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TOPCAT Minerando dados com AGA 0513 e-Science 2020 André L. Figueiredo

TOPCATgastao/aga0513/pdf/eScience_topcat...LMC e SMC estrelas do arquivo local Com um clique em Tables Lista, selecione a primeira tabela Com a primeira Usamos o botão de Sky plot

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TOPCAT

Minerando dadoscom

AGA 0513 e-Science2020

André L. Figueiredo

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● Inicialmente carregamos um arquivo local: (arquivo_local.txt, aqui: http://www.astro.iag.usp.br/~gastao/aga0513/Scripts.html)○ Esse arquivo será lido como uma tabela pelo TOPCAT○ O arquivo contém o nome de estrelas de tipo espectral B que se localizam na

região central da Grande Nuvem de Magalhães e suas respectivas coordenadas

● Vamos buscar por informações extras para essas estrelas, que são especificamente:○ Avermelhamento○ Quais estrelas podem ser membros de aglomerados estelares

● Ao final, mostramos como podemos salvar uma sessão ou tabelas criadas dentro do TOPCAT

● Além disso, apresentamos como conseguir informações dos artigos que forneceram os dados encontrados utilizando o TOPCAT

Proposta

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Abrindo um arquivo local

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Vamos abrir um arquivo local no TOPCAT Vá até a aba “File” > “Load Table”

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● Uma nova janela abrirá

● clique em “Filestore browser”

● Outra janela é aberta

● Vá até a localização do arquivo

● Não se esqueça de mudar o formato do arquivo que está sendo lido, que nesse caso é ascii

● Clique em “OK”

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● Uma nova janela abrirá

● vá até a localização do arquivo

● não se esqueça de mudar o formato do arquivo que está sendo lido, que nesse caso é ascii

● clique em “OK”

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● Este botão mostra as informações contida em cada coluna da tabela

● As colunas da tabela contém:

1. Nome das estrelas

2. Ascensão Reta

3. Declinação

● Para checar os valores da tabela é só dar um clique duplo no nome da tabela, mostrado em “Table List”

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Procurando por informações de aglomerados compatíveis

com a lista de estrelas

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Vamos utilizar o botão “VO” para procurar por mais informações● clique em “VO” e em “VIZIER Catalogue Service”

Uma nova janela se abrirá, e há várias opções de busca.

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Com a nova janela aberta:

● Selecione “all rows”

● Vamos usar a opção “By Keyword”

Procuramos por lmc cluster

Vamos usar as informações de Glatt+2010o sétimo trabalho mais popular

e clique em “OK”

A opção mais intuitiva é a busca por palavras chaves!

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A nova tabela foi carregada no topcat

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A nova tabela foi carregada no topcat

Como mencionado anteriormente, com um clique duplo no nome da tabela, podemos checar os valores aí contidos

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A nova tabela foi carregada no topcat

Podemos ver as informações contidas em cada coluna da tabela usando novamente o mesmo botão

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● Com um clique em Tables List, selecione a primeira tabela

● Agora clique no botão “Sky Plot” para ver a posição espacial das estrelas da tabela local

● Uma nova janela é aberta com o gráfico:

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● Essa é a distribuição espacial das estrelas no céu

● Na opção “Position” são mostradas a tabela e que colunas estão sendo utilizadas no gráfico, que nesse caso é o arquivo local e a Ascensão Reta (RA) e Declinação (DEC)

● Na opção “Subsets” é possível nomear os dados (opção “Label”) e trocar a cor dos dados

● Podemos adicionar os aglomerados listados na segunda tabela, para fazer isso clicamos no botão “Add”e um novo conjunto de dados vazio será mostrado aquiclique uma vez, para selecionar o novo conjunto

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● Vamos até a opção “Position”e selecionamos a segunda tabela

● Automaticamente, os dados do cluster são mostrados na figura

Para dar Zoom-in e out use a rolagem do mouse

É possível salvar a figura no botão “Export” no topo da janela

Clusters da LMC e SMC

estrelas do arquivo local

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● Com um clique em Tables Lista, selecione a primeira tabela

●● Com a primeira Usamos o botão

de Sky plotpara ver a posição espacial das estrelas da tabela local

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Vamos criar um novo conjunto de dados para comparar com a posição dos aglomerados

Selecionamos a tabela de aglomerados(veja próximo slide)

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Os cluster já são graficados automaticamente em outra cor

Agora vamos mudar a identificação dos dadosClique em “subsets”

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Os cluster já são graficados automaticamente em outra cor

Agora vamos mudar a identificação dos dadosClique em “subsets”

Nomeie os dados

O gráfico atualizaautomaticamente

Se desejar, é possível salvar esta imagem clicando em “Export”

Importante: se a figura for fechada ela não pode ser reaberta, você terá que refazer os passos anterior para ter essa figura novamente

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Esta é a figura exportada pelo topcat

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Como fazer um crossmatch

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Agora vamos cruzar as informações (crossmatch) das duas tabelas procurando por estrelas e aglomerados que são compatíveis

Para isso precisamos usar a opção de match, que está nesse botão que parecem dois palitos de fósforos (esse é um trocadilho em inglês, a palavra match também tem o significado de palito de fósforo)

Unidade em graus

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Agora vamos cruzar as informações (crossmatch) das duas tabelas procurando por estrelas e aglomerados que são compatíveis

Para isso precisamos usar a opção de match, que está nesse botão que parecem dois palitos de fósforos (esse é um trocadilho em inglês, a palavra match também tem o significado de palito de fósforo)

● Uma nova janela se abre

● selecionamos a distância angular para a qual consideramos um match

● selecionamos as tabelas e as colunas referentes às coordenadas e as respectivas unidades

● E clicamos em “GO”

Tabela 1

RA e DEC

Tabela 2

RA e DECUnidade em graus

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Agora vamos cruzar as informações (crossmatch) das duas tabelas procurando por estrelas e aglomerados que são compatíveis

Para isso precisamos usar a opção de match, que está nesse botão que parecem dois palitos de fósforos (esse é um trocadilho em inglês, a palavra match também tem o significado de palito de fósforo)

● Uma nova janela se abre

● selecionamos a distância angular para a qual consideramos um match

● selecionamos as tabelas e as colunas referentes às coordenadas e as respectivas unidades

● E clicamos em “GO”

Tabela 1

RA e DEC

Tabela 2

RA e DECUnidade em graus

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Sucesso!Temos 20 alvos compatíveis

Note que temos uma nova tabela que contém as colunas das tabelas anteriores

● É oferecida opção de graficar os resultados

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● Esse é o resultado graficado, note que as características do gráfico são as mesmas da imagem feita anteriormente:

○ aglomerados em azul

○ estrelas em vermelho

○ estrelas e aglomerados compatíveis são ligados por uma linhas cinza

● Se desejar é possível salvar essa imagem usando o botão “Export”, no topo da janela

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Buscando informações de avermelhamento

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Outra informação importante, é o avermelhamentoVamos repetir o mesmo procedimento de busca, mas agora utilizamos o termo “reddening map”

Vamos novamente no botão “VO” no topo da página e escolhemos a opção VIZIER Catalogue Service

Como já havíamos procurado pela expressão “LMC cluster”, as opções já estão salvas, basta trocar as palavras de busca por “reddening map”

Usaremos a terceira referência mais popular Subramaniam+2005

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A nova tabela é mostrada na “table list”

Para saber se há correlação entre a nossa lista de estrelas inicial e a essa nova tabela, utilizaremos novamente a opção de Sky plotting

Procedendo da mesma forma que anteriormente, obtemos a seguinte figura:

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Sucesso 2!

Podemos utilizar essa última tabela de Subramaniam+2005 para estimar o avermelhamento para os nossos alvos

Vamos fazer mais um crossmatch entre a lista de estrelas e o mapa de avermelhamento

Note que o mapa de avermelhamento é subdividido em campos.

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selecionamos as tabelas de interesse, e a distância angular para considerar correspondência é de ~3arcmin

Essa distância é aproximadamente o tamanho de cada campo

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Como resultado, encontramos correspondência entre 73 estrelas campos do mapa de avermelhamento

Vamos checar visualmente o resultado:

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Como salvar uma sessão do TOPCAT

e como ler uma sessão salva

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Agora temos, no total 5 tabelas:

● lista de estrelas● lista de aglomerados● lista resultante do primeiro match● Mapas de avermelhamento● Resultado do segundo match

Essas listas podem ser salvas de forma individual, com vários formatos diferentes

Ou pode-se salvar o atual estado que estamos, salvando a sessão corrente do TOPCAT

Vá até botão “File”, no topo da janela principale selecione “Save Table(s)/Session”

Uma nova janela se abrirá….

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pode-se salvar a tabela atualmente selecionada

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pode-se salvar a tabela atualmente selecionada

Várias tabelas ao mesmo tempo

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● pode-se salvar a tabela atualmente selecionada

● Várias tabelas ao mesmo tempo

● Ou salvar a sessão completa○ os formatos disponíveis são

relacionados com formatos de VOs

○ Esta última opção apenas grava os dados contidos na tabela, enquanto que as figuras são perdidas.

➔ O TOPCAT não reconhece o formato de forma automática

➔ Então é uma boa prática especificar no nome do arquivo o formato utilizado para salvar

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Agora vamos ler uma sessão salva

Inicie o TOPCAT

Vá até o botão “File”, no topo da janela e selecione a opção “Load Table”

Na nova janela aberta, selecione “Filestore Browseer”

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Agora vamos ler uma sessão salva

Inicie o TOPCAT

Vá até o botão “File”, no topo da janela e selecione a opção “Load Table”

Na nova janela aberta, selecione “Filestore Browseer”

Selecione o arquivo com a sessão salva

Não se esqueça de usar o formato correto

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Agora vamos ler uma sessão salva

Inicie o TOPCAT

Vá até o botão “File”, no topo da janela e selecione a opção “Load Table”

Na nova janela aberta, selecione “Filestore Browseer”

Selecione o arquivo com a sessão salva

Não se esqueça de usar o formato correto

As informações compiladas na sessão salva são mostradas novamente

NOTA IMPORTANTE: As figuras não são recuperadas

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Como obter as fontes das tabelas encontradas no

TOPCAT

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Nas demonstrações, encontramos duas tabelas, intituladas:

● J_A+A_517_A50_clusters● J_A+A_430_421_table1

Para acessarmos os artigos que contém essas tabelas, devemos ir ao site do CDS

Clique na opção Vizier, que é o catálogo utilizado para encontrar as tabelas acima

Esses códigos são referentes à artigos

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Na página do Vizier, copiamos o código da segunda tabela, substituindo os “_” por “/”

Clique em “Find”

Esses códigos são referentes à artigos

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As informações encontradas na tabela são apresentadas, entre outras informações, como o link para o artigo original

Dessa forma temos acesso unívoco ao trabalho, uma vez que temos o código da tabela, o que nos ajuda a verificar como as medidas foram feitas, que dados utilizados etc.

Link para acesso ao artigo

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Tarefa proposta Utilize, pelo menos duas outras referências para estimar o avermelhamento para a lista de estrelas fornecida.

Se quiser, pode comparar os diferentes valores encontrados, via gráficos.

Por gentileza, dúvidas e sugestões podem ser encaminhadas para o email:

[email protected] cópia para [email protected]