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Maciez da Carne em Nelore: Uma Realidade Brasileira Cláudio Ulhôa Magnabosco Pesquisador EMBRAPA/ANCP/CNPq Ribeirão Preto – SP 2016

Seminário ANCP 2016 – Cláudio Magnabosco – Maciez da Carne em Nelore: Uma Realidade Brasileira

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Maciez da Carne em Nelore: Uma Realidade Brasileira

Cláudio Ulhôa MagnaboscoPesquisador EMBRAPA/ANCP/CNPq

Ribeirão Preto – SP2016

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TópicosIntrodução Estado da ArteQualidade da Carne do NeloreIniciativas BrasileirasObjetivosMateriais e MétodosResultados

• Descritivas Gerais• Correlações Genéticas• GWAS e Seleção Genômica

Perspectivas FuturasConsiderações Finais

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• 2° Maior produtor de carne bovina • Maior rebanho comercial de bovinos (208 milhões de cabeças – FAZ/USDA, 2015)

•Rússia•Egito•Venezuela•Hong Kong

•Estados Unidos•Reino Unido•Itália

80,9% Mercado Interno

19,6% Exportação76,6%

carne in natura 12,7% carne processada

BRASIL

Introdução

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> Exportador em Volume $ EUA e Austrália

Carne Brasileira : Considerada Média / Baixa - QUALIDADE

Principal Fator da Depreciação da Carne Brasileira pelos

Compradores Internacionais

FALTA DE MACIEZ

Introdução

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• Rebanho bovino: raças de origem zebuína

80% raça Nelore

RusticidadeTardiaCarne qualidade inferior

• Produção extensiva a pasto

Introdução

Animais velhos, com aspectos qualitativos e quantitativos

indesejáveis - Maciez

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• Literatura: O Nelore pode apresentar carne macia e tem variabilidade genética, ex:

• Existência de animais capazes de produzir carne de alto padrão de qualidade – Touros que tiveram 40% das progênies classificadas como Choice

– Quality Grade (Sainz et al., 2005)

• Bovinos Nelore Mocho selecionados para maciez da carne apresentaram WBSF por volta de 3,0 kgf

– Castro et al., 2014

Estado da Arte

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Estado da Arte

• Principais importações do Nelore ocorreram em 1962

• Formação das linhagens atuais da raça Nelore

• Adaptabilidade da raça proporcionou uma rápidadisseminação no território brasileiro– Adaptação– Rusticidade– Fertilidade

A raça Nelore

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Estado da Arte

• 1957 Nelore Mocho – Nasceu o bezerro Caburey OB, desprovido de chifres.

• Ausência de chifres:– facilidade de manejo;– evita machucaduras;– Evita acidentes e danos no couro.

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Qualidade da Carne do Nelore

POR QUE???

O Brasil é o maior exportador de carne bovina do mundo!!!

Produz carne de qualidade inferior!!!

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Qualidade da Carne do Nelore

Criação de bovinos à pasto

Gramíneas de baixa qualidade

Permanência por mais tempo a pasto

Abate em idades avançadas

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Alterações composição

muscularCARNE DE

QUALIDADE INFERIOR

Qualidade da Carne do Nelore

Calpastatina

Colágeno

Tipo de fibra

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Característica organoléptica de maior influência na aceitação da carne pelo consumidor

Qualidade da Carne do Nelore

MACIEZ DA CARNE

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Qualidade da Carne do NeloreCaracterística multifuncional

Idade Genética Alimentação

MACIEZ DA CARNE

sexoVelocidade de resfriamento

MaturaçãoManejo pré

abate

Alta Influência Ambiental

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O QUE FAZER? Ferramentas promissoras:

Biotecnicas Moleculares

- Marcadores moleculares SNP (alta densidade) Estudos de associação genômica ampla (GWAS) Seleção genômica ampla (GWS)

Vantagens aumenta a eficiência de seleção genética diminui o tempo gasto no desenvolvimento de linhagens para carne macia maior acurácia de predição do valor genético

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Com a genotipagem o painel de SNPs pode ser utilizados para várias características!

Qualquer característica de interesse econômico com baixa estimativa de herdabilidade de efeito genético aditivo direto

O QUE FAZER?

