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Resultados em Duas Gerações de Seleção
do L. vannamei com Microsatélites e Estudo
de Diversidade Alélica de 2017 a 2019
ONELABT SA
SAMARIA UNIDADE DE PÓS LARVAS Ltda
A Onelabt SA se formou em 2005. Começou a com marcadores moleculares para paternidade(microsatelites), prestando serviço a programas genéticos de camarão.
Inicialmente o trabalho foi guiar maturações comerciais, dirigindo cruzamentos entre linhasmassais, baixando índices de consanguinidade e alcançando maior crecimento.
Gradualmente, as maturações foram mudando de programa, de massal a programas de seleçãofamiliar ou massal guiado por microsatelites.
Temos a capacidade de monitorar sobrevivência e crecimento a nivel familiar desde o povoamentocom PL12 até despesca através de perfis genéticos. Trabalhamos rotineiramente para distinguir indivíduos em populações com misturas de 40 a 120 famílias.
O laboratório pode processar 6000 amostras mensalmente usando 12 microssatélites ou até 720.000 PCRs por mês.
Temos 12 anos de experiência no setor, e clientes que trabalham conosco durante esse tempo com Projetos no Equador, Mexico e Brasil.
Primeiros passos do Programa 2017
Levantamento e Análise de Estrutura
Populacional
Agrupamentos por Distância Genética
Direcionamento de cruzamentos para
construir população base
- Análise de 49 Grupos Genéticos (Famílias Potiporã).
- 1591 Indivíduos.- 12 Microssatélites
- Variabilidade Genética (Baixa)- Nível de Imbreeding (Populações
variam de -0,35 a 0,27)- Estrutura Populacional
- Formar População Base
- Seleção Ambiental
- Produzir Famílias de Primos
- Produzir Breeding pool(Gerar Variabilidade Genética)
-Usado para produzir os Batchs.
BATCH
Ambiente 1 Ambiente 2
Famílias Selecionadas
FH FH
FH FH
Cruzamentos direcionados entre elites
e
FH FH FH FH
FH FH FH FH
BreedingPool
BP Famílias PP(Clusters) G0
GERAÇÕES DO PROGRAMA GENÉTICO
Batch 1PPG1FH1-32
Batch 2PPG1FH33-64
Batch 3PPG1FH65-96
G1
Batch 4PPG2FH1-22
Batch 5PPG2FH23-54
G2Batch 6PPG2FH55-86
Batch 7PPG3FH1-32
G3
(PPG1FP1,2,3,4,5,6) (PPG1FP7,8)
(PPG2FP1,2) (PPG2FP3,4) (PPG2FP5,6)
Batch 8PPG3FH33-64
Batch 9PPG3FH64-93
novembro
Batch 10
2017
2018
2019
BP Fam PP x RVZRVZ x RVZ
Resultados 5 º Batch
0,0% 10,0% 20,0% 30,0% 40,0% 50,0% 60,0% 70,0% 80,0% 90,0% 100,0%
FH23
FH24
FH25
FH26
FH27
FH28
FH29
FH30
FH31
FH32
FH33
FH34
FH35
FH36
FH37
FH38
FH39
FH40
FH41
FH42
FH43
FH44
FH45
FH46
FH47
FH48
FH49
FH50
FH51
FH52
FH53
FH54
Potipora Aquisa
BP
Sobrevivência PPG2FH23-54 em Desafíos Aquisa e Potipora
FP4/BP
FP3/BP
BP
FP3/BP
BPBP
FP4/BP
FP3/BP
FP4/BP
BP
BP
LARVA POTIPORA VE223
FAMILIA n %Contribuição n %SBV Peso OBS-EXP EBVSBV EBVCrec
PPG2FH71 21 1,49% 142 132% 12,2 0,08 2,74 0,36
PPG2FH73 40 2,84% 113 55% 13,0 0,05 1,63 1,04
PPG2FH69 36 2,56% 76 41% 12,6 0,03 0,89 0,68
PPG2FH70 14 0,99% 16 22% 13,9 0,00 0,04 1,87
PPG2FH55 12 0,85% 41 66% 13,1 0,02 0,65 1,10
PPG2FH86 89 6,32% 61 13% 13,7 -0,02 -0,69 1,66
PPG2FH63 14 0,99% 50 69% 11,3 0,02 0,81 -0,46
PPG2FH76 13 0,92% 11 16% 12,5 0,00 -0,05 0,58
PPG2FH61 54 3,83% 62 22% 11,5 0,00 0,15 -0,32
PPG2FH57 36 2,56% 73 39% 12,1 0,02 0,82 0,22
PPG2FH81 48 3,41% 25 10% 12,7 -0,02 -0,55 0,79
PPG2FH59 17 1,21% 33 38% 11,7 0,01 0,35 -0,17
PPG2FH62 10 0,71% 30 58% 11,8 0,01 0,45 -0,03
PPG2FH74 61 4,33% 77 25% 13,2 0,01 0,32 1,26
PPG2FH72 72 5,11% 52 14% 12,6 -0,02 -0,50 0,69
PPG2FH56 28 1,99% 68 47% 10,9 0,03 0,89 -0,86
PPG2FH65 11 0,71% 12 21% 10,6 0,01 0,25 -1,10
PPG2FH78 66 4,68% 50 15% 12,1 -0,01 -0,41 0,19
PPG2FH60 61 4,33% 48 15% 11,7 -0,01 -0,33 -0,09
PPG2FH82 58 4,12% 30 10% 12,0 -0,02 -0,67 0,17
PPG2FH77 6 0,43% 11 36% 10,4 0,00 0,11 -1,34
PPG2FH68 2 0,14% 6 58% 10,5 0,00 0,09 -1,19
PPG2FH58 7 0,50% 12 33% 10,6 0,00 0,11 -1,09
PPG2FH69 28 1,99% 20 14% 10,3 -0,01 -0,20 -1,41
PPG2FH66 2 0,14% 10 97% 10,0 0,01 0,18 -1,70
PPG2FH80 17 1,21% 7 8% 10,4 -0,01 -0,24 -1,28
PPG2FH64 8 0,57% 12 29% 10,0 0,00 0,09 -1,70
PPG2FH75 106 7,52% 43 8% 11,9 -0,05 -1,50 0,08
PPG2FH85 114 8,09% 68 12% 12,4 -0,03 -1,12 0,51
PPG2FH83 159 11,28% 106 13% 12,4 -0,04 -1,31 0,50
PPG2FH84 209 14,83% 84 8% 13,0 -0,09 -2,98 1,04
Envios 2018 e 2019 - Fazendas
2018 2019ago.18 ene.19
Potiporã L1 Potiporã L1/L2/L3Aquisa L1/LP Aquisa L1/L2/L3
sep.18 feb.19Potiporã L1 Potiporã L1/L2/L3/L4Aquisa L1 Aquisa L1/L2/L3/L4
oct.18 mar.19Potiporã L1 Potiporã L2/L3/L4Aquisa L1 Aquisa L2/L3/L4
nov.18 abr.19Potiporã L1/L2 Potiporã L3/L4Aquisa L1/L2 Aquisa L3/L4
dic.18 may.19Potiporã L1/L2 Potiporã L3/L4/L5Aquisa L1/L2 Aquisa L3/L4/L5
jun.19Potiporã L3/L5Aquisa L3/L5
jul.19Potiporã L5Aquisa L5
Geração Batch Origem Cruzamento LinhaG1 Batch 2 G1FP4 G1FP3 L1G1 Batch 1 G1FP2 G1FP1 L2G1 Batch 1/Batch 2 G1FP5 G1FP6 L3G1 Batch 1/Batch 2 G1FP1 G1FP3 L4G1 Batch 3 G1FP8 G1FP7 L5G2 Batch 4 G2FP1 G2FP2 L6
Out 2019: produção de L6Geração 2: G2FP1 x G2FP2
Envios comerciais de Pós-larvas
A partir das despescas de Dezembro/18 devemos ver efeito da seleção genética.
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
1600
Aquisa, kg/ha 2017-2019
2017 2018 2019
0
500
1000
1500
2000
2500
Potiporã, kg/ha 2017-2019
2017 2018 2019
Meses propensos para WSSV
0
200
400
600
800
1000
1200
1400
1600
2017 2018 2019
730
1178
1580
361 386
1066
Média, kg/ha, 2017-2019
Potipora Aquisa
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
90%
100%
40000 60000 80000 100000 120000 140000 160000 180000 200000
Sob
revi
ven
cia
Densidade de povoamento por Ha
Rolesa, Densidade povoamento vs Sobrevivência
2008
2011
2014
2017
Linear (2008)
Linear (2011)
Linear (2014)
Linear (2017)
51
4644
39
2927
30
3436
45
0
10
20
30
40
50
60
70
Potiporã, %Sobrevivência 2017-2019, Densidade de povoamento 2017-2019
2017%Sbv 2018%Sbv 2019%Sbv 2017Densidad 2018Densidad 2019Densidad
46
56
53
44
36
33 3432
20
0
10
20
30
40
50
60
Aquisa, %Sobrevivência 2017-2019, Densidade de Povoamento 2017-2019
2017%Sbv 2018%Sbv 2019%Sbv 2017Densidad 2018Densidad 2019Densidad
2017:8%2019:20%
2017:16%2019:53%
2018:9%2019:44% 2017:13%
2019:33%
0,40
0,60
0,80
1,00
1,20
1,40
1,60
1,80
2,00
20000 30000 40000 50000 60000 70000 80000 90000 100000 110000 120000
Cre
c Se
man
al
Densidad Cosechada
Fimasa Densidade de despesca vs Crescimento 2008-2017
2008
2010
2011
2014
2013
2015
2016
2017
Linear (2008)
Linear (2010)
Linear (2011)
Linear (2014)
Linear (2013)
Linear (2015)
Linear (2016)
Linear (2017)
0,0 5,0 10,0 15,0 20,0
2017
2018
2019
AQ Cos/m PP Cos/m
0,00 0,20 0,40 0,60 0,80 1,00 1,20
2017
2018
2019
AQ Crec PP Crec
0 20 40 60 80 100 120
2017
2018
2019
AQ Dias PP Dias
0,00 5,00 10,00 15,00
2017
2018
2019
AQ Peso PP Peso
GENÉTICA = CONFIANÇAA genética facilita o manejo. O manejo permite realizar potencial genético.O aumento na produção desde 2001 até 2019 no Equador principalmente, não é devido a maior densidade de povoamento. É devido a mais ciclos por ano.
Genética, seleção constante;RacewaysTransferência, Bifase, TrifaseMelhor Nutrição, Investimento Nicovita, Skretting, Biomar, CargillFrequência de AlimentaçãoRecirculação, Probióticos
BR_P15 (F
P7)BR_P18 (FP7)
BR_VE44_BATCH 8
BR_F4G2_VE45
BR
_VE45_F4G
2
BR
_P
19(F
1G
2)
BR
_F2G
2_V
M2
BR
_BA
TCH
7_VM
11
BR_VE43 -F3G
2BR_P17 (FP8)
EC_G4FP9XG4FP10
EC_MIX MASAL_G4 -TR
EC_DESVS2018-1X64FP11
EC_G4FP11XG4FP12
MX_AQAPCFC _Est 62 y 63
MX_Boca_Grandes
MX_FP1
MX
_Boca_P
romedio
MX
_P
RLM
R_E
st 6
2 y
63
MX
_FP
2
MX
_FP
3
MX_FP4
MX_FP5
0.05
Mapa Genético 2019
10 linhas PP
4 linhas Ecuador
9 linhas México
-0,40
-0,30
-0,20
-0,10
0,00
0,10
0,20
0,30
0,40
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38
2017 Brasil 9 Linas 2017 38 lineas PP 10 lineas PP 2019 lineas mx2019 lineas ecuador2019
Variação no Fis (Consanguinidade) Brasil 2017 e 2019
Variação no Fis (Consanguinidade) Brasil 2017 e 2019
-0,40
-0,30
-0,20
-0,10
0,00
0,10
0,20
0,30
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
2017 Brasil 9 Linas 2017 38 lineas PP 10 lineas PP 2019 lineas mx2019 lineas ecuador2019
Ne indica o número efetivo de alelos corregidos para tamanho da amostra. Ne indica onúmero de alelos detectados com cada microssatélite, indicando a diversidade alélica da população.
0,00
0,50
1,00
1,50
2,00
2,50
3,00
3,50
4,00
4,50
5,00
2017 Brasil 9 Linas 2017 38 lineas PP 10 lineas PP 2019 lineas mx2019 lineas ecuador2019
4,69
2,65
3,30
4,24
3,04
Valores médios do Ne no Brasil 2017, 2019
-0,08
-0,16 -0,16
-0,19
-0,11
0,00
-0,07
0,01
-0,13
0,01
-0,20
-0,15
-0,10
-0,05
0,00
0,05
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Valores Fis 10 Linhas PP 2019
3,5
2,9
3,5
3,13,3
3,5 3,6 3,6
3,1 2,9
0,0
0,5
1,0
1,5
2,0
2,5
3,0
3,5
4,0
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Valores Ne 10 Linhas PP 2019
CONCLUSÕES
Samaria UPL Ltda mantém um programa de seleção familiar assistida com microssatellites.Anualmente avaliam 128 famílias em 4 batches de 32 familias.O programa começou em Janeiro de 2017. Os primeros reprodutores cultivados de familias elites começaram a produzienauplios a nível comercial, na maturação em Agosto de 2018. Os primeiros resultados de despescas comerciais com a primeirageração de famílias elites, foram evidentes a partir de dezembro de 2018.
Na Aquisa, a biomasa/ha aumentou de 315 kg/ha em Dezembro de 2017 a 648 kg/ha em Dezembro de 2018. Durante 2019 a media de biomassa/ha tem sido 1066 kg/ha versus 386 kg/ha em 2018 e 361 kg/ha em 2017.Nos meses onde temos dados com densidades de povoamento parecido, as diferenças em %Sobrevivência são os seguintes:
16%, 21/m (2017) 53%, 16/m, (2019) dados Março9%, 27/m (2018) 44%, 23/m (2019) dados Abril13% 36/m (2017) 33%, 33/m (2019) dados Junho8%, 28/m (2017) 20%, 25/m (2019) dados Setembro.
CONCLUSIONES
Na Potiporã, a media de povoamento foi 32/m em 2018 e 40/m em 2019. A densidade de povoamento aumentou 25% em2019. A sobrevivência na media foi de 40% em 2018 e 38% em 2019. A sobrevivência se manteve estável desde que a densidade aumentou 25%. A biomasa/ha de despesca em 2019 tem sido 1580 kg/ha versus 1178 kg/ha em 2018 e 730 kg/ha en 2017. Densidade de despesca/ha aumentou a 15.3/m en 2019 versus 12.5/m en 2018 e 8.4/m em 2017.Crescimiento em g/semana se manteve estável.
O número de alelos efetivos (Ne) entre linhas de Samaria UPL em 2017 teve uma media de 2.65 alelos/microsatellite. Em 2019 a media de Ne entre as linhas foi de 3.3. Os resultados demonstram que diversidade alélica é maior em 2019 do que em2017..
Em 2017 as linhas de Samaria UPL variavan entre -0.35 a 0.27 em valores de Fis. Em 2019, as linhas variavan entre -0.19 a 0.01. Os resultados demonstram que linhas de 2019 não indicam consaguinidade, mas tem bons indicadores de outbreeding (mais heterozigosidade em 2019 vs 2017).
Os valores Ne na média, indican 3.3 em linhas Samaria, 4.24 em linhas doMéxico e 3.03 em linhas Aquagen. No entanto, existe diversidade para seguir selecionando.
CONCLUSIONES
Nas gerações de seleção, estamos formando famílias de primos com os avaliados no Batch 7. Este batch é proveniente da Terceira geração em seleção de reprodutores.
Na produção comercial, o laboratório está produzindo L6, Larvas que são da segunda geração de seleção.
Os resultados do programa na Samaria UPL, vão seguir a mesma tendência que programas no Equador e no México. Aumentando a sobrevivência seguindo a pressão de seleção interfamiliar aplicada. Entretanto, menteremos 70% de pressãopara sobrevivência e 30% para crescimento. Uma vez que a sobrevivência na media aumentou a níveis aceitáveis para produção comercial (70% aproximadamente) o enfoque provavelmente vai mudra para aplicar mais pressão em crescimento.