DNA Seqüenciamento Alinhamento 1 - Introdução Usuário Cenário atual 2 - Problema Nossa...

BASES

• Resposta aproximada• Rápido

BLAST

Interface voltada para biólogos

rápido saída do

alinhamento personalizada

Disponível na web Smith-Waterman Custo-benefício

7,5 GB

Interface Complexa Penalidades Saída pouco legível Blast

Informatas Servidor Blast

Informatas Desktop Limitado a um

usuário

BD

WEB

FPGAs

Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de Requisitos

Escolher algoritmo 31/08 - Gerente de Desenvolvimento de Hardware

Escolher interface de comunicação FPGA-PC

31/08 - Equipe de Desenvolvimento de Hardware

Escolher FPGA 31/08 - Gerente de Desenvolvimento de Hardware

Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoAlgoritmo 16/08 30/09 Algoritmo

possui detalhes específicos da implementação.Plano corretivo: Continuar estudando.

Bernardo ReisPedro Bello

Estudar Stratix II 16/08 - Diogo LagesThiago Lessa

Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoProcessador Nios II

16/08 30/09 Realocação de pessoal causou atrasos.Plano corretivo: Tutorial com o pessoal do HPCin, mais alocação de tarefas para o novo pessoal.

André FelipeLeyla Manoella

Protocolo de comunicação

16/08 30/09 Protocolo bastante complicado.Plano corretivo: Continuar estudando.

Diogo LagesThiago Lessa

Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefa de ModelagemArquitetura paralela do Smith-Waterman

23/09 - Pedro Bello

Arquitetura do sistema em FPGA

23/09 - Gerente de Desenvolvimento de Hardware

Implementação e Teste de Protótipo

23/09 - Pré-requisito: Aquisição da Placa

Bernardo ReisPedro Bello

Tarefa Prazo Previsto Responsável

Implementar protótipo do algoritmo segundo Byang

07/10 Bernardo ReisPedro Bello

Estudar módulo Ethernet para NIOS II

07/10 Diogo LagesThiago Lessa

Implementar NIOS II customizado

07/10 André FelipeLeyla Manoella

Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo

Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoFerramentas de Bancos de Dados

21/09 André e Thiago

Modelagem do Banco de Dados das Cadeias de DNA

21/09 25/09 Reunião com os Clientes Adiada.

André e Thiago

Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de RequisitosEscolha do Servidor

21/09 30/09 Devido a realocação.

André e Thiago

Pesquisa com os clientes

21/09 25/09 Reunião com os Clientes Adiada.

André e Thiago

Tarefa Prazo Previsto Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefa de ModelagemImplementação do Servidor

11/10 André e Thiago

Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de RequisitosEscolher da linguagem

31/08 30/09 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Viabilidade de ferramentas e material de estudo

31/08 30/09 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefas de EstudoApi das linguagens web e linguagem padrão: CSS, HTML

20/08 30/09 Devido a realocação

Paulo OrlandoJonathan

Estudo da linguagem do servidor

20/08 - Dependência da escolha do servidor

Paulo OrlandoJonathan

Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Tarefa de ModelagemCriar prototipagem 1.0

16/9 21/09 Paulo OrlandoJonathan

Criar prototipagem 2.0

28/9 - Paulo OrlandoJonathan

Tarefa Prazo Previsto

Novo Prazo Efetivamente Realizado

Problemas Responsável

Levantamento de RequisitosAnalisa os requisitos com o cliente

21/09 30/09 Problema de reunião

Paulo OrlandoJonathan

Tarefa Prazo Previsto Responsável

Teste de ferramentas/Testes das APIS

06/10 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Reuniões com os clientes 06/10 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Prototipagem 2.0 06/10 Equipe de Desenvolvimento de Interface

Software de Imagens: Adobe Fireworks Corel Drawn MovieGear4

Linguagens de Programação Ajax JavaScript HTML CSS

Adobe FlexBuilder Professional/Aptana/DreamweaverCS4 – IDES

IDES Adobe FlexBuilder Professional Aptana DreamweaverCS4

Uma Interface organizada. Respostas Organizadas Entradas que aceitem mais de um contig Privacidade no Banco de Dados Usar formato FASTA Velocidade de análise das sequências de

DNAS Sem penalidades temporais

Melhora no fluxo da informação Interface com Diversos Bancos de

Dados Atualização automática do Banco de

Dados Mundial Colocar dados Estatísticos

10 horas semanais