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Estudos de Associação Genômica - GWAS

Identificação de genes associados à maciez de carne especificamente para as

raças zebuínas

• Associação de genes com características complexas• Possível após Sequenciamento do Genoma Bovino (The Bovine Hapmap Consortium, 2009)

• Identificação das regiões cromossômicas que afetam tais características fenotípicas

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• Análise de enriquecimento de vias baseada em SNPs - Ontologias Gênicas

– objetivo expandir interpretação GWAS (Mapeamento associativo)

SNPs de um fenótipo são enriquecidos em genes que constituem uma via ou têm regulação em comum, o

que permite um melhor entendimento dos mecanismos biológicos envolvidos

poder do mapeamento associativo

identificação marcadores de efeito pequeno

(Subramanian et al., 2005; Weng et al. 2011)

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Seleção Genômica – GS

Baseada no valor genético genômico de

cada animal

Obtido partir da soma dos efeitos estimados de marcadores genéticos

Permite a estimação de valores de características

de interesse logo ao nascimento

acelerando o progresso genético de características que se expressam tardiamente na vida do animal

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Pedigree +

Dados Produtivos +

Dados Genômicos

Estimação dos efeitos dos

SNPs

Valor Genômico (GEBV)

Valores genômicos para animais SEM dados

produtivos!

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Iniciativas Brasileiras• Marca OB / Guaporé Pecuária – desenvolve trabalhos de seleção do Nelore

Mocho há mais de 60 anos

• 2002: OB - Choice: Estudo de Linhagens da raça Nelore Mocho

Crescimento pré e pós desmama, Precocidade de acabamento, Qualidade de carcaça e da carne

• Sainz et al. (2005) identificaram touros cujos filhos produziram carne com os melhores padrões de qualidade.

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Projeto OB-Choice - Variação entre touros na maciez da carne da progênie

Pai WBSF, kg %< 3,91 4.24 71%2 3.72 25%3 3.83 37%4 4.96 71%5 4.23 42%6 4.00 42%7 4.20 53%8 3.80 33%9 4.52 56%

10 3.92 45%11 4.22 53%12 4.26 75%13 4.44 73%14 3.36 25% (Sainz et al., 2005)

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Iniciativas Brasileiras• Macroprograma 2 Embrapa – “Caracterização e seleção genética para maciez da

carne em bovinos Nelore Mocho” coordenado pela Embrapa Cerrados

• 2009: MP2: caracterizar, multiplicar e selecionar bovinos Nelore Mocho de elevado potencial genético para a característica de maciez

• Castro et al. (2014) identificaram indivíduos portadores de genes favoráveis a maciez da carne e, observou a alta variação dos valores de WBSF dentro da população em estudo• Média: 3,97 kgf (máximo: 8,84 kgf e mínimo: 1,53 kgf)• Verificou ausência de correlação genética: maciez x carcaça e crescimento

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Iniciativas Brasileiras

• Programa de Qualidade Nelore Natural: garantir o padrão de carcaças bovinas, sistemas de cria, sistemas de engorda e reprodutores da raça Nelore

• Bases lançadas em 1999 – Carlos Viacava• Orientações do Prof. Dr. Pedro Felício - Unicamp

• Objetivo: Oferecer ao mercado um produto diferenciado por sua padronização e qualidade controlada.

• Valorização e divulgação da raça Nelore como principal marca de carne no Brasil.

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Iniciativas Brasileiras

• Rymer Tullio (Embrapa Pecuária Sudeste): Estratégia de cruzamento e de manejo para melhorar a eficiência de produção e a qualidade da carne bovina no Brasil

• Sarah Bonilha (Instituto de Zootecnia): Eficiência na utilização de alimentos, qualidade de carne e composição da carcaça em animais jovens da raça Nelore

• Lucia Galvão (Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho): Estudo genético quantitativo da qualidade de carcaça e da carne em bovinos da raça Nelore

• Luciana Regitano (Embrapa Pecuária Sudeste): Bases moleculares da qualidade da carne em bovinos da raça Nelore

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Objetivo

“Caracterização e seleção genética para maciez da carne em bovinos Nelore Mocho” (2009)

Apresentar os resultados do Projeto de MacroPrograma 2 (MP2) da Embrapa Cerrados:

Interagindo no sentido de atingir os objetivos específicos do projeto estratégico para a cadeia

produtiva de carne no Brasil

Equipe multidisciplinar e interinstitucional

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Equipes ExecutorasProjeto executado graças a contribuição inequívoca de:

• Quatro unidades da Embrapa (CPAC, CNPAF, CPPSE e CNPGC),

• Duas Universidades Federais (UFG e UFU),

• Duas Universidades Estaduais (USP e UNESP),

• Uma empresa privada (Guaporé Pecuária – Marca OB),

• Duas Universidade americanas (University of Wisconsin/Madison e University of California/Davis)

• Uma Associação: Associação Nacional de Criadores e Pesquisadores (ANCP)

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Equipes Executorase sob envolvimento dos profissionais de varias subareas:

Embrapa• Artur Rosa (CPAC)• Cláudio Magnabosco (CPAC)• Eduardo Eifert (CPAC)• Luciana Regitano (CPPSE)• Marcos Fernando Costa (CNPAF)• Renata Nassu (CPPSE)• Rodrigo Fragoso (CPAC)• Rymer Tullio (CPPSE)

Guaporé Pecuária• Ovídio Carlos Brito • Fernando Manicardi• Angelo Nakagawa

UNESP

• Fernando Baldi (UNESP)

University of California

• Roberto D. Sainz (UCDavis)

University of Wisconsin

• Guilherme Rosa (UW-Madison)• Fernando B. Lopes (UW-Madison)

ANCP

• Raysildo Lôbo (ANCP)

UFG• Cristiano Prado (UFG)• Letícia M. de Castro (UFG)• Mariana Mamede (UFG)

UFU

• Carina U. Faria (UFU)

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Objetivos Específicos

• Análise genética para maciez de carne e suas relações com as características produtivas em bovinos Nelore Mocho

• Genética quantitativa• Mamede et al. (2016) – in press

• Identificação de SNPs e rotas metabólicas associadas à maciez da carne em bovinos Nelore Mocho

• GWAS e Ontologias Gênicas• Castro et al. (2016) – in press

• Utilização de Diferentes Modelos de Regressão para Seleção Genômica para Maciez da Carne em Bovinos Nelore Mocho, Brasil

• Seleção genômica para maciez da carne• Lopes (2015) e Magnabosco et al. (2016) – in press

Apresentar os resultados de três sub-projetos do MP2, nessa apresentação:

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• Histórico base de dados- banco de dados fenotípico: três abates (2005, 2008 e 2012) - Maciez WBSF (Warner-Bratzler shear force),- raça Nelore Mocho, PO, genealogia completa

• Programa OBchoice (Estudos de linhagens/qualidade de carne e carcaça)- Abate 1 (232 Fenótipos WBSF)- Abate 2 (145 Fenótipos WBSF)

• Macroprograma 2 - Embrapa Cerrados (Base população OBChoice)- Abate 3 (83 Fenótipos WBSF)- população desenhada a partir de fenótipos extremos para maciez da carne

Materiais e Métodos

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Materiais e Métodos

•Fenotipagem para maciez – força de cisalhamento (460 animais)

•Análises quantitativas (Toda a população: 460 animais – Abates 1, 2 e 3)

•Genotipagem (427 animais)

•Controle de Qualidade (amostras e marcadores moleculares)

•Análises Genômicas (GWAS, GO, GS)

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Materiais e Métodos• Três abates (2005, 2008 e 2012) em frigorífico comercial

• Terminação em regime de confinamento

• Os animais abatidos quando atingiam, no mínino, 5 mm de espessura de gordura na costela e/ou peso acima de 500 kg

Idade média de 24 meses

Idade e Acabamento Grande influência na maciez

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Materiais e Métodos• Utilizadas amostras do músculo Longissimus dorsi para medição da maciez da

carne por Warner-Bratzler Shear Force

Laboratório de Análises de Carne - Embrapa Pecuária Sudeste

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Materiais e MétodosAs análises genético-quantitativas bi-características

• Características Produtivas (P120, P210, P365, P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF)

e+pZ+mZ+aZXβ=y 321

- y: vetor de observações de cada uma das variáveis

- X, Z1, Z2 e Z3: matrizes de incidência que associam y aos efeitos fixos, efeitos genéticos aditivos diretos e, exceto para

P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF, os efeitos genéticos maternos e efeitos de ambiente permanente, respectivamente,

- β: vetor dos efeitos fixos (grupo de contemporâneos e idade da vaca ao parto (exceto para P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF),

e a idade do animal (somente para as características de carcaça) como covariável),

- a: vetor de efeitos genéticos aditivos diretos aleatórios,

- m: vetor de efeitos genéticos aditivos maternos aleatórios,

- p: vetor de efeitos de ambiente permanente maternal aleatórios,

- e é o vetor dos efeitos aleatórios residuais.

(Mamede et al., 2016 – in press)

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Materiais e Métodos• Características Reprodutivas (PE365, PE450, P365, P450, EG EGP8, IPP, PAC e STAY)

e+ZaXβ=y

- y: vetor de observações de cada uma das variáveis;

- X: matriz de incidência que associa β com y,

- β: vetor dos efeitos fixos (grupo de contemporâneos para todas as características e idade da vaca ao parto

somente para P365 e P450),

- Z: matriz de incidência dos efeitos genéticos aditivos diretos,

- a: vetor de efeitos genéticos aditivos diretos aleatórios,

- e: vetor dos efeitos aleatórios residuais.

- Características da carcaça: idade do animal como covariavel

- Covariâncias residuais entre WBSF e as características: PAC, IPP e STAY*, foram fixadas em zero

(Mamede et al., 2016 – in press)

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Materiais e Métodos

- GIBBS2F90

- 1.000.000 iterações, descarte das 500.000 primeiras, intervalo amostral a cada 50

- Estimativas a posteriori: POSTGIBBSF90

- As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas como a média a posteriori dos respectivos

componentes de variância.

- Os intervalos de credibilidade das marginais posteriores foram obtidos com 95% de credibilidade.

As análises genético-quantitativas bi-características

• Características Produtivas (P120, P210, P365, P450, AOL, EG, EGP8 e WBSF)

• Características Reprodutivas (PE365, PE450, P365, P450, EG EGP8, IPP, PAC e STAY)

(Mamede et al., 2016 – in press)

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Genotipagem: 427 produtos (+ pais e mães)

- BovineHD Beadchip (777k SNPs) (Illumina Inc.)

- Chips GGP-Indicus (77k SNPs) (GeneSeek – Neogen Corp.)

IMPUTAÇÃO DE GENÓTIPOS

Controle de Qualidade – Amostras DNA e Marcadores SNP

Call Rate (eficiência genotipagem): marcadores (90%) e amostras (80%)

Heterozigosidade média (± 3σ)

Desvios das proporções do equilíbrio de Hardy-Weinberg: p < 0,01

Frequência alélica mínima: MAF < 0,01

Verificação estratificação populacional

Materiais e Métodos

(Castro et. al, 2016 – in press)

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Estudos de Associação Genômica Ampla (GWAS)

- Método P3D/EMMAx (Zhang et al., 2010; Kang et al., 2008)- Implementado: TASSEL 5.0 (Bradbury et al. 2007) - Modelo misto:

Materiais e Métodos

eZuXy - y : vetor de fenótipos para WBSF (n x 1)- X: matriz de incidência que relaciona β a y- β: vetor de efeitos fixos (sexo, grupo de abate e os marcadores SNP)- Z: matriz incidência dos efeitos aleatórios que associa u com y- u: efeito aleatório (n x 1) do modelo misto- e: vetor (n x 1) de resíduos

u ~N(0, K) e e ~N(0, I)

Assume-se que:

- K: matriz (n x n) de parentesco genômica derivada dos marcadores

- : variância genética aditiva

- é a variância residual e I a matriz identidade (n x n) apropriada

(Castro et. al, 2016 – in press)

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Materiais e Métodos

Localizado na sequência genômica do gene

Localizado em 20 kbp - 5’ e 3’ finais (primeiro e último éxon)

capturar regiões reguladoras e funcionais próximas aos genes

Gene Ontology Consortium (GO)

InterPro (IP)

Enciclopédia de genes e genomas de Kyoto (KEGG)

(Ashburner et al., 2000)

(Mulder et al., 2003)

(Kanehisa et al. 2002)

• SNP atribuído ao gene se:

• Gene significamente associado com WBSF: se pelos menos um SNP p-valor < 0,01

• Bancos de dados - definir conjuntos de genes funcionais associados à característica

Materiais e MétodosAnálise de enriquecimento de vias metabólicas – Ontologias gênicas

- SNP-based gene-set enrichment analysis (SNP-GSEA)

(Castro et. al, 2016 – in press)

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Seleção Genômica (GS)

Modelos de predição genômica:

Bayesian Ridge Regression

Bayesian Lasso

Bayes A / Bayes B / Bayes Cπ

Modelo estatístico geral:

K

1jjj eazXb1μy

y : vetor n × 1 de características fenotípicas;µ é o intercepto;X: matriz de incidência relacionada aos efeitos fixos em b;K: número de marcadores ajustados; : vetor n × 1 que denota os genótipos dos animais para o marcador j; : efeito do marcador j; e: vetor dos efeitos residuais

Validação cruzada

- Leave-One-Out (LOOCV)- comparar habilidade predição de diferentes

modelos- acurácia de predição: correlação entre valores

genômicos e fenotípicos

Materiais e Métodos

Melhor adequação aos dados > Acc no GEBVs

(Lopes, 2015)

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ResultadosFenotipagem maciez – toda a população (Abates 1, 2 e 3)

TABELA 1 - Estatística descritiva da característica de força de cisalhamento (WBSF – Warner-Bratzler shear) do Longissimus dorsi em bovinos da raça Nelore Mocho

Característica N Média (kgf) DP (kgf) CV (%) Valor Mínimo

Valor Máximo

WBSF (kgf) 460 3,88 1,35 34,82 1,07 8,87

N: nº de animais, DP: desvio padrão, CV: coeficiente de variação,

coeficiente de variação (34,82%) relativamente alto

população experimentalmente delineada de forma a manter certo

grau de heterogeneidade

(Magnabosco et al., 2014)

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ResultadosFigura 1. Histograma de frequência relativa e percentual acumulativo para WBSF.

limite proposto literatura carne macia: Shackelford et al. (1991) 4,6 kgf; Mackeith et al. (1985) 4,5 kgf; Felicio

(1997) 5 kgf, Boleman et al. (1997) 3,5 kgf

51% - WBSF abaixo de 3,80 kgf: maior parte com WBSF bem próximos aos menores valores limiar

para maciez

(Magnabosco et al., 2014)

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Resultados

Características Média Moda Mediana DP IC 2,5% IC 97,5% Genética

P120 x WBSF -0,70 -0,86 -0,80 0,26 -0,95 0,09P210 x WBSF -0,78 -0,96 -0,90 0,23 -0,98 -0,22P365 x WBSF -0,44 -0,70 -0,58 0,43 -0,96 0,55P450 x WBSF -0,22 -0,35 -0,26 0,34 -0,80 0,50AOL x WBSF -0,09 -0,14 -0,10 0,45 -0,94 0,95EG x WBSF -0,12 -0,19 -0,12 0,39 -0,81 0,63

EGP8 x WBSF -0,10 -0,12 -0,11 0,30 -0,68 0,46 Residual

P120 x WBSF -0,12 -0,15 -0,13 0,11 -0,33 0,09P210 x WBSF -0,12 -0,14 -0,13 0,13 -0,33 0,16P365 x WBSF 0,10 0,04 0,05 0,30 -0,32 0,97P450 x WBSF -0,09 -0,05 -0,08 0,15 -0,40 0,18AOL x WBSF -0,06 -0,09 -0,06 0,11 -0,27 0,17EG x WBSF -0,01 0,00 -0,01 0,05 -0,11 0,09

EGP8 x WBSF -0,02 -0,02 -0,02 0,08 -0,16 0,14

Tabela 2. Estimativas de médias posteriores das correlações genéticas e residuais entre as características de crescimento, carcaça e maciez da carne em bovinos Nelore Mocho, machos e fêmeas.

Análises Genético-Quantitativa – toda a população (Abates 1, 2 e 3)

(Mamede et al., 2016 – in press)

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ResultadosAnálises de Associação Ampla do Genoma - GWAS

Quantil – Quantil (Q-Q plot) - ajuste do modelo e associações verdadeiras - valores observados distanciam dos esperados com o aumento do nível de significância - desvio generalizado - inflação do teste

FIGURA 2 - Gráfico quantil-quantil (Q-Q plot), da distribuição dos valores observados e esperados para o estudo de associação genômica para maciez da carne em bovinos Nelore Mocho

Modelo ajustado aos dados:valores observados encontram-se próximos a diagonal, distribuídos de modo uniforme

Evidências de associações verdadeiras: valores observados distanciaram-se da distribuição esperada sob a hipótese

nula

(Castro et. al, 2016 – in press)

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 Cromossomos SNPs Significatovos(p < 0,0001)

2 13 36 17 18 3

10 213 215 116 317 418 319 220 521 525 327 528 2

Tabela 4 - Número de SNPs significativos (p < 0,0001) por cromossomo para a maciez da carne em bovinos da raça Nelore Mocho > nº SNPs associados:

cromossomos 20, 21 e 27

p < 0,0001 46 SNPs Significativos

Explicaram entre 4,15% até 6,64% da variância fenotípica

Não existe um gene de efeito maior por trás da maciez da carne

Vários genes em diferentes loci dentro do genoma de efeito

pequeno

Características Quantitativas Complexas

(Castro et. al, 2016 – in press)

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ResultadosEnriquecimento de vias metabólicas baseada em SNPs - – Ontologias gênicas

Geradas listas: 22.365 genes (completa e sem repetição)

1.010 genes significativos

Identificados: 22 termos GO (vias) e 2 temas InterPro (vias)

Com genes significativamente associados à maciez da carne

(Castro et. al, 2016 – in press)

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ResultadosTermos GO (vias gene ontology) significativos com genes associados à maciez, destaque para:-Atividade da proteína tirosina-quinase (GO:0004713)-Atividade da proteína serina/treonina quinase (GO:0004674)- Cascata MAPK (GO:0000165)

Ligadas ao crescimento celular

Auxilia na ligação dos fatores de crescimento com seu receptor específico na parede celular

Crescimento Muscular (relacionado a fatores de crescimento) vs. Qualidade da carne – Divergências:

Koohmaraie et al., 2002 – Crescimento Muscular: não causa efeito no processo de maciez

Duclus et al., 2007 - estudo diferentes taxas de crescimento (altas e baixas) evidências de relação da velocidade do desenvolvimento muscular e a maciez

(Silva et al., 2009)

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Resultados- Ligante ao íon cálcio (GO:0005509)

Cálcio – grande papel no Sistema Calpaína-Calpastatina

Sistema de maior importância na maciez da carne relacionado degradação das proteínas

miofibrilares

- Processo metabólico lipídico celular (GO:0044255)

Síntese de ácidos graxosconversão do acetil-CoA em malonil-CoA pela atividade

da acetil-CoA carboxilase

enzima está fortemente correlacionada deposição de

gordura nos animais

• Deposição Gordura na Carcaça - Evita encurtamento pelo frio (Cold-Shortening)• Marmoreio – Presença de gordura entre as fibras• Deposição de gordura no tecido muscular – quebra feixes de colágeno do perimísio

(maciez da carne) (Webb e O’Neil, 2008; Wood et al., 2008; Rosato et al., 2010)

(Koohmaraie, 1994; Alves e Mancio, 2007; Geesink et al., 2006; Andrighetto et al., 2006)

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ResultadosssGWAS – single-step genomic BLUP

(Peripoli et al., 2016 – in press)

• GWAS: genótipo pais e avós, mesmo sem fenótipo (matriz H)

• Variância calculada a cada janela de 1 Mb

• Resultado: 19 janelas explicaram mais de 1% da variância

• Dentre janelas, genes relacionados à:

• Gene CAST (Calpastatina) encontrado próximo à região de maior variância genética para maciez da carne

• Receptores lipídicos intracelulares e Proteínas ligante ao ácido graxo - OSBPL1A (BTA24) and FABP7 (BTA9)• Regulação crescimento do filamento da actina - CAPZA1 (BTA3)• Marmoreio - TAGLN2 (BTA3)• Ligante ao íon cálcio e fosfolipídio cálcio-dependente - MCTP1 (BTA7)• Codificação da Miosina III - MYO3B (BTA2)

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Resultados

Encontrado Genes e SNPs em comum:

- GWAS emmax + genes das vias ontológicas + ssGWAS

Consistência – qualidade fenótipo e genótipo

Análise de Expressão Gênica

Em andamento na Embrapa

Cerrados

(Fragoso, 2016)

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Resultados

Figura 4. Estimativa de correlação entre a maciez da carne e o valor genético molecular predito pelos modelos Bayes RR, Bayes LASSO, Bayes A, Bayes B e Bayes Cπ utilizando marcadores amostrados pelo GWAS (p-valor)

todos os modelos apresentarem uma estimativa de correlação positiva

Bayes Bmelhor ajuste do modelo

(Magnabosco et al, 2016 – in press)

GS – Seleção Genômica

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Resultados

• GEBVs de 632 animais

- produtos MP2, - pais, mães, avós- Touros consagrados de Centrais- Touros participantes do Nelore Brasil

2.86

3.08

3.30

3.53

3.75

3.97

4.20

4.42

4.64

4.87

5.09

5.31

5.53

0.00

10.00

20.00

30.00

40.00

50.00

60.00

70.00

80.00

90.00

100.00

0.00

0.10

0.20

0.30

0.40

0.50

0.60

0.70

0.80

0.90

1.00

Freqüência % cumulativo

GEBV, WBSF

Freq

üênc

ia

% C

umul

ativ

o

Figura 5. Histograma da frequência relativa e percentagem cumulativa dos valores genômicos (GEBV) para a maciez da carne (WBSF) de bovinos Nelore mocho

(Magnabosco et al, 2016 – in press)

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Publicações

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ASAS 2013, Indianapolis-USA

J. Anim. Sci. Vol. 91, E-Suppl. 2/J. Dairy Sci. Vol. 96, E-Suppl. 1

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WCGALP 2014, Vancouver-Canada

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J. Anim. Sci. Vol. 93, Suppl. s3/J. Dairy Sci. Vol. 98, Suppl. 2

ASAS 2015, Orlando-USA

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Aceito para publicação

Journal of animal Science - 2016

J. Anim. Sci Accepted Paper, posted 04/28/2016. doi: 10.2527/JAS.2016-0279

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Próximos passos:

– GEBVs: Acc variabilidade genética

– SNPs identificados: conhecemos a proporção da variação

Aumentar PopulaçãoAumentar

– Validação os resultados obtidos pelo MP2-Embrapa

MP3“Estudos de associação e seleção genômica em características da carne e da carcaça em

bovinos de corte da raça Nelore”

Estratégias de Pesquisa e Validação

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Perspectivas futuras

Análises de expressão gênicaEm andamento

Possibilidade da criação de chip temático para maciez da Carne

Capitalizar toda variação SNPs e genes ligados ao GWAS, às vias ontológicas e ao GS

Parceria Embrapa-Neogen/Geneseek

Em construção o chip personalizado em Lincoln – Nebraska – ( 2º semestre 2016)

Consequente aplicação nos programas de melhoramento genético

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Resultado das Análises Genômicas:

• Regiões do Genoma associadas à maciez• Genes e Marcadores Moleculares

associados à Maciez• Marcadores com alta acurácia de seleção

genômica – animais com GEBVs indicados

Captar toda a variação genética das análises Chip Customizados –

Marcadores com alta acurácia para maciez

Seleção Genômica, animais genotipados – Valor genômico para

maciez com alta acurácia

GEBVs (DEPs)

Maciez com alta

acurácia

DEP Genômica para maciez – alta acurácia

Programas de Melhoramento Seleção e utilização de touros

com DEP para maciez

Realidade no Campo – Fazendas

Valorização da carne Nelore macia pelos frigoríficos

Valorização dos corte cárneos Valor agregado real da carcaça - premiação

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Perspectivas futuras

Marcadores moleculares permitirão uma seleção mais acurada

DEPs genômicas para maciez da carne : realidade

Seleção para maciez da carne em programas de melhoramento genético

Aumento da competitividade no mercado internacional

Remuneração justa ao produtor de carne de qualidade

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Considerações Finais

A seleção para maciez não afetará a seleção para características de carcaça

O Nelore é capaz de produzir carne de qualidade e com maciez

Aumento da competitividade da cadeia produtiva da carne Retorno Real para o produtor

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Fazenda Barreiro – Silvânia/GO

Agradecimentos