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(Postdeirid neuroblast) emplos de defeitos heterocrônicos no desenvolviment Ambros, Curr. Opin. Genet Develop. 10, 428-433, VPC lf G1 lin-4

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(Postdeirid neuroblast)

Exemplos de defeitos heterocrônicos no desenvolvimento

Ambros, Curr. Opin. Genet Develop. 10, 428-433, 2000

VPC

lf

G1

lin-4

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Ambros, Curr. Opin. Genet Develop. 10, 428-433, 2000

Atividades estágio específicas da via heterocrônica

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Genes heterocrônicos de C. elegans e seus produtos

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Processos afetados por ncRNAs

Storz, Science 296, 1260-1263, 2002

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Modificação de nucleotídeos de rRNA

Shine-Dalgarno Box

RNA polimerase reconhece o RNA 6S como um promotor aberto

tmRNA mimetiza um mRNA e um tRNAOs ncRNAs podem funcionar como parte de um complexo proteico maior, como ocorre com o SRP

Storz, Science 296, 1260-1263, 2002

Diferentes mecanismos dos ncRNAS

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Prováveis alvos de miR-277 de Drosophila

Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060

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Comparação dos UTR 3´ com os sítios de ligação dos miRNA

Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060

REGIÕES CONSERVADAS

Locais de pareamento dos miRNA

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Z = desvio padrão acima da média dos matches de fundo. Selecionaram Z 3 como cuttoff.

Z como medida da probabilidade de ligação do miRNA ao alvo

Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060

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Enzimas da via metabólica de degradação de Val, Leu e Ile provavelmente controladas por miR-277

Stark e cols., PLoS Biol. 1, DOI: 10.1371/journal.pbio.0000060

Z>3

Z>2 em Anopheles

Enzimas detectadas em Drosophila

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Modelo para regulação sucessiva das atividades gênicas heterocrônicas por lin-4 e let-7

Reinhart e cols., Nature 403, 901-906, 2000

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O micro RNA (miRNA) lin-4 é processado a partir do transcrito primário por Dicer

Ambros, Cell 107, 823-826, 2001

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As vias de RNAi e stRNA possuem uma intersecção

Hutvágner e cols. Science 293, 834-838, 2001

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Ambros, Cell 107, 823-826, 2001

Regulação da estrutura e função do RNP por um miRNA genérico

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Karazian Jr, Science 303, 1626-1632, 2004

ITR = inverted terminal repeatsDRs = short direct repeats

Transposão tipo Tc1/mariner

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Sijen & Plasterk, Nature 426, 310-314, 2003

Detecção de dsRNA por "RNase protection assay"

tot = sem pré-tratamentods = pré-tratamento com alto sal- = pré-tratamento com baixo sal (degrada dsRNA e ssRNA)

fragmentos protegidos, correspondentes a dsRNA