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1 Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência Filogenética 1. Introdução 2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição 3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas 4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas

Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

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Page 1: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

1

Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas

Page 2: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

2

Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

Objetivo: Compreender que a sistemática biológica é uma ciência histórica, comparativa e inferencial.

Page 3: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

3Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

Systematics is the branch of evolutionarybiology that aims to recover thegenealogical relationships underlyingorganic diversity.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo objetivo é recuperar as relações genealógicas subjacentes à diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

Page 4: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

4Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia

evolutiva cujo objetivo é recuperar as

relações genealógicas subjacentes à

diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

Page 5: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

5Arhat Abzhanov

Page 6: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

61. Sistemática biológica

Introdução

TempoEspaço

Diversidade

Page 7: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

7

EspaEspaççooTem

po

Tem

po

Descendência com modificação

1. Sistemática biológica

Introdução

Page 8: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

8

EspaEspaççoo

Tem

po

Tem

po

Descendência com modificação

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo

objetivo é recuperar as relações genealógicas

subjacentes à diversidade orgânica

1. Sistemática biológica

Introdução

Page 9: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

9

C. crassirostris

C. pallidaG. fortis

C. parvulus

G. magnirostris

G. conirostris

G. scandens

C. pauper

C. heliobates

C. olivacea

Ancestral comum

Introdução

1. Sistemática biológica

Page 10: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

10Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva

cujo objetivo é recuperar as relações

genealógicas subjacentes à diversidade

orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

Page 11: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

11

G. magnirostris

G. fortis

G. fuliginosa

G. scandens C. pallida

C. heliobatesG. conirostris C. crassirostris

C. parvulus C. pauper

C. olivacea T. obscura

Introdução

1. Sistemática biológica

Page 12: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

12

Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

Page 13: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

132. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

Page 14: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

14

A G

TC

2. Preservação e destruição da informação

Introdução

Page 15: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

15

População descendente População descendente

Sequênciasdescendentes

AA

CCTT

População ancestral

Sequência ancestral

Page 16: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

16

AC — ATGAACGT — CAA CGC — T — C

ACTGAACGTAACGC

ACTGA — T — GAC — GGTA A — G CGC

A AC ∗ AT TG GG ∗ AA AG ∗ CG GT ∗ CA AG ∗ AC CG GC C

Sequência ancestral

Sequênciadescendente 1

Sequênciadescendente 2

Sequênciasobservadas

Page 17: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

172. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

A G

TC

Page 18: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

18

Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

Page 19: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

19

EspaEspaççooTem

po

Tem

po

Page 20: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

203. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

Page 21: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

213. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

Dados de distribuição de caracteres

Métodos deinferência

Padrão filogenético+ →

Page 22: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

22

Histórica Comparativa Inferencial

A sistemática biológica éuma ciência

Page 23: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

233. Padrão e processo

Introdução

Matriz de caracteres alinhadosEvolução (não-observável)

CGACTTG

CCACATG

DADOS DE SEQUÊNCIAS

GC TAA

Análise filogenética

Page 24: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

Page 25: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

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Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas