SNOMED CT Padrão Terminológico e Ontológico Internacional

Stefan SchulzInstitute of Medical Informatics, Statistics and Documentation

(Medical University of Graz - Austria)

SNOMED CT

Standardized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms: Sistema de codificação para todo o conteúdo do prontuário eletrônico

Padrão terminológico global

Manutenção / desenvolvimento: IHTSDO (International Health

Terminology Standards Development Organisation):

Membros: Austrália, Canadá, Chipre, Dinamarca, Estônia, Islândia,

Israel, Lituânia, Malta, Nova Zelândia, Polônia, Cingapura, República

Eslovaca, Eslovenia, Espanha, Suécia, Holanda, Reino Unido, Estados

Unidos

SNOMED: Descenvolvimento

SNOP SNOMED SNOMED II SNOMED 3.0 SNOMED 3.5 SNOMED RT SNOMED CT

1965 1970 1975 1980 1985 1990 1995 2000 2005

Nomenclatura Patologia

Nomenclatura multiaxial para toda

a medicina

Descriçõeslógicas

Fusão com CTV3

(Reino Unido)

Princípios ontológicos

Context Model

IHTSDO

SNOMED em UMLS

SNOMED CT:

SNOMED CT como vocabulário controlado

SNOMED CT como sistema formal

SNOMED CT como ontologia

SNOMED CT como vocabulário controlado

SNOMED CT como vocabulário controlado

Termos médicos (inclusive sinônimos

e traduções) são conectados com

conceitos (portadores de significado)

z.Zt.311 000

conceitos

z.Zt. 732 000

termos em Inglês

Déficit de versões anteriores da SNOMED

D5-46210 Acute appendicitis, NOS

D5-46100 Appendicitis, NOSG-A231 Acute

M-41000 Acute inflammation, NOSG-C006 InT-59200 Appendix, NOS

G-A231 AcuteM-40000 InflammationG-C006 InT-59200 Appendix, NOS

SNOMED INTERNATIONAL

SNOMED CT como sistema formal

SNOMED CT como sistema formal

taxonomias:especialização

(is-a)

SNOMED CT como sistema formal

Restrições: lógica de descriçãoC1 – Rel – C2 significa:x: instanceOf(x, C1) y: instanceOf(C2) Rel(x,y)ouC1 ⊑ Rel.C2

Relações (Attributos): Associated morphologyFinding site (50 tipos)

Lógica descritiva

SNOMED CT como sistema formal

definierte vs. primitive Konzepte

conceitos definidos conceitos primitivos ⊑

SNOMED CT como Ontologia

SNOMED CT como Ontologia

Ordem de um domínio de acordo com propriedades genéricas e invariáveis

Ontologia: categorias disjuntas com critérios estritos(process, object, substance, quality)

Número restrito de relações (z.B. part-of, has-location, …) „Ontological commitment“: quais são as instâncias?

objetos no mundo (“minha dor de estômago”) objetos de documentação (o que está documentado sobre minha

dor de cabeza conhecimento (o que o médico atualmente sabe sobre

minha dor de cabeça)

Social context (10)CommunityFamilyGroup

(…)Special concept

Namespace conceptNavigational conceptNon-current concept

Specimen (45)Biopsy sampleBody substance sampleCardiovascular sample(…)

Staging and scales (6)Assessment scalesEndometriosis

classificationof American Fertility

Society(…)

Substance (11)Allergen classBiological substanceBody substance (…)

Body structure (10)Acquired body structureAnatomical organizational pattern(…)

Clinical finding (22)Administrative statusesAdverse incident outcome categories

(…)Environment or geographical location

EnvironmentGeogr. and/or political region of the

worldEvent (19)

AbuseAccidental eventBioterrorism related event (…)

Linkage conceptAttributeLink assertion

Observable entityAge AND/OR growth periodBody product observable (…)

Clin. history / examination observable (21)Device observableDrug therapy observableFeature of Entity (…)

Organism (11)AnimalChromistaInfectious agent (…)

Pharmaceutical / biologic product (58)

Alcohol productsAlopecia preparationAlternative medicines

(…)Physical force (21)

AltitudeElectricity

(…)Physical object (8)

DeviceDomestic, office and

garden artefactFastening

(…)Procedure (23)

Administrative procedureCommunity health

procedure(…)

Qualifier value (52)ActionAdditional dosage

instructions(…)

Record artifactRecord organizerRecord type

Situation with explicit context (17)A/N risk factorsCritical incident factors

(…)

SNOMED CT Top

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

SNOMED CT : Hierarquias taxonômicas

Disorder of appendix (disorder)Disorder of digestive system (disorder)Disease (disorder)Appendicitis (disorder)Disorder of digestive organ (disorder)Disorder of lower gastrointestinal tract (disorder)Disorder of digestive tract (disorder)Disorder of intestine (disorder)Finding by site (finding)Finding of large intestine (finding)Disorder of abdomen (disorder)Disorder of gastrointestinal tract (disorder)General finding of abdomen (finding)Disorder of large intestine (disorder)Disorder by body site (disorder)Disorder of trunk (disorder)Inflammatory disorder (disorder)Acute inflammatory disease (disorder)

Inflammatory disorder of digestive tract (disorder)SNOMED CT Concept (SNOMED RT+CTV3)Abdominal organ finding (finding)Bowel finding (finding)Finding of appendix (finding)Finding of body region (finding)Inflammation of large intestine (disorder)Finding of trunk structure (finding)Disorder of body system (disorder)Inflammation of specific body organs (disorder)Inflammation of specific body structures or tissue (disorder)Inflammation of specific body systems (disorder)Inflammatory disorder of digestive system (disorder)Digestive system finding (finding)Gastrointestinal tract finding (finding)Disorder of body cavity (disorder)Clinical finding (finding)Viscus structure finding (finding)

Root Concept: Acute appendicitis (disorder)The following 36 "Is a" antecedents are present in the SNOMED hierarchy:

Pre- e Póscoordinação

SNOMED CT proporciona síntaxe composicional para gerar expressões complexas

413350009 | finding with explicit context | : { 246090004 | associated finding | = ( 284196006 | burn of skin | : 246112005 | severity | = 24484000 | severe | , 363698007 | finding site | = 321472003 | structure of dermatoglyphic patterns of palm |) , 408729009 | finding context | = 410515003 | known present | , 408731000 | temporal context | = 410512000 | current or specified | , 408732007 | subject relationship context | = 410604004 | subject of record | }

O que SNOMED não é

Um modelo de informação (que especifica o tipo de dados a ser coletados) para um determinado conceito clinico

Uma base de conhecimento a ser consumida por sistemas de apóio a decisão

Necessariamente um sistema de codificação para uso médico

Futuro de SNOMED CT

SNOMED CT usado como base ontológica para CID-11 (a partir de 2015)

Ampliação do grupo de paises-membros (Brasil ? China?, Alemanha? França...?)

Projetos de mapeamento (ICD-0, ICF, ICPC...)

Casos de uso conexão com modelos de informação (HL7-CDA, openEHR,

EN13606)

codificação automatizada utilizando PLN

Recursos

Home Page IHTSDO: www.ihtsdo.org

IHTSDO em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/IHTSDO

SNOMED CT em Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/SNOMED_CT

Cliniclue navegador livre: http://www.cliniclue.com/

VetMed navegador web: http://viw2.vetmed.vt.edu/sct/menu.cfm

Outros navegadores: http://www.nlm.nih.gov/research/umls/Snomed/snomed_browsers.html

SNOMED e Modelos de Informação: SemanticHealthNet: http://www.semantichealthnet.eu/

SNOMED via UMLS: https://uts.nlm.nih.gov/home.html

Mais perguntas?Contato: Stefan Schulz: stefan.schulz@medunigraz.at