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TOPCAT
Minerando dadoscom
AGA 0513 e-Science2020
André L. Figueiredo
● Inicialmente carregamos um arquivo local: (arquivo_local.txt, aqui: http://www.astro.iag.usp.br/~gastao/aga0513/Scripts.html)○ Esse arquivo será lido como uma tabela pelo TOPCAT○ O arquivo contém o nome de estrelas de tipo espectral B que se localizam na
região central da Grande Nuvem de Magalhães e suas respectivas coordenadas
● Vamos buscar por informações extras para essas estrelas, que são especificamente:○ Avermelhamento○ Quais estrelas podem ser membros de aglomerados estelares
● Ao final, mostramos como podemos salvar uma sessão ou tabelas criadas dentro do TOPCAT
● Além disso, apresentamos como conseguir informações dos artigos que forneceram os dados encontrados utilizando o TOPCAT
Proposta
Abrindo um arquivo local
Vamos abrir um arquivo local no TOPCAT Vá até a aba “File” > “Load Table”
● Uma nova janela abrirá
● clique em “Filestore browser”
● Outra janela é aberta
● Vá até a localização do arquivo
● Não se esqueça de mudar o formato do arquivo que está sendo lido, que nesse caso é ascii
● Clique em “OK”
● Uma nova janela abrirá
● vá até a localização do arquivo
● não se esqueça de mudar o formato do arquivo que está sendo lido, que nesse caso é ascii
● clique em “OK”
● Este botão mostra as informações contida em cada coluna da tabela
● As colunas da tabela contém:
1. Nome das estrelas
2. Ascensão Reta
3. Declinação
● Para checar os valores da tabela é só dar um clique duplo no nome da tabela, mostrado em “Table List”
Procurando por informações de aglomerados compatíveis
com a lista de estrelas
Vamos utilizar o botão “VO” para procurar por mais informações● clique em “VO” e em “VIZIER Catalogue Service”
Uma nova janela se abrirá, e há várias opções de busca.
Com a nova janela aberta:
● Selecione “all rows”
● Vamos usar a opção “By Keyword”
Procuramos por lmc cluster
Vamos usar as informações de Glatt+2010o sétimo trabalho mais popular
e clique em “OK”
A opção mais intuitiva é a busca por palavras chaves!
A nova tabela foi carregada no topcat
A nova tabela foi carregada no topcat
Como mencionado anteriormente, com um clique duplo no nome da tabela, podemos checar os valores aí contidos
A nova tabela foi carregada no topcat
Podemos ver as informações contidas em cada coluna da tabela usando novamente o mesmo botão
● Com um clique em Tables List, selecione a primeira tabela
● Agora clique no botão “Sky Plot” para ver a posição espacial das estrelas da tabela local
● Uma nova janela é aberta com o gráfico:
● Essa é a distribuição espacial das estrelas no céu
● Na opção “Position” são mostradas a tabela e que colunas estão sendo utilizadas no gráfico, que nesse caso é o arquivo local e a Ascensão Reta (RA) e Declinação (DEC)
● Na opção “Subsets” é possível nomear os dados (opção “Label”) e trocar a cor dos dados
● Podemos adicionar os aglomerados listados na segunda tabela, para fazer isso clicamos no botão “Add”e um novo conjunto de dados vazio será mostrado aquiclique uma vez, para selecionar o novo conjunto
● Vamos até a opção “Position”e selecionamos a segunda tabela
● Automaticamente, os dados do cluster são mostrados na figura
Para dar Zoom-in e out use a rolagem do mouse
É possível salvar a figura no botão “Export” no topo da janela
Clusters da LMC e SMC
estrelas do arquivo local
● Com um clique em Tables Lista, selecione a primeira tabela
●● Com a primeira Usamos o botão
de Sky plotpara ver a posição espacial das estrelas da tabela local
Vamos criar um novo conjunto de dados para comparar com a posição dos aglomerados
Selecionamos a tabela de aglomerados(veja próximo slide)
Os cluster já são graficados automaticamente em outra cor
Agora vamos mudar a identificação dos dadosClique em “subsets”
Os cluster já são graficados automaticamente em outra cor
Agora vamos mudar a identificação dos dadosClique em “subsets”
Nomeie os dados
O gráfico atualizaautomaticamente
Se desejar, é possível salvar esta imagem clicando em “Export”
Importante: se a figura for fechada ela não pode ser reaberta, você terá que refazer os passos anterior para ter essa figura novamente
Esta é a figura exportada pelo topcat
Como fazer um crossmatch
Agora vamos cruzar as informações (crossmatch) das duas tabelas procurando por estrelas e aglomerados que são compatíveis
Para isso precisamos usar a opção de match, que está nesse botão que parecem dois palitos de fósforos (esse é um trocadilho em inglês, a palavra match também tem o significado de palito de fósforo)
Unidade em graus
Agora vamos cruzar as informações (crossmatch) das duas tabelas procurando por estrelas e aglomerados que são compatíveis
Para isso precisamos usar a opção de match, que está nesse botão que parecem dois palitos de fósforos (esse é um trocadilho em inglês, a palavra match também tem o significado de palito de fósforo)
● Uma nova janela se abre
● selecionamos a distância angular para a qual consideramos um match
● selecionamos as tabelas e as colunas referentes às coordenadas e as respectivas unidades
● E clicamos em “GO”
Tabela 1
RA e DEC
Tabela 2
RA e DECUnidade em graus
Agora vamos cruzar as informações (crossmatch) das duas tabelas procurando por estrelas e aglomerados que são compatíveis
Para isso precisamos usar a opção de match, que está nesse botão que parecem dois palitos de fósforos (esse é um trocadilho em inglês, a palavra match também tem o significado de palito de fósforo)
● Uma nova janela se abre
● selecionamos a distância angular para a qual consideramos um match
● selecionamos as tabelas e as colunas referentes às coordenadas e as respectivas unidades
● E clicamos em “GO”
Tabela 1
RA e DEC
Tabela 2
RA e DECUnidade em graus
Sucesso!Temos 20 alvos compatíveis
Note que temos uma nova tabela que contém as colunas das tabelas anteriores
● É oferecida opção de graficar os resultados
● Esse é o resultado graficado, note que as características do gráfico são as mesmas da imagem feita anteriormente:
○ aglomerados em azul
○ estrelas em vermelho
○ estrelas e aglomerados compatíveis são ligados por uma linhas cinza
● Se desejar é possível salvar essa imagem usando o botão “Export”, no topo da janela
Buscando informações de avermelhamento
Outra informação importante, é o avermelhamentoVamos repetir o mesmo procedimento de busca, mas agora utilizamos o termo “reddening map”
Vamos novamente no botão “VO” no topo da página e escolhemos a opção VIZIER Catalogue Service
Como já havíamos procurado pela expressão “LMC cluster”, as opções já estão salvas, basta trocar as palavras de busca por “reddening map”
Usaremos a terceira referência mais popular Subramaniam+2005
A nova tabela é mostrada na “table list”
Para saber se há correlação entre a nossa lista de estrelas inicial e a essa nova tabela, utilizaremos novamente a opção de Sky plotting
Procedendo da mesma forma que anteriormente, obtemos a seguinte figura:
Sucesso 2!
Podemos utilizar essa última tabela de Subramaniam+2005 para estimar o avermelhamento para os nossos alvos
Vamos fazer mais um crossmatch entre a lista de estrelas e o mapa de avermelhamento
Note que o mapa de avermelhamento é subdividido em campos.
selecionamos as tabelas de interesse, e a distância angular para considerar correspondência é de ~3arcmin
Essa distância é aproximadamente o tamanho de cada campo
Como resultado, encontramos correspondência entre 73 estrelas campos do mapa de avermelhamento
Vamos checar visualmente o resultado:
Como salvar uma sessão do TOPCAT
e como ler uma sessão salva
Agora temos, no total 5 tabelas:
● lista de estrelas● lista de aglomerados● lista resultante do primeiro match● Mapas de avermelhamento● Resultado do segundo match
Essas listas podem ser salvas de forma individual, com vários formatos diferentes
Ou pode-se salvar o atual estado que estamos, salvando a sessão corrente do TOPCAT
Vá até botão “File”, no topo da janela principale selecione “Save Table(s)/Session”
Uma nova janela se abrirá….
pode-se salvar a tabela atualmente selecionada
pode-se salvar a tabela atualmente selecionada
Várias tabelas ao mesmo tempo
● pode-se salvar a tabela atualmente selecionada
● Várias tabelas ao mesmo tempo
● Ou salvar a sessão completa○ os formatos disponíveis são
relacionados com formatos de VOs
○ Esta última opção apenas grava os dados contidos na tabela, enquanto que as figuras são perdidas.
➔ O TOPCAT não reconhece o formato de forma automática
➔ Então é uma boa prática especificar no nome do arquivo o formato utilizado para salvar
Agora vamos ler uma sessão salva
Inicie o TOPCAT
Vá até o botão “File”, no topo da janela e selecione a opção “Load Table”
Na nova janela aberta, selecione “Filestore Browseer”
Agora vamos ler uma sessão salva
Inicie o TOPCAT
Vá até o botão “File”, no topo da janela e selecione a opção “Load Table”
Na nova janela aberta, selecione “Filestore Browseer”
Selecione o arquivo com a sessão salva
Não se esqueça de usar o formato correto
Agora vamos ler uma sessão salva
Inicie o TOPCAT
Vá até o botão “File”, no topo da janela e selecione a opção “Load Table”
Na nova janela aberta, selecione “Filestore Browseer”
Selecione o arquivo com a sessão salva
Não se esqueça de usar o formato correto
As informações compiladas na sessão salva são mostradas novamente
NOTA IMPORTANTE: As figuras não são recuperadas
Como obter as fontes das tabelas encontradas no
TOPCAT
Nas demonstrações, encontramos duas tabelas, intituladas:
● J_A+A_517_A50_clusters● J_A+A_430_421_table1
Para acessarmos os artigos que contém essas tabelas, devemos ir ao site do CDS
Clique na opção Vizier, que é o catálogo utilizado para encontrar as tabelas acima
Esses códigos são referentes à artigos
Na página do Vizier, copiamos o código da segunda tabela, substituindo os “_” por “/”
Clique em “Find”
Esses códigos são referentes à artigos
As informações encontradas na tabela são apresentadas, entre outras informações, como o link para o artigo original
Dessa forma temos acesso unívoco ao trabalho, uma vez que temos o código da tabela, o que nos ajuda a verificar como as medidas foram feitas, que dados utilizados etc.
Link para acesso ao artigo
Tarefa proposta Utilize, pelo menos duas outras referências para estimar o avermelhamento para a lista de estrelas fornecida.
Se quiser, pode comparar os diferentes valores encontrados, via gráficos.
Por gentileza, dúvidas e sugestões podem ser encaminhadas para o email:
[email protected] cópia para [email protected]
