PubMed: informação em ciências da saúde

PUBMED FONTE DE INFORMAÇÃO EM CIÊNCIAS DA SAÚDE

Bibliotecas da Universidade de Aveiro 2012

PubMed Sumário !  Sobre a PubMed

!  Conteúdos !  Funcionalidades !  Pesquisa !  Espaço pessoal

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Bibliotecas da Universidade de Aveiro | 2012

PubMed

Informação científica

!  A publicação científica é a componente formal da comunicação científica e tem como função! documentar, disseminar e certificar os resultados da investigação científica.

!  Um dos meios tradicionais e ainda o mais usado e considerado para a publicação são os artigos em revistas científicas.

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PubMed O processo de peer review ou refereeing (revisão por pares)

!  Processo utilizado na publicação de artigos em revistas e que consiste em submeter o trabalho científico à avaliação de um ou mais especialistas da área. Através deste processo é certificada a qualidade dos artigos publicados numa revista científica.

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PubMed O processo de peer review ou refereeing (revisão por pares)

!  As práticas, os meios e mecanismos de publicação científica variam em função das diferentes áreas de conhecimento e práticas de investigação, variando assim, também, as plataformas e estratégias para pesquisa e descoberta de informação.

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PubMed Bases de dados de artigos científicos

!  Reúnem num único ponto de acesso revistas científicas de diferentes editores e permitem a realização de pesquisas abrangentes.

!  São as ferramentas adequadas para a realização de uma revisão bibliográfica sobre um determinado assunto.

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!  Podem ser multidisciplinares ou temáticas.

!  A PubMed é a base de dados temática internacional considerada essencial para a pesquisa de informação, nas áreas científicas das Ciências da Saúde e Biomedicina.

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!  Outras bases de dados podem ser usadas para pesquisa de informação científica nas áreas científicas das Ciências da Saúde e Biomedicina. As bases de dados multidisciplinares, ou seja, que abrangem todas as áreas do conhecimento, que estão disponíveis para a comunidade académica são a SCOPUS, a Web of Science e a Academic Search Complete.

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!  As bases de dados estão disponíveis no portal das bibliotecas da ua, na página Web “artigos”, com o endereço eletrónico

http://www.ua.pt/sbidm/biblioteca/artigos

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Sobre a PubMed


PubMed Sobre !  Endereço eletrónico da Pubmed?

http://www.pubmed.org ou http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

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PubMed Sobre !  Base de dados bibliográfica especializada em

literatura biomédica; !  Criada em 1997, nos Estados Unidos, pela

National Library of Medicine, com o objetivo de tornar os conteúdos da Medline pesquisáveis através da Internet;

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PubMed Sobre !  Áreas indexadas: medicina, enfermagem,

medicina veterinária, medicina dentária, cuidados de saúde, ciências pré-clínicas;

!  Pesquisa livre na Web - http://www.pubmed.org;

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PubMed Sobre !  As referências podem conter o acesso ao texto

integral dos artigos, quer através da PubMed Central, quer do portal Web do editor;

!  Possibilita o acesso ao texto integral dos artigos das revistas assinadas pela UA, consórcio b-on e acesso livre (Open Access);

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PubMed Sobre !  Indexa mais de 22 milhões de registos – artigos

científicos e de revisão, conferências, livros eletrónicos, entre outros;

!  Atualizada diariamente;

!  Com artigos desde 1865 até ao presente;

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PubMed Sobre !  Os assuntos atribuidos aos artigos são

controlados pelo Thesaurus MeSH;

!  Com os conteúdos da Medline e OldMedline. A OldMedline contém artigos de revistas publicadas entre 1946 e 1965 de cerca de 80 países;

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PubMed !  Artigos out-of-scope

"  Artigos selecionados pela National Library of Medicine (NML) que pertencem a revistas multidisciplinares (selectively indexed journal) que não são abrangidas pela Medline (ex. Science e Nature). Estes artigos pertencem às áreas das ciências da vida e biomedicina, e são indexados na base de dados Medline. Na PubMed, um artigo out-of-scope tem na sua citação a tag [PubMed].

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Sobre

PubMed !  Pesquisa de ensaios clínicos (Clinical trials)

"  Estudos biomédicos e investigação relacionada com áreas da saúde, aplicados em seres humanos e que seguem protocolos pré-definidos;

!  Inclui citações in-process "  Artigos que ainda não foram indexados com os termos

do thesaurus MeSH;

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Sobre

Ferramentas da PubMed


PubMed Ferramentas !  A PubMed oferece aos seus utilizadores um

conjunto de ferramentas específicas. O acesso é feito a partir da página de entrada da base de dados, opção “PubMed Tools”. http://www.pubmed.org

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PubMed Ferramentas !  Single Citation Matcher

"  Permite localizar um artigo através de dados da referência bibliográfica. Usa-se quando se pretende um artigo em concreto, e não se tem muito informação.

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PubMed Ferramentas !  Batch Citation Matcher

"  Pesquisa um grupo de artigos de uma só vez, através de várias referências bibliográficas já existentes. Esta ferramenta requer o conhecimento exato de vários elementos da citação - nome da revista, ano, volume, 1ª página do artigo, nome do autor, e a chave “VS”.

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"  A Query de pesquisa deve obedecer à estrura: journal_title|year|volume|first_page|author_name|your_key|

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Med J Aust|1970|2|787|Ananthakrishnan|VS

Nome da revista Ano

Vol.

1º pág. do artigo

Autor Chave Your key


"  Como usar?

1.  Preencher o campo “Email”; 2.  Preencher o campo “Citations Strings”

Indian J Cancer|1978|15|55|Advani|VS Cancer|1980|45|2843|Advani|VS Indian Pediatr|1989|26|868|Ali|VS Med J Aust|1970|2|787|Ananthakrishnan|VS

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"  Como usar?

3.  Opção “search”; 4.  Condultar o email e retirar os PMIDs que se encontram

no final dos elementos anteriormente enviados. Indian J Cancer|1978|15|55|Advani|VS|374240 Cancer|1980|45|2843|Advani|VS|7379014 Indian Pediatr|1989|26|868|Ali|VS|2634004 Med J Aust|1970|2|787|Ananthakrishnan|VS|5487232

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PMIDs


"  Como usar?

5.  Copiar os PMIDs para a caixa de pesquisa da PubMed e dar início à pesquisa: 374240, 7379014, 2634004, 5487232

6.  Consultar a lista das referências e os conteúdos a

elas associados (abstract, texto integral, assuntos, etc.).

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"  Como usar?

7.  Uma das vantagens desta ferramenta, reside na localização dos artigos através de listas de referências bibliográficas já existentes, em forma XLS ou DOC. As queries de pesquisa devem obedecer à estrutura anteriormente apresentada;

8.  Mais informação sobre esta ferramenta: "  Web http://med-lib-l.wikispaces.com/Batch+Citation+Matcher+instructions

"  PDF http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/pdf/pubmedhelp.pdf

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PubMed Ferramentas !  Clinical Queries

"  Ferramenta de pesquisa avançada e especializada da PubMed;

"  Desenvolvida principalmente para clínicos,

disponibiliza investigação clínica baseada na evidência.

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"  A pesquisa "  Os resultados da pesquisa através desta ferramenta,

estão limitados a áreas específicas de investigação clínica. Para pesquisas mais abrangentes, deve usar o serviço de pesquisa da PubMed.

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"  A pesquisa "  Ao lançar o(s) termo(s) da pesquisa, os resultados são

apresentados em três colunas, organizados por: "  Clinical Study Category (apresenta referências selecionadas

sobre um determinado estudo clínico, categoria ou âmbito. Com possibilidade de refinamento de resultados);

"  Systematic Reviews Referências de revisão sistemática de literatura, artigos de revisão de ensaios clínicos (clinical trials), conferências, linhas orientadoras (guidelines), etc.);

"  Medical Genetics (referências que dizem respeito à Genética Médica).

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PubMed Ferramentas !  Topic-Specific Queries

"  Diretório com Queries específicas para clínicos e investigadores, áreas, interfaces, coleções de revistas;

"  Após a seleção de uma destas Queries, as pesquisas na PubMed são feitas com esse filtro ativo. Para uma pesquisa geral na PubMed, deverá desativar o filtro/Query selecionado(a) – opção “clear all”.

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PubMed Ferramentas !  PubReader

"  Formato acessível para leitura dos artigos científicos da PubMedCentral, através de dispositivos móveis.

!  PubMed Mobile

"  Versão para dispositivos móveis.

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PubMed Ferramentas !  RSS Feeds

"  Esta tecnologia permite saber se a base de dados tem novos artigos, ou outras publicações sobre o assunto pesquisado, sem ter que voltar a realizar novas pesquisas. A leitura do feed é possível através do browser da Internet ou de um agregador de feeds Google Reader. "  Na janela dos resultados da pesquisa, clicar no icon do

RSS Feed e copiar o endereço do feed para o leitor.

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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

Pesquisar na PubMed


PubMed Antes de começar a pesquisar

!  Desenvolver a estratégia de pesquisa

1.  Identificar os termos/conceitos de pesquisa.

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!  Os termos devem estar em língua inglesa; !  Verifique se estão escritos corretamente;

!  Verifique se existem sinónimos ou palavras relacionadas com o termo a pesquisar;

!  Verifique possíveis variantes linguísticas e siglas;

PubMed !  Desenvolver a estratégia de pesquisa


!  Usar vocabulário controlado sempre que possível "  !"#$%&'()*"+#",-)"'$."+/*0,*1#$+"+&/"+.2+-2)3"/+.2+

$//&,-"+#",-)"'$."/+4!"#$%#&%+5$)$+.2/#)262)+"+#",-27."+.2+$)80"/+23+%$/2/+.2+.$."/9:+2/-2/+-2)3"/+5".23+/2)+.2/*0,$."/+.2+#$%2;$'<"/+.2+$//&,-"+4!'()*+",-*#%.$/!9=+-2)3"/+.2+-2/$&)"/+"&+.2/#)*-")2/>+

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Antes de começar a pesquisar



!  Compreender o vocabulário: o thesaurus MeSH® "  A PubMed usa vocabulário controlado para indexar os seus

artigos, o que significa que existe um conjunto de termos específicos para descrever cada artigo. A utilização deste vocabulário controlado, vai fazer com que as pesquisas efetuadas tragam resultados mais assertivos. O Thesaurus MeSH® - Medical Subject Headings – é a ferramenta que impõe uniformidade e consistência à literatura indexada na PubMed.

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!  Compreender o vocabulário: o thesaurus MeSH® "  Os termos do MeSH® estão ordenados

hierarquicamente e são atualizados anualmente. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

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2.  Refinar a pesquisa por:

"  Tipo de publicação; "  Espécie; "  Resumos ou texto integral dos artigos ; "  Língua da publicação; "  Sexo; "  Idade; "  Data; "  …

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2.  Refinar a pesquisa por:

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Atenção: •  Uma vez aplicados limites a uma pesquisa, se não forem

desativados, permanecem nas pesquisas seguintes; •  Só os limites por data ou língua é que não excluem os artigos in

process; •  A aplicação de filtros dá origem a menos resultados. - Para eliminar os limites - Change ou Remove.

PubMed Pesquisa !  Pesquisa simples

"  Pode simplesmento digitar um termo na caixa de pesquisa, e automaticamente é apresentada uma lista com termos que podem ser selecionados. Para desativar esta funcionalidade, basca clicar em “Turn off”, no final da lista de termos propostos.

"  A PubMed apresenta muitos termos. Para pesquisas mais eficientes, seja o mais específico(a) possível.

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PubMed Pesquisa !  Pesquisa avançada - Search Builder

"  Ferramenta de pesquisa avançada da base de dados. "  Permite pesquisar por campos específicos (autor,

assunto, título de revista, afiliação, etc.). "  Com registo do histórico de pesquisas durante 8 horas.

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PubMed Pesquisa !  Por assunto

"  Ao inserir o assunto a pesquisar, a base assume o operador boleano AND e vai buscar automáticamente os termos controlados do MeSH para esse assunto – automatic term mapping. Os termos são pesquisados no título e resumo (abstract) dos artigos. "  Ex: Ao escrever heart attack a base vai pesquisar os artigos que têm

no título e no resumo heart attack e, também, os artigos com o assunto controlado do MeSH myocardial infarction.

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PubMed Pesquisa !  Por autor

"  Usar primeiro o último nome do autor e só depois as iniciais, sem pontuação entre eles. Quando se pesquisa apenas pelo último nome, sem iniciais, deve-se colocar à frente do nome [au].

"  Ex: Kosbland ME

"  Ex: Kosbland [au]

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PubMed Pesquisa !  Por título de revista

"  Usar o título completo da revista ou a breviatura qualificada com [ta]

"  Ex. Current Biology [ta] "  Caso não saiba o título completo da revista, pesquise no

“Journals in NCBI Databases” – menu “More resources” > literature”.

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PubMed Pesquisa !  Operadores boleanos

"  Os operadores boleanos AND, OR, NOT existem para combinar termos. A última operação deve ser colocada entre (). "  Ex. Common cold AND (vitamin C OR zinc)

"  AND – usado para recuperar um conjunto de referências que contenham todos os termos de pesquisa "  EX. salmonella AND hamburger

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"  OR – usado para recuperar um conjunto de referências que contenham pelo menos um dos termos de pesquisa. Use este operador para agrupar artigos com temáticas similares "  EX. football OR hockey OR soccer

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"  NOT – usado para recuperar um conjunto de referências que contenham o primeiro termo de pesquisa. O termo seguido do operador é automaticamente excluido dos resultado. "  EX. arthritis NOT letter

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Atenção: Os aporadores boleanos devem estar em letra maiúscula.

PubMed Pesquisa !  Truncatura

"  Usar o * para substituir vários caratéres no final da palavra. "  Ex. Bacter* recupera bacteria, bacterium, bacteriophase.

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PubMed Pesquisa !  Artigos relacionados (related citations) – Ao entrar no

registo de um artigo, estão disponíveis outros artigos que citam as mesmas bibliográficas “Related citations in PubMed”;

!  Artigos de revisão – Um artigo de revisão (review article) é uma publicação que descreve, analisa e discute conhecimentos científicos ou tecnológicos já publicados. "  Nos resultados de uma pesquisa são, também,

apresentados os artigos de revisão.

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Ferramentas de apoio


PubMed My NCBI

!  Área pessoal onde podem ser personalizados serviços na PubMed e outras bases de dados da NCBI. "  Após a criação de uma conta pessoal, é possível:

"  Salvar pesquisas, coleções de referências e bibliografias por autor;

"  Partilhar coleções bibliográficas com outros utilizadores; "  Enviar por e-mail atualizações de pesquisas; "  Selecionar e criar filtros para as pesquisas.

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PubMed My NCBI

!  Salvar pesquisas – Opção “Save search” disponível na janela de resultados após a pesquisa. "  Esta pesquisa pode ser parametrizada segundo a

atualização de novos resultados, formato dos artigos, número de items.

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PubMed My NCBI

!  Criar filtros – Criar e aplicar filtros nas pesquisas, por áreas de interesse (15 no máximo) "  Manage Filters – Aplicar filtros pré-definidos ou

personalizados.

!  Atividade recente – Grava o percurso feito pelo utilizador nas bases de dados da NCBI, durante 6 meses.

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PubMed My NCBI

!  Personalizar o My NCBI – Na opção “Customize homepage” e “NCBI Site Preferences”, o utilizador pode personalizar o espaço pessoal "  Alterar password’s e e-mail’s; "  Partilhar pastas; "  Criar as janelas dos filtros, pesquisas, coleções,

bibliografias, etc.

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PubMed EndNote !  A PubMed permite a exportação de referências

bibliográficas para o EndNote 1.  Após a pesquisa, na janela de resultados, selecionar as

referências a exportar; 2.  Na opção “send to:”, localizada no topo dos resultados,

selecionar a opção “File” > “Medline” > “Recently Added” > “Create File”;

3.  Guardar o ficheiro localmente;

4.  Abri-lo com o EndNote e selecionar a opção de filtro “PubMed (NLM).

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http://search.epnet.com/ (EBSCO)

A MEDLINE With Full Text 1


MEDLINE With Full Text Sobre !  Base de dados bibliográfica especializada em

informação médica; !  Acesso limitado ao domínio ua.pt; !  Acesso exclusivo ao texto integral de 1470

revistas

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MEDLINE With Full Text Conteúdos !  Áreas indexadas: medicina, enfermagem,

medicina veterinária, medicina dentária, cuidados de saúde, ciências pré-clínicas.

!  Acesso a mais de 1450 revistas em texto integral;

!  Recupera informação a partir de 1949. Texto integral só a partir de 1965;

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MEDLINE With Full Text

Conteúdos !  Todos os artigos incluidos estão indexados com os termos controlados do MeSH;

!  Não faz ligação ao texto integral de revistas do consórcio b-on ou subscritas individualmente pela UA;

!  Interface de pesquisa em várias línguas.

4



Serviços !  Assente na plataforma de pesquisa EBSCO; !  Pesquisa simples e avançada; !  Possibilidade de pesquisa integrada com outras

bases de dados subscritas pela UA, disponíveis na mesma plataforma;

!  Ligação com o catálogo A to Z das bibliotecas da UA;

!  Possibilidade de pesquisa dentro de uma revista específica;

!  Espaço pessoal;

5



!  Assente na plataforma de pesquisa EBSCO; !  Possibilidade de adição de notas aos registos (com

espaço pessoal); !  Link permanente dos registos; !  Filtros (texto integral, tipologia, data, etc.); !  Exportação de referências para o EndNote; !  Subscrição de RSS Feeds; !  Uso dos operadores boleanos na pesquisa – and, or,

not, “ “;

Serviços 6


Mais informação… 57


!  http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/

!  http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html

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Tutoriais

PubMed

!  http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/glossary.html

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Glossário

PubMed

Outras fontes !  Artigos científicos, papers de conferências, teses e relatórios,

também podem ser pesquisados em: "  Repositórios de documentos digitais – RIA, RCAAP, DRIVER "  Sistemas agregadores – b-on, Sciverse Hub "  Bases de dados de artigos científicos – SCOPUS (indexa na totalidade as

referências da Medline) "  Motores de pesquisa Web – Google Scholar

!  Mais informação na página Web:+<?5@AABBB>&$>5-A/%*.3A%*%'*"-2#$A$)80"/++

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BIBLIOTECAS DA UNIVERSIDADE DE AVEIRO 2012 HTTP://WWW.UA.PT/SBIDM/BIBLIOTECA

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PubMed: informação em ciências da saúde