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MISSÃO
Solucionar de forma otimizada os problemas que exijam alto esforço computacional e assim assegurar a satisfação dos clientes
ROTEIRO
• Engenharia Genética• Genes
1 - Introdução
• Cenário Atual• Usuário
2 - Problema
• Concorrentes• Nossa Solução• Nossa Proposta
3 - Solução• Gereciamento• Hardware• Usabilidade• Andamento
4 - Projeto
US$ 300 bilhões
ENGENHARIA GENÉTICA
}
}
GENES
DNA
NECESSIDADE DA PESQUISA GENÉTICA
EXEMPLO : DIABETES
GENE DA INSULINA
PROBLEMA
GENE DA INSULINA
PROBLEMA:
INDENTIFICAÇÃO DE
GENES NO DNA
EXEMPLO : DIABETES
7000 cadeias (100 MB)
CENÁRIO ATUALATAACTCGGTATGTTGCTAG
TGGATAGACG]GACCATGGACATGACGACT...
7000 cadeias (100 MB)
ATAACTCGGT
7000 cadeias (100 MB)
CENÁRIO ATUAL
7000 cadeias (100 MB)
7000 cadeias (100 MB)
ATAACTCGGT
ATAACTCGGT
ATAACTCGGT
•Penalidade
2 min
•Pesquisa Cadeia 2
•Penalidade
4 min
•Pesquisa Cadeia 3
1 min
•Pesquisa Cadeia 1
ATAACTCGGT
ATAACTCGGT
ATAACTCGGT
CENÁRIO ATUAL
7000 cadeias (100 MB)
CENÁRIO ATUAL
GENBANK
7,5 GBBANCO PRIVAD
O
TATAACTCGGTTCGAGATCGTAGCTATCGACTGCATGCATCGACTAGCATATAACTCGGTGCATAACTCGGTCCGGATCGATGCATGCATCGATCGATGACTGACTGACTAGCATCGATGCTAGCATGCTAGCTAGCTGATGCATGCATCGATCGATCGATCGATCGACGATCGACGATGCATGCATGCATCGATCATAACTCGGTCGAGCTAGCTAGCAGCAGCATGCACGATACGGCACAAACATCGATCGAGACGGCCACGATCGATCGATCGTGCTGTCGATGTTT
CENÁRIO ATUAL
ATAACTCGGT
ATAACTCGGT
ATAACTCGGT
Blast
TATAACTCGGTTCGAGATCGTAGCTATCGACTGCATGCATCGACTAGCATATAACTCGGTGCATAACTCGGTCCGGATCGATGCATGCATCGATCGATGACTGACTGACTAGCATCGATGCTAGCATGCTAGCTAGCTGATGCATGCATCGATCGATCGATCGATCGACGATCGACGATGCATGCATGCATCGATCATAACTCGGTCGAGCTAGCTAGCAGCAGCATGCACGATACGGCACAAACATCGATCGAGACGGCCACGATCGATCGATCGTGCTGTCGATGTTT
ATAACTCGGT
CENÁRIO ATUAL
ATAACTCGGT
ATAACTCGGT ATAACTCGGT
ATAACTCGGT
Smith-Waterman7000
cadeias (100 MB)
7000 cadeias (100 MB)
CENÁRIO ATUAL
ALGUNS DIAS DEPOIS...
CENÁRIO ATUAL
7000 cadeias (100 MB)
MAIS ALGUNS DIAS...
CENÁRIO ATUAL
CENÁRIO ATUAL
O USUÁRIO
Interface simples Rápido Saída configurável Disponível na web Smith-Waterman Privacidade Compartilhamento
Web
NOSSA SOLUÇÃO
7000 cadeias (100 MB)
ATAACTCGGTATGTTGCTAG
TGGATAGACG]GACCATGGACATGACGACT...
7000 cadeias (100 MB)
ATAACTCGGT
NOSSA SOLUÇÃO
7,5 GBBANCO PRIVAD
O
NOSSA SOLUÇÃO
COMO OTIMIZAR O ALINHAMENTO
Smith-Waterman:Forte paralelismo
HARDWARE ESPECIALIZADO
ARQUITETURA
BD
WEB
FPGAs
CURVA DE VALOR - COMPARATIVO
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1
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6
Busca On-LineServidores LocaisCube
PÚBLICO ALVO
Acesso LimitadoAcesso Ilimitado
Investidores
• Gereciamento• Hardware• Usabilidade
4 - Projeto
PROJETO
DÚVIDAS
AGRADECIMENTO
OBRIGADO!
