Introdução - GBIF · 2017. 9. 4. · Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF ISA, 4-6 Setembro 2017 I m a g e m: C é s a r G a r c i a BLOCO

Curso de formação:

Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF

Rui Figueira

[email protected]

Nó Português do GBIF, Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa

Introdução

Curso de formação: Publicação de dados de biodiversidade através do GBIFISA, 4-6 Setembro 2017

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BLOCO 1 – INTRODUÇÃO GERAL

1.1. O panorama da informática para a biodiversidade e o papel do GBIF

1.2. Importância da publicação de dados através do GBIF

1.3. Ciência Aberta e Dados Abertos

1.4. Fluxo de publicação de dados através do GBIF

SUMÁRIO


GBIF EM NÚMEROS Dados de

ocorrência de espécies

Instituiçõespublicadoras

https://demo.gbif.org/the-gbif-network

783.732.6082.592.455

447.939

Global:

Para PT:

Por PT:

1.33416

Global:

De PT:

54 países / 40 participantes associados


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GBIF A NÍVEL NACIONAL

NÓNACIONAL

UNIVERSI-DADES

UNIDADES DE I&D MUSEUS CIÊNCIA

CIDADÃSECTORPRIVADO

INVESTI-GADORES

PUBLICAÇÃO / USO / FORMAÇÃOINST.

PÚBLICOS

USO / FORMAÇÃO

RIPORBIOTA

INFRAESTRUTURA PADRÕESFORMAÇÃO


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DADOS PUBLICADOS PELO GBIF

Baseados em Observações● Projectos científicos● Monitorização / amostragens /

inventários● Ciência Cidadã

Baseados em Espécimes● Coleções biológicas (incluindo HN)● Bancos de germoplasma / coleções

vivas

OCORRÊNCIAS E DADOS DE AMOSTRAGENS

CHECKLISTS

METADADOS


PORTAIS de DADOSNACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org


PUBLICAÇÃO PORINSTITUIÇÕES PORTUGUESAS


VANTAGENS DA PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF

● Plataforma global: dados padronizados → indexação → pesquisa

● Fácil citação do uso através de DOI

● Mais citações → Maior impacto

● Preservação dos dados

● Rastreamento e informação sobre o uso dos dados

● Dados mantém a propriedade original

● Licença padrão: CC0, CC-BY, CC-BY-NC


USO DOS DADOS

Palavras-chave de ~1900 artigos que citam o GBIFhttp://www.mendeley.com/groups/1068301/gbif-public-library/

4200 artigos científicos

108 para autores com afiliação portuguesa

2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 20170

20

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Portugal

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Global

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cia


http://www.biodiversityinformatics.org

ENQUADRAMENTO GLOBAL








O PANORAMA GLOBAL

GBIF coopera com outras organizações ou iniciativas internacionais, que desenvolvem actividade complementar: - Catalogue of Life, Encyclopedia of Life, Biodiversity Heritage Library, BOLD, Plazi- LifeWatch, DISSCO, CETAF;- EEA- CBD, IPBES, UNEP-WCMC- comunidade: TDWG- desenvolvimento de um curriculum académico em informática para a biodiversidade


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SUMÁRIO


PORQUÊ PUBLICAR DADOS ATRAVÉS DO GBIF?

Aumentar o impacto



A disponibilidade dos dados da investigação científica decresce rapidamente com a idade

Vines, Timothy H et al.. 2014. “The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age.” Current Biology 24 (1): 94–97. doi:10.1016/j.cub.2013.11.014.

Assegurar a preservação e acessibilidade dos dados



Aumentar a visibilidade da colecção / bd



Potenciar investigação inovadora



Requisito do financiador



Compromisso assumido por Portugal, através da Declaração do Rio de Janeiro (2003),durante a cimeira de MCT da CPLP, de partilha e disponibilização, por via digital, do patrimóniocientífico nacional com origem nos países da CPLP.

Responder à missão da instituição/ Responsabilidade social



Ciência cidadã / participação social


PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS

Aumentar do impacto científico

Aumentar a exposição a nível global, valorizando

Facilitar a revisão das colecções por especialistas

Assegurar a preservação dos dados

Responder a compromissos internacionais

Responder ao interesse de comunidades específicas

Cumprir requisitos do financiador


PRINCIPAIS MOTIVAÇÕES PARA A PUBLICAÇÃO DE DADOS

Executar a decisão política - adopção de acesso aberto

● Maximizar o reconhecimento pelo uso dos dados

● Potenciar nova investigação

● Promover a boa gestão de recursos naturais

Melhorar a qualidade dos estudos de impacte ambiental

Promover a capacitação


BARREIRAS À PUBLICAÇÃO DE DADOS

Psicológicas e culturais

– falta de conhecimento

– falta de vontade

– qualidade dos dados

Institucionais

– privacidade

– autorização

Capacidade e recursos

– tempo / planificação

– capacidade

Práticas

– fundos / RH

– infraestrutura

Sharon Grant. Foundations for the BID Workshop – Biodiversity Data Mobilization. Kigali 2016


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SUMÁRIO


CIÊNCIA ABERTA / DADOS ABERTOS

FAIR

Findable, Accessible, Interoperable, Reusable.

http://www.ciencia-aberta.pt/

FACILITATE OPEN SCIENCE TRAINING FOR EUROPEAN RESEARCH


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PARTE 1.4


TIPOS DE DADOS PUBLICADOS ATRAVÉS DO GBIF

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● Metadados de recursos de dados

● Lista de espécies (Checklists)

● Dados de ocorrênciaCORE: OCORRÊNCIA

● Dados baseados em eventos de amostragens ou inventários

CORE: EVENTO

Os dados podem ser apenas publicados por INSTITUIÇÕES ou ORGANIZAÇÕES.

Os cidadãos podem publicar através de projectos de ciência cidadã



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Fontes de dados:

- colecções zoológicas, de herbário, microbianas, de tecidos, de ADN, bancos de germoplasma, colecções vivas;

- dados de satélite, armadilhas, câmaras fotográficas ou vídeo automáticas;

- teses, relatórios, literatura;

- bases de dados de observações, programas de monitorização, estudos de impacte ambiental;

- projectos de ciência cidadã;

- listas de espécies, checklists, listas vermelhas.



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https://www.gbif.org/sampling-event-data

Dados baseados em eventos de amostragem ou inventários - estrutura


FLUXO DE PUBLICAÇÃO DE DADOS ATRAVÉS DO GBIF

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1. Estabelecer acordos/autorizações institucionais

2. Fazer o registo e solicitar o aval pelo Nó:https://www.gbif.org/become-a-publisher

- Tomar conhecimento do Acordo de Publicação de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-publisher - Tomar conhecimento do Acordo de Uso de dadoshttps://www.gbif.org/terms/data-user

3. Seleccionar as ferramentas de publicação e estabelecer a infraestrutura

Pode usar-se o serviço IPT.GBIF.PT para alojamento dos dados

4. Preparar os dados para publicaçãoFormatar segundo o padrão de dados, fazer verificação de qualidade

5. Seleccionar uma licença (CC0, CC-BY, CC-BY-NC) (pode ser definida para cada dataset)

PASSOS INSTITUCIONAIS (1ª vez)

https://www.gbif.org/become-a-publisher

https://www.gbif.org/terms/data-publisher

https://www.gbif.org/terms/data-user


PREPARAÇÃO DE UM CONJUNTO DE DADOS

Dados Padronização(DwC)

Descrição(metadados)

Validação

Publicação de dados

Publicação de metadados

(Artigos de dados)


ACESSO AOS DADOS PUBLICADOS

NACIONAL: http://dados.gbif.ptGLOBAL: http://www.gbif.org

FONTE: e.g. http://ipt.gbif.pt(gerido autonomamente pelo publicador)

http://ipt.gbif.pt/

Obrigado pela atenção

Nó Português do GBIFInstituto Superior de AgronomiaHerbárioTapada da Ajuda1349-017 Lisboa, Portugal

Tel: (+351) 213653165email: [email protected]://www.gbif.pt

O Nó Português é acolhido no ISA com o apoio da FCT.

Esta apresentação é publicada segundo a licença CC-BY-SA

Publicação de dados de biodiversidade através do GBIF

http://www.gbif.pt/

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