Introdução à Bioinformática

Prof. Dr. Francisco Prosdocimi

Questionário inicial

• Apresentação

• Você já ouviu falar em bioinformática?

• O que é a bioinformática, no seu ponto de vista?

• Sobre o que trata a bioinfo?

• São precisos computadores potentes e sequenciadores de larga-escala para fazer a bioinformática?

O que é a bioinformática?

• Desenvolvimento dos conceitos de ciência• Plasticidade do desenvolvimento científico

• Exemplos:– Análise de prognóstico para cárie baseado em

radiografias– Estudos comportamentais através

de análises complexas de dados de EEG

– Genômica comparativa– Estrutura de proteínas

Sinônimos ou antônimos?

• Bioinformática, quimioinformática, neuroinformática• Biologia computacional• Genômica, transcriptômica, proteômica, lipidômica e outras

ômicas• Algoritmos • Análise estatística de dados

biológicos• Biologia digital• Biologia de sistemas• Data mining

– Text mining

Sugestão?

• Todo o tipo de estudo ou de ferramenta que se pode produzir para obter informação biológica usando seqüências de biomoléculas

• Pouco importa...• Definição pragmática

– Bioinformática é o que os bioinformatas fazem

O que queremos...

Systems biology

Integrative biology

O que faz um bioinformata?

• Abordagem pragmática• No Brasil: faz tudo!

– Sabe utilizar, configurar e gerenciar sistemas operacionais LINUX

– Sabe programar em uma ou mais linguagens de programação

– Sabe utilizar e montar bancos de dados em larga escala

– Tem um grande conhecimento em biologia molecular, estatística

– Escreve o artigo, responde o revisor, consegue dinheiro...

Área estratégica de pesquisa

• Os bancos de dados genômicos disponíveis gratuitamente na internet hoje contêm mais informação biológica do que todos os cientistas do mundo serão capazes de analisar, não importa quanto tempo se dediquem

• Dados gratuitos e de qualidade– Muitas vezes pobremente analisados: a corrida genômica– Brasil: pra quê financiar pesquisas tão caras?

• Não seria melhor investir na educação?

• Tarefa do bioinformata: ser criativo e produtivo ao mesmo tempo– Não perde o tempo da produção do dado– Economiza “50%” do esforço científico

• Faça da bioinformática o seu ócio criativo

• E vcs, o que fazem?