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1.9
TableofContentsManualdeFormaçãoemCiênciaAberta
1-IntroduçãoaoManual
2-IntroduçãoàCiênciaAberta
2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
2.3-SoftwareAbertonaInvestigação
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
2.5-AcessoAbertoaPublicações
2.6-LicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiro
2.7-PlataformasColaborativas
2.8-RevisãoporParesAberta,MétricaseAvaliação
2.9-PolíticasdeCiênciaAberta
2.10-CiênciaCidadã
2.11-RecursosEducativosAbertos
2.11-DefesaePromoçãodaCiênciaAberta
3-SobreAprendizagemeFormação
4-AspetosOrganizativos
5-ExemploseOrientaçãoPrática
6-Glossário
7-Referências
8-FichaTécnica
1
ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta
Emfevereirode2018,umgrupodecatorzeautoresreuniram-senaBibliotecaNacionalAlemãdeCiênciaeTecnologia(TechnischeInformationsbibliothek-TIB),emHanover,paracriarummanualabertoevivosobreformaçãoemCiênciaAberta.AsformaçõesdeelevadaqualidadesãofundamentaisquandosepretendeumamudançaculturalemdireçãoàimplementaçãodosprincípiosdaCiênciaAberta.Osrecursosdeformaçãosãoumsuportefundamentalparainstrutoreseformadores.OManualdeFormaçãoemCiênciaAbertaseráumrecursochaveeumprimeiropassoparaodesenvolvimentodeprogramascurricularesenaeducaçãocontínuaemAcessoAbertoeCiênciaAberta.ApoiandoeinterligandoumacomunidadeemergentenaáreadaCiênciaAbertaquedesejatransmitiroseusaberefuncionarcomomultiplicadoradoconhecimento,estemanualiráenriquecerasatividadesdeformaçãoedesbloquearopotencialdestacomunidade.
AopartilharasuaexperiênciaeperícianadifusãodosprincípiosdaCiênciaAberta,osautores(verabaixo)produziramumrecursoeducativoabertoorientadoparaoensinoprático.OobjetivofundamentaldestenovomanualnãoédivulgarasideiasdaCiênciaAbertamasmostrarcomodivulgarestasideiasdeformaeficaz.Oformatodeumlivroelaboradorápidaecolaborativamente(booksprint)maximizouacriatividadeeainovaçãoeassegurouaproduçãodeumrecursovaliosoemapenasalgunsdias.
EstemanualpretendeapoiarosformadoresemCiênciaAbertajuntandoumconjuntodemétodos,técnicasepráticas.OresultadopretendidoéquesejaumguiaútilemcomodivulgaroconhecimentosobreosprincípiosdaCiênciaAbertaàsnossasredes,instituições,colegaseestudantes.Iráigualmenteinstruireinspirarosformadoresparaacriaçãodesessõesenvolventesedegrandequalidade.Abordandodesafiosefornecendosoluções,iráfortaleceracomunidadedeformadoresemCiênciaAbertaqueseencontramnumprocessodeautoeducação,autoinformaçãoeautoinspiração.
Ajude-nosamelhoraromanualAgradecemososcomentárioseopiniõesdetodasaspessoas,independentementedasuaáreadecompetênciaouformação.Aformamaisfácildeofazerécontactar-nos.Poderáaindausarafuncionalidade“Pullrequest”(queequivaleapropormodificações)dentrodowebsiteouaplicaçãoGitbook,oucomoutraaplicação.OconteúdodomanualémantidonorepositórioGitHub.
VamosfazerjuntosumaformaçãosobreCiênciaAbertaEstáinteressadoemorganizarouparticiparemformaçõesouwebinarsquetirampartidodoManualdeFormaçãoemCiê[email protected]–adoraríamosreceberoseucontacto.
ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta
2
mailto:[email protected]://github.com/Open-Science-Training-Handbook/Open-Science-Training-Handbook_PTmailto:[email protected]
Comoreferenciaromanual
Porfavorconsiderefazerareferênciabibliográficaquandousaroconteúdodestemanual.Parareferenciarestemanualrecomendamosamençãoa:https://doi.org/10.5281/zenodo.1212496,queéaformacitávelcomoDOIatravésdareferênciaaoarquivo(menoscompreensível)dolivro.
Osautores,colaboradoresetradutoresdestemanualcolaborativo
Saibamaissobreosautoresefacilitadoresdolivro,suasexperiênciasefontesdeinspiração,suaafiliação,informaçãodecontacto,perfisTwittereORCID,bemcomosobreostradutoreserevisoresdestaversãoportuguesanoúltimocapítulodoManual.
Agradecimentos
GwenFranck(EIFL,Bélgica)pelacoberturadosmeiosdecomunicaçãosocialduranteaelaboraçãodomanualepornosmantermotivadoscomdinâmicasdegrupoPatrickHochstenbach(UniversidadedeGent,Bélgica)pelodesigndosfantásticosdesenhosanimadosedasimagensVassoKalaitzi(LIBER,PaísesBaixos)porgravarosótimosvídeosMatteoCancellieri(UniversidadeAberta,ReinoUnido)peloapoiofornecidoemquestõestécnicasenacriaçãodogitbookSimonWorthington(TIB,Hannover,Alemanha)pelosconselhosdemanutençãoeconversãodosmetadadosbibliográficos
Declaraçãodedireitosdeautor
OManualdeFormaçãoemCiênciaAbertaéumRecursoEducativoAberto,peloqueédisponibilizadosobalicençaCreativeCommonsDedicaçãoaoDomínioPúblico(CC01.0Universal).Nãoénecessárioobterpermissãoparareutilizarecopiarinformaçãodestemanual.Noentanto,algunsmateriaisreferidosnestelivropoderãoestarprotegidospordireitosdeautor–nessescasosserádadaindicaçãonotexto.Tentámosreferenciartodasasnossasfontes,masseporalgummotivonosesquecemosdeatribuiroscréditosdevidos,talnãofoifeitocomintençãomaliciosa.Poderácontactar-nospeloendereçoeletró[email protected]çõesafazer.
ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta
3
https://foster.gitbook.io/manual-de-formacao-em-ciencia-aberta/https://legacy.gitbook.com/download/pdf/book/open-science-training-handbook/bookhttps://legacy.gitbook.com/download/epub/book/open-science-training-handbook/bookhttps://legacy.gitbook.com/download/mobi/book/open-science-training-handbook/bookhttps://doi.org/10.5281/zenodo.1212496https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/mailto:[email protected]
Financiamento
EsteprojetofoifinanciadopeloprogramadeinvestigaçãoeinovaçãoHorizonte2020daUniãoEuropeia,projetoFOSTERPlus(FosteringthepracticalimplementationofOpenScienceinHorizon2020andbeyond),soboacordodesubvençãonúmero741839.
ManualdeFormaçãoemCiênciaAberta
4
https://www.fosteropenscience.eu/about
ObjetivodoManual"QuandotodososinvestigadoresestãocientesdoqueéaCiênciaAberta,esãoformados,apoiadoseorientadosemtodasasetapasdasuacarreirapararealizarCiênciaAberta,opotencialestáláparamudarfundamentalmenteaformacomoapesquisaérealizadaedisseminada,fomentandoumecossistemacientíficoemqueapesquisaganhemaiorvisibilidade,sejacompartilhadadeformamaiseficienteerealizadadeformamaisintegra."OpenScienceSkillsWorkingGroupReport(2017)
ACiênciaAbertaéomovimentoparaproduzirprodutoseprocessoscientíficosacessíveisereutilizáveisportodos,nãosónoquedizrespeitoàculturadoconhecimentomastambémàstecnologiaseserviços.Convencerosinvestigadoresdosbenefíciosdamudançadassuaspráticaseproporcionar-lhescompetências,ferramentaseconhecimentoparaaplicarestatransformaçãotorna-seumatarefadamaiorimportância.
EstemanualofereceorientaçõeserecursosnãosóparainstrutoreseformadoresnoâmbitodaCiênciaAberta,mastambémparatodasaspessoasinteressadasemmelhorarosseusníveisdetransparênciaeparticipaçãonaspráticasdepesquisaeinvestigação.DeformaaapoiareinterligaracomunidadeemergentenaconjunturadaCiênciaAberta,quepretendepartilharoseuconhecimento,opresentemanualpropõeatividadesdeformaçãoquepodemseradaptadasavárioscontextosepúblicos-alvo.Omanualfornecemétodos,instruções,exemplosdeexercícioseideiasaosformadoresparaconcretizaremosseusprópriosplanosdeformaçãosobreaCiênciaAberta.FacultaaindaapromoçãoedefesadaCiênciaAbertadeformauniversalcomumKnow-howbaseadonosprincípiosdaCiênciaAbertadeformaaauxiliarnãosóinvestigadores,mastambémosprofissionaisdeapoioaestasáreas.Oqueresulta?Oquenãoresulta?Comotiraromáximopartidocomrecursoslimitados?Atravésdesteguiaencontraráumasériederecursosqueoajudarãoaconstruirassuasprópriasformações.
