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Mestrado do Mar Mestrado do Mar 2004.06.16 Ferramentas de modelação ecológica: Sistemas de Informação Geográfica (SIG) Ana Nobre Instituto do Mar

Ferramentas de modelação ecológica - ecowin.org · o Definição e conceitos o Representação dos dados num SIG (Formatos) ... Overall Kappa = 0.93. Modelo ecológico da Ria Formosa

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Mestrado do MarMestrado do Mar2004.06.16

Ferramentas de modelação ecológica:

Sistemas de Informação Geográfica

(SIG)

Ana Nobre

Instituto do Mar

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Utilização de SIG’s em modelação ecológica

Tópicos• Sistemas de informação geográfica

o Definição e conceitoso Representação dos dados num SIG (Formatos)

• Detecção remota em ecologia• Casos de estudo

o Projecto C2C – Detecção remota da área de mangal na baía de Maputo

o Projecto OAERRE – Modelo ecológico da Ria Formosa

o Projecto TICOR- Typology and reference conditions for transitional and coastal Portuguese water

• Síntese • Exercícios práticos

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Definição e conceitosSistemas de informação geográfica

Definição geral:Definição geral:The Geographer's Craft Project (K.E., Foote, Lynch, M., 2000)

“SIG é uma base de dados digital específica em que o principal meio de referência é um sistema espacial de coordenadas.”

Funções:Funções:• Introdução de dados• Armazenamento, retribuição e ‘query’ de dados• Transformação, análise e modelação de dados• Apresentação dos dados em mapas

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63 2537 87

Lon Lat Atributo

Definição e conceitos

7.30 37.9 637.35 37.9 257.30 37.5 377.35 37.5 87

ArmazenarManipular

Retribuir

X

Esquema simplificado

Introdução de dados

International GIS dicitionary (McDonnell, R., Kemp, K., 1996)

“Sistema computacional destinado a armazenar, integrar, manipular e retribuir dados que estão espacialmente referenciados relativamente à terra.”

Sistemas de informação geográfica

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Vectorial ‘Raster’Formatos

Representação dos dados

Sistemas de informação geográfica

Célula

Armazena e representa graficamente os dados através de pontos, linhas ou polígonos

Armazena e representa graficamente os dados através de uma matriz ou grelha de células.

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Sistemas de informação geográfica

Representação dos dadosVectorial ‘Raster’

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Aplicações da detecção remota

Detecção remota em ecologia

• Modelos de classificação supevisada e não supervisada

o Mapeamento de habitatso Classificação do uso de solo da bacia de drenagem

• Detecção remota da qualidade da águao Detecção / quantificação de substâncias na água (spm’s, chl a)

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Caso de estudo: Projecto Catchment to Coast (C2C)

RemoteRemote sensing sensing applications to Maputo applications to Maputo

Bay Bay –– Mangrove Mangrove classificationclassification

Pau

la, J

. et a

l, 19

98.

J. P

lank

. Res

. Vol

20

Rem

ote

sens

ing

clas

sific

atio

n

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Caso de estudo: C2C

Mangrove habitat classificationMangrove habitat classification

- Fusion of classification methods

- Training area rectification

• Data overview

• Ecological role of mangrove areas

- Validation

- Multiple classifier approach

• Mangrove classification process

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Data overviewData overview-- field data field data -

Caso de estudo: C2C

-– Mangrove mapping of the Incomati estuary:

Incomati estuary land cover classes

< 5

0

10

> 20

Depth (m)

0 10 km

< 5

0

10

> 20

Depth (m)

0 10 km0 10 km

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Data overviewData overview-- satellite imagery satellite imagery -

Caso de estudo: C2C

-– Acquisition Date: 2001-05-07

– Radiometric and Ortho Rectification

– Satellite: Landsat 7

– Sensor: ETM+Composites created from ETM+

(RGB5_4_3) (RGB5/4_3/5_3) (RGB3_2_1)

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Caso de estudo: C2C

Classification process overviewClassification process overview– Training area rectification

– Multiple classifier approach

– Fusion of classification methods

– ValidationInhaca Island

(RGB3_2_1) ( MSAVI2) ( RGB7/4_5/2_3)

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Caso de estudo: C2C

Training areas rectificationTraining areas rectification– The training areas presented two major concerns:

• Spatial displacement with satellite imagery

• Lack of spectral homogeneity necessary for a supervised classification process

– Rectification of the areas was conducted using:

• a standard spatial adjustment for geoposition errors

• Unsupervised classification to determine spectrally homogenous areas

Overlay of training areas and RGB3_2_1

Incomati Estuary

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Supervised classificationSupervised classificationMultiple classifier approachMultiple classifier approach

– Minimum Distance to Means

– Neural Network using Back Propagation Technique

– Maximum likelihood using 0,1,2.5 and 5% exclusion

– Bayesian ClassifierPreliminary classifications

(Minimum distance to Means) (Maximum likelihood) ( Neural Network)

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Fusion of classification methodsFusion of classification methods– For each classification method it was calculated the accuracy of

each class– Higher accuracy classes were extracted from each classification

method and then merged to create the final result– “Noise” reduction was achieved using mode filters (to reduce the

“salt and pepper” effect)

Final mangrove areas

Preliminary classifications

Final classification

ClassesMangroveDwarf mangroveDegradedmangrove

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ValidationValidation– Final classification was matched against previously selected test areas

– Confusion matrix was generated to evaluate class accuracy

– Kappa Index Of Agreement (KIA) was calculated to assess overall classification accuracy

Inhaca Island

0.94Mangrove0.98Dwarf Mangrove0.99Degraded Mangrove0.92Marshes 20.95Marshes 10.81Urban 20.88Urban 10.89Dune Vegetation0.86Sand Dunes0.91Other

KIAClass Name

Overlay of classification and RGB3_2_1Overall Kappa = 0.93

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Modelo ecológico da Ria Formosa

Caso de estudo: Projecto OAERRE

Obtenção e análise de dados usando as Obtenção e análise de dados usando as funções disponibilizadas num SIGfunções disponibilizadas num SIG

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Caso de estudo: Projecto OAERRE

Divisão do sistema em caixas

Com base:-Batimetria;

-Dados de fluxos.

Depth (m)> -5

0-3

3> 5

0 4000 mCaixas Caixas do do modelo ecológico modelo ecológico

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Caso de estudo: Projecto OAERRE

Cálculo de áreas e volumes

# N

(H)

(H x A)

Parâmetros morfológicosParâmetros morfológicosÁrea N x AVolume H x A x N

N – número de célulasA – área da célulaH – altura de água

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Caso de estudo: Projecto OAERRE

Cálculo de áreas e volumes

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Interpolação de dados de qualidade da água

Distribuição espacial de substâncias

Nitrate

Dados de qualidade da água geo-referenciados

Importação para uma superfície

Interpolação de pontos

Caso de estudo: Projecto OAERRE

Phosphate

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Caso de estudo: Projecto OAERRE

Mapas de distribuição de Mapas de distribuição de nutrientesnutrientes

Os mapas resultantes da aplicação de modelos de Os mapas resultantes da aplicação de modelos de interpolação espacial contribuem para a: interpolação espacial contribuem para a: • Compreensão geral do sistema

• Identificação de áreas problemáticas

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Mapas de distribuição de Mapas de distribuição de nutrientesnutrientes

Nitrate

Caso de estudo: Projecto OAERRE

Principal afluente (R. Gilão)

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Phosphate

Caso de estudo: Projecto OAERRE

Mapas de distribuição de nutrientes

Pontos de descarga de águas residuais

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Caso de estudo: Projecto OAERRE

Mapas de razão de nutrientes

Verão

Inverno

Verão

Inverno

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Classificação dos usos do solo da bacia de drenagem por detecção remota

Caso de estudo: Projecto OAERRE

LandSat TMResolução de 30 m7 bandas espectrais

Imagem Imagem classificadaclassificada

Algoritmo

de classificação

Análise espectral das zonas de treino

Imagem georeferenciada

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Caso de estudo: Projecto OAERRE

Classificação dos usos do solo da bacia de drenagem por detecção remota

Imagem classificadaImagem classificada

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Potencial de exportação de nutrientes para a Ria

Coeficientes de exportação de fósforo

Caso de estudo: Projecto OAERRE

Coeficientes deexportação de azoto

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Cartografia da vegetação de sapalCaso de estudo: Projecto OAERRE

LandSat TM

Resolução de 30 m7 bandas espectrais

Imagem georeferenciada

Aplicação do indíce de vegetação (NDVI)

IV – banda do infra-vermelhoV – banda do vermelho

NDVI = (IV – V)/(IV + V)

IVVIVVZonamento da vegetação

O verde indica actividade de clorofila

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Distribuição espacial do sapal

Sapal SuperiorSapal Inferior

0

50

100

150

200

250

3.4

- 3.3

3.3

- 3.2

3.2

- 3.1

3.1

- 3

3 - 2

.9

2.9

- 2.8

2.8

- 2.7

2.7

- 2.6

2.6

- 2.5

2.5

- 2.4

2.4

- 2.3

2.3

- 2.2

2.2

- 2.1

2.1

- 2

2 - 1

.9

1.9

- 1.8

1.8

- 1.7

1.7

- 1.6

1.6

- 1.5

1.5

- 1.4

1.4

- 1.3

1.3

- 1.2

1.2

- 1.1

1.1

- 1

1 - 0

.9

0.9

- 0.8

0.8

- 0.7

0.7

- 0.6

Elevation (m)

Are

a (h

a)

0

50

100

150

200

250

3.4

- 3.3

3.3

- 3.2

3.2

- 3.1

3.1

- 3

3 - 2

.9

2.9

- 2.8

2.8

- 2.7

2.7

- 2.6

2.6

- 2.5

2.5

- 2.4

2.4

- 2.3

2.3

- 2.2

2.2

- 2.1

2.1

- 2

2 - 1

.9

1.9

- 1.8

1.8

- 1.7

1.7

- 1.6

1.6

- 1.5

1.5

- 1.4

1.4

- 1.3

1.3

- 1.2

1.2

- 1.1

1.1

- 1

1 - 0

.9

0.9

- 0.8

0.8

- 0.7

0.7

- 0.6

Elevation (m)

Are

a (h

a)

Preia mar média Maré média Baixa mar médiaSapal superior Sapal Inferior

Caso de estudo: Projecto OAERRE

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Caso de estudo TICOR:Typology and reference conditions for

transitional and coastal Portuguese waters

Caso de estudo: Projecto TICOR

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data0 2000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data0 2000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data0 2000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data0 2000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

Depth (m)> -5

0-3

3> 5LimitsNo data

0 4000 m

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Caso de estudo: Projecto TICOR

Determinação dos limites das águas costeiras portuguesa

Definição da Directiva Quadro da Água (WFD) para ”Águas costeiraDefinição da Directiva Quadro da Água (WFD) para ”Águas costeiras”:s”:

‘…surface water on the landward side of a line every point of w‘…surface water on the landward side of a line every point of which is at a hich is at a distance of one nautical mile on the seaward side from the nearedistance of one nautical mile on the seaward side from the nearest point st point of the baseline from which the breadth of territorial waters is of the baseline from which the breadth of territorial waters is measured…’measured…’

1. “baseline from which the breadth of territorial waters is measured” = ‘Linha de fecho e de base recta” definida no D.L. 495/85;

2. Limite interior – limite de terra;

3. Limite exterior – linha cujos pontos distam uma milha náutica na direcção do mar da linha definida em 1.

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Pontos que definem Pontos que definem “linhas de fecho e “linhas de fecho e

de base recta” de base recta” (D.L.nº495/85)(D.L.nº495/85)

Limite exterior: dista Limite exterior: dista 1 milha nautica da 1 milha nautica da

linha de fecholinha de fecho

Criteria:

t.d.

Baseline points Baseline

Determinação dos limites das águas costeiras portuguesa

Caso de estudo: Projecto TICOR

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Determinação dos limites das águas costeiras portuguesa

Caso de estudo: Projecto TICOR

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Caso de estudo: Projecto TICOR

Definição da tipologia da Ria de AveiroDe acordo com as definições da WFD um critério determinante na distinção entre águas de transição e costeiras é o gradiente salino.

SIG foi usado para apoio à tomada de decisão para interpolar dados de salinidade

Método de interpolação: Inverse distance weighted

Este algoritmo de interpolação assume que cada ponto têm uma influência local que diminui com a distância. Dá maior peso aos pontos mais próximos da célula em processo do que aos pontos mais distantes.

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Category Type Descriptor SystemsSurface watersTransitional A1 Mesotidal stratified Minho estuary Lima estuary

estuary Leça estuary Douro estuary

A2 Mesotidal torrential Ria de Aveiro ? Mondego estuaryestuary Tejo estuary Sado estuary

Mira estuary Guadiana estuaryArade estuary

Surface watersCoastal A3 Mesotidal semi-enclosed S. Martinho lagoon Óbidos lagoon

lagoon Albufeira lagoon Melides lagoonSto André Lagoon

A4 Mesotidal shallow lagoon Ria Formosa Ria de AlvorRia de Aveiro ?

A5 Mesotidal exposed Atlantic From the Minho estuary until Coast Cabo Carvoeiro

A6 Mesotidal moderately From Cabo Carvoeiro until Pontaexposed Atlantic Coast da Piedade (Algarve)

A7 Mesotidal sheltered Coast From Ponta da Piedade until VilaReal de Sto António

Definição da tipologia da RiaDefinição da tipologia da Ria de de AveiroAveiro

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Caso de estudo: Projecto TICOR

Superfície de salinidadeValor de salinidade em cada estação calculado com base na:

Média Mediana

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Caso de estudo: Projecto TICOR

Superfície de salinidade- valores médios sazonais -

Inverno Primavera Verão Outono

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Category Type Descriptor SystemsSurface watersTransitional A1 Mesotidal stratified Minho estuary Lima estuary

estuary Leça estuary Douro estuary

A2 Mesotidal torrential Ria de Aveiro Mondego estuaryestuary Tejo estuary Sado estuary

Mira estuary Guadiana estuaryArade estuary

Surface watersCoastal A3 Mesotidal semi-enclosed S. Martinho lagoon Óbidos lagoon

lagoon Albufeira lagoon Melides lagoonSto André Lagoon

A4 Mesotidal shallow lagoon Ria Formosa Ria de Alvor

A5 Mesotidal exposed Atlantic From the Minho estuary until Coast Cabo Carvoeiro

A6 Mesotidal moderately From Cabo Carvoeiro until Pontaexposed Atlantic Coast da Piedade (Algarve)

A7 Mesotidal sheltered Coast From Ponta da Piedade until VilaReal de Sto António

Definição da tipologia da RiaDefinição da tipologia da Ria dede AveiroAveiro

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Permite:

• Representar dados espaciais (formato raster e vectorial)

• guardar dados numa base de dados geográfica

• analisar dados (funções SIG: álgebra de mapas, reclassificação de atributos, geoestatística)

• obter novos dados (detecção remota, digitalização, processamento de mapas existentes)

• Visualizar resultados

Síntese - SIG’s como ferramenta de modelação -

Sistemas de informação geográfica

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Importante para:

• Delimitação dos sistemas aquáticos

• Visão global do sistema

• Identificação de zonas problemáticas

• Mapeamento de habitats

• Detecção / quantificação de parâmetros de qualidade da água

• Determinação de parâmetros morfológicos

Síntese - SIG’s como ferramenta de modelação -

Sistemas de informação geográfica