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O que é a PubMed?

A PubMed é uma base de dados de bibliografia especializada na área da biomedicina, com

informação também sobre biomateriais e informática médica, contendo mais de 18.200.000

de artigos.

Produzida pela National Library of Medicine (http://www.nlm.nih.gov/) dos Estados Unidos,

em conjunto com editores de literatura biomédica, começa por ser uma inteface de acesso à

Medline, incluindo também a Oldmedline e citações avulsas. Contém registos desde 1865 e é

uma poderosa ferramenta de pesquisa de artigos científicos e outra bibliografia, incluindo

revistas em texto integral dos editores participantes. A PubMed faz ligação a todos os artigos

que estejam em Open Access disponibilizados no arquivo PubMedCentral

(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/) assim como às revistas subscritas em formato

electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B-on (com acesso ua.pt).

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A Medline

A Medline é uma base de dados da National Library of Medicine e que resulta da PubMed.

Inclui apenas artigos científicos com peer-review e nas áreas da biomedicina e as

referências nela incluídas passam por um processo de análise e indexação mais

consistente. Abrange menos publicações do que a PubMed, mas as que reúne são da

máxima pertinência. Uma das mais-valias da Medline é a ligação ao texto integral dos

artigos das revistas que estão incluídas no consórcio B-on.

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O acesso à Medline com interface EBSCO

O acesso está limitado ao domínio ua.pt ou, a partir do exterior, desde que

configure o seu computador pessoal à rede VPN.

O manual de configuração VPN está disponível na página do CICUA

– www.cic.ua.pt > manuais&forms > manuais.

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O acesso à Medline com interface EBSCO

http://search.epnet.com (ua.pt)

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A Medline com interface EBSCO

› Artigos científicos nas áreas da medicina, enfermagem, medicina veterinária, cuidados de saúde, medicina dentária;

› Indexa 4.800 revistas biomédicas e inclui citações das bases de dados Index Medicus, International Nursing Index, Index to Dental Literature, PREMEDLINE, AIDSLINE, BIOETHICSLINE, e HealthSTAR;

› Contem cerca de 1.900 revistas da base de dados de enfermagem CINAHL;

› Analisa artigo a artigo e indexa-os com termos controlados através do thesaurus MeSH;

› Interface de pesquisa em várias línguas, incluindo o português;

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A Medline com interface EBSCO

› Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.;

› Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not), truncatura (*) e termo

composto ou pesquisa por frase (“ “);

› Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre;

› Acesso ao texto integral das publicações subscritas pela UA e das que fazem parte da B-on

– Biblioteca do Conhecimento Online;

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A Medline com interface EBSCO

› Thesaurus;

› Cruzamento da pesquisa com outras bases de dados EBSCO;

› Subscrição de feeds RSS;

› Exportação para EndNote;

› Espaço pessoal.

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O acesso à PubMed

http://pubmed.gov (acesso universal e gratuito)

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A PubMed

› Inclui a MEDLINE, a OLDMEDLINE e citações avulsas;

› A OLDMEDLINE contém artigos anteriores a 1966 (1865 a 1965) de cerca de 80 países;

› Possibilidade de pesquisa em várias publicações, que podem ir dos artigos científicos aos

pré-prints e livros;

› São também incluídas desde logo na PubMed as citações in-process e as citações

fornecidas pelos editores;

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A PubMed

› As citações avulsas compreendem as citações out-of-scope (por exemplo, de artigos sobre geofísica, arqueologia, astronomia) de alguns periódicos indexados na MEDLINE, cujos artigos relacionados com as ciências da saúde já são indexados. Incluem também citações que precedem o ano a partir do qual um dado periódico passou a ser integrado na MEDLINE (catalogação retrospectiva) e citações de outros periódicos não incluídos na MEDLINE, mas que submetem o seu texto integral à PubMedCentral e são avaliados positivamente pela NLM;

› As citações in-process fornecem a citação básica e, na maior parte dos casos, o resumo do artigo, antes mesmo da introdução dos assuntos (termos MeSH).

Estes registos são acrescentados diariamente e contêm a indicação [PubMed – in process].

À medida que os dados vão sendo acrescentados e os registos ficam completos, passam a conter a indicação [PubMed – indexed for MEDLINE];

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A PubMed

› Filtro por texto integral, tipologia do documento, data, etc.;

› Possibilidade de pesquisa com operadores boleanos (and, or, not), truncatura (*)

e termo composto ou pesquisa por frase (“ “);

› Acesso ao texto integral de algumas publicações subscritas pela UA ou que fazem

parte da B-on – Biblioteca do Conhecimento Online (desde que no dominio ua.pt);

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A PubMed

› Acesso ao texto integral de documentos em acesso livre;

› Possibilidade de pesquisa em outras bases de dados e clinical trials;

› Thesaurus;

› Subscrição de feeds RSS;

› Exportação para EndNote;

› Espaço pessoal.

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O thesaurus MeSH

Vocabulário controlado

O MeSH (Medical Subject Headings) é o vocabulário controlado que é utilizado para

indexar os artigos da PubMed e da Medline. A terminologia controlada que é usada no

thesaurus MeSH dá a possibilidade de recuperar informação sobre um determinado

assunto de uma forma sistemática, eliminando os registos que não são pertinentes para

aquele tópico.

É uma óptima ferramenta de apoio para a realização de pesquisas na PubMed e Medline

pois diminui ou limita o ruído, proporcionando maior precisão.

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... suspeita de que há pouca informação

publicada relativa ao tópico que lhe interessa.... quer encontrar rapidamente um aspecto

específico de um tópico genérico.

... quer obter registos de artigos publicados

recentemente. Uma pesquisa por termo MeSH não consegue recuperar citações com a indicação «Pubmed – in process», às quais ainda não foram associados termos MeSH.

... necessita de efectuar uma pesquisa

elaborada, combinando vários aspectos de diferentes tópicos ou assuntos.

... pretende informação sobre um conceito

médico novo ou emergente, para o qual ainda não existe um termo MeSH.

... precisa de efectuar uma pesquisa exaustiva e precisa sobre um determinado tópico (os documentos ainda não indexados não serão

apresentados).

Use palavras quando...Use o MeSH quando...

Quando usar e quando não usar o MeSH…

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A pesquisa

1 – Por autor

Use o último nome do autor, mais iniciais sem pontuação – Ex: Lederberg J

2 – Por assunto

Digite o termo seleccionado na caixa de pesquisa e opte por uma das sugestões

apresentadas.

Identifique o conceito e utilize o thesaurus MeSH para uma pesquisa direccionada

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Através da pesquisa do título completo, da abreviatura ou do ISSN de uma revista, a PubMed

apresenta uma relação de todos os artigos nela publicados, desde que indexados na base de

dados.

3 – Localização de artigos através do título de uma revista

A pesquisa

4 - Localização de revistas por título

Aceda à base de dados das revistas em http://www.ncbi.nlm.nih.gov/journals e digite o título.

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A pesquisa

5 - Localização de um artigo através de informações bibliográficas já existentes

Quando já tem o título da revista, volume, número e páginas, use o Single Citation Matcher

para localizar o artigo - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/pubmedutils/citmatch.

6 – Pesquisa avançada

A pesquisa avançada para além de permitir a combinação de vários campos numa mesma equação (autor, título, assunto…) através de operadores boleanos, permite também a consulta do histórico das pesquisas realizadas.

A Search Builder permite através do termo de pesquisa, da selecção do campo e da opção “Index”, uma listagem associada ao termo pesquisado (índices alfabéticos), onde informa também o número de citações para cada termo e campo.

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A pesquisaSímbolos de pesquisa da PubMed:

AND, OR e NOT como operadores boleanos (ex: cerebral angiography and moniz);

*como truncatura (ex: child* recupera registos com os termos child, children, childhood,

etc.;

“ ” para uma frase exacta ou termo composto.

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O texto integral dos artigos

No registo completo do artigo, a existência do icon de “free-text article” ou ”full- text

article” dá acesso ao texto integral, caso seja uma revista disponível em acesso livre ou uma publicação subscrita em formato electrónico pela Universidade de Aveiro ou pela B-on.

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› Tutoriais PubMed

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmed.html

http://nnlm.gov/training/resources/pmtri.pdf

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/bookshelf/br.fcgi?book=helppubmed&part=pubmedhelp

› Citation Matcher

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/pubmedutils/citmatch

› Lista de bases PubMed

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/gquery?itool=toolbar

Tutoriais de apoio

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Exercícios

1.

- Pesquise artigos sobre malaria infections in africa.

- A partir da lista de resultados, verifique a disponibilidade em texto integral do artigo:Predictive factors of imported malaria in 272 febrile returning travelers seen as

outpatients.

- Confira se o artigo já está indexado na Medline ([PubMed - in process] ou [PubMed -indexed for MEDLINE]).

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Exercícios

2.

- Encontre o artigo correspondente à seguinte referência bibliográfica:

Rotavirus gastroenteritis and seizures in young children.

Lloyd MB, Lloyd JC, Gesteland PH, Bale JF Jr.

Pediatr Neurol. 2010 Jun;42(6):404-8.

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Exercícios

3.

- Pesquise artigos sobre SIDA, usando o thesaurus.

- Analise a informação do thesaurus sobre Acquired Immunodeficiency Syndrome e efectue uma nova pesquisa cruzando este termo com transmission.

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Exercícios

4.

- Verifique se a revista PLOS Biology está indexada na PubMed.

- Pesquise artigo nesta revista sobre Immunohistochemistry.

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A PubMed – Subscrição de feeds RSS1

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A PubMed – Subscrição de feeds RSS

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A PubMed – exportação para EndNote 1 2

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Questionário

http://portal.doc.ua.pt/formquest.asp

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