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Engenharia genética e biossegurança: perspectivas e aspectos importantes para sua aplicação em mandioca Francisco J. L. Aragão Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia [email protected]

Engenharia genética e biossegurança: perspectivas e ...M L M F V K L K T I K M E E T E E I Tetramer (11.2KD) ß-Turn Hydrophobic monomer MLEELFKKMTEWIEKVIKTMG GMTKIVKEIWETMKKFLEELMR

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  • Engenharia genética e biossegurança: perspectivas e aspectos importantes para sua

    aplicação em mandioca

    Francisco J. L. AragãoEmbrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia

    [email protected]

  • Soja tolerante a imidazolinona – Embrapa/BASF

    BASF

  • TransgênicoTransgênicoGenômica Bioquímica

    Genética clássica Bi

    olog

    ia M

    olec

    ular

    Bios

    segu

    ranç

    a Melhoramento

    Maior complexidade = maior necessidade de capacitação

    Investimento

    Legislação

  • multibrotação

    FEC &

    Suspenção

    SistemasSistemas de de regeneraregeneraççãoão de de mandiocamandioca

    Embrigênesissomática

  • Transformação genética AgrobacteriumGene gun (PIG)

  • SeleSeleççãoão

    Seleção direta

    Marcadores

    antibióticosHig, kan, geneticina etc.

    Seleção positivamanose (MPI)

    Marcadores visuaisGus etc, res. herbicidas

    Screening

  • University of Bath, UK

    TS

    LS

    xilemaparênquima

    tiloses

    PAL-gus

    Estudo funcional de promotores

    Resposta a estresse (ferimento)

  • DNA A~2.7 kb

    LIR

    Rep/AC1

    TrAP/AC2

    Ren/AC3

    CP/AV1

    AV2

    TA

    T

    T

    G

    T

    T

    TA

    AA

    AA

    A

    CCC

    C

    CC

    G

    G

    G

    G

    GG

    GG

    CCC

    C

    T

    CAGAACACCCAAGGGGCCAA GCCCCCTTTAATGTGGTCCCCGCGC

    Conserved sequence

    hairpin

    (+) DNA

    Bidirectional promoter

    DNA B~2.7 kb

    LIR

    MPB/BC1

    NSP/BV1

  • Single stranded circularDNA viruses

    Transmitido por moscabranca e mecanicamente

    WhiteflyWhitefly

    DNA-A DNA-Brep

    CP

    ren

    trapBC1 BV1

    RCRC

  • barnase

    Local plant cell deathVirus infection

    Virus spreadX

    Without virus infection No functional Barnase

    Barstar

    35S!

    Barnase 35S!ACp/AVp

    Hm35Sp AC1 35S!

    Hm35Sp AC2 35S!

    Hm35Sp AC3 35S!

    RNA antisense

    Inst. Tec. Zurich

  • Componente B defectivoretardamento no aparecimento dossintomas

    Replicase mutada e gene defectivo

    #1#44 Controle

    Simtomas 7 dpi

  • Plant Molecular Biology 56: 601–611, 2004.

    African cassava mosaic virus (ACMV)East African cassava mosaic Cameroon virus (EACMCV) Sri Lankan cassava mosaic virus (SLCMV)

    Estável (3 anos). Funcional no campo? ACMV e EACMV?Nigéria, Quênia e Uganda.

  • Valine

    N-hydroxyvaline

    2-Methyl proponol oxime

    Acetone cyanohydrin

    Linamarin

    UDP-Glucose + Acetone cyanohydrin

    Acetone +HCN

    CYP79D1CYP79D2

    Linamarase

    Hydroxynitrile lyase(or spontaneously)

    UDPG-glucosyltransferase

    PutativeCYP71E

    Mandioca acianogênica pela redução da expressão de CYP79D1 e CYP79D2

    The Ohio State University

  • Antisense de CYP79D1 e CYP79D2 isolados de mandioca

    0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 120

    20

    40

    60

    80

    100

    4

    15.3

    5966.6

    25.5

    6.2

    41.729.4

    40.5

    23.5

    11.3

    % L

    inam

    arin

    2215 (WT) vs Cab1 transformants

    0

    1

    2

    96

    98

    100

    0.44

    0.73

    0.290.330.26

    0.98

    % L

    inam

    arin

    2215(WT) vs Cab1 transformants

  • Inst. Tec. Zurich

    K

    W

    M

    L

    M

    F

    V

    K

    L

    K

    T

    I

    K

    M

    E

    E

    T

    E

    E

    I

    Tetramer (11.2KD)

    ß-Turn

    Hydrophobic

    monomer

    MLEELFKKMTEWIEKVIKTMG GMTKIVKEIWETMKKFLEELMR

    RMLEELFKKMTEWIEKVIKTMG

    MTKIVKEIWETMKKFLEELMR

    PG

    PG

    PG

    Monomer

    Dimer

    Trimer

    Tetramer

    ß-Turns

    Hydrophilic

    HydrophilicHydrophobic

    Proteína de reserva artificial (ASP1)DEMEGEN INC., U.S. Patent # 5811654, 1998

  • Ile10% Leu

    10%

    Lys20%

    Met15%

    Phe5%

    Thr10%

    Trp5%

    Val5%

    Others20%

  • P WT S1 S2 S3 S4 S5 S6 S7 S8 S9 S10 S11 S12 S13 S14 S15 S16

    1 kb

    500 bp

    Análises de Southern and northern analysis

    11.2 KD

    WT P77 Q7 Q12 S5 S11 S13 S16

    Folhas

    Raízes primárias

    11.2 KD

    WT P77 Q7 Q12 S5 S11 S13 S16

    Westhern blots

  • Hernán Ceballos, 16/07

    Genes CryMelhoramento nutricionalTolerância a herbicidas

  • Aragão, 2006

    Processo regulatório?

  • Biossegurança: tão ou mais seguro

  • Resolução Normativa Nº 5 da CTNBio, de 12 de março de 2008

    Dispõe sobre normas para liberação comercial de Organismos Geneticamente Modificados e seus derivados

    - informações relativas ao OGM- avaliação de risco à saúde humana e animal- avaliação de risco ao meio ambiente- plano de monitoramento (mínimo de 5 anos)

  • BASF

  • Biossegurança: tão ou mais seguro

  • Recursos Genéticos e Biotecnologia

    Arroz e Feijão

    Soybean

    Milho e Sorgo

    Agrobiologia

    Agroinsdústria

    UNESP-Botucatu

  • O que fizemos ?

    X

    Como fizemos ?

  • Caracterização Molecular

    • Número de insertos, estabilidade• Número de cópias dos elementos genéticos • Integridade dos cassetes de expressão• Presença de DNA adicional (backbone)• Seqüência flanqueadoras no DNA genômico• Seqüência dos elementos inseridos• Marcadores de DNA (eventos específicos)

  • ahas cds

    AC1 seq

    AC1 seq

    pdk intron

    ahas5´

    35SCaMV

    ahas3´

    ocs3´

    Nco I (3963)

    Xho I (7812)

    Xba I (6444)

    Xba I (9440)

    ahas cds

    AC1 seq

    AC1 seq

    pdk intron

    ahas5´

    35SCaMV

    ahas3´

    ocs3´

    Nco I (3963)

    Fsp I (480)

    Xho I (669)

    Xho I (7812)

    Xba I (732)

    Xba I (6444)

    Xba I (9440)

    E4

    ...tcagtggaacgaaacgaaagggggatgtgct...

    StableGenerations x after crosses

  • Presence of transgenes, no antibiotic resistance genes

    haploid genome

  • Caracterização da Proteína,Alimento / segurança para alimentação

    •Caracterização da proteína e equivalente•Concentração da proteína dos tecidos da planta•Caracterização da proteína purificada como alimento•Alergenicidade? •Toxicidade?

  • BASF

  • BASF

  • Equivalencia agronômica, Segurança ambiental

    • Caracterização agronômica / variações fenotípicas? •Adaptabilidade•Segurança ambiental•Cadeia no meio ambiente

  • Equivalência de Composição,Equivalência Nutricional

    •Amostras de multi-locais, multi-anos, com réplicas de campos•Metabólicos secundários•Processamento em escala piloto, análises de nutrien tes/ antinutrientes (métodos validados)•Confirmação da segurança como alimento•Estudos de alimentação em animais

  • Protein, Zn, Cu, Ca, Fe, Mg, Phytate, Folates, lipids, etc.

  • Crop Trait Developer Regulatory status

    Cassava Viral resistance Donald Danforth Plant Sciences Center

    ---

    Cotton Insect resistance Monsanto ---

    Maize Drought tolerance Monsanto ---

    Crop Trait Developer Regulatory status

    Cassava Bio-fortification Gates Foundation ---

    Cassava Viral resistance Donald Danforth Plant Sciences Center

    ---

    Cowpea Insect resistance African Agricultural Technology Foundation (AATF)

    ---

    Sorghum Bio-fortification* Africa Harvest ---* Increased levels of pro-vitamin A, vitamin E, iron, zinc, amino acids, and protein

    Malawi

    Nigeria

    Quênia e UgandaCrop Trait Developer Regulatory Status Year

    Sorghum Bio-fortification* Africa Harvest--- ---

    Cassava Viral resistanceDonald Danforth Plant Sciences Center

    Confined field trial 2006

    Cotton Insect resistance MonsantoConfined field trial 2007

    Corn Insect resistanceKenya Agricultural Research Institute, Syngenta, CIMMYT

    Confined field trial 2006

  • Não é realistico esperar encontrar um ambiente que seja arroz “GM-free” (USA). Pode ser negativo para “Arroz GM, masnão zero-GM”

  • Estudos para co-existência

  • Obrigado !