Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência

1

Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas

2

Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

Objetivo: Compreender que a sistemática biológica é uma ciência histórica, comparativa e inferencial.

3Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

Systematics is the branch of evolutionarybiology that aims to recover thegenealogical relationships underlyingorganic diversity.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo objetivo é recuperar as relações genealógicas subjacentes à diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

4Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia

evolutiva cujo objetivo é recuperar as

relações genealógicas subjacentes à

diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

5Arhat Abzhanov

61. Sistemática biológica

Introdução

TempoEspaço

Diversidade

7

EspaEspaççooTem

po

Tem

po

Descendência com modificação

1. Sistemática biológica

Introdução

8

EspaEspaççoo

Tem

po

Tem

po

Descendência com modificação

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo

objetivo é recuperar as relações genealógicas

subjacentes à diversidade orgânica

1. Sistemática biológica

Introdução

9

C. crassirostris

C. pallidaG. fortis

C. parvulus

G. magnirostris

G. conirostris

G. scandens

C. pauper

C. heliobates

C. olivacea

Ancestral comum

Introdução

1. Sistemática biológica

10Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva

cujo objetivo é recuperar as relações

genealógicas subjacentes à diversidade

orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

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G. magnirostris

G. fortis

G. fuliginosa

G. scandens C. pallida

C. heliobatesG. conirostris C. crassirostris

C. parvulus C. pauper

C. olivacea T. obscura

Introdução

1. Sistemática biológica

12

Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

132. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

14

A G

TC

2. Preservação e destruição da informação

Introdução

15

População descendente População descendente

Sequênciasdescendentes

AA

CCTT

População ancestral

Sequência ancestral

16

AC — ATGAACGT — CAA CGC — T — C

ACTGAACGTAACGC

ACTGA — T — GAC — GGTA A — G CGC

A AC ∗ AT TG GG ∗ AA AG ∗ CG GT ∗ CA AG ∗ AC CG GC C

Sequência ancestral

Sequênciadescendente 1

Sequênciadescendente 2

Sequênciasobservadas

172. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

A G

TC

18

Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

19

EspaEspaççooTem

po

Tem

po

203. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

213. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

Dados de distribuição de caracteres

Métodos deinferência

Padrão filogenético+ →

22

Histórica Comparativa Inferencial

A sistemática biológica éuma ciência

233. Padrão e processo

Introdução

Matriz de caracteres alinhadosEvolução (não-observável)

CGACTTG

CCACATG

DADOS DE SEQUÊNCIAS

GC TAA

Análise filogenética

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

25

Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas