESUMO

Este documento se resume ao estudo de vrios mtodos e abordagens

diferentes sobre formas de configurao de um Cluster Beowulf, em um sistema

Debian GNU / Linux. Trata-se de uma abordagem tcnica, em que alunos possam

aproveitar uma rede de computadores para processamento de programas que

utilizam MPI.

Palavras-chave: Processamento Paralelo. Cluster BEOWULF. Debian.

LISTA DE ABREVIATURAS

MPI Message Passing Interface

NFS Network File System

RSH Remote Shell

SUMRIO

1 INTRODUO ................................................................................... 6

1.1 Objetivo ......................................................................................... 6

2 CONFIGURANDO O CLUSTER ........................................................ 7

2.1 Configurao comum para todos os computadores ...................... 7

2.2 Configurando o n mestre ............................................................ 10

2.3 Configurando os ns escravos ..................................................... 14

2.4 Iniciando a MPI no n mestre ....................................................... 16

2.5 Testando a MPI ............................................................................. 17

2.6 Comandos MPI ............................................................................. 19

2.6.1 Lamclean ................................................................................. 19

2.6.2 Mpitask ...................................................................................... 19

2.6.3 Mpimsg ..................................................................................... 19

2.6.4 Lamnodes ................................................................................. 20

3 PROBLEMAS DEBIAN 6 (Squeeze) ................................................... 21

4 VERIFICAO DO CLUSTER GUIA RPIDO................................... 22

5 CLUSTER CONFIGURADO E USADO.................................................. 24

6 CONSIDERAES FINAIS ................................................................ 25

7 REFERNCIAS BIBLIOGRFICAS .................................................. 26

6

1 INTRODUO

Um cluster, ou tambm visto como um aglomerado de computadores formado

por um conjunto de computadores interconectados por uma rede ou barramento, que

utilizam de uma configurao ou sistema operacional classificado como sistema

distribudo.

Muitas vezes constitudo de computadores convencionais que atravs de

uma rede trabalham juntos para realizar uma nica tarefa como se fosse uma

mquina de grande porte. Existem diversos tipos de cluster, mas esse documento se

focar em um tipo muito famoso, conhecido como BEOWULF, que consiste em

vrios ns escravos gerenciados por um n principal, denominado de n mestre.

Este documento reflete os conhecimentos adquiridos na configurao do

cluster do Laboratrio 3 (de Engenharia de Redes) da Pontifcia Universidade

Catlica de Minas Gerais campus Poos de Caldas.

1.1 Objetivo

O objetivo deste documento no descrever como desenvolver programas

para serem processados em paralelo, mas em descrever de forma simples e objetiva

a arte de configurar um ambiente com o sistema operacional Linux Debian, para que

possa trabalhar como um cluster que utiliza da extenso funcional MPI a fim de

propiciar uma base confivel para execuo de programas que fazem uso de

processamento paralelo.

Para aqueles que pretendem se aventurar em configurar um cluster

BEOWULF, primeiramente deve-se adquirir um conhecimento bsico sobre

comandos de shell e a estrutura de diretrios do sistema operacional Linux Debian

Sarge / Debian Etch / Debian Lenny / Debian Squeeze. O conjunto de passos que

sero descritos neste documento parte do pressuposto que este conhecimento j

tenha sido adquirido.

7

sudo gedit /etc/apt/sources.list

deb cdrom:[Debian GNU/Linux 5.0.0 _Lenny_ - Official i386 CD Binary-1 20090214-16:29]/ lenny

main

2 CONFIGURANDO O CLUSTER

Em nossa experincia utilizamos duas implementaes da extenso funcional

MPI, uma delas, mais conhecida no contexto da Universidade, chamada LAM-MPI e

outra chamada MPICH. As duas em conjunto permitem a execuo de programas

paralelos que utilizam no somente dos computadores, aqui chamados de ns, para

distribuio de tarefas, mas tambm da quantidade de ncleos do processador de

cada n.

Foi de nossa preferncia realizar a reinstalao do sistema operacional de

cada n para que no houvesse a possibilidade de conflitos com instalaes

anteriores. Recomendamos fortemente que as pessoas encarregadas em gerenciar

o cluster faam o mesmo, tanto para aprenderem mais profundamente sobre o

processo de configurao, quanto para garantir que nada de errado ocorrer.

2.1 Configurao comum para todos os computadores

Foi realizada a instalao bsica do Linux Debian em todos os computadores,

onde foram definidos um nome de super-usurio e um de usurio em comum para

todos.

Para fazer login como super-usurio, usar:

usurio: root, senha: pproot..

Para fazer login como usurio comum, usar:

usurio: cluster, senha: ppcluster.

Aps a instalao, o primeiro procedimento foi autenticar-se como super-

usurio e configurar o repositrio da Universidade, para que as atualizaes fossem

mais rpidas. Este procedimento consiste em substituir o contedo do arquivo

/etc/apt/sources.list pelo contedo abaixo:

No terminal digite:

Para evitar que o Debian fique pedindo o CD de instalao toda vez que uma

instalao ou atualizao for realizada, comente a seguinte linha:

8

deb ftp://ftp.pucpcaldas.br/debian-security/ etch/updates main contrib

deb ftp://ftp.pucpcaldas.br/debian/ etch main contrib non-free

sudo apt-get update

*OBS: Para comentar uma linha, insira um # na frente da linha a ser

comentada!

E insira no final do arquivo as seguintes linhas:

Em seguida, realize a sincronizao do repositrio com o seguinte comando:

Optamos por instalar todos os pacotes, tanto do n mestre (servidor) quanto

dos ns escravos (clientes), para que seja possvel a comunicao bidirecional com

o terminal remoto e que seja permitida a execuo local atravs de processos

paralelos em cada n. Porm o que definiu o mestre e os escravos foi

configurao que se fez para os pacotes instalados.

A lista abaixo foi utilizada na instalao:

build-essential: uma lista informativa que contm todos os pacotes necessrios

para compilao de programas em linguagem c.

lam-mpidoc: documentao para a MPI.

lam-runtime: ambiente de tempo de execuo para programas paralelos.

lam4-dev: pacote de desenvolvimento para programas em MPI.

mpich-bin: implementao da MPI.

libmpich1.0-dev: bibliotecas estticas e de desenvolvimento da MPICH.

libmpich1.0gf: ambiente compartilhado de tempo de execuo da MPICH.

rsh-client: cliente RSH (Cliente de terminal remoto).

rsh-server: servidor RSH (Servidor de terminal remoto).

nfs-kernel-server: habilita o suporte ao servidor NFS.

libgmp3c2: biblioteca aritmtica de nmeros gigantes.

libgmp3-dev: pacote de desenvolvimento da biblioteca de nmeros gigantes.

libgmp3-doc: documentao da biblioteca de nmeros gigantes.

9

sudo apt-get install build-essential lam-mpidoc lam-runtime lam4-dev

mpich-bin libmpich1.0-dev libmpich1.0gf rsh-client rsh-server nfs-kernel-server

nfs-common libgmp3-dev libgmp3-doc libgmp3c2

sudo adduser cluster

sudo usermod u 1001 cluster

sudo groupmod g 1002 cluster

sudo gedit /etc/securetty

sudo apt-get install gcc lam-runtime lam4-dev nfs-user-server libgmp3

libgmp3-dev libgmp3-doc

Os pacotes acima foram instalados com o seguinte comando*:

*OBS: Digite o comando acima tudo na mesma linha!

Para o Debian Sarge, devem-se seguir as seguintes instrues:

Realizado o login com o usurio root execute o seguinte comando (antes se for

necessrio digite apt-setup e inclua os espelhos HTTP dos locais: Unicamp e

Debian.org.):

Como citado anteriormente, criamos um usurio especfico para o cluster

(Usurio cluster), pois ser atravs dele que o n principal enviar as tarefas para

os ns escravos. importante ressaltar que o usurio deve ser idntico em todos os

ns e para isto foi necessrio executar os seguintes comandos:

Para adicionar um novo usurio, com o nome de cluster. Digite no terminal:

Para modificar o id do usurio cluster para o nmero 1001. Digite no terminal:

Para modificar o grupo do usurio cluster para o nmero 1002. Digite no

terminal:

Em seguida o servio de terminal remoto foi permitido em todos os ns atravs

da insero de seus servios no arquivo /etc/securetty. Para isto bastou

acrescentar as seguintes linhas no fim do arquivo, no terminal digite:

10

rlogin

rsh

rexec

sudo gedit /etc/hosts.equiv

192.168.5.40

192.168.5.41

192.168.5.42

192.168.5.44

192.168.5.45

sudo gedit /etc/exports

E insira no final do arquivo as seguintes linhas:

O cliente de terminal remoto envia o usurio do sistema automaticamente no

incio da conexo, assim no necessrio digitar o nome de usurio. E para que

no seja necessrio digitar a senha foi preciso informar em cada n quais eram os

ns confiveis da rede. Ento foi editado o arquivo /etc/hosts.equiv, e em seu

contedo foi inserido o endereo IP de cada n do cluster, um por linha. No terminal

digite:

*OBS: bem provvel que esse arquivo esteja vazio...

E insira no arquivo as seguintes linhas (um em cada linha):

Realizado os procedimentos acima, encerra-se a configurao comum para

todos os ns.

2.2 Configurando o n mestre

O n mestre, tambm chamado de n zero, o responsvel por distribuir as

tarefas para os outros ns, que so chamados de ns escravos. Para que isso fosse

possvel foram necessrios alguns procedimentos.

Primeiramente, devemos exportar o diretrio do usurio cluster atravs do

servio de NFS. Ento, como super-usurio, inserimos a seguinte linha no fim do

arquivo /etc/exports. No terminal digite:

11

/home/cluster/ *(rw, no_root_squash)

#!/bin/sh

echo -ne '\033c'

echo "+=========================================================================+"

echo "| GERALAM.SH |"

echo "+=========================================================================+"

echo "| OBJETIVO: Script para verificar se os hosts do CLUSTER estao ativos... |"

echo "+=========================================================================+"

echo "+=========================================================================+"

echo "| VERSAO: 2.20810 |"

echo "+=========================================================================+"

echo "| Ciencia da Computacao - PUC Minas - Pocos de Caldas |"

echo "| |"

echo "| DISCIPLINA: Processamento Paralelo |"

echo "| PROFESSOR: Dr. Joao Carlos de Moraes Morselli Jr. |"

echo "+=========================================================================+"

echo -e "# IP dos hosts ativos" > /etc/mpich/machines.LINUX

echo -e "# IP dos Hosts ativos" > /etc/lam/lam-bhost.def

echo "| |"

echo "| Verificando bancada do CLUSTER... |"

echo "| |"

NET="192.168.5."

HOST="40"

CONT="0"

while [ ${HOST} -lt 46 ]; do

ATIVO=`/bin/ping -c 1 ${NET}${HOST} | /bin/grep 'transmitted' | awk '{print $4}'`

if [ X"${ATIVO}" = X"1" ]; then

RSH=`rsh ${NET}${HOST} echo -e $SHELL`

if [ X"${RSH}" = X"/bin/bash" ]; then

CONT=$((CONT+1))

IP=${NET}${HOST}

echo "| ${IP} [ X ] ATIVO [ ] INATIVO

|"

echo ${IP} >> /etc/lam/lam-bhost.def

echo ${IP} >> /etc/mpich/machines.LINUX

E insira no final do arquivo as seguinte linha:

Em seguida, foi criado o script de shell abaixo, responsvel por testar a

comunicao com cada n escravo, para que sejam criados os arquivos de

configurao da MPI.

marceloNotaacrescentar o comado sync(rw,sync,no_root_squash)

12

else

IP=${NET}${HOST}

echo "| ${IP} [ ] ATIVO [ X ] INATIVO

|"

fi

else

IP=${NET}${HOST}

echo "| ${IP} [ ] ATIVO [ X ] INATIVO |"

fi

HOST=$((HOST+1))

done

echo "| |"

echo "+=========================================================================+"

echo "| TOTAL: ${CONT} host(s) ativo(s) |"

echo "+=========================================================================+"

echo ""

cp /etc/mpich/machines.LINUX /etc/lam/lam-bhost.def

sudo chmod 555 /home/cluster/scripts/geralam.sh

Definimos a localizao do script em /home/cluster/scripts e seu nome como

geralam.sh, e depois restringimos as permisses para que o usurio cluster possa

apenas executar o script, e no editar. Para isso:

No terminal digite:

Configurao SSH: Apenas Debian Sarge

O SSH um servio que estabelece conexes entre mquinas implementando

os mecanismos de autenticao atravs de chave cifrada utilizando algoritmo de

criptografia.

Para que o n mestre consiga se conectar aos ns escravos, uma senha de

acesso dever ser fornecida. Iremos configurar uma chave pblica no SSH para que

seja possvel a conexo com os ns escravos sem ter que digitar uma senha.

Para que isso seja permitido deve estar no usurio que ir usar o cluster, (no

caso deste trabalho o usurio se chama cluster) e executar os seguintes comandos

no shell :

ssh-keygen -t das (das ou rsa)

Rodar no n

zero e trocar

sempre o

endereo do

escravo.

marceloNotacriar este diretorio com o usuario cluster.

13

shutdown r now

sudo cat /home/cluster/.ssh/id_das.pub

ssh cluster@192.168.5.41 'cat >> /home/cluster/.ssh/authorized_keys '

Logue como usurio cluster e digite o comando a seguir

Dicas:

Colocar o IP das mquinas que ser utilizado exemplo acima

192.168.5.41.

s vezes necessrio liberar o arquivo sudo chmod 777

/home/cluster, /.ssh/id_das.pub ou o /home/cluster

/.ssh/authorized_keys.

s vezes os clientes no possuem o arquivo de chaves pblicas, e

necessrio cria-lo executando o comando ssh-keygen -t das (das ou

rsa) nos clientes

Sendo que o primeiro comando criar dentro do diretrio SSH no n mestre, o

arquivo id_das(ou rsa).pub que a chave pblica do usurio neste n.

O segundo comando executa a transmisso desta chave para o n escravo

fazendo assim que o mesmo, a partir de agora, autorize o n mestre a se conectar

com ele sem que seja utilizada uma senha.

Para se transmitir esta chave para mais ns escravos, basta executar o

segundo comando novamente colocando o IP do n escravo que se desejam fazer a

autorizao.

Para testar se a configurao esta funcionando faa um SSH para o n que

recebeu a chave de autorizao, se no pedir senha o mesmo est funcionando.

E por fim, reiniciamos o n mestre atravs do seguinte comando:

2.3 Configurando os ns escravos

Para que houvesse comunicao no momento da execuo de programas

paralelos, foi necessrio mapear o diretrio do usurio cluster, presente no n

mestre, em todos os ns escravos. Ento, como super-usurio, editamos o arquivo

/etc/fstab e inserimos a seguinte linha no fim do arquivo, no terminal digite:

14

sudo gedit /etc/fstab

192.168.5.40:/home/cluster/ /home/cluster/ nfs exec,dev,suid,rw 1 1

192.168.5.40:/home/cluster /home/cluster nfs

rsize=8192,wsize=8192,timeo=14,intr

portmap: ALL

lockd: ALL

mountd: ALL

rquotad: ALL

portmap: 192.168.5.41

lockd: 192.168.5.41

rquotad: 192.168.5.41

mountd: 192.168.5.41

statd: 192.168.5.41

Insira no final do arquivo a seguinte linha:

Para o Debian Sarge insira essa linha ao invs da linha anterior e siga os

prximos passos at a o comando de montagem:

Depois de feita as modificaes devem ser salvas e deve ser editado o arquivo

/etc/hosts.denny para definir a segurana do compartilhamento inserir as seguintes

linhas no final do mesmo:

Aps adicionar estas informaes, o arquivo deve ser salvo e deve ser editado

o arquivo /etc/hosts.allow para definir o IP ou faixa de IPs que podero "concorrer"

aos compartilhamentos, ou seja, especificar quem ter acesso a cada servio.

Neste caso ser adicionando o direito de concorrer ao compartilhamento

apenas ao n escravo que tem o IP 192.168.5.41, para adicionar direitos de

concorrer ao compartilhamento a mais ns escravos deve adicionar as informaes

da seguinte forma:

marceloNotadeny = negar

marceloNotaverificar se todas as pasta que estiverem neste caminho sero compartilhadas

15

sudo gedit /home/cluster/.rhosts

192.168.5.40

192.168.5.41

192.168.5.42

192.168.5.44

192.168.5.45

shutdown r now

sudo mount -a

portmap: host1, host2, host3, hostX

lockd: host1, host2, host3, hostX

rquotad: host1, host2, host3, hostX

mountd: host1, host2, host3, hostX

statd: host1, host2, host3, hostX

statd: 172.20.1.2

Onde host1, 2, 3 e X correspondem aos endereos IPs dos ns escravos que

se quer dar o direito de concorrer ao compartilhamento da rea.

Aps adicionar as informaes necessrias o arquivo deve ser salvo e est

configurado o servidor NFS.

E por fim, para montar a partio compartilhada, digite (comando de

montagem):

Em seguida autenticamos no sistema com o usurio cluster, criamos o arquivo

/home/cluster/.rhosts, e nele definimos os endereos IP de todos os ns confiveis

para este usurio. Por consequncia o contedo do arquivo ficou idntico ao

/etc/hosts.equiv. No terminal digite:

*OBS: bem provvel que esse arquivo esteja vazio...

E insira no arquivo as seguintes linhas (um em cada linha):

Ento certificamo-nos que o n mestre estava ligado, e reiniciamos o n

escravo:

marceloNotacolocar este arquivo no root tbmnano .rhosts

16

sh /home/cluster/scripts/geralam.sh

gedit /etc/mpich/machines.LINUX

gedit /etc/lam/lam-bhost.def

lamboot -v

sudo gedit /home/cluster/lamhosts

2.4 Iniciando a MPI no n mestre

No n mestre, nos autenticamos no sistema com o usurio cluster e

executamos /scripts/geralam.sh para criar os arquivos de configurao da MPI. Os

arquivos criados contm os endereos IP dos ns ativos do cluster. No terminal

como ROOT digite:

*OBS: Esse procedimento deve ser realizado no TERMINAL COMO ROOT, e

no no terminal normal...

Verifique se os seguintes arquivos foram devidamente criados:

*OBS: Verifique tambm se tais arquivos realmente contenham os endereos

IPs apenas dos ns ativos do cluster...

Aps a criao dos arquivos foi necessrio iniciar efetivamente o ambiente MPI

atravs do seguinte comando. No terminal digite:

*OBS: Este comando consulta os arquivos gerados (citados acima) com os

endereos IP dos ns ativos do cluster...

Caso seja necessrio realizar a manuteno de um dos ns do cluster, esse

dever ficar de fora do mesmo. Para isso, o usurio poder criar um arquivo texto

qualquer com os endereos IPs ativos do cluster e pass-lo como parmetro para o

comando lamboot. Exemplo:

O n referente ao IP = 192.168.5.42 precisar passar por uma manuteno.

Ento devemos retir-lo do cluster. Para isso, vamos criar um arquivo chamado

lamhosts, e passar apenas os endereos IPs dos ns ativos do cluster. No terminal

digite:

marceloNotalogar com usuario cluster no mestreexecutar comando:sh /home/cluster/geralam.sh

17

192.168.5.40

192.168.5.41

192.168.5.43

192.168.5.44

192.168.5.45

lamboot v lamhosts

#include

#include

#include "mpi.h"

main(int argc, char *argv[])

{

int ret, rank, size, i, tag;

MPI_Status status;

char message[12];

ret = MPI_Init(&argc, &argv);

ret = MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);

ret = MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

tag=100;

E insira no arquivo apenas os endereos ativos do cluster:

E por fim:

Com isso, nota-se que o n referente ao IP = 192.168.5.42 no se encontra

mais presente ou ativo em nosso cluster.

Uma vez realizada a manuteno, este n poder ser ativado novamente. Para

isso, execute o script geralam.sh novamente, e em seguida o comando lamboot v

(tais passos j foram citados acima).

2.5 Testando a MPI

Para atestar que o ambiente MPI est funcionando corretamente, o seguinte

cdigo-fonte foi utilizado, que nada mais do que um Hello-World em paralelo,

onde cada n escravo ativo enviar para o n mestre uma mensagem indicando que

este se encontra ativo:

18

if (rank == 0)

{

strcpy(message,"Ola, Mundo!");

for (i=0; i

19

lamclean -v

mpitask [ -h ]

mpimsg

inexistentes, programas que no encerravam, dentre muitos outros

problemas. Caso isso ocorra, deve-se digitar no terminal do n mestre o seguinte

comando:

No terminal digite:

*OBS: Este comando responsvel por matar todos os programas MPI e

apagar todas as mensagens pendentes...

2.6.2 Mpitask

Um outro comando interessante o mpitask. Com ele possvel saber o

estado corrente dos programas MPI sendo executados. Esse comando anlogo ao

comando UNIX os. No terminal digite:

*OBS: A opo h na linha de comando fornece um breve resumo desse

comando...

2.6.3 Mpimsg

Similar ao comando mpitask, esse comando fornece informaes sobre

programas MPI que esto sendo executados. O mpimsg mostra todas as

mensagens pendentes no ambiente MPI corrente. Com esse comando, voc pode

ver as mensagens que nunca foram recebidas, mesmo depois que seu programa

MPI tenha sido completado. No terminal digite:

*OBS: Esse comando no til se voc estiver usando o modo "client-to-client"

que o default. Voc deve especificar a opo -lamd no seu comando mpirun para

que o comando mpimsg funcione corretamente.

2.6.4 Lamnodes

20

lamnodes

Para listar todos os ns ativos do cluster (incluindo o n mestre),

execute o comando lamnodes. No terminal digite:

Ser exibido no prprio terminal quais ns esto ativos, e quantos

processadores disponveis cada n possui.

n0 192.168.5.40:1:origin.this_node

n1 192.168.5.41:1:

n2 192.168.5.42:1:

n3 192.168.5.43:1:

n4 192.168.5.44:1:

n5 192.168.5.45:1:

*OBS: Aps executar o comando lamnodes, os seguintes ns foram listados.

Isso indica que cada um desses ns est ativo no cluster, e que cada um possui

apenas 1 processador disponvel (:1). Inclusive o n mestre aparece nessa lista...

21

Section "InputDevice" Identifier "Generic Keyboard" Driver "kbd" Option "XkbRules" "xorg" Option "XkbModel" "abnt2" Option "XkbLayout" "br" Option "XkbVariant" "abnt2" EndSection Section "InputDevice" Identifier "Configured Mouse" Driver "mouse" EndSection Section "Device" Identifier "Configured Video Device" Driver "vesa" EndSection Section "Monitor" Identifier "Configured Monitor" EndSection Section "Screen" Identifier "Default Screen" Monitor "Configured Monitor" EndSection

3 PROBLEMAS DEBIAN 6 (Squeeze)

Na reescrita deste documento, a verso 6 do Debian (Squeeze) tem uma

incompatibilidade com as placas de vdeo ATI, onde os atuais computadores que

compem o cluster possuem placas de vdeo deste fabricante.

Aps a formatao e instalao do Debian 6, o computador no conseguir

iniciar no modo grfico, logo tem-se que utilizar o modo de recuperao do grub e

logar como usurio root.

Uma vez logado em modo texto com o usurio root, deve-se criar o arquivo

/etc/X11/xorg.conf, essa verso do Debian no possui o mesmo e se criado ele

seguir as configuraes contidas no mesmo.

O arquivo dever ficar com as seguintes linhas:

Aps a reinicializao do sistema, o mesmo j dever ser capaz de entrar no

modo grfico

22

cd /home/cluster/scripts

sh geralam.sh

mpicc o nomeDoExecutavel nomeDoPrograma

mpirun N nomeDoExecutvel

Por exemplo:

mpicc o hello helloworld.c

mpirun N hello

4- VERIFICAO O CLUSTER GUIA RPIDO

Para que os gerentes do cluster faam uma verificao diria, onde verificamos

se o cluster est funcionando perfeitamente, basta apenas seguir os seguintes

passos.

I. Se o cluster estiver desligado, lembre-se que o n Mestre o 1 que deve

ser ligado, depois seus ns escravos;

II. Faa login como root.

III. Rode o geralam.sh. Ele verificar se todos os ns esto ativos. Para isso

faa

Todos os ns devero aparecer [Ativo]. Caso algum n estiver [Offline]

verificar se o mesmo est conectado rede ou se ele foi ligado 1 que o n mestre

ou quaisquer outros motivos.

IV. Dar logout e logar como cluster.

V. Execute o comando lamboot v.

VI. Compilar o hello world. Para isso faa:

Caso aparecer Ol Mundo vindo de todos os ns, est correto!

No Esquea!

Para remover, gerenciar: logar como usurio root.

Para compilar, executar: logar com usurio cluster.

23

ssh nomeDoUsuario@IPdoNoMestre

Por Exemplo:

ssh root@192.168.5.40 ou

ssh cluster@192.168.5.40

possvel conectar-se com o cluster a partir de qualquer

computador, desde que esteja conectado rede da universidade (PUC Minas

campus Poos de Caldas). Para isso, abra o terminal de digite:

Normalmente aparece um aviso onde digitamos yes e logo aps solicitado

a senha do usurio.

No esquecendo que:

Para fazer login como super usurio, usar:

usurio: root, senha: pproot..

Para fazer login como usurio comum, usar:

usurio: cluster, senha: ppcluster.

24

rm rf nomeDoArquivoQueDesejaExcluir

Por exemplo:

rm rf exemplo.c

rm rf al550000000

scp arquivoAcopiar userDestino@ipDestino:~/

Por Exemplo:

scp helloworld.c cluster@192.168.5.40:~/

5 CLUSTER CONFIGURADO E INSTALADO

Caso o cluster j estiver configurado e possuir cdigos de alunos anteriores,

tem que deixa-lo pronto para outros alunos usarem. Nesse caso, apague todos os

arquivos .c e pastas com matrculas de alunos, caso existir (mantenha apenas o

cdigo de backup ou outros necessrios, para isso, consulte o professor

responsvel). Nesse caso aps logar como root, faa:

No caso do cdigo do Hello World, verificar se o mesmo do arquivo original

mostrado anteriormente. Do contrrio, tem que se criar um Hello World, para isso

entre como root e faa os seguintes passos:

Onde o usurio vai ser o cluster, o IP Destino o do N Mestre e :~/ significa que vai

ser colocado na home desse usurio, ou seja, onde est os outros arquivos .c.

25

6 CONSIDERAES FINAIS

Em alguns artigos disponveis na internet, recomenda-se que a comunicao

entre as mquinas do cluster seja feita atravs de SSH, porm a comunicao entre

os ns neste documento foi feita via RSH, devido a problemas com permisses entre

os arquivos que contm as chaves de criptografia (authorized-keys) de cada usurio

nos ns. A nica vantagem de utilizar comunicao SSH que as informaes

trafegadas na rede so criptografadas, e como se trata de uma rede local, neste

caso no h necessidade de tal procedimento de segurana.

Em caso de um cluster com um grande nmero de mquinas o cabeamento da

rede no deve ser convencional e sim estruturado, de maneira que a comunicao

entre cada n escravo com o n mestre seja rpida e leve praticamente o mesmo

intervalo de tempo.

26

7 REFERNCIAS BIBLIOGRFICAS

ALVIM, ADRIANA C. F. Executando programas sob LAM / MPI. Disponvel em

. Acesso em Outubro / 2010.

ALVES, MARCOS J. P. Computao Baseada em Clusters. Disponvel em

.

Acesso em Maio / 2010.

LAM / MPI Development Team. LAM / MPI Parallel Computing. Disponvel em

. Acesso em Maro / 2010.

SILVA, BRIVALDO A. J. Instalando o LAM-MPI no Debian. Disponvel em

. Acesso em Maio

/ 2010.

SILVA, GLEYDSON M. Guia Foca Linux. Disponvel em

. Acesso em Maio / 2010.