Construídocombasenaexperiênciaacumuladadosautores,mastambémnassuascompetênciasaníveldatransmissãodosprincípiosdaCiênciaAberta,estemanualéorientadoparaoensinopráticodoconhecimentoabertoemambienteeducacional.Poroutraspalavras,ofocodestemanualnãosefundamentanaideiadedivulgaraCiênciaAberta,massimapoiardeformaeficazaspráticasdaCiênciaAberta.
ParaQueméEsteManual?
1-IntroduçãoaoManual
5
https://ec.europa.eu/research/openscience/pdf/os_skills_wgreport_final.pdf#view=fit&pagemode=none
Estemanualdestina-seaqualquerpessoaquedesejeorganizareacolherformaçõessobreaCiênciaAbertamastambémtemafinalidadede,emsessõesdeformaçãodirecionadasapúblicosespecíficos,promoveraadoçãodepráticasdepesquisaabertas,mostrandoosconceitosdaCiênciaAberta.Istoengloba,investigadores,bibliotecários,administradoresdeinfraestruturas,colaboradoresdeapoioàpesquisa,financiadoresedecisorespolíticos.Estemanualédestinadoaindaatodosaquelesquetêmumcontactoregular,oumesmoocasional,cominvestigadores(eoutrosstakeholders)equedesejampartilharosseusconhecimentossobreCiênciaAberta,sejaemcontextoprofissionaloucomouminvestimentoextradoseutempo.Oimportanteéquesejaútilparatodososquedesejamacolhersessõesdeformaçãoparapromoverareutilização,aparticipação,aeficiência,aequidadeeapartilhadepesquisas,independentementedeatribuírem(oudesejaremutilizar)otermoCiênciaAberta.
Nestemanual,“Formador“,independentementedoseuníveldeexperiência,édefinidocomoqualquerpessoaquedesejeorientarformaçõessobreCiênciaAberta.Éimportantereferirqueestaquestãoincluitodosaquelesquesesentemmenosconfortáveis,ouquenãopretendemutilizarorótulodeCiênciaAberta,nassuassessõesdeformação.Omanualcontémaconselhamentoconcretomastambémconceitossobreoensinodecompetênciasparaaperfeiçoarotrabalhodosinvestigadores.Eapesardamaioriadostermosestardebaixodograndechapéude“CiênciaAberta”elesnãoprecisamdeserlecionadoscomotal.Énecessárioteralgumacautelaaoutilizarorótulode“CiênciaAberta”emcontextodeformação,vistoque“CiênciaAberta”podeatrairapenasumsegmentoespecíficodeinvestigadores,enquantoautilizaçãodotermo“Comopublicarosseusdados”temgrandesprobabilidadesdeatrairumgrupomaisdiversificado.Partedotrabalhodeumformadorédefiniroseupúblico-alvoeencontrarasmelhoresestratégiasparaalcança-lo,eamelhorpessoaparatomarestetipodedecisõeséopróprioformador.
OqueéaCiênciaAberta?
DeacordocomFOSTERtaxonomy,"ACiênciaAbertaéomovimentoparatornarapesquisacientífica,osdadoseasuadisseminaçãoacessíveisatodososníveisdeumasociedadeobservadora."Epodeserdefinidaatravésdeumconjuntodeprincípiosepráticas:
Principios:ACiênciaAbertapretendeincrementartransparência,reutilização,participação,cooperação,responsabilidadeereprodutibilidadenoprocessodeinvestigação.Temcomoobjetivomelhoraraqualidadeeafiabilidadedapesquisaatravésdeprincípioscomoinclusão,justiça,equidadeepartilha.ACiênciaAbertapodeservistacomoumapesquisasimplesdevidamenteefetuadaeestende-seatravésdasCiênciasdaFísicaedaVida,Engenharia,Matemática,CiênciasSociaiseHumanidades.(OpenScienceMOOC).Praticas:ACiênciaAbertacontémmudançasnaformacomoaciênciaérealizada–incluindooacessoabertoapublicaçõescientificas,ocompartilhamentodedados,cadernosabertos,transparêncianaavaliaçãodepesquisas,garantirareprodutibilidadedapesquisa(quandopossível),atransparêncianosmétodosdepesquisa,nocódigo-fonteaberto,nosoftwareeinfraestruturas,naciênciacidadãenosrecursoseducacionaisabertos.
Umnotasobrealinguagem:Comoapalavrainglesa"ciência"tradicionalmentenãoincluiasciênciashumanasesociais,ostermosmaisconcretoseparticularescomo"bolsadeestudoaberta"ou"pesquisaaberta"sãousadosdeformafrequentementeparacaracterizaressalacuna.Como“CiênciaAberta”éotermomaiscomum,vamosutilizá-loaqui,masdeveserlidocomoreferênciaàpesquisadetodasasdisciplinasacadémicas.
1-IntroduçãoaoManual
6
https://www.fosteropenscience.eu/taxonomy/term/7https://docs.google.com/document/d/1KuTSECSYHXZmZX15GDjyD65pJ90eRMhHVEZ-1trsw30/edit?usp=sharing
ComoutilizaroManual?
Estemanualfoiconcebidodeformamodular.Sinta-seàvontadeparaescolhercapítulosesaltaroutrosquepossamnãoserrelevantesparasiouparaasuaformação.
OCapítulo2centra-senoconteúdodasuaformação.TodosostópicosrelativosàCiênciaAbertasãoapresentadoseexplicadosnestapartedomanual.Jáestáfamiliarizadocomumoudoistópicos?Ótimo,analiseseexistemoutrostópicosquepodeaindanãoconhecer.Mesmoquenãoestejaaplanearformaçõessobreessestópicosiráperceberqueosmesmosserãoúteis,vistoqueexistealgumasobreposiçãoentreostópicossobreaCiênciaAberta.
Setempoucoounenhumtipodeconhecimentopréviosobreformaçãoemgeral,porfavorconsulteoCapítulo3:SobreAprendizagemeFormação.Estecapítuloofereceumavisãogeraldastécnicasdeformação,alémdedicaspráticasparaconstruiroseuplanodeformação.Sejátemalgumaexperiência,podetambémutilizá-lonãosóparareciclarosseusconhecimentos,mastambémparaconheceroutrostiposdeabordagemaoníveldoensino.
Workshopseeventosdecarizinformativodemaioresdimensõespodemexigirmuitapreparação.Paraqueoseueventosejabem-sucedido,teráquetomardiversasdecisões,desdeasmaispequenasatéàsmaiores,tendosempreemconsideraçãoquesãosuscetíveisaquestõestemporais.OCapítulo4forneceinformaçõesúteissobreaspetosorganizacionaisedisponibilizaaindaumachecklistbastanteútilparaajudarnoplaneamentodaformação.
Asformaçõeseeventosdenaturezainterativarequerematividadesatrativasedeenvolvimento.Osnossosexemplosdeexercícioseadisponibilizaçãoderecursosadicionaisirãoajudarnoenvolvimentodopúblico-alvo,nãosóatravésdeinformaçõespráticassobretópicosteóricos,mastambématravésdofeedbackdosparticipantes.OCapítulo5ofereceumavariedadedeexercícioserecursostestadoseaprovadosporespecialistasemformaçãosobreCiênciaAberta.Sinta-selivreparaostestar,adaptarereutilizar!
Comoqualqueroutraáreaemergente,aCiênciaAbertautilizaumaterminologiaporvezesdifícil,comtermosqueeventualmentepodenãoconhecer.Nãodesanime!OGlossárioexplicaráamaioriadostermoseconceitosquelhesãomenosfamiliares.
Estemanualfoicriadoparaserumrecursovivo,oquesignificaqueseráatualizadocomregularidadedevidoaosprogressosnaCiênciaAberta,mastambémcomorespostaàssugestõesefeedbackdeoutrosformadoresnaáreadaCiênciaAberta,assimcomodopúblicoemgeral.Sinta-selivredeadicionarepartilharassuasmelhorespráticas,exemplos,recursos,opiniõesouexperiênciasatravésdoGitBook.
Esperamosquedesfrutedaleituradestemanualedesejamos-lheomaiorsucessonassuasfuturasformaçõessobreCiênciaAberta.
LicençaAbertaeCréditos
1-IntroduçãoaoManual
7
OManualdeFormaçãoemCiênciaAbertafoielaboradocomoumRecursoEducativoAbertoparapermitirautilizaçãodomesmodamelhorformapossível.Estetrabalhoé,portanto,disponibilizadosobalicençaCreativeCommonsDedicaçãoaoDomínioPúblico(CC01.0Universal).Nãoénecessáriopedirautorizaçãoparareutilizarecopiarinformaçõescontidasnestemanual.Sinta-selivreparautilizarainformaçãoeosseusconteúdos,paraelaborarslidesouimagensquelhepareçamadequadasàssuassessõesdeformação.Tomenotaquealgunsdosmateriaiscitadosnestemanualpodemestarprotegidospordireitosdeautoredireitosconexos.Nessescasos,essainformaçãoseráindicadanotexto.Pedimosque,seutilizarconteúdodestemanual,citeasuafonte.
Fizemostodososesforçosparareferenciarasfontesqueutilizamos.Seporalgummotivonãoascitámos,issonãoaconteceudeformamaldosa.Sinta-selivreparanoscontactarparaelearning@fosteropenscience.eunocasodesernecessárioefetuarqualquertipodecorreção.
1-IntroduçãoaoManual
8
https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/deed.ptmailto:[email protected]
IntroduçãoàCiênciaAbertaEstecapítulotemcomoobjetivocontextualizareapresentarospontosprincipaisdoscomponentesmaisrelevantesdaCiênciaAberta.TendocomopontodepartidaosconceitoseosprincípiosfundamentaisdaCiênciaAberta,ocapítulotambémabordaoutroselementostaiscomoDadosdeInvestigaçãoAbertos,AcessoAberto,RevisãoporParesAbertaePolíticasdeCiênciaAberta,referindo,simultaneamente,aspetosmaispráticostaiscomoInvestigaçãoReprodutível,SoftwareAberto,LicenciamentoAbertoeFormatodeArquivos.
Cadasecçãoestáestruturadademodoaincluirumabrevedescriçãodotópico,umaexplicaçãodasuarelevânciaparaaCiênciaAberta,osprincipaisobjetivosdeaprendizagemquedevemserconsideradosemcontextoformativo,osprincipaiscomponentes(conhecimentosecompetências)quedevemserimplicados,algumasperguntas/obstáculos/equívocosmaisfrequentesnoâmbitodessetópicoe,finalmente,osresultadosesperadosdeumasessãodeformaçãoealgumassugestõesdeleituraadicional.
Capítulos
1.ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta2.DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos3.SoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto4.InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados5.AcessoAbertoaPublicações6.LicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiros7.PlataformasColaborativas8.RevisãoporParesAberta,MétricaseAvaliação9.PolíticasdeCiênciaAberta10.CiênciaCidadã11.RecursosEducativosAbertos12.DefesaepromoçãodaCiênciaAberta
2-IntroduçãoàCiênciaAberta
9
1.ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta
Oqueé?
ACiênciaAbertaéapráticacientíficaquepermitequeoutrospossamcolaborarecontribuir,ondeosdadosdainvestigação,asnotaslaboratoriaiseoutrosprocessosinvestigativossãolivrementedisponibilizados,sobcondiçõesquepossibilitemoreuso,aredistribuiçãoeareproduçãodainvestigaçãoedosdadosemétodossubjacentes(FOSTEROpenScienceDefinition).Emsuma,aCiênciaAbertaéoconhecimentotransparenteeacessívelqueépartilhadoedesenvolvidoatravésderedesdetrabalhocolaborativas(Vicente-Sáez&Martínez-Fuentes2018).
ACiênciaAbertaimplicaaumentarorigor,aresponsabilidadeeareprodutibilidadedainvestigação.Baseia-seemprincípiosdeinclusão,justiça,equidadeepartilhae,emúltimainstância,procuramudaromodocomoainvestigaçãoérealizada,quemestáenvolvidoecomoévalorizada.Oobjetivoétornarainvestigaçãomaisabertaàparticipação,àrevisão/refutação,àmelhoriaeaoseu(re)usoparabenefíciodetodos.
Existemváriasdefiniçõesde“abertura”noquedizrespeitoàciência;aOpenDefinitiondefine-aassim:“Osdadoseconteúdosabertospodemserusadoslivremente,modificadosepartilhadosporqualquerpessoaparaqualquerfim”.ACiênciaAbertaenglobaumasériedepráticas,normalmenteincluindoáreascomooacessoabertoàspublicações,dadosdeinvestigaçãoabertos,softwareeferramentasdecódigoaberto,fluxosdetrabalhoabertos,ciênciacidadã,recursoseducativosabertosemétodosalternativosparaavaliarainvestigação,incluindoarevisãopelosparesaberta(Pontikaetal.,2015).
Pontikaetal.(2015)
2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta
10
https://www.fosteropenscience.eu/foster-taxonomy/open-science-definitionhttp://opendefinition.org/https://f1000research.com/articles/6-588/v2#ref-59
OsobjetivoseospressupostossubjacentesaoimpulsoparaimplementarestasváriaspráticasforamanalisadosporFecher&Friesike(2013),cujarevisãodaliteraturaidentificoucincomaiorespreocupaçõesou“escolasdepensamento”.Sãoelas:
EscolaDemocrática:Acreditandoqueháumadistribuiçãodesigualdoacessoaoconhecimento,estaáreaestápreocupadaemtornaroconhecimentoacadémico(incluindopublicaçõesedados)disponívelparatodos.
EscolaPragmática:Seguindooprincípioqueaproduçãodoconhecimentoémaiseficienteseforassentenacolaboraçãoefortalecidaatravésdacrítica,estaáreaprocuraaproveitarosefeitosdaredeestabelecendoaligaçãoentreinvestigadoresetornandoosmétodosinvestigativostransparentes.
EscoladeInfraestruturas:Estalinhaémotivadapelasuposiçãodequeainvestigaçãoeficienterequerplataformasfacilmenteacessíveis,ferramentaseserviçosparadisseminaçãoecolaboração.
EscolaPública:Combasenoreconhecimentodequeoverdadeiroimpactosocialrequercompromissosocialnainvestigaçãoenacomunicaçãodosresultadoscientíficosfacilmentecompreensível,estaáreapretendeimplicaropúbliconaconstruçãodoconhecimentoatravésdaciênciacidadã,etornaroconhecimentomaisfacilmentecompreensívelatravésderesumosnumalinguagemacessível,blogseoutrosmeiosdecomunicaçãomenosformais.
EscoladeAvaliação:Motivadopeloreconhecimentodequeasmétricastradicionaisparamediroimpactocientíficosetêmmostradoproblemáticas(porsefocaremdemasiadonaspublicações,muitasvezesapenasaoníveldasrevistas,porexemplo),estavertenteprocura"métricasalternativas"quepossamfazerusodasnovaspossibilidadesdeferramentasdigitaisemredepararastrearemediroimpactodainvestigaçãoatravésdeatividadesanteriormenteinvisíveis.
Fundamentação
ACiênciaAberta,comodefinidaanteriormente,englobaumgrandenúmerodepotenciaismudançasestruturaisnapráticacientífica,cujaculturapodeser,muitasvezes,hierárquicaeconservadora.Alémdisso,mesmoquandoosinvestigadoressimpatizamcomosobjetivosdaCiênciaAberta,épossívelqueaindanãopercebamautilidadedeosadotar,umavezqueosmecanismosdeincentivoexistentesaindanãorefletemessanovaculturadeaberturaecolaboração.Comoconsequência,convencerosinvestigadoresdanecessidadedemudarassuaspráticasexigiráumbomentendimentonãosódosbenefícioséticos,sociaiseacadémicos,mastambémdequemaneira,aoadotaraspráticasdeCiênciaAberta,issorealmentepoderácontribuirparaosucessodasuainvestigação.Estaseçãodescreveráalgunsdosprincipaisconceitos,princípios,atoresepráticasdaCiênciaAbertaecomoestesseencaixamnumecossistemadeinvestigaçãomaisamplo.
2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta
11
https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=2272036
ObjetivosdeAprendizagem
1. Compreenderosconceitoseosprincípiossociais,económicos,legaiseéticosquesustentamaCiênciaAberta.
2. Familiarizar-secomahistóriadaCiênciaAberta,bemcomocomadisparidadeediversidadedeperspetivasoriundasdediferentescomunidadesdeinvestigação,disciplinaseculturas.
3. ConhecerosdesenvolvimentosemtornodaCiênciaAbertaedoimpactopessoalqueaquelespodemtersobreosinvestigadores,ainvestigaçãoe,numaperspetivamaisalargada,nasociedade.
Componentes-chave
ConhecimentoseCompetências
2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta
12
ACiênciaAbertaéomovimentoqueajudaatornarosresultadosdainvestigaçãoacadémicamaisacessíveis,incluindocódigo,dadoseartigoscientíficos.
Abrangemuitosaspetosdiferentes,masmuitasvezesrelacionados,queafetamtodoociclodevidadainvestigação,incluindopublicaçãoaberta,dadosabertos,softwaredecódigoaberto,registoscientíficosabertos,revisãoporparesaberta,disseminaçãoabertaemateriaisabertos(veroglossárioparadefinições).
HistóriadaCiênciaAbertaeasmotivaçõespordetrásdomovimento.
AsorigensdapublicaçãoacadémicaremontamaoséculoXVIIcomasprimeirasrevistasacadémicas.
Crescentemotivaçãoparapartilharrecursosentreasdiferentesdisciplinas,bemcomooaumentodatransparênciaparaobtermaiseficiência,rigor,responsabilidade,sustentabilidadeparafuturasgeraçõesereprodutibilidade.
Casoséticospelosquaisoaumentodatransparênciapodereduzirfraudes,manipulaçãodedadoseapresentaçãoseletivaderesultados.
Oestadoatualsurgiudapressãoporpartedascomunidadesacadémicasedosgovernosparaqueasinvestigaçõesfinanciadascomfundospúblicosfossempartilhadasmaisabertamente,muitasvezescomopropósitodeacelerarocrescimentoeconómicoesocialeainovação.
Osresultadosdainvestigaçãofinanciadacomfundospúblicosdevemestarpublicamenteacessíveis.
Énecessáriolevaracaboumamudançaculturalnainvestigaçãoeentreosinvestigadores.
AdotarferramentasdaWebetecnologiasparafacilitaracolaboraçãocientífica.
Diferençasepontoscomunsnoâmbitodaspráticas,princípiosecomunidadesdeCiênciaAberta.*
ÉgeralmenteaceitequeaCiênciaAbertaconduzaummaiorimpactoassociadoaumapartilhaereutilizaçãomaisamplos\porexemplo,achamada"openaccesscitationadvantage").
ACiênciaAbertapodeaumentaraconfiançanaciênciaenafiabilidadedosresultadoscientíficos.
CiênciaAbertaesuarelaçãocomlicençasedireitosdeautor.
Normalmente,osresultadosdainvestigaçãoabertasãolicenciadosabertamenteparamaximizarareutilização,permitindoqueoautormantenhaapropriedadeerecebacréditopeloseutrabalho.
Perguntas,obstáculoseequívocoscomuns
Q:"QualadiferençaentreCiênciaAbertae'ciência'?"
A:CiênciaAbertaimplicafazerciênciatradicionalcommaistransparêncianassuasváriasfases,porexemplopartilhandodeformaabertacódigoedados.Muitosinvestigadoresjáfazemistoatualmente,masnãolhechamamCiênciaAberta.
Q:"ACiênciaAbertaexcluíasCiênciasSociaseHumanas?
A:Não,otermoCiênciaAbertaéinclusivo.Naverdade,oqueaconteceéqueporvezesaCiênciaAbertaégenericamentereferidacomo"InvestigaçãoAberta"ou"InvestigaçãoAcadémicaAberta"(de"OpenScholarship")parasermaisinclusivaaoutrasdisciplinas,princípiosepráticas.Noentanto,CiênciaAbertaéumtermocomumenteusadoemváriosníveise,portanto,fazsentidoadotá-loparafinsdecomunicação,comacondiçãoqueincluitodasasdisciplinasdainvestigação.
2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta
13
https://sparceurope.org/what-we-do/open-access/sparc-europe-open-access-resources/open-access-citation-advantage-service-oaca/oaca-list/
Q:"ACiênciaAbertaconduzaousoindevidoouincompreensãodainvestigação?"
A:Não,aaplicaçãodosprincípiosdaCiênciaAbertaé,defato,umaproteçãocontraousoindevidooumal-entendido.Atransparênciageraconfiançaepermitequeoutraspessoasverifiquemevalidemoprocessodeinvestigação.
Q:"ACiênciaAbertairáprovocarumasobrecargadeinformação?"
A:Émelhortermuitainformaçãoelidarcomisso,doquetermuitopoucaevivercomoriscodeperderaspartesimportantes.EhátecnologiascomoRSSfeeds,aprendizagemautomáticaoudemáquinaeinteligênciaartificialquefacilitamaagregaçãodeconteúdo.
Resultadosdeaprendizagem
1. Sercapazdeexplicarosprincípioseconceitosacadémicos,económicosesociaiscentraisquesustentamaCiênciaAberta,eporquerazãoissoéimportanteemtermosdeimpactosmaisalargados.
2. DesenvolverumacompreensãodasnumerosasdimensõesdaCiênciaAbertaedealgumasdasferramentasepráticasenvolvidas.
3. EstarfamiliarizadocomoestadoatualdaCiênciaAbertaecomadiversidadedeperspetivasqueissoengloba.
Leituraadicional
EuropeanCommission'sDirectorate-GeneralforResearch&Innovation(RTD)(2016).Openinnovation,OpenScience,opentotheworld-avisionforEurope.ec.europa.eu/digital-single-market/en/news/open-innovation-open-science-open-world-vision-europe
FecherandFriesike(2014).OpenScience:OneTerm,FiveSchoolsofThought.doi.org/10.1007/978-3-319-00026-8_2
HighLevelGroup(2017).Europe'sfuture.Openinnovation,OpenScience,opentotheworld:reflectionsoftheResearch,InnovationandSciencePolicyExperts(RISE).doi.org/10.2777/79895
MasuzzoandMartens(2017).DoyouspeakOpenScience?Resourcesandtipstolearnthelanguage.doi.org/10.7287/peerj.preprints.2689v1
Watson(2015).Whenwill‘OpenScience’becomesimply‘science’?.doi.org/10.1186/s13059-015-0669-2
2.1-ConceitoePrincípiosdaCiênciaAberta
14
https://ec.europa.eu/digital-single-market/en/news/open-innovation-open-science-open-world-vision-europehttps://doi.org/10.1007/978-3-319-00026-8_2https://doi.org/10.2777/79895https://doi.org/10.7287/peerj.preprints.2689v1https://doi.org/10.1186/s13059-015-0669-2
2.DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
Oquesão?
Dadosdeinvestigaçãoabertossãodadosquepodemserlivrementeacedidos,reutilizados,remisturadoseredistribuídos,paraefeitosdeinvestigaçãoacadémicaeensinoeoutrosfins.Idealmente,osdadosabertosnãotêmrestriçõesdereutilizaçãoouredistribuição,etêmlicençasapropriadasparatal.Emcasosexcecionais,porexemploparaproteçãodeidentidadedepessoas,sãoestabelecidasrestriçõesespeciaisoulimitadasdeacesso.Partilharabertamenteosdadosexpõe-nosàinspeção,oqueconstituiabaseparaaverificaçãoereprodutibilidadedainvestigação,eabreocaminhoparaamaisamplacolaboração.Nomáximo,osdadosabertospodemestarsujeitosaorequisitodeatribuiçãoepartilhademodoigual(verOpenDataHandbook).
Fundamentação
Osdadosdeinvestigaçãosãofrequentementeoresultadomaisvaliosodemuitosprojetosdeinvestigação,sãousadoscomofontesprimáriasquesustentamainvestigaçãocientíficaepossibilitamaderivaçãodedescobertasteóricasouaplicadas.Deformaatornardescobertas/estudosreplicáveis,oupelomenosreprodutíveloureutilizável(referênciaàInvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados)dequalqueroutraforma,arecomendaçãodeboaspráticasparaosdadosdeinvestigaçãoéseremomaisabertoseFAIRpossíveis,tendoemcontaosconstrangimentoséticos,comerciaisedeprivacidadededadossensíveisoudadosproprietários.
Objetivosdeaprendizagem
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
15
http://opendatahandbook.org/guide/en/what-is-open-datahttps://www.force11.org/fairprinciples
1. CompreenderascaracterísticaseprincípiosbásicosdosdadosdeinvestigaçãoabertoseFAIR,incluindooempacotamentoedocumentaçãoapropriados,parapermitirqueoutrosentendem,reproduzam,ereutilizemdeformasalternativas.
2. Familiaridadecomostiposdedadosquepodemserconsideradossensíveis,easrestriçõesouconstrangimentosdeospartilharabertamente.
3. Sercapazdeconverterumconjuntodedados'fechados'em'aberto'implementandoasmedidasnecessáriasnumplanodegestãodedados,comaadministraçãodosdadosemetadadosapropriados.
4. Sercapazdeusarplanosdegestãodedadosetornarosseusresultadosdeinvestigaçãolocalizáveiseacessíveis,mesmoquecontenhamdadossensíveis.
5. Compreenderosprósecontrasdepartilharabertamentediferentestiposdedados(ex.,privacidade,sensibilidade,anonimização,acessomediado).
6. Compreenderaimportânciademetadadosapropriadosparaoarquivosustentáveldosdadosdeinvestigação.
7. Compreenderosfluxosdetrabalhobásicoseasferramentasparapartilhadedadosdeinvestigação.
Componentes-chave
Conhecimento&Capacidades
PrincípiosFAIR
Em2014,foielaboradoumconjuntodeprincípiosbásicosdeformaaotimizarareutilizaçãodedadosdeinvestigação,aquefoidadosonomedePrincípiosparaDadosFAIR.RepresentamumconjuntodenormaseboaspráticasdesenvolvidaspelacomunidadeparaassegurarqueosdadosouqualquerobjetodigitalsãoFindable(localizáveis),Accessible(acessíveis),Interoperable(interoperáveis)eRe-usable(reutilizáveis):
Findable:Oprimeirorequisitoparