002 Estrutura e Organização do DNA.pdf

01. DNA Structure and Organization

Informação adicional: 1.  Densidade da molécula nativa muito alta

2.  Decomposição da molécula nativa em nucleótidos resultava em que as proporções dos diferentes componentes eram sempre: Guaninas = Citocinas Adeninas = Timinas 3. A molécula nativa tinha um diâmetro constante (20 Å)

Estabilidade do DNA

Interações hidrofóbicas entre as bases que resultam na sua orientação principalmente perpendicular ao eixo da molécula.

Desnaturation e renaturation do DNA

DNA melting curves

Southern blotting

Estrutura secundaria do DNA

Linear DNA molecule

Região de dupla simetria com sequencias repetidas invertidas

Positive supercoiling

Link number = 0

Link number = 3

Nucleossoma

Modelos da organização da cromatina

Bead on a string 11 nm

Modelos da organização da cromatina

Solenoid 30 nm

Remodelação da cromoatina

Dependente do ATP

Diversas proteínas interatuam com o DNA

C-terminal das histonas

O Código epigenético

O Código epigenético

1 6-7 40 680 1.2 x 10

4

Packing ratio

Organização do DNA nu núcleo

Scaffold Matrix Mitotic Interphase (nucleus)

The chromosome Scaffold

Remover DNA com nucleases e DNA com NaCl Proteínas não histonas Topoisomerase II Structural Maintenance of Chromosomes SMCs

Codensin is involved in the organization of mitotic chromosomes

Cohesin maintains sister chromatids together from G1 to end of Mitosis

DNA Condensin Cohesin

Cornelia de Lange Syndrome (1/10,000) severe developmental deffects

Mutations at SMC1/3 or SCC2 (chaperone of SCC1)

O Genoma de um organismo

1 N = Haploide 2 N = Diploide

Chromosome territories in human cells

Gene localization changes within the nucleous in response to transcription

Genomics

DNA complexity

25,000

Repeats Transpose Repeat

TE

Transposons

Barbara McClintock 1902-1992 Nobel prize of Physiology and Medicine 1983

Transposition

- Normalmente reprimida - Pode ser activada - Induz alterações em genes - Induz quebras cromossomicas

Transposons “copy paste via RNA or DNA”

Transposons

Heterocromatina

Eucromatina

Telómero Centrómero Telómero

O Genoma humano

SINEs: Short Interspersed Nuclear Elements - Short <500 b -  Transcribed by RNA pol III -  Non-coding -  Alu sequences (280 b) cut RE Alu -  1,5 M copies -  Use TEs for mobilization

LINEs: Long Interspersed Nuclear Elements - Heterogenous in lenght -  Transcribed by RNA pol II -  Code for reverse transcriptase and endonuclease -  500,000 copies -  Move by coping so enlarge the genome