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- Enzimas oxidativas envolvidas na degradação de lignina: estrutura, função, como determinar e aplicações no branqueamento de polpas - Lacase usada na funcionalização de fibras (seminário) André Ferraz Departamento de Biotecnologia Escola de Engenharia de Lorena Universidade de São Paulo Lorena, SP Enzimas em conversão de biomassa

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- Enzimas oxidativas envolvidas na degradação

de lignina: estrutura, função, como determinar

e aplicações no branqueamento de polpas

- Lacase usada na funcionalização de fibras

(seminário)

André Ferraz

Departamento de Biotecnologia

Escola de Engenharia de Lorena

Universidade de São Paulo

Lorena, SP

Enzimas em conversão de biomassa

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Outline - LiP, MnP e VP (peroxidases) - Lacases - Determinação experimental - Aplicações em branqueamento de polpas - Aplicação de lacases na funcionalização de fibras (artigo para discussão no terço final da aula)

Ref. básicas:

1. T Teerii and G Henriksson. 2009 Enzymes degrading wood components. In:

In: Pulp and Paper Chemistry and Technology Volume 1, Wood Chemistry

and Wood Biotechnology

Edited by Monica Ek, Göran Gellerstedt, Gunnar Henriksson

cap. 11, pp. 245-270

2. Kenneth E Hammel and Dan Cullen, 2008. Role of fungal peroxidases in

biological ligninolysis. Current Opinion in Plant Biology 11:349–355

3. seminário: Jordi Garcia-Ubasart, Josep F. Colom, Carlos Vila, Nuria

Gómez Hernández, M. Blanca Roncero, Teresa Vidal . 2012. A new procedure

for the hydrophobization of cellulose fibre using laccase and a hydrophobic

phenolic compound. Bioresource Technology 112: 341–344.

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Revisando sobre o modo de ação dos organismos degradadores de lignina

A hifa do fungo habita o lúmen da célula; a degradação ocorre no interior da parede celular

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Enzimas

envolvidas na

degradação de

lignina

princípio do

modo de ação

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Lógica de

fragmentação,

independente

da ação

enzimática,

dos radicais

inicialmente

gerados por

envolvidas

oxidativas

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Lacase (Cu2+)

Lacase red. (Cu1+)

O2

H2O PhOH

PhO•

Enzimas oxidativas (lacases) (EC 1.10.3.2) (AA1_1)

Quem são as enzimas envolvidas na degradação de

lignina??

grupo 1: Lacases

Cupro-proteínas que recebem elétrons dos fenóis a partir da redução do Cu2+ a Cu1+. A Lac-Cu1+ é então oxidada por O2 que é reduzido à água

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Lacases de Trametes versicolor 52J listada no CAZy

(white-rot fungi)

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Visão geral dos 4 íons Cobre. Os

íons denominados T1 realizam a

oxidação do substrato; T2/T3

reduzem o O2

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A estequeometria da reação envolve mais de 1 molécula fenólica

por O2 reduzido, pois há 4 cobres na molécula de lacase

Cada O-H fenólico perde 1 e-, gerando um radical fenoxila que se decompõe, por várias vias, conforme mostrado anteriormente

A enzima atua somente sobre compostos com hidroxilas fenólicas

(de fato, também pode atuar sobre aminas aromáticas), pois a

capacidade oxidativa é baixa

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Potencial redox do Cu2+ (T1) varia de acordo com o tipo de lacase O. V. Morozova, G. P. Shumakovich, M. A. Gorbacheva, S. V. Shleev, and A. I. Yaropolov (2007) Blue” Laccases. Biochemistry (Moscow) 72:1136-1150.

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A capacidade oxidativa pode ser aumentada se a ação é

inicialmente realizada sobre mediadores sintéticos (ABTS ou

HBT). Nestes casos a oxidação pode ocorrer mesmo em

substratos não fenólicos de lignina

Fonte: Reproduzido de Bourbonnais et al. (1999).

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Oxidação de ABTS em dois estágios, que podem ser iniciados por lacase

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Mediadores naturais já descritos para lacases

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Quem são as enzimas envolvidas na degradação de

lignina??

a) Fenoloxidases

b) Enzimas que produzem peróxido de hidrogênio

C0 CI

CII

S

S+•

S

S+•

H2O2

H2O H 2 O

C 0 C I

C II

H 2 O 2

Mn3+

Mn2+

PhOH PhO

.

Mn3+

Mn2+

ou

LiP (EC 1.11.14) (AA 2) MnP (EC 1.11.1.13) (AA2)

Enzimas oxidativas (peroxidases) - visão simplista

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Lip e MnP de Phanerochaete chrysosporium (white-rot fungi). Estruturas similares em todas as peroxidases (grupo heme é o sítio ativo).

No caso da MnP, há um sítio de ligação de Mn2+ que funciona como um co-fator para a ação da enzima

http://chemistry.umeche.maine.edu/CHY431/Wood4.html

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Ciclo de oxi-redução no sítio catalítico das peroxidases

Forma nativa da enzima Forma oxidada da enzima

oxidação do substrato

oxidação do substrato. Se for uma MnP: Mn2+>>Mn3+

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Mn3+ ou .OH

.

Mn2+ ou H2O

COOH

O2

COOH.

COOH

OO.

Abstração de H de um doador

COOH

O OH

COOH

COOH

COOH.(etapa de propagação)

(etapa de iniciação)

B

OCH3

OOCH3

OH

HO

OC2H5

ROO.

ROOH

OCH3

OOCH3

OH

HO

OC2H5

.O2

OCH3

OOCH3

OH

HO

OC2H5

.OO

HOO.

OC2H5

OH

OCH3O

OCH3

O

OCH3O.

+

OC2H5

HO

OH

OCH3

OCH3

OH

OC2H5

O

AB

Figura 5. (A) Reação de peroxidação de ácido linoleico iniciada por íons Mn3+

ou radicais

hidroxila. (B) Degradação de um composto modelo de lignina (não fenólico) iniciada por radical

organoperoxila (ROO) gerado in situ pelo sistema MnP, ácido linoleico e H2O2. O modelo

proposto explicaria a via de oxidação C-alfa (A) e a clivagem beta-O-4 (B). Ambas reações

seriam iniciadas pela abstração do um hidrogênio benzílico do composto modelo através da ação

de um radical peroxila gerado pelo sistema MnP/ácido linoleico/H2O2

Fonte: Reproduzido com modificações de Kapich et al. (1999).

Ação de MnP, mediada por ácidos graxos

insaturados, sobre modelos não fenólicos de lignina

Peroxidação de ácido graxo iniciada por Mn3+

Degradação de modelo não fenólico por ROO gerado por MnP

Fonte: Reproduzido com modificações de Kapich et al. (1999).

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Degradação in vitro de

lignina contida em um

material lignocelulósico

pelo sistema MnP/ácido

linoleico

G.G.S. Cunha et al. / Enzyme and

Microbial Technology 46 (2010) 262–

267

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Enzimas oxidativas (Peroxidase versátil - VP)

(EC 1.11.1.16) (AA2)

Híbrido estrutural de LiP e MnP. Combina as propriedades catalíticas das 2 enzimas, oxidando substratos de LiP e MnP.

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Versátil Peroxidase de Pleurotus eryngii

VPL has the three acidic amino acid residues required for Mn2+ binding, and a catalytic efficiency (kcat/Km) for Mn2+ oxidation in the general range exhibited by typical MnPs. In addition, VPL has a tryptophan residue, trp164, analogous to the LiPA trp171 that participates in electron transfer from aromatic donors and consequently enables the enzyme to oxidize nonphenolic lignin-related structures The catalytic efficiency of P. eryngii VPL on veratryl alcohol is relatively low the same reaction catalyzed by P. chrysosporium LiP

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Celobiose desidrogenase (EC 1.1.99.18) (AA3) Oxida polissacarídeos, reduzindo Fe3+, O2 ou mesmo coopera com o ciclo catalítico das LPMOs (AA9)

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glicose oxidase

(EC 1.1.3.4) (AA3)

(intracelular)

glioxal oxidase

(AA5_1)

(extracelular)

aril-álcool oxidase

(EC 1.1.3.7) (AA3)

(extracelular)

Enzimas que produzem peróxido

(são acessórias às peroxidases)

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Enzimas que produzem peróxido

Também MnP pode gerar H2O2 a partir da oxidação de

ácidos orgânicos como o malônico e oxálico.

O=O

H-O-O. + CO2

Doador de H

HO-(C=O)-(C=O)-OH

Mn3+ Mn2+

O=C=O + H+ + HO-C.=O

H2O2

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Biobranqueamento com o sistema Lacase/mediador

Exemplo do efeito da ação do sistema lacase/HBT sobre polpa kraft não branqueada

Fonte: Reproduzido de Call e Muncke (1997)

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Figura 8. Linha de branqueamento piloto composta das etapas L-E-Q-P Fonte: Reproduzido de Call e Muncke (1997).

Figura 9. Número kappa e alvura das polpas tratadas em planta piloto após os tratamentos com

lacase/mediador (L) e lacase/mediador seguido de extração alcalina (L-E). Fonte: Reproduzido de Call e Muncke (1997).

Lacase/HBT em linha piloto de biobranqueamento

Incluindo a etapa final de branqueamento (QP), polpa atingiu 76.5% ISO de alvura.

Fonte: Reproduzido de Call e Muncke (1997)

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Figura 13. Estrutura de mediadores alternativos testados no sistema lacase/mediador. O

mediador de referência foi o HBT, mostrado na figura “L”. Fonte: reproduzido de Camarero et al. (2007).

Mediadores alternativos ao HBT

HBT

Fonte: Reproduzido de Camarero et al. (2007)

AS

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Mediadores alternativos ao HBT

Fonte: Reproduzido de Camarero et al. (2007)

HBT

AS

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Eficiência da MnP em função do tipo de ácido graxo insaturado presente no meio reacional Kappa inicial = 8,5

Fonte: Reproduzido de Bermeck et al. (2002)

Alvura inicial = 39,3%

Biobranqueamento com o sistema MnP/mediador

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Lacase usada na funcionalização de fibras (seminário)

Garcia-Ubasart et al., 2012. A new procedure for the hydrophobization of cellulose fibre using laccase and a hydrophobic phenolic compound. Bioresource Technology 112: 341-344