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UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA ANUÁRIO DA PRODUÇÃO CIENTÍFICA- 2014 Diretor do ICB: Jackson Bittencourt Vice Diretor: Luis Carlos Ferreira Chefe do Departamento: Gabriel Padilla Maldonado Vice Chefe: Marilis do Valle Marques Coordenadoria de Pesquisa: Marilis do Valle Marques Carlos Frederico Martins Menck Mário Henrique de Barros Wellington Araújo

Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

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Page 1: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO

INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOMÉDICAS

DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA

ANUÁRIO DA PRODUÇÃO CIENTÍFICA- 2014

Diretor do ICB: Jackson Bittencourt

Vice Diretor: Luis Carlos Ferreira

Chefe do Departamento: Gabriel Padilla Maldonado

Vice Chefe: Marilis do Valle Marques

Coordenadoria de Pesquisa:

Marilis do Valle Marques

Carlos Frederico Martins Menck

Mário Henrique de Barros

Wellington Araújo

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Justificativa

Este é o quinto anuário da produção científica dos docentes do Departamento de

Microbiologia, organizado pela Coordenadoria de Pesquisa do Departamento, e mantém

basicamente a mesma estrutura de apresentação dos anteriores a fim de permitir uma

melhor análise comparativa da nossa produção científica. Mantivemos, portanto, a

avaliação dos principais indicadores atuais de produção científica: número de artigos

publicados em revistas indexadas, fator de impacto das revistas nas quais foram publicados

esses artigos, número de patentes, bolsas de produtividade do CNPq pelos docentes,

citações acumuladas e índice H. Também foi incluída uma análise da captação de recursos

para financiamento de pesquisa por agências de fomento.

Constituição do Departamento

O Departamento de Microbiologia em 2014 contou com 33 docentes na ativa, sendo

5 titulares, 7 associados e 21 doutores. Houve neste ano o ingresso de dois novos doutores,

e a transferência de um professor para outra Unidade da USP no mês de novembro (os

dados referentes a estes docentes estão incluídos na análise deste ano). O Departamento

possui também 5 docentes aposentados com termo de adesão, que participam

principalmente de atividades educacionais. Em nosso quadro de servidores não docentes, o

Departamento contou com 4 técnicos administrativos, 6 especialistas de nível superior, 10

técnicos de laboratório de nível médio e 15 técnicos de laboratório de nível básico,

totalizando 35 funcionários. É importante também destacar que além destes, dois desses

especialistas de nível superior atuam, na verdade, no Centro de Facilidades de Apoio à

Pesquisa-USP (CEFAP-USP), que é sediado no ICB, mas não atuam no diretamente no

Departamento.

Um dos conceitos importantes deste Departamento é a indissociabilidade entre a

pesquisa e ensino. E isso é claro dentro do programa de pós-graduação em Microbiologia

que em 2014 contou com 116 alunos de Pós-Graduação, sendo 66 de Mestrado e 50 de

Doutorado. Nesse ano tivemos 20 novos alunos de Mestrado e 18 de Doutorado

ingressantes, sendo que 12 alunos concluíram sua tese e receberam título de doutor e 9

concluíram dissertação e receberam título de mestre.

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O Departamento vem mantendo um grande número de alunos de Iniciação

Científica, oriundos de outras Unidades da USP e de outras Universidades. Mas este ano

tivemos alguns alunos de IC do próprio Curso de Ciências Biomédicas, cuja primeira turma

iniciou em 2012. Alguns desses alunos também fazem estágios curriculares em nosso

Depto. A maioria dos alunos de IC são contemplados com bolsas de iniciação científica,

especialmente da FAPESP e do CNPq (PIBIC). Os alunos PIBIC apresentam seus trabalhos

no Simpósio de Iniciação Cientifica da USP (SIICUSP), que sofreu recentes modificações

em seu formato, passando a contar com duas fases de seleção. Os alunos de IC participam

do SIICUSP e da Reunião Científica do Departamento, apresentando seus trabalhos. Além

disso, os alunos de IC são estimulados a apresentarem seus trabalhos nos congressos

nacionais de sociedades científicas importantes na área (Microbiologia, Genética,

Bioquímica, etc). Oito alunos de graduação da USP e de outras universidades realizaram

sua iniciação científica em nosso Departamento dentro do programa PIBIC do CNPq.

Tivemos ainda dois alunos de IC, bolsistas do programa Santander, além de dez alunos com

bolsa FAPESP, e doze sem bolsa, que não conseguimos contabilizar.

Além disso, o Departamento contou em 2014 com 35 pesquisadores dentro do

programa de pós-doutoramento desta universidade, que são financiados com bolsas da

FAPESP (18), CNPq (6), CAPES-PNPD (5), um da EcoHealth Alliance, um da FUSP e

quatro sem bolsa (Figura 1). Um Jovem Pesquisador (FAPESP) completa o quadro de

pesquisadores nessa etapa da carreira desenvolvendo trabalhos de pesquisa em nosso

Departamento. As atividades de pós-doutorandos no Departamento têm como principal

objetivo o desenvolvimento de projetos de pesquisa junto aos grupos dos docentes, o que é

reflexo das exigências das agencias financiadoras. Vários pós-doutorandos também

orientam alunos de IC, inclusive alunos com bolsas PIBIC, fornecendo uma valiosa

oportunidade para se iniciar na atividade de orientação. Esses pesquisadores indicam

claramente a capacidade de atração e interesse que despertam as atividades em

Microbiologia desenvolvidas aqui e vêm somar nos esforços e contribuir com objetivos de

melhorar a produção qualificada de conhecimento em nosso Departamento.

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Figura 1- Número de pós-doutorandos do Departamento nos últimos cinco anos.

Bolsistas Produtividade - CNPq

O número de docentes na ativa do Departamento com bolsas de produtividade do

CNPq – científica e tecnológica – somam 17, número que não variou em 2015 em

comparação ao ano anterior. Reforçamos neste anuário as considerações referentes à

importância dessas bolsas na qualificação do corpo docente e reiterar ao Departamento que

incentive todos os docentes a pleitear sua concessão. Trata-se de uma avaliação externa,

que contempla qualidade da pesquisa realizada neste Departamento, sendo assim temos

expectativas que em futuro próximo a grande maioria de nossos docentes seja contemplada

com essa importante distinção.

Em 2014, 17 docentes (51,5% dos docentes) receberam bolsas de produtividade

científica do CNPq, sendo 9 de PQ nível 1 e 5 de PQ nível 2 e 3 bolsas de

Desenvolvimento Tecnológico PD 2. Os docentes qualificados como PQ nível 1 se dividem

em 1- 1A, 3 – 1B, 3 – 1C e 2-1D.

Publicações

No ano de 2014, os docentes do Departamento participaram como autores de 87

artigos científicos, 75 deles (86,2%) em revistas indexadas. Das publicações não indexadas

25

27

29

31

33

35

2010 2011 2012 2013 2014

mer

o d

e p

ós-

do

cs

Número de pós-doutorandos

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muitas saíram em revistas novas principalmente “open access” lançadas nos últimos anos e

ainda não indexadas. Dos 87 artigos publicados, 49 (56,3%) apresentaram os docentes

como 1o autor, ou autor correspondente, indicando que os grupos de pesquisa do

Departamento têm realizado muitas colaborações científicas com grupos no Brasil e no

exterior. Além disso, deve-se salientar que os docentes participaram como autores e co-

autores em 6 capítulos de livro, sendo todos de publicação internacional. Esses trabalhos

demonstram a inserção de nossos docentes no cenário de pesquisa internacional.

A evolução da produção científica do Departamento de Microbiologia também foi

avaliada (não computados capítulos de livros e artigos sem indexação). Em 2014, o número

absoluto de artigos não mostrou aumento em relação ao observado em 2013, mas foi

superior a 2011-2012, evidenciando a manutenção da tendência de aumento da produção

dos docentes (Figura 2).

Figura 2- Evolução do número de publicações pelo Departamento

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Assim, comparando-se com o quadro de publicações de 2010-2012, nota-se que em

2013-2014 houve uma retomada no número absoluto de artigos, que vem sendo obtida

graças a um aumento do número de artigos em periódicos indexados (Tabela 1). Um

aumento no número de trabalhos em periódicos internacionais em detrimento das revistas

nacionais também indica uma confirmação da tendência de buscar maior visibilidade e

internacionalização de nossa pesquisa. Nota-se especialmente em 2014 um bom aumento

nos artigos em periódicos com fator de impacto acima de 4,0, em detrimento daqueles na

faixa 2,0-3,0. Portanto, em relação a uma avaliação qualitativa, baseada no valor do fator de

impacto do conjunto de periódicos, verifica-se claramente uma melhora das publicações

dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3).

Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento de Microbiologia, pelo

índice de impacto (FI- Fator de Impacto) das revistas científicas (JCR).

FI <0,99 1 - 1,99 2 - 2,99 3 - 3,99 >4,0

2005 9 14 16 8 6

2006 6 18 17 9 5

2007 15 22 18 8 7

2008 15 19 19 13 8

2009 14 24 25 9 12

2010 5 15 24 10 11

2011 8 9 22 13 14

2012 6 13 23 21 13

2013 7 12 27 22 14

2014 6 17 13 21 18

Por esses dados fica claro também que o número de publicações nos períodos

anteriores se deve principalmente a um grande número de publicações na faixa de impacto

menor que dois. Nos últimos 3 anos, observou-se uma melhoria significativa de

publicações em revistas com impacto acima de 3. Ressalta-se que em 2014 pela primeira

vez mais de 50% dos artigos indexados foram publicados em periódicos com impacto >3,0

(Figuras 3 e 4).

Page 7: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

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Figura 3 – Distribuição relativa do fator de impacto das publicações do Departamento

(fator de impacto do JCR).

Figura 4– Distribuição anual por Fator de Impacto das publicações do Departamento.

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Conforme observado na figura 5, desde 2012 a média dos fatores de impacto dos

artigos publicados mantém-se acima de 3,0, evidenciando a preocupação com a qualidade

dos periódicos de escolha. Deve-se também levar em consideração a flutuação dos valores

de fator de impacto dos periódicos da área medidos pelo JCR nestes últimos anos, que

sofreu bastante alteração, especialmente de queda em 2014, o que pode explicar a pequena

redução na média deste ano.

O Departamento tem como meta o aumento da internacionalização de sua pesquisa,

e tem procurado incentivar este aspecto tanto entre docentes como alunos. Os docentes do

Departamento têm publicado ativamente artigos de colaboração com pesquisadores do

Brasil e do exterior, e nota-se uma tendência de manutenção da participação estrangeira na

co-autoria, de cerca de 31% do total de artigos em média entre 2010-2014, com exceção de

2011 com apenas 15% do total. Consideramos que um terço dos trabalhos com parceria

com pesquisadores do exterior é um número bastante expressivo e denota uma tendência

consolidada de internacionalização de nossa pesquisa.

Figura 5 – Fator de Impacto Médio das publicações do Departamento.

Page 9: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

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Produção por docente

A análise do número de artigos publicados (75 artigos científicos em periódicos

indexados) pelo número de docentes do Departamento (considerando para 2014 33

docentes) ficou em 2,27 publicações/ano/docente (Figura 6). Este número no período 2013-

2014 melhorou em relação a 2011-2012. Este dado juntamente com os anteriores é

importante, porque mostra que o aumento da produtividade docente tem sido buscado, e

sempre acompanhado de uma melhoria na qualidade das publicações.

Figura 6 – Evolução da produção científica por docente.

Inovação Tecnológica

A Microbiologia representa uma das áreas acadêmicas com maior viés para

inovação tecnológica. Aspectos aplicados da microbiologia movimentam parcela

expressiva de economia mundial e garantem conforto e saúde a toda humanidade. A

geração de biocombustíveis, insumos relacionados à saúde humana e animal, a manutenção

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do equilíbrio ambiental por meio do controle de poluição, a geração de alimentos e

incontáveis aplicações industriais são alguns dos aspectos onde descobertas inovadoras em

microbiologia mudaram e mudam os rumos da sociedade.

O Departamento de Microbiologia da USP se destaca não apenas pela excelência no

ensino, na pesquisa e na extensão acadêmica, mas também pela sua presença ativa como

polo de geração de tecnologias inovadoras envolvendo diferentes aspectos microbiológicos.

Projetos relacionados à pesquisa de bioplásticos (material plástico biodegradável produzido

por bactérias), novos métodos de biorremediação (controle de fontes poluidoras como

metais pesados por meio da introdução de microrganismos naturais ou geneticamente

modificados), detectores de radiação ultravioleta, pesquisas sobre novas vacinas, sistemas

de expressão de proteínas recombinantes em bactérias e fungos, geração de microrganismos

transgênicos para uso industrial, médico ou biotecnológico estão entre as descobertas e

processos inovadores feitos por pesquisadores, estudantes, técnicos e docentes vinculados

ao Departamento de Microbiologia da USP nos últimos anos.

Um parâmetro utilizado frequentemente para a avaliação da atividade inovadora de

um grupo de pesquisa é o número de pedidos de patentes depositados por seus membros em

instituições específicas, como o Instituto Nacional de Propriedade Industrial (INPI), que

avaliam e conferem proteção a descobertas de produtos e processos que possam gerar lucro

aos seus inventores e às instituições envolvidas. O Departamento de Microbiologia tem

feito de forma regular e continuada depósitos de pedidos de patente junto ao INPI. Nos

últimos 15 anos foram depositados vários pedidos de patente no INPI por docentes do

Departamento indicando uma forte presença dessa atividade por parte de seus

pesquisadores. Os pedidos de patente envolveram descobertas inovadoras relacionadas à

novas vacinas, despoluição de águas, biorremediação ambiental, prevenção da cárie dental

e monitoramento da radiação ultravioleta ambiental.

Outros Indicadores de Produtividade

O levantamento do número de citações e fator “H” dos docentes do Departamento

foi realizado por buscas na base de dados “Scopus” e pelas indicações dos docentes em seu

currículo Lattes. A base Scopus também fornece o cálculo do fator “H” de cada docente

pesquisado, considerando somente os artigos publicados a partir de 1995. O fator “H” é um

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importante valor de qualificação da produção científica produtividade por considerar o

número de citações que um dado conjunto de artigos recebeu, minimizando eventuais

distorções do número absoluto de citações. Assim, por exemplo, H=10 entende-se que o

pesquisador tem dez artigos que foram citados pelo menos 10 vezes.

Em 2014 o número de citações recebidas por docentes do departamento aumentou,

passando de 22.752 para 26.766, o que dá uma média de 811 citações por docente (Figura

7). O avanço do número de citações, contudo deve ser compreendido como também devido

ao aprimoramento na busca ao conjunto de trabalhos de um dado docente. Também

podemos detectar um aumento no valor do “H” médio do departamento que passou de 12,2

em 2013 para 13,2 em 2014 (Figura 8). A maior ênfase observada na publicação de artigos

em revistas de maior impacto deve refletir em melhora futura no número de citações e no

índice “H” médio do Departamento de Microbiologia.

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Figura 7 – Evolução das citações das publicações.

Figura 8 – Evolução do Índice H dos docentes.

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O Departamento tem participado de vários projetos em redes temáticas de iniciativa

das agências governamentais, bem como projetos com o setor privado, através de parcerias

com as agências de fomento. Dentre os projetos deste tipo, destacamos os mais atuais:

1. Auxílio Pesquisa - Chamada Nº 30/2013 MCTI/CNPq/CT-Biotec. Coordenador: Welington Luiz de

Araújo

2. CNPq/INCT de Vacinas. Coordenador: Ricardo Gazinelli. Participação Luis Carlos de Souza

Ferreira (abril de 2009 a março de 2015).

3. Projeto CEPID/FAPESP: “Centro para o Estudo do Genoma Humano”, coordenado pela Dra.

Mayana Zatz, IB, USP, (2013/08028-1). Participação Carlos F.M. Menck

4. CNPq, Edital MCT/CNPq/CT-SAÚDE nº 57/2010 - Genética Clínica. Coordenador: Carlos F. M.

Menck

5. CAPES/MES- Cuba: (Univ. de La Havana, Cuba). Coordenador: Carlos F. M. Menck

6. CAPES/MES Cuba (Centro de Estudios de Biotecnología Industrial, Facultad de Ciencias

Naturales, Universidad de Oriente, Cuba). Coordenador: José Gregório Cabrera Gomez

7. Projeto Temático- FAPESP (Proc. # 2014/15982-6). Coordenação: Carlos F.M.Menck

8. Projeto Temático FAPESP (Proc. #2014/04046-8). Coordenação: Marilis V. Marques

9. Projeto Vale S.A. e BNDES em parceria com o Dr. Claudio Oller (Engenharia Química da Escola

Politécnica, USP). Participação: Dr. Benedito Correa

10. Projeto conjunto Faculdade de Saúde Pública (FSP USP), Secretaria de Saneamento e Recursos

Hídricos (São Paulo - Estado) e SABESP. Pesquisador responsável: Maria Helena Matte.

Participação Dolores Mehnert.

11. Rede de Pesquisa em Bioprodutos Financiamento: Petrobrás/ANP. Coordenador: José Gregório

Cabrera Gomez

12. Rede de Pesquisa Petroquímica Financiamento: Petrobrás/ANP Cooperação com COPPE/UFRJ.

Coordenador: Tito Livio Moitinho Alves (UFRJ). Participação: José Gregório Cabrera Gomez

13. Auxílio à pesquisa (PITE) FAPESP/GSK (processo 2012/50.362-3) Coordenador: Luís Carlos de

Souza Ferreira.

Finalmente, vale a pena destacar que durante o ano de 2014, os pesquisadores de

Departamento arrecadaram R$4.909.448,35 em novos projetos pela FAPESP (Figura 9),

mas também obtiveram apoio de agências federais (principalmente CNPq e CAPES) para

financiamento de suas pesquisas. Esses dados são importantes, pois indicam a capacidade

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desses pesquisadores de trazer recursos para a pesquisa na universidade. Porém, o dado

deve ser analisado com cautela pelas dificuldades em se obter um levantamento real em

várias das agências de financiamento do país, ou mesmo de empresas privadas, além de não

incluir recursos obtidos em projetos científicos realizados em colaboração e coordenados

em outras instituições.

Figura 9 – Captação de recursos FAPESP pelos docentes do Departamento.

Uma análise importante é a distribuição dos projetos FAPESP concedidos nos

últimos anos pelos docentes do Departamento. A Figura 10 mostra a evolução do número

de projetos pelos docentes. Observa-se que 15 docentes obtiveram um ou nenhum projeto

FAPESP no período de 2009 a 2014, e 17 docentes obtiveram dois ou mais projetos neste

período. Este resultado deve ser tomado com cautela, já que vários docentes adquirem

financiamento de outras fontes, como a iniciativa privada, e outros novos docentes ainda

não integravam o Departamento, sendo contratados após 2009. Entretanto, seria

interessante que mais docentes obtivessem financiamento da FAPESP, ficando como um

ponto para observação de sua evolução futura.

Page 15: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

15

Figura 10 – Distribuição de projetos FAPESP pelos docentes do Departamento.

A seguir apresentamos a lista das publicações de docentes do Departamento do ano

de 2014, seguido das cópias das primeiras páginas da maior parte dessas publicações.

Nestas, destacamos a publicação de artigos em revistas de alto impacto na área da Biologia

em geral e principalmente Microbiologia. Esperamos com isso contribuir com o processo

de melhora, sobretudo de qualidade dos trabalhos de pesquisa deste Departamento.

COORDENADORIA DE PESQUISA DO DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA.

0

2

4

6

8

10

0 1 2 3 4 5

me

ro d

e d

oce

nte

s

Número de projetos

Distribuição dos projetos FAPESP 2009-2014

Page 16: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

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Reunião Científica do Departamento Microbiologia 2014.

O Departamento de Microbiologia realiza a sua Reunião Científica há 14 anos

consecutivos, nas quais pesquisadores de destaque na área são convidados para apresentar

seus trabalhos, assim como são selecionados trabalhos de alunos (graduação e pós

graduação), pós doutorandos e funcionários entre aqueles que foram publicados no ano

anterior. Entre os trabalhos apresentados alguns recebem o prêmio Destaque em

Microbiologia do ano. Abaixo apresentamos o programa da reunião de 2014, assim como a

relação dos premiados.

XIII REUNIÃO CIENTÍFICA DO

DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA

11/12/2014

Anfiteatro 2, Ed. Biomédicas 2, anexo.

10:00 h Discussão aberta com Átila Iamarino: Acesso aberto e métricas alternativas:

quem é dono do nosso trabalho e como somos avaliados?

13:00 h Abertura: Pesquisa no Depto. de Microbiologia, ICB, USP

Prof. Marilis V. Marques - Depto. de Microbiologia

13:30 h Conferência:

Microrganismos Enteroinvasores

Prof. Dra. Marina Baquerizo Martinez

Presidente da Sociedade Brasileira de Microbiologia

15:00 h apresentação dos trabalhos Prêmio Destaque Pesquisa em Microbiologia –

2014:

Clarissa R. R. Rocha. Glutathione depletion sensitizes cisplatin- and temozolomide-

resistant glioma cells in vitro and in vivo. Cell Death and Disease. 5:e1505. 2014.

Caio C. M. Freire . Molecular Evolution of Zika Virus during Its Emergence in the 20th

Century. PLoS Neglected Tropical Diseases, 8(1):e2636. 2014.

Marcia R. Salvadori. Nickel oxide nanoparticles film produced by dead biomass of

filamentous fungus. Scientific Reports. 4, 6404, 2014.

16:00 h entrega dos prêmios e Coquetel

Page 17: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

17

XIII REUNIÃO CIENTÍFICA DO DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA –

11.12.2014

Prêmios Destaque em Publicação Científica 2014

DESTAQUE:

Clarissa R. R. Rocha:

Clarissa R. R. Rocha, C C M Garcia, D B Vieira, A Quinet, L C de Andrade-Lima, V

Munford, J E Belizário and C F M Menck. Glutathione depletion sensitizes cisplatin-

and temozolomide-resistant glioma cells in vitro and in vivo. Cell Death and Disease.

5:e1505. 2014.

Caio C. M. Freire:

Oumar Faye, Caio C. M. Freire, Atila Iamarino, Ousmane Faye, Juliana Velasco C.

de Oliveira, Mawlouth Diallo1, Paolo M. A. Zanotto, Amadou Alpha Sall. Molecular

Evolution of Zika Virus during Its Emergence in the 20th Century. PLoS Neglected

Tropical Diseases, 8(1):e2636. 2014.

Marcia Regina Salvadori:

Marcia Regina Salvadori, Nascimento, C. A. O. & Corrêa B. Nickel oxide nanoparticles

film produced by dead biomass of filamentous fungus. Scientific Reports. 4, 6404, 2014

PRÊMIOS - MENÇÃO HONROSA

ALUNOS DE PÓS GRADUAÇÃO:

1. ROBL, DIOGO; DELABONA, P.; MERGEL, C.M.; ROJAS, J.D.; COSTA, P.;

PIMENTEL, I.C; VICENTE, V.A.; PRADELLA, J. G.; PADILLA, G.. The capability of

endophytic fungi for production of hemicellulases and related enzymes. BMC

Biotechnology, v. 13, p. 94, 2013.

2. Vanessa Rodrigues Pegos, Jéssica Faria Nascimento, Tiago José Paschoal Sobreira,

Bianca Alves Pauletti, Adriana Paes-Leme, Andrea Balan Phosphate regulated proteins of

Page 18: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

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Xanthomonas citri subsp. citri: A proteomic approach. JOURNAL OF PROTEOMICS 108

(2014) 78 – 88.

PÓS DOCS:

1. Jansen de Araujo, Severino M. de Azevedo Junior, Nicolas Gaidet, Renata F.

Hurtado, David Walker, Luciano M. Thomazelli, Tatiana Ometto,Marina M. M. Seixas,

Roberta Rodrigues, Daniele B. Galindo, Adriana C. S. da Silva, Arlinea M. M. Rodrigues,

Leonardo L. Bomfim, Marcelo A. Mota, Maria E. Larrazabal, Joaquim O. Branco, Patricia

Serafini, Isaac S. Neto, John Franks, Richard J. Webby, Robert G. Webster, Edison L.

Durigon (2014). Avian Influenza Virus (H11N9) in Migratory Shorebirds Wintering in the

Amazon Region, Brazil. PLoS ONE 9(10): e110141.

2. Carla Torres Braconi, Daniel Mendes Pereira Ardisson-Arau´jo, Adriana Franco

Paes Leme, Juliana Velasco de Castro Oliveira, Bianca Alves Pauletti, Alejandra Garcia-

Maruniak, Bergmann Morais Ribeiro, James E. Maruniak and Paolo Marinho de Andrade

Zanotto. Proteomic analyses of baculovirus Anticarsia gemmatalis multiple

nucleopolyhedrovirus budded and occluded vírus. Journal of General Virology (2014), 95,

980–989.

3. Milene Tavares Batista, Renata D. Souza, Ewerton L. Ferreiraa, Rebekah Robinette,

Paula J. Crowleyb, Juliana F. Rodriguesa, L. Jeannine Bradyb, Luís C. S. Ferreira and Rita

C. C. Ferreira. Immunogenicity and in vitro and in vivo protective effects of antibodies

targeting a recombinant form of the Streptocccus mutans P1 surface protein. Infect Immun.

2014 Sep 15. pii: IAI.02074-14.

4. Jaime Henrique Amorim Santos; Rúbens P. S. Alves; Sílvia B. Boscardin; Luís

Carlos de Souza Ferreira. The dengue virus non-structural 1 protein: risks and benefits.

Virus Research, v181, p.53-60, 2014

5. Annabel Quinet, Vessoni AT2, Rocha CR3, Gottifredi V4, Biard D5, Sarasin A6,

Menck CF7, Stary A. Gap-filling and bypass at the replication fork are both active

mechanisms for tolerance of low-dose ultraviolet-induced DNA damage in the human

genome. DNA Repair (Amst). 2014 Feb;14:27-38.

6. Ricardo Ruiz Mazzon, Vânia Santos Braz, José Freire da Silva Neto, Marilis do

Valle Marques. Analysis of the Caulobacter crescentus Zur regulon reveals novel insights

in zinc acquisition by TonB-dependent outer membrane proteins. BMC Genomics. 2014;

15(1): 734.

7. Ellen Sayuri Ando-Suguimoto, da Silva MP, Kawamoto D, Chen C, DiRienzo JM,

Mayer MP. The cytolethal distending toxin of Aggregatibacter actinomycetemcomitans

inhibits macrophage phagocytosis and subverts cytokine production. Cytokine. 2014

Mar;66(1):46-53.

Page 19: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

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8. Priscila Larcher Longo, Nunes AC, Umeda JE, Mayer MP. Gene expression and

phenotypic traits of Aggregatibacter actinomycetemcomitans in response to environmental

changes. J Periodontal Res. 2013 Dec;48(6):766-72.

FUNCIONÁRIOS:

1. Jansen de Araujo, Severino M. de Azevedo Junior, Nicolas Gaidet, Renata F.

Hurtado, David Walker, Luciano M. Thomazelli, Tatiana Ometto,Marina M. M. Seixas,

Roberta Rodrigues, Daniele B. Galindo, Adriana C. S. da Silva, Arlinea M. M. Rodrigues,

Leonardo L. Bomfim, Marcelo A. Mota, Maria E. Larrazabal, Joaquim O. Branco, Patricia

Serafini, Isaac S. Neto, John Franks, Richard J. Webby, Robert G. Webster, Edison L.

Durigon (2014). Avian Influenza Virus (H11N9) in Migratory Shorebirds Wintering in the

Amazon Region, Brazil. PLoS ONE 9(10): e110141.

2. MENCK, C.; MUNFORD, VERIDIANA. DNA repair diseases: What to they tell us

about cancer and aging?. Genetics and Molecular Biology, v. 37, p. 220-233, 2014

Page 20: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

20

DOCENTES NA ATIVA DO DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA

1. ANDREA BALAN FERNANDES

2. ARMANDO MORAIS VENTURA

3. BENEDITO CORRÊA

4. BENY SPIRA

5. CARLOS FREDERICO MARTINS MENCK

6. CARLOS PELLESCHI TABORDA

7. CHARLOTTE MARIANNA HÁRSI

8. CRISTIANE RODRIGO GUZZO CARVALHO

9. DOLORES URSULA MEHNERT

10. EDISON LUIZ DURIGON

11. ELISABETE JOSÉ VICENTE

12. ENRIQUE MARIO BOCCARDO PIERULIVO

13. GABRIEL PADILLA MALDONADO

14. IRMA NELLY GUTIERREZ RIVERA

15. JORGE TIMENETSKY

16. JOSÉ GREGORIO CABRERA GOMES

17. KELLY ISHIDA

18. LUÍS CARLOS DE SOUZA FERREIRA

19. LUIZIANA FERREIRA DA SILVA

20. MARCIA PINTO ALVES MAYER

21. MARCIO VINICIUS BERTACINE DIAS

22. MARIA REGINA LORENZETTI SIMIONATO

23. MARILIS DO VALLE MARQUES

24. MARIO JULIO AVILA CAMPOS

25. MARIO HENRIQUE DE BARROS

26. NILTON ERBET LINCOPAN HUENUMAN

27. PAOLO MARINHO DE ANDRADE ZANOTTO

28. RENÉ PETER SCHNEIDER – Transferido para EP/USP em 28.11.2014

29. RITA DE CÁSSIA CAFÉ FERREIRA

30. ROBSON FRANCISCO DE SOUZA

31. RODRIGO DA SILVA GALHARDO

32. SILVANA CAI

33. WELINGTON LUIZ DE ARAÚJO

DOCENTES APOSENTADOS COM TERMO DE ADESÃO - PROGRAMA

PROFESSOR SÊNIOR

1. ANA CLARA GUERRINI SCHENBERG

2. ANTONIO FERNANDO PESTANA DE CASTRO – Encerrado em 25.9.2014

3. HELOIZA RAMOS BARBOSA

4. MARIA LIGIA COUTINHO CARVALHAL

5. SERGIO OLAVO PINTO DA COSTA

Page 21: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

21

TÉCNICOS DE NÍVEL BÁSICO

1. ALEXANDRE APARECIDO ALVES

2. ARICELMA PINHEIRO DE FRANÇA

3. CAROLINA BERTELLI DE SOUZA FERREIRA

4. CARLOS AUGUSTO DA SILVA

5. CLAUDIA DE SOUSA CAETANO

6. EDUARDO GIMENES MARTINS

7. ELAINE CRISTINA ALVES COSTA

8. ELAINE DE FÁTIMA DOS SANTOS

9. JOSÉ GOMES DOS SANTOS FILHO

10. LEONOR APARECIDA GABRIELA FERNANDES

11. LUÍS CONSTANTINO SALES

12. MARCIA HARUMI FUKUGAITI

13. MARIA HELENA DE OLIVEIRA

14. MARIA NORMANDIA LIMA

15. VALDINO MENDES DE SOUZA

TÉCNICOS DE NÍVEL MÉDIO

1. ADOLFO TADEU BARBOSA

2. ALINE CAROLINA DA COSTA LEMOS

3. ANDEMIR DA SILVA

4. JOÃO PAULO RIBEIRO

5. JOSÉ MARIA LOPES

6. LEO BATISTA CRUZ

7. MARIA JACINTA DE FARIA

8. MARCO AURÉLIO FLORIANO PIANTOLA

9. SHIRLEI APARECIDA VIEIRA MARQUES

10. ZITA MARIA DE OLIVEIRA GREGÓRIO

ESPECIALISTAS DE NÍVEL SUPERIOR (6)

1. IRIS TAKAKO MORIBE

2. LEANDRO MAZZA GARRIDO

3. LUCIANO MATSUMIYA THOMAZELLI

4. TATIANA ALVES DOS REIS

5. TELMA ALVES MONEZI

6. VERIDIANA MUNFORD

TÉCNICOS ADMINISTRATIVOS (4)

1. ANA ISABEL FERRAZ

2. CACIARA CRISTIANE BARBOSA

3. GISELE DA GRAÇA SANTANA

4. NAÍDE RODRIGUES FARRIPAS

Page 22: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

22

PÓS DOUTORANDOS CADASTRADOS EM 2014

1. ALESSANDRA LUIZA PELEGRINI

2. ALEXANDRE PEREIRA

3. ANA LETÍCIA GORI LUSA

4. ANGÉLICA CRISTINE DE ALMEIDA CAMPOS

5. ANNABEL QUINET DE ANDRADE

6. ARIANNE COSTA BAQUIÃO

7. ARIEL EURIDES STELLA

8. ATILA IAMARINO

9. BRUNO BUENO SILVA

10. CARINA BUZZO DE LIMA

11. CARLA TORRES BRACONI

12. CAROLINA ANTUNES DO PRADO TAVARES DA SILVA

13. DAIENE DE SOUZA SANTOS

14. DANIELA DIB GONÇALVES

15. DIONE KAWAMOTO

16. DOMINGOS ALEXANDRE CICCONE BOTTE

17. ELIANE GONÇALVES DA SILVA

18. ELLEN SAYURI ANDO

19. ESTELA YNÉS VALENCIA MORANTE

20. GARDÊNIA MARCIA SILVA CAMPOS MATA

21. GLAUCE MARY GOMES RITTNER

22. HUMA ASIF

23. JAIME HENRIQUE AMORIM SANTOS

24. JANSEN DE ARAÚJO

25. JOHANNA KATHERINE BOCANEGRA RODRIGUEZ

26. JULIÁN ESTEBAN MUÑOZ HENAO

27. JULIANA FALCÃO RODRIGUES

28. KAREL OLAVARRIA GAMEZ

29. LAIS TEIXEIRA HELENA

30. LARISSA GOMES DA SILVA

31. LUCAS MIRANDA MARQUES

32. LUCIANA KAZUE OTUTUMI

33. LUCIANA RODRIGUES GOMES

34. LUIZ GUSTAVO BETIM GÓES

35. MANUELLA NÓBREGA DOURADO RIBEIRO

36. MARCIA REGINA SALVADORI

37. MARIANA DE OLIVEIRA DINIZ

38. MARIANA DOPRADO

39. MILENE TAVARES BATISTA

40. PATRÍCIA REGINA NEVES

41. PATRÍCIA ZORZETE

42. PRISCILA LARCHER LONGO

43. RAFAEL DE OLIVEIRA ANDRETTI

44. RAQUEL BRAGHINI

Page 23: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

23

45. RICARDO RUIZ MAZZON

46. ROSA ESTELA CASEIRA CABRAL

47. RODRIGUES SOARES FORTUNATO

48. TATIANA OMETTO

49. VIVIANE NAKANO

JOVENS PESQUISADORES (1)

MARILDA KEICO TACIRO

Page 24: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

24

PRODUÇÃO INTELECTUAL DO CORPO DOCENTE

DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA - INSTITUTO DE CIÊNCIAS

BIOMÉDICAS - ICB

2014

ARTIGOS PUBLICADOS COM FATOR DE IMPACTO – ISI

1) Pegos VR, Medrano FJ, Balan A. Crystallization and preliminary X-ray diffraction

analysis of the phosphate-binding protein PhoX from Xanthomonas citri. Acta

Crystallogr F Struct Biol Commun. 2014 Dec 1;70(Pt 12):1604-7.

IF: 0.527

2) Pegos VR, Nascimento JF, Sobreira TJ, Pauletti BA, Paes-Leme A, Balan A.

Phosphate regulated proteins of Xanthomonas citri subsp. citri: a proteomic

approach. J Proteomics. 2014 Aug 28;108:78-88.

IF: 3.888

3) Medrano FJ, de Souza CS, Romero A, Balan A. Structure determination of a

sugar-binding protein from the phytopathogenic bacterium Xanthomonas citri. Acta

Crystallogr F Struct Biol Commun. 2014 May;70(Pt 5):564-71. doi:

10.1107/S2053230X14006578. Epub 2014 Apr 17.

IF: 0527

4) Pasqualoto KF, Balan A, Barreto SA, Simons SM, Chudzinski-Tavassi AM.

Structural findings and molecular modeling approach of a TFPI-like inhibitor.

Protein Pept Lett. 2014 May;21(5):452-7.

IF: 1.608

5) Medina-Armenteros Y, Farinha-Arcieri LE, Braga CJ, Carromeu C, Tamura

RE, Ventura AM. Mapping of CD8 T cell epitopes in human respiratory syncytial

virus L protein. Intervirology, 57 (2): 55-64, 2014.

FI: 1.683

6) Rodrigues D, Farinha-Arcieri LE, Ventura AM, Chura-Chambi RM, Malavasi NV,

Lemke LS, Guimarães JS, Ho PL, Morganti L. Effect of pressure on refolding of

recombinant pentameric cholera toxin B. Journal of Biotechnology, 173: 98-105,

2014.

FI: 2.871

7) Reis TA, Baquião AC, Atayde DD, Grabarz F, Corrêa B. Characterization of

Aspergillus section Flavi isolated from organic Brazil nuts using a

polyphasicapproach. Food Microbiology, 42: 34-9, 2014.

FI: 3.331

8) Salvadori MR, Ando RA, Nascimento CAO, Corrêa B. Intracellular biosynthesis

and removal of copper nanoparticles by dead biomass of yeast isolated from the

wastewater of a mine in the Brazilian Amazonia. Plos One, 9 (1): e87968, 2014.

Page 25: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

25

FI: 3.234

9) Rocha LO, Tralamazza SM, Reis GM1, Rabinovitch L, Barbosa CB, Corrêa B.

Multimethod approach for characterizing the interaction between Fusarium verticilli

oides and Bacillus thuringiensis subsp. Kurstaki. Plos One, 9 (4): e92189, 2014.

FI: 3.234

10) Salvadori MR, Nascimento CA, Corrêa B. Nickel oxide nanoparticles film

produced by dead biomass of filamentous fungus. Scientific Reports, 4: 6404,

2014.

FI: 5.578

11) Galbiati HF, Taschner NP, Spira B. The effect of the rpoSam allele on gene

expression and stress resistance in Escherichia coli. Archives of Microbiology, 196

(8): 589-600, 2014.

FI: 1.667

12) Spira B, Ferreira GM, Almeida LG. relA enhances the adherence of

enteropathogenic Eschericia coli. Plos One, 9 (3): e91703, 2014.

FI: 3.234

13) Menck CF, Munford V. DNA repair diseases: what do they tell us about cancer

and aging? Genetics and Molecular Biology, 37 (Supl 1): 220-33, 2014.

FI: 1.202

14) Rocha CR, Garcia CC, Vieira DB, Quinet A, de Andrade-Lima LC, Munford V,

Belizário JE, Menck CF. Glutathione depletion sensitizes cisplatin- and

temozolomide-resistant glioma cells in vitro and in vivo. Cell Death & Disease, 5:

e1505, 2014.

FI: 5.014

15) Quinet A, Vessoni AT, Rocha CR, Gottifredi V, Biard D, Sarasin A, Menck CF,

Stary A. Gap-filling and bypass at the replication fork are both active mechanisms

for tolerance of low-dose ultraviolet-induced DNA damage in the human genome.

DNA Repair, 14: 27-38, 2014.

FI: 3.111

16) Schuch, AP, Moraes MCS, Yagura T, Menck CFM. Highly sensitive biological

assay for determining the photoprotective efficacy of sunscreen. Environmental

Science & Technology, 48 (19): 11584-90, 2014.

FI: 5.330

17) Faintuch BL, Oliveira EA, Munõz JE, Travassos LR, Taborda CP. Radiochemical

pharmacokinetic profile of P10 peptide with antifungal properties. Medical

Mycology, 52 (5): 545-51, 2014.

FI: 2.335

Page 26: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

26

18) Thomaz L, Nosanchuk JD, Rossi DC, Travassos LR, Taborda CP. Monoclonal

antibodies to heat shock protein 60 induce a protective immune response against

experimental Paracoccidioides lutzii. Microbes and Infection, 16 (9): 788-95, 2014.

FI: 2.861

19) Muñoz JE, Luft VD, Amorim J, Magalhães A, Thomaz L, Nosanchuk JD,

Travassos LR, Taborda CP. Immunization with P10 peptide increases specific

immunity and protects immunosuppressed BALB/c mice infected with virulent

yeasts of Paracoccidioides brasiliensis. Mycopathologia, 178 (3-4): 177-88, 2014.

FI: 1.528

20) Vidal MS, Del Negro GM1, Vicentini AP, Svidzinski TI, Mendes-Giannini

MJ, Almeida AM, Martinez R, de Camargo ZP, Taborda CP, Benard G.

Serological diagnosis of paracoccidioidomycosis: high rate of inter-laboratorial

variability among medical mycology reference centers. Plos Neglected Tropical

Diseases, 8 (9): e3174, 2014

FI: 4.446

21) Lorenzon-Ojea AR, Caldeira W, Ribeiro AF, Fisher SJ, Guzzo CR, Bevilacqua E.

Stromal cell derived factor-2 (Sdf2): a novel protein expressed in mouse.

International Journal of Biochemistry & Cell Biology, 53: 262-70, 2014.

FI: 4.046

22) Dunger G, Guzzo CR, Andrade MO, Jones JB, Farah CS. Xanthomonas citri

subsp. citri type IV Pilus is required for twitchingmotility, biofilm development,

and adherence. Molecular Plant-Microbe Interactions , 27 (10): 1132-47, 2014.

FI: 3.944

23) Schwind JS, Goldstein T, Thomas K, Mazet JAK, Smith WA, PREDICT

Consortium. Capacity building efforts and perceptions for wildlife surveillance to

detect zoonotic pathogens: comparing stakeholder perspectives. BMC Public

Health, 14: 108, 2014.

FI: 2.264

24) Ferone EA, Berezin EN, Durigon GS, Finelli C, Felício MC, Storni JG, Durigon

EL, Oliveira DB. Clinical and epidemiological aspects related to the detection of

adenovirusor respiratory syncytial virus in infants hospitalized for acute lower

respiratory tract infection. Jornal de Pediatria, 90 (1): 42-9, 2014.

FI: 1.194

25) Dominguez SR, Shrivastava S,Berglund A, Qian Z, Góes LG, Halpin RA, Fedorova

N, Ransier A, Weston PA, Durigon EL, Jerez JA, Robinson CC, Town CD,

Holmes KV. Isolation, propagation, genome analysis and epidemiology of HKU1

betacoronaviruses. Journal of General Virology, 95 (PT 4): 836-48, 2014.

FI: 3.183

Page 27: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

27

26) Araujo, DB, Martorelli LA, Kataoka AP, Campos AC, Rodrigues CS, Sanfilippo

LF, Cunha ES, Durigon, EL,Favoretto SR. Antibodies to rabies virus in terrestrial

wild mammals in native rainforest on the north coast of São Paulo State, Brazil.

Journal of Wildlife Diseases, 50 (3): 469-77, 2014.

FI: 1.355

27) De Araujo J, de Azevedo SM Jr, Gaidet N, Hurtado RF, Walker D4, Thomazelli

LM1, Ometto T, Seixas MM, Rodrigues R, Galindo DB, da Silva AC, Rodrigues

AM, Bomfim LL, Mota MA, Larrazábal ME,Branco JO, Serafini P, Neto IS, Franks

J, Webby RJ, Webster RG, Durigon EL. Avian influenza virus (H11N9)

in migratory shorebirds wintering in the Amazon Region, Brazil. Plos One, 9 (10):

e110141, 2014.

FI: 3.234.

28) Pinheiro C, Garcia EA, Morais-Santos F, Scapulatempo-Neto C, Mafra

A, Steenbergen RD, Boccardo E, Villa LL,Baltazar F, Longatto-Filho A. Lactate

transporters and vascular factors in HPV-induced squamous cellcarcinoma of

the uterine cervix. BMC Cancer, 14: 751, 2014.

FI: 3.362

29) Stone SC, Rossetti RA, Bolpetti A, Boccardo E, Souza PS, Lepique AP. HPV16-

associated tumors control myeloid cell homeostasis in lymphoidorgans, generating a

suppressor environment for T cells. Journal of Leukocyte Biology, 96 (4): 619-31,

2014.

FI: 4.289

30) da Rosa MR, Falcão AS, Fuzii HT, da Silva Kataoka MS, Ribeiro AL, Boccardo

E, de Siqueira AS, Jaeger RG, de Jesus Viana Pinheiro J, de Melo Alves Júnior S.

EGFR signaling downstream of EGF regulates migration, invasion, and MMP

secretion of immortalized cells derived from human ameloblastoma. Tumour

Biology, 35 (11): 11107-20, 2014.

FI: 3.611

31) De Almeida JB, de Carvalho SP, de Almeida AL, Campos GB, Oliveira

MV, Timenetsky J, Marques LM. Detection, antibiotic resistance, and

pathogenicity of staphylococci insamples from a Brazilian human milk bank.

Breastfeeding Medicine, 9 (10): 557-8, 2014.

FI: 1.248

32) Burgher Y, Miranda L, Rodriguez-Roche R, de Almeida Campos AC, Lobo E,

Neves T, Martínez O, Timenetsky J. Ureaplasma diversum in pneumonic lungs of

swine. Infection, Genetics and Evolution, 21: 486-88, 2014.

FI: 3.015

33) Guimaraes AM, Santos AP, Timenetsky J, Bower LP, Strait E, Messick JB.

Identification of Mycoplasma suis antigens and development of a

Page 28: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

28

multiplexmicrobead immunoassay. Journal of Veterinary Diagnostic Investigation,

26 (2): 203-12, 2014.

FI: 1.353

34) 32) Guimaraes AM, Santos AP, do Nascimento NC, Timenetsky J, Messick JB.

Comparative genomics and phylogenomics of hemotrophic mycoplasmas. Plos

One, 9 (3): e91445, 2014.

FI: 3.234

35) Oliveira PS, Souza SG, Campos GB, da Silva DC, Sousa DS, Araújo SP, Ferreira

LP, Santos VM, Amorim AT, Santos AM, Timenetsky J, Cruz MP, Yatsuda R,

Marques LM. Isolation, pathogenicity and disinfection of Staphylococcus aureus

carried by insects in two public hospitals of Vitória da Conquista, Bahia, Brazil.

The Brazilian Journal of Infectious Diseases, 18 (2): 126-36, 2014.

Fi: 1.299

36) Amorim A, Marques L, Santos AM, Martins H, Barbosa M, Rezende I, Andrade E,

Campos G, Lobão T, Cortez B, Monezi T, Machado-Santelli G, Timenetsky J.

Apoptosis in Hep-2 cells infected with ureaplasma diversum. Biological Research,

47 (1): 38, 2014

FI: 1.408

37) Ishida K, Cipriano TF, Rocha GM, Weissmüller G, Gomes F, Miranda K, Rozental

S. Silver nanoparticle production by the fungus Fusarium oxysporum: nanoparticle

characterization and analysis of antifungal activity against pathogenic yeasts.

Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, 109 (2): 220-8, 2014.

FI: 1.592

38) Alves RPS, Yang MJ, Batista MT, Ferreira LCS. Alzheimer’s disease: is a

vaccine possible?. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, 47 (6):

438-44, 2014.

FI: 1.006

39) Batista MT, Souza RD, Ferreira EL, Robinette R, Crowley PJ, Rodrigues JF, Brady

LJ, Ferreira LC, Ferreira RC. Immunogenicity and in vitro and in vivo protective

effects of antibodies targeting a recombinant form of the Streptococcus mutans P1

surface protein. Infect Immun., 82(12):4978‐88, 2014.

FI: 3.731

40) Nizard M, Diniz MO, Roussel H, Tran T, Ferreira LC, Badoual C, Tartour E.

Mucosal vaccines: novel strategies and applications for the control of pathogens and

tumors at mucosal sites. Hum Vaccin Immunother, 10(8):2175‐87, 2014.

FI: 2.366

41) Diniz, M.O., F.A.M.Cariri, L.R.M.M.Aps, and L.C.S.Ferreira (2013). Enhanced

therapeutic effects conferred by an experimental DNA vaccine targeting human

papillomavirus-induced tumors. Human Gene Therapy, 24:861-870.

Fi: 3.755

Page 29: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

29

42) Souza RD de, Batista MT, Luiz WB, Cavalcante RCM, Amorim JH, Bizerra RSP,

Martins EG, Ferreira LCS. Bacillus subtilis Spores as Vaccine Adjuvants: Further

Insights into the Mechanisms of Action. Plos One, 9 (1): e87454, 2014.

FI: 3.234

43) Hu JC, Mathias-Santos C, Greene CJ1, King-Lyons ND, Rodrigues

JF, Hajishengallis G, Ferreira LC, Connell TD. Intradermal administration of

the Type II heat-labile enterotoxins LT-IIb andLT-IIc of enterotoxigenic

Escherichia coli enhances humoral and CD8+ Tcell immunity to a co-administered

antigen. Plos One, 9 (12): e113978, 2014.

FI: 3.234

44) Amorim JH, Alves RP, Boscardin SB, Ferreira LC. The dengue virus non-

structural 1 protein: risks and benefits. Virus Research, 181C: 53-60, 2014.

FI: 2.324

45) Melo, F.M., C.J. M. Braga, F.V. Pereira, J.T. Maricato, C.S.T. Origassa, M.F.

Souza, A.C. Melo, P. Silva, S.L. Tomaz, K.P. Gimenes,

J.A.B. Scutti, M.A. Juliano,

D.S. Zamboni, N.O. Câmara, L.R. Travassos, L.C.S.Ferreira and E.G. Rodrigues.

(2014) Anti-metastatic immunotherapy based on mucosal administration of

flagellin and immunomodulatory P10. Anti-metastatic immunotherapy based on

mucosal administration of flagellin and immunomodulatory P10. Immunology and

Cell Biology, v. 93, p. 86-98.

FI: 4.147

46) Tavares Batista M, Souza RD, Paccez JD, Luiz WB, Ferreira EL, Cavalcante

RC, Ferreira RC, Ferreira LC. Gut adhesive Bacillus subtilis spores as a platform

for mucosal delivery ofantigens. Infection and Immunity, 82 (4): 1414-23, 2014.

FI: 3.731

47) Silva LF, Taciro MK, Raicher G, Piccoli RA, Mendonça TT, Lopes MS, Gomez

JG. Perspectives on the production of polyhydroxyalkanoates in biorefineries

associated with the production of sugar and ethanol. International Journal of

Biological Macromolecules, 71: 2-7, 2014.

FI: 2.858

48) Lopes MS, Gomez JG, Taciro MK, Mendonça TT, Silva LF.

Polyhydroxyalkanoate biosynthesis and simultaneous remotion of organicinhibitors

from sugarcane bagasse hydrolysate by Burkholderia sp. Journal of Industrial

Microbiology & Biotechnology, 41 (9): 1353-63, 2014.

FI: 2.439

49) Ando-Suguimoto ES, da Silva MP, Kawamoto D, Chen C, Dirienzo JM, Mayer

MP. The cytolethal distending toxin of Aggregatibacter actinomycetemcomitans

inhibits macrophage phagocytosis and subverts cytokine production. Cytokine, 66

(1): 46-53, 2014.

Page 30: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

30

FI: 2.664

50) Longo PL, Artese HP, Rabelo MS, Kawamoto D, Foz AM, Romito GA, Dib

SA, Mayer MP. Serum levels of inflammatory markers in type 2 diabetes patients

with chronic periodontitis. Journal of Applied Oral Science, 22 (2): 103-8, 2014.

FI: 0.923

51) Saraiva L, Rebeis ES, Martins Ede S, Sekiguchi RT, Ando-Suguimoto ES, Mafra

CE, Holzhausen M,Romito GA, Mayer MP. IgG sera levels against a subset of

periodontopathogens and severity of disease in aggressive periodontitis patients: a

cross-sectional study of selected pocket sites. Journal of Clinical Periodontology,

41 (10): 943-51, 2014.

FI: 4.010

52) Calandrini CA, Ribeiro AC, Gonnelli AC, Ota-Tsuzuki C, Rangel LP, Saba-Chujfi

E, Mayer MP. Microbial composition of atherosclerotic plaques. Oral diseases, 20

(3): 128-34, 2014.

FI: 2.427

53) Bedran TB, Mayer MP, Spolidorio DP, Grenier D. Synergistic anti-inflammatory

activity of the antimicrobial peptides humanbeta-defensin-3 (hBD-3) and

cathelicidin (LL-37) in a three-dimensional co-culture model of gingival epithelial

cells and fibroblasts. Plos One, 9 (9): e106766, 2014.

FI: 3.234

54) Tanaka MH, Rodrigues TO, Finoti LS, Teixeira SR, Mayer MP, Scarel‐Caminaga

RM, Giro EM. The effect of conventional mechanical periodontal treatment on red

complex microorganisms and clinical parameters in Down syndrome periodontitis

patients: a pilot study. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 601-8, 2014.

FI: 2.668

55) Durso SC, Vieira LM, Cruz JN, Azevedo CS, Rodrigues PH, Simionato MR.

Sucrose substitutes affect the cariogenic potential of Streptococcus mutans biofilms.

Caries Research, 48 (3): 214-22, 2014.

FI: 2.281

56) Teixeira SR, D'Epiro TT, Pinheiro ET, Simionato MR, Taniwaki NN, Kisielius JJ,

Mayer MP. Lineage variability in surface components expression within

Porphyromonas gingivalis. Microbial Pathogenesis, 77: 100-4, 2014.

FI: 1.794

57) DIAS, MARCIO VINICIUS BERTACINE ; TYRAKIS, PETROS ;

DOMINGUES, ROMENIA RAMOS ; LEME, ADRIANA FRANCO PAES ;

BLUNDELL, TOM L. . Mycobacterium tuberculosis Dihydrofolate Reductase

Reveals Two Conformational States and a Possible Low Affinity Mechanism to

Antifolate Drugs. Structure (London), v. 22, p. 94-103, 2014.

FI: 5.618

Page 31: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

31

58) Mazzon RR, Braz VS, da Silva Neto JF, do Valle Marques M. Analysis of the

Caulobacter crescentus Zur regulon reveals novel insightsin zinc

acquisition by TonB-dependent outer membrane proteins. BMC Genomics, 15:

734, 2014.

FI: 3.986

59) Llanco LA, Nakano V, Avila-Campos MJ. Sialidase production and genetic

diversity in Clostridium perfringens typeA isolated from chicken with necrotic

enteritis in Brazil. Current Microbiology, 70 (3): 330-7, 2014.

FI: 1.423

60) Borgo PV, Rodrigues VAA, Feitosa ACR, Xavier KCB, Avila-Campos MJ.

Association between periodontal condition and subgingival microbiota in women

during pregnancy: a longitudinal study. Journal of Applied Oral Science. 22: 528-

533, 2014.

FI: 0.923

61) Fabris AS, Nakano V, Avila-Campos MJ. Bacteriological analysis of necrotic

pulp and fistulae in primary teeth. Journal of Applied Oral Science, 22 (2): 118-24,

2014.

FI: 0.923

62) De Aquino SG, Abdollahi-Roodsaz S, Koenders MI, van de Loo FA, Pruijn GJ,

Marijnissen RJ, Walgreen B, Helsen MM, van den Bersselaar LA, de Molon RS,

Avila Campos MJ, Cunha FQ, Cirelli JA, van den Berg WB. Periodontal

pathogens directly promote autoimmune experimental arthritisby inducing a TLR2-

and IL-1-driven Th17 response. Journal of Immunology, 192 (9): 4103-11, 2014.

FI: 4.922

63) De Molon RS, de Avila ED, Boas Nogueira AV, Chaves de Souza JA, Avila-

Campos MJ, de Andrade CR, Cirelli JA. Evaluation of the host response in

various models of induced periodontal disease in mice. Journal of Periodontology,

85 (3): 465-77, 2014.

FI: 2.706

64) Pérez-Chaparro PJ1, Cerdeira LT, Queiroz MG, de Lima CP, Levy CE, Pavez M,

Lincopan N, Gonçalves EC, Mamizuka EM, Sampaio JL, Nunes MR, McCulloch

JA. Complete nucleotide sequences of two blaKPC-2-bearing IncN plasmids

isolated from sequence type 442 Klebsiella pneumoniae clinical strains

four years apart. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 58 (5): 2958-60, 2014.

FI: 4.476

65) De Almeida LM, de Araújo MR, Iwasaki MF, Sacramento AG, Rocha D, da Silva

LP, Pavez M, de Brito AC,Ito LC, Gales AC, Lincopan N, Sampaio JL, Mamizuka

EM. Linezolid resistance in vancomycin-resistant Enterococcus faecalis and

Enterococcus faecium isolates in a Brazilian hospital. Antimicrobial Agents and

Chemotherapy, 58 (5): 2993-4, 2014.

Page 32: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

32

FI: 4.476

66) Aizawa J, Neuwirt N, Barbato L, Neves PR, Leigue L, Padilha J, Pestana de Castro

AF, Gregory L, Lincopan N. Identification of fluoroquinolone-resistant extended-

spectrum β-lactamase (CTX-M-8)-producing Escherichia coli ST224, ST2179 and

ST2308 in buffalo(Bubalus bubalis). Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 69

(10): 2866-9, 2014.

FI: 5.313

67) Oliveira S, Moura RA, Silva KC, Pavez M, McCulloch JA, Dropa M, Matté MH,

Mamizuka EM, Sato MI, Pestana de Castro AF, Lincopan, N. Isolation of KPC-2-

producing Klebsiella pneumoniae strains belonging to the high-risk multiresistant

clonal complex 11 (ST437 and ST340) in urban rivers. J Antimicrob Chemother.

2014 Mar;69(3):849-52. doi: 10.1093/jac/dkt431.

FI: 5.313

68) Faye O, Ba H, Ba Y, Freire CC, Faye O, Ndiaye O, Elgady IO, Zanotto PM, Diallo

M, Sall AA. Reemergence of Rift Valley fever, Mauritania, 2010. Emerging

Infectious Diseases, 20 (2): 300-3, 2014.

FI: 6.751

69) 63) Faye O, Freire CC, Iamarino A, Faye O, de Oliveira JV, Diallo M, Zanotto

PM, Sall AA. Molecular evolution of Zika virus during its emergence in the 20(th)

century. Plos Neglected Tropical Diseases, 8 (1): e2636, 2014.

FI: 4.446

70) Villabona-Arenas CJ, de Oliveira JL, Capra Cde S, Balarini K, Loureiro M,

Fonseca CR, Passos SD, Zanotto PM. Detection of four dengue serotypes suggests

rise in hyperendemicity in urban centers of Brazil. Plos Neglected Tropical

Diseases, 8 (2): e2620, 2014.

FI: 4.446

71) Paola ND, Zanotto PM. Where there is no overlap, there is a gap. Revista da

Sociedade Brasileira de Medicina Tropical, 1: 675-6, 2014.

FI: 0.977

72) Braconi, C. T. ; ARDISSON‐ARAUJO, D. M. P. ; LEME, A. F. P. ; OLIVEIRA, J.

V. D. C. ; PAULETTI, B. A. ; GARCIA‐MARUNIAK, A. ; RIBEIRO, B. M. ;

MARUNIAK, J. E. ; Zanotto, P. M. A. . Proteomic analyses of baculovirus

Anticarsia gemmatalis multiple nucleopolyhedrovirus budded and occluded virus

and associated host cell proteins. Journal of General Virology, v. 10.109, p. 980-9,

2014.

FI: 3.183

73) Iyer LM, Zhang D, de Souza RF, Pukkila PJ, Rao A, Aravind L. Lineage-specific

expansions of TET/JBP genes and a new class of DNA transposons shape fungal

Page 33: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

33

genomic and epigenetic landscapes. Proceedings of the National Academy of

Sciences of the United States of America, 111 (5):1676-83, 2014.

FI: 9.674

74) Caravieria F A, AJ Ferreira, Ferreira A, Clivatia D, De Miranda VFO, Araújo W

L. Bacterial community associated with traps of the carnivorous plants Utricularia

hydrocarpa and Genlisea filiformis. Aquatic Botany, 116: 8-12, 2014.

FI: 1.608

75) Quecine MC, Araújo WL, Tsui S, Parra JR, Azevedo JL, Pizzirani-Kleiner AA.

Control of Diatraea saccharalis by the endophytic Pantoea agglomerans 33.1

expressing cry1Ac7. Archives of Microbiology, 196 (4): 227-34, 2014.

FI: 1.667

ARTIGOS PUBLICADOS SEM FATOR DE IMPACTO

1) Pegos VR, Canevarolo RR, Sampaio AP, Balan A, Zeri AC. Xanthan Gum

Removal for 1H-NMR Analysis of the Intracellular Metabolome of the Bacteria

Xanthomonas axonopodis pv. citri 306. Metabolites. 2014 Apr 22;4(2):218-31.

2) Braga CJ, Rodrigues JF, Medina-Armenteros Y, Farinha-Arcieri LE, Ventura AM,

Boscardin SB, Sbrogio-Almeida ME, Ferreira LC. Parenteral adjuvant effects of

an enterotoxigenic Escherichia coli natural heat-labile toxin variant. Frontiers in

Immunology, 4 (487): 1-10, 2014

3) Rojas JD, Starcevic A, Baranas̆ić D, Ferreira-Torres MA, Contreras CA, Garrido

LM, Araújo WL, de Souza RF, Zucko J, Hranueli D, Long PF, Cullum J, Padilla

G. Genome sequence of Streptomyces olindensis DAUFPE 5622, producer of the

antitumoral anthracycline cosmomycin D. Genome Announcements, 2 (3): e00541-

14, 2014.

4) Arruda-Neto JD, Segreto HR, Gomez JG, Silva LF, Jorge SA, Mendonca TT, Nieto

L , Cavalcante GT, Rodrigues TE, Righi H , Prado GR, Genofre GC. Radio

sensitization bystatic electric fields is observed in the extremophilic Deinococcus

Radiodurans exposed to gamma radiation. Webmed Central Plus BIOPHYSICS, 5

(9): WMCPLS00385 (1-10), 2014.

5) Lee DP, Espejo-Trung LC, Simionato MRL, DE Alves FA , Novelli MD, De

Cerqueira MAA. The effects of ionizing radiation on the development of human

caries lesions in vitro. Clinical and Laboratorial Research in Dentistry, 20 (1): 46-

53, 2014.

6) De Azevedo CS, Garbui BU, Martins e Silva C, Simionato Lorenzetti MR, de

Freitas AZ, Matos AB. Obtaining artificially caries‐affected dentin for in vitro

studies. J Contemp Dent Pract. 2014 Jan 1;15(1):12‐9.

Page 34: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

34

7) Demasi M, Netto LE, Silva GM, Hand A, de Oliveira CL, Bicev RN, Gozzo F,

Barros MH, Leme JM3, Ohara E. Redox regulation of the proteasome via S-

glutathionylation. Redox Biology, 2: 44-51, 2014.

8) Merino VRC, Nakano V, Finegold SM, Avila-Campos MJ. Genes Encoding Toxin

of Clostridium difficile in Children with and without Diarrhea. Scientifica.

http://dx.doi.org/10.1155/2014/594014. 2014.

9) Llanco LA, Nakano V, Avila-Campos MJ. Clostridium perfringens and necrotic

enteritis in poultry: virulence, genetic and molecular factors. Brazilian Journal

Veterinary Research in Animal Science. 51: 178-193, 2014.

10) Fernandes MR, Ignacio A, Martins FH, Rocha LB, Piazza RMF, Vaz TMI, Avila-

Campos MJ, Nakano V. Presence of Shiga toxin 2e-producing Escherichia coli and

atypical enterotoxigenic E. coli in an asymptomatic child. Journal of Medical

Microbiology Case Reports. DOI 10.1099/jmmcr.0.000001. 2014.

11) Neves PR, Cerdeira LT, Mitne-Neto M, Oliveira TG, McCulloch JA, Sampaio JL,

Mamizuka EM, Levy CE,Sato MI, Lincopan N. Complete genome sequence of

an F8-like lytic myovirus (ϕSPM-1) that infects metallo-β-lactamase-producing

Pseudomonas aeruginosa. Genome Announcements, 2 (2): e00061-14, 2014.

12) De Oliveira LG, Tormet Gonzalez GD, Samborsky M, Marcon J, Araujo WL, de

Azevedo JL. Genome sequence of Streptomyces wadayamensis strain A23, na

endophytic actinobacterium from Citrus reticulate. Genome Announcements, 2 (4):

e00625-14, 2014.

CAPÍTULOS DE LIVROS

1. MENDONÇA, TT ; GOMEZ, JGC ; Tortajada,M ; VIDAL, DR ; AR ;

BUSTAMANTE, D. ; SILVA, LF Efeito do suprimento de diferentes proporções

glicose/ácido hexanóico na composição do copolímero poli(3-hidroxibutirato-co-3-

hidroxihexanoato) P(3HB-co-3HHx) produzido por Burkholderia sacchari. In: Reis

MA; Mendez, BS. (Org.). In: InTech Open Acess Publisher. Bioplásticos.

1ed.Madrid: CYTED. P. 9-22 (2014).

2. Urtuvia, V. ; Pamela Villegas ; LOZANO, G. C. ; Gonzáles M ; SILVA,

LUIZIANA FERREIRA ; GOMEZ, JOSÉ GREGÓRIO CABRERA ;

SEEGER, M. Comparación de diferentes medios de cultivo para la biosíntesis de

PHA en Burkholderia xenovorans LB400. In: Reis MA; Mendez BS. (Org.).

Bioplásticos. 1ed.Madrid: CYTED. P 33-38 (2014).

3. CATALAN, A. I.; Batista Cordoba, S.B. ; TACIRO, Marilda Keico; GOMEZ,

JOSÉ GREGÓRIO CABRERA. Análisis de flujos metabólicos en cultivos

alimentados de Herbaspirillum seropedicae durante la síntesis de poli-3-

Page 35: Anuário produção científica do departamento de Microbiologia · dos docentes do Departamento (Tabela 1 e Figura 3). Tabela 1: Distribuição da produção científica do Departamento

35

hidroxibutirato. In: Reis MA; Mendez BS. (Org.). Bioplásticos. 1ed.Madrid:

CYTED. P39-48 (2014).

4. BOCANEGRA, JOHANNA KATHERINE; GODOY, M. S.; SILVA, LUIZIANA

FERREIRA; GOMEZ, JOSÉ GREGÓRIO CABRERA ; PETTINARI, M. J.

Produção do copolímero poli-3-hidroxibutirato-co-3-hidroxivalerato (P3HB-co-

3HV) por mutantes de Escherichia coli ldhA- bktB+. In: Reis MA; Mendez BS.

(Org.). Bioplásticos. 1ed.Madrid: CYTED. P49-50 (2014).

5. GODOY, M. S. ; BOCANEGRA, JOHANNA KATHERINE ; Pettinari, M.J.

; GOMEZ, JOSÉ GREGÓRIO CABRERA . Efectos del regulador global CreC

en el metabolismo central de Escherichia coli. Bioplásticos. 1ed.Madrid: CYTED.

p 53-54 (2014).

6. NEVES, P; MCCULLOCH, J ; MAMIZUKA, E. M.; LINCOPAN, N..

Pseudomonas: Pseudomonas aeruginosa. In: Batt, C.A., Tortorello, M.L.. (Org.).

Encyclopedia of Food Microbiology. 1ed.Oxford: Elsevier, 2014, v. 3, p. 253-260.