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USP, ESALQ, LGN313 - MELHORAMENTO GENÉTICO, PROF. NATAL A. VELLO Prof. Natal Vello [email protected] LGN 313 Melhoramento Genético Tema 8 Caracteres, herdabilidade e ganho genético Departamento de Genética

LGN 313 Melhoramento Genético · 2016-03-15 · Departamento de Genética. USP, ESALQ, LGN313 - MELHORAMENTO GENÉTICO, PROF. NA TAL A. VELLO ... Verde Amarelo Distribuição em

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Prof. Natal [email protected]

LGN 313 Melhoramento Genético

Tema 8 Caracteres, herdabilidade e ganho genético

Departamento de Genética

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Heranças Oligogênica e Poligênica

Variação

Contínua

Caracteres Quantitativos

Descontínua

Caracteres Qualitativos

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Caracteres qualitativos

• Segregações conhecidas (mendelianas): p.ex. 3:1 ou 1:2:1 (um gene) e 9:3:3:1 (dois genes)

• Dominância, dominância parcial

• Os estudos qualitativos são feitos a nível de indivíduos e a interpretação da herança é feita com base na contagem e proporções definidas pelos resultados observados nas descendências dos cruzamentos

• Testes estatísticos: Qui-quadrado ( χ2 )

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Caracteres qualitativos: exemplos

Cor do tegumento dos grãos de milho

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Caracteres qualitativos: exemplosGrãos de Milho : Normal vs Doce

Geração F2

323

97

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Caracteres quantitativos• Genética Quantitativa : estuda os caracteres quantitativos, os

quais distinguem-se dos caracteres qualitativos nos seguintes aspectos:

- Herança poligênica: os caracteres quantitativos são, em geral, regulados por vários genes.

- Estudo a nível de populações e baseado na estimação de parâmetros tais como média, variância e covariância.

- Variações contínuas e efeito do meio.

• Como regra geral, os caracteres quantitativos exibem variações contínuas e são parcialmente de origem não genética, ou seja, são grandemente afetados pelo ambiente.

• Exemplos:

– Produtividade (grãos, frutos, leite, carne, ovos ), altura da planta, peso 6

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Caracteres quantitativos: exemplosAltura de inserção de espiga em milho (cm) de 100 plantas F2

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Caracteres quantitativos: exemplosAltura de inserção da espiga em milho (cm) de 100 plantas F2

Histograma: Altura de inserção da espigaN

°d

e ob

serv

açõe

s

Altura de inserção

Distribuição normal esperada

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Caracteres quantitativos: número de genes

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Caracteres quantitativos: número de genes

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Caracteres quantitativos: número de genes

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Mais exemplos: cor das sementes

ERVILHA(1 gene, Dominância)

TRIGO(3 genes, Aditiva)

FENÓTIPOS

Genitores

Híbrido F1

Geração F2

P1 P2

Amarela Verde

Amarela

F1

Amarela

F2F2

Verde

P1

Branca Vermelha

Rosa

F1

F2

Branca Rosa Vermelha

P2

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Caracteres Qualitativos: Cor dos grãos de ervilha (Mendel)

F1: totalmente heterozigóticos F2: (3/4 amarelos) + (1/4 verdes)(Amarelo)

,0

,50

1,0

1,50

2,0

2,50

3,0

3,50

Verde Amarelo

Distribuição em F2

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Caracteres quantitativos: Cor dos grãos de trigo (Nilsson – Ehle)

http://www.biologia.ufrj.br/PDF_GENETICA_MDI/Genetica_Quantitativa_1.pdf14

brancos vermelhos

rosas

vermelhosbrancos rosas

F2

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Nº genes, Nº genótipos, Tamanho da população

Exemplo: n = 3 locos gênicos;

m1 = m2 = m3 = 2 alelos/loco

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X X

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Genótipos possíveis:

C1C1

B1B1 C1C2

C2C2

C1C1

A1A1 B1B2 C1C2

C2C2

C1C1

B2B2 C1C2

C2C2

C1C1

B1B1 C1C2

C2C2

C1C1

A1A2 B1B2 C1C2

C2C2

C1C1

B2B2 C1C2

C2C2

C1C1

B1B1 C1C2

C2C2

C1C1

A2A2 B1B2 C1C2

C2C2

C1C1

B2B2 C1C2

C2C2

1

2

3

4

5

6

7

8

9

1

2

3

4

5

6

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7

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16x x

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Híbridos entre linhagens que diferem em “n” pares de alelos

No de Pares de

Alelos

Classes

possíveis:

Gametas

em F1

Classes possíveis:

Genótipos

em F2

Tamanho mínimo de

uma população F2

perfeita

Dominância

completa

Ação

intermediária

1 2 3 4 2 3

2 4 9 16 4 9

3 8 27 64 8 27

4 16 81 256 16 81

10 1.024 59.049 1084.576 1.024 59.049

21 2.197.152 10.460.353.203 4.398.046.511.104 2.197.152 10.460.353.203

...

n 2n 3n 4n 2n 3n

* **

*

**

Número de genótipos resultantes de retrocruzamentos = número de genótipos homozigóticos ou linhagens

Supondo que os heterozigotos em fase de associação e repulsão são equivalentes

A , a

A , a ; B , b

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N. Fenótipos

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Ação gênica tipo DOMINANTE

Genitores contrastantes

P1 AABB 8

P2 aabb 4

F1 AaBb 8

F2

1 AABB 8

2 AABb 8

1 AAbb 5

2 AaBB 8

4 AaBb 8

2 Aabb 5

1 aaBB 7

2 aaBb 7

1 aabb 4

Média F2 7

Genitores semelhantes

P1 AAbb 5

P2 aaBB 7

F1 AaBb 8

F2

1 AABB 8

2 AABb 8

1 AAbb 5

2 AaBB 8

4 AaBb 8

2 Aabb 5

1 aaBB 7

2 aaBb 7

1 aabb 4

Média F2 7

Supondo: AA = Aa = 2 aa = 1 BB = Bb = 6 bb = 3

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Ação gênica tipo SOBREDOMINANTE

Genitores contrastantes

P1 AABB 8

P2 aabb 4

F1 AaBb 13

F2

1 AABB 8

2 AABb 10

1 AAbb 5

2 AaBB 11

4 AaBb 13

2 Aabb 8

1 aaBB 7

2 aaBb 9

1 aabb 4

Média F2 9,5

Genitores semelhantes

P1 AAbb 5

P2 aaBB 7

F1 AaBb 13

F2

1 AABB 8

2 AABb 10

1 AAbb 5

2 AaBB 11

4 AaBb 13

2 Aabb 8

1 aaBB 7

2 aaBb 9

1 aabb 4

Média F2 9,5

Supondo: AA= 2 Aa = 5 BB = 6 Bb = 8aa = 1 bb = 3

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Ação gênica tipo ADITIVA

Genitores contrastantes

P1 AABB 16

P2 aabb 8

F1 AaBb 12

F2

1 AABB 16

2 AABb 13

1 AAbb 10

2 AaBB 15

4 AaBb 12

2 Aabb 9

1 aaBB 14

2 aaBb 11

1 aabb 8

Média F2 12

Genitores semelhantes

P1 AAbb 10

P2 aaBB 14

F1 AaBb 12

F2

1 AABB 16 *

2 AABb 13

1 AAbb 10

2 AaBB 15 *

4 AaBb 12

2 Aabb 9 *

1 aaBB 14

2 aaBb 11

1 aabb 8 *

Média F2 12

Supondo: A = 2 a = 1 B = 6 b = 3

*segregantes transgressivos 20

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Tipo de ação gênica e melhoramentoALÉLICA NÃO ALÉLICA

Ausência de Interação

Recomendação

Aditividade alélica

Homozigotos

Aditividade não-alélica

Homozigotos

Presença de Interação

Recomendação

Algum grau de dominância

ou sobredominância

Heterozigotos

Epistase

? = f(Tipo)

LOCO A LOCO B TIPO DE EPISTASE MELHORAMENTO

Homozigoto Homozigoto (A x A) Aproveita

homozigotos

Homozigoto

Heterozigoto

Heterozigoto

Homozigoto

(A x D) Nem homozigotos

Nem heterozigotos

Heterozigoto Heterozigoto (D x D) Aproveita

heterozigotos 21

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Propriedades da herança poligênica ou quantitativa

� A segregação ocorre para nº grande de genes que controlam o caráter.

� Cada gene contribui para o valor total fenotípico com uma pequena parcela.

� Entre os muitos genes que controlam um caráter poligênico ocorrem várias

ações gênicas: Dominante, Aditiva, Sobredominante, Epistática.

� A expressão fenotípica de caracteres poligênicos é consideravelmente

alterada por pequenas diferenças do ambiente a que estão expostos os

membros de uma dada população.

� A maioria das populações carrega uma grande reserva de variabilidade

genotípica (população heterogênea).

� Dependendo da ação gênica da maioria dos genes que controla o caráter,

tem-se diferentes distribuições em F2.

OBSERVANDO A CURVA TIPO DE AÇÃO GÊNICA22

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Componentes da variância fenotípica :

F = G + E

F(1)F(2)

.

.

.F(N)

G(1)G(2)

.

.

.G(N)

E(1)E(2)

.

.

.E(N)

sF2 sG

2 sE2

Ex.:

Plantas F2

A ser

estimada

Plantas de uma

híbrido F1)

Plantas de uma

População auxiliar

(clone, linhagem,

híbrido F1)

==

=

++

+

23

= +

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Coeficiente de herdabilidade

h2 = 0 variação de natureza ambiental

h2 = 1 variação de natureza genética

Magnitudes:

Baixa: até 0,30 ex. produtividade de grãos

Média: 0,31 a 0,60 ex. altura da planta

Alta: > 0,60 ex. ciclo, resistência a doenças 24

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Progresso genético na seleção (Gs)

x x x

x x x x

x x x x

x x x x

x x x

x x

x x

x x xx x x

x x x x

x x x x

x x x x

x x x

x x

População original

População selecionada

Multiplicação

População melhorada

Ganho observado:

Ganho esperado:

Diferencial de seleção: 25

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Site:

• http://adi-8.bio.ib.usp.br/QTL2001/conceitos.html

– Página do Prof. Dr. Sérgio R. Matioli (IB/USP)

• Disciplina Optativa

– LGN 449 – Genética Quantitativa e de Populações

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Tema 8

Caracteres quantitativos e qualitativos

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Prática: exercícios sobre herdabilidade (h2) e ganho na seleção (Gs)

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1) Em uma propriedade foram obtidas duas capineiras, uma por sementes e a outra por mudas. Após 150 dias do plantio foram obtidos os dados do peso verde das plantas, em gramas:

Capineira obtida por sementes Capineira obtida por mudas

800 700 600 500 1000 250 700 750 800 790

400 350 700 650 850 900 810 820 950 880

250 350 450 850 1050 220 720 890 860 850

430 550 620 720 150 890 780 810 830 900

1020 829 930 740 1200 210 890 850 860 800

105 125 450 480 360 800 830 820 840 810

420 410 850 920 860 1010

a) Pede-se: a1 ) estimar a variância fenotípica em ambos os casos;

a2 ) explicar o que está contido nesta variância.

b) Estimar a variância genética.

c) Estimar a herdabilidade para a capineira obtida por sementes.

d) Se forem selecionadas plantas com 900 ou mais gramas na capineira obtida por mudas,

qual será a média esperada da descendência?

e) Se forem selecionadas todas as plantas com mais de 1000g na capineira por sementes,

qual será a média esperada da capineira melhorada?

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Capineira

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Fórmulas:

• Fórmulas:• s² = [1/ (N – 1)] Σ (Xij – X)² • = [1/ (N – 1)] [Σ X2

ij – (1/N) (Σ Xij)²]

• s2F = s2

G + s2E

• h² = s2G / s

2F

• Ĝs = h² × ds

• ds = Xs – Xo

• Xs = média da população selecionada

• Xo = média da população original

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Soluções exercício 1: capineiraa1) Sementes

média = X = (1/42) (800 + 700 + ... + 1010) = (1/42)(25949) = 617,83

s2F = [(800 - 617,83)² + ... + (1010 – 617,83)²] = 85122,7764

42 – 1

a2) Mudas

média = X = (1/24) (700 + 750 + ... + 810) = (1/24)(19840) = 826,67s2

F = s2E = [(700 – 826,67)² + ... + (810 – 826,67)²] = 3223,1884 = s2

E

24 – 1

b) s2G = 85122,7764 - 3223,1884 = 81899,588

c) h² = s2G = 81899,588 × 100 = 96,21% ou 0,9621

s2F 85122,7764

d) Mudas Média = X = 826,67

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Capineira obtida por sementes Capineira obtida por mudas

800 700 600 500 1000 250 700 750 800 790

400 350 700 650 850 900 810 820 950 880

250 350 450 850 1050 220 720 890 860 850

430 550 620 720 150 890 780 810 830 900

1020 829 930 740 1200 210 890 850 860 800

105 125 450 480 360 800 830 820 840 810

420 410 850 920 860 1010

Soluções exercício 1: capineirae) Seleção pop. Sementes: plantas > 1000 g

Xo = 800 + 400 + ... + 860 = 617,83g

42

Xs = 1020 + 1050 + 1200 + 1010 = 1070g

4

ds = Xs – Xo

ds = 1070 – 617,83 = 452,17g

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OĜs = h² × ds

Ĝs = 0,9621 × 452,17 = 435,0327g

Ĝs % = (Ĝs / Xo ) × 100

Ĝs % = (435,0327 / 617,83) × 100 = 70,4 %

Xm = Xo + Ĝs

Xm = 617,83 + 435,0327 = 1052,8g

Soluções exercício 1: capineira

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2) Um melhorista de essências florestais desejando melhorar a sucupiracoletou sementes de todo o povoamento nativo e estacas da melhor árvore. Obteve assim, na estação experimental uma plantação por sementes e a outra por estacas. Após 3 anos ele mediu a altura das plantas (em metros) e obteve os seguintes resultados:

Plantação por sementes Plantação por estacas

3,0 2,8 2,5 3,2 1,2 0,8 2,0 1,8 2,1 1,8 1,9

2,6 2,7 3,3 3,0 2,8 1,0 2,2 1,7 1,8 1,9 2,0

0,9 0,8 1,3 2,2 2,1 2,4 2,1 2,3 2,4 2,2 2,0

0,5 2,3 3,1 2,4 2,5 2,3 1,9 1,8 2,2 2,3 2,0

2,8 2,6 2,2 2,0 1,4 1,6

1,8 1,4 1,2 2,2 2,3 3,2

2,1 2,2 1,8 1,4 1,2 1,5

1,8 2,0 2,6 2,4 2,5 3,0

a) Estime a variância fenotípica nos dois casos. Qual a causa dessa variação em ambos os

casos?

b) Estime a variância genética.

c) Estime a herdabilidade na plantação obtida por sementes e por estacas.

d) Se forem selecionadas todas as plantas com três ou mais metros no povoamento obtido

por sementes, qual será o ganho esperado com a seleção?

US

P, E

SA

LQ, L

GN

313

-M

ELH

OR

AM

EN

TO

GE

TIC

O, P

RO

F. N

AT

AL

A. V

ELL

O

Sucupira

US

P, E

SA

LQ, L

GN

313

-M

ELH

OR

AM

EN

TO

GE

TIC

O, P

RO

F. N

AT

AL

A. V

ELL

O

a1 ) Sementes

Média = x = (1/48) (3,0 + 2,8 +... + 3,0) = (1/48) (100,8) = 2,10m

s2F = [(3,0 – 2,10)² + ... + (3,0 – 2,10)²] = 24,81 = 0,5278

48 – 1 47

a2) Estacas

Média = x = (1/20) (2,0 + 1,8 +... + 2,0) = (1/20) (40,4) = 2,02m

s2F = [(2,0 – 2,02)² + ... + (2,0 – 2,02)²] = 0,752 = 0,0395 = s2

E

20 – 1 19

b)

s2F = s2

G + s2E

s2G = 0,5278 – 0,0395 = 0,488

c1) Sementes

h² = s2G = 0,488 = 0,924 ou 92,4 %

s2F 0,5278

c2 ) Estacas

s2G = 0 e h² = 0,0 %

Soluções exercício 2: sucupira

US

P, E

SA

LQ, L

GN

313

-M

ELH

OR

AM

EN

TO

GE

TIC

O, P

RO

F. N

AT

AL

A. V

ELL

O

xs = 3,0 + 3,3 + 3,1 + 3,2 + 3,0 + 3,2 + 3,0 = 3,11m

7

ds = Xs – Xo = 3,11 – 2,10 = 1,01m

Ĝs = h² × ds = 0,924 × 1,01 = 0,93324 m

Ĝs % = Ĝs × 100 = 0,93324 × 100 = 44,4 %

Xo 2,10

Xm = Xo + Ĝs = 2,10 + 0,93324 = 3,03 m

Soluções exercício 2: sucupira

Plantação por sementes Plantação por estacas

3,0 2,8 2,5 3,2 1,2 0,8 2,0 1,8 2,1 1,8 1,9

2,6 2,7 3,3 3,0 2,8 1,0 2,2 1,7 1,8 1,9 2,0

0,9 0,8 1,3 2,2 2,1 2,4 2,1 2,3 2,4 2,2 2,0

0,5 2,3 3,1 2,4 2,5 2,3 1,9 1,8 2,2 2,3 2,0

2,8 2,6 2,2 2,0 1,4 1,6

1,8 1,4 1,2 2,2 2,3 3,2

2,1 2,2 1,8 1,4 1,2 1,5

1,8 2,0 2,6 2,4 2,5 3,0

d) Seleção pop. sementes: plantas = > 3 m