Laboratório Resultados solicitados para revisão no laboratório de origem Resultados reportados...

Laboratório

Resultados solicitados para

revisão no laboratório de

origem

Resultados reportados

após revisão na origem

Resultados reanalisados

pela REDE HLA

Resultados de tipagem HLA discordantes

Observações

REGIÃO CENTRO-OESTE 16 16 16 3

Controles de exon 2 e 3 muito baixos (22 e 34) Repetição necessária

REGIÃO SUDESTE

179 179 178 9Ajustes em beads com gráficos diminuídos no loco DRB1

170 170 6 0  

84 82 10 0  

33 33 5 0 

REDIÃO SUL

51 51 35 0  

191 185 14 2Ajustes em beads com gráficos diminuídos no loco A

64 11 11 0  

430 39 27 1Loco DRB1 bead 3 duvidosa, repetição necessária

RESUMO DA REANÁLISES FEITAS PELA REDE BRASIL DE IMUNOGENÉTICA

RESULTADOS NA RENÁLISE PELA REDE HLA

Resultado raro no laboratório de

origemReanálise REDE HLA Ajustes

A*66:12 A*30:ZNAJ A*66:VWKN Bead 81

A*02:65 A*02:CVPC A*31:CVP Beads 23,38,68,46     

DRB1*07:19 DRB1*07:ZJZH DRB1*11:XMDS Beads 42 e 88

DRB1*03:70 DRB1*03:ZKVN DRB1*11:ZKXF Bead 38

DRB1*08:43 DRB1*08:ZRTC DRB1*11:ZMUS Bead 52

DRB1*09:15 (DRB1*08:WNGC DRB1*09:VXBR) Beads 52 e 4 (repetir)

DRB1*04:24 Repetição necessária Bead 3 duvidosa

DRB1*01:42output de 1 só amostra, muito

background.  

Alelos que deverão ser confirmados por Sequenciamento Direto de DNA

LOCO A LOCO B LOCO DRB1A*02:52 B*07:32 DRB1*01:12A*02:26 B*07:41 DRB1*04:68A*11:11 B*15:83 DRB1*13:21A*23:38N B*15:156 DRB1*13:77A*24:28 B*18:07 DRB1*13:44

A*24:129 B*18:19 DRB1*16:09 A*24:50 B*18:35  

A*26:05 B*35:80  

A*29:13 B*37:10  

A*34:03 B*39:29  

A*34:06 B*44:60  

  B*55:21  B*56:13

B*56:06TOTAL = 11 alelos de loco A

TOTAL = 14 alelos de loco B

TOTAL = 6 alelos de loco DRB1

Verificar valores para exon 2 e exon 3 (acima de 700 )Verificar padrão de reação das beads (positivas/negativas/ leve background)Verificar reações próximas ao cutoff ( beads FN ou FP)Comparar formato e tamanho dos gráficos

Loco A gráfico diminuído bead 68

Loco A gráfico diminuído bead 68 escala 1:200

Loco DRB1 gráfico diminuído bead 38

Loco DRB1 gráfico aumentado bead 31

CONSIDERAÇÕES FEITAS NA REANÁLISE:

Controles positivos para exon 2 e exon 3 acima de 700Contagem de beads acima de 75

Testar gráficos diminuídos (FN)Testar gráficos aumentados (FP)

Beads problemáticas:

Loco B Loco DRB1

bead 26 bead 2bead 71 (B*07:33) bead 9bead 58 bead 25Bead 99 (B*40:33) bead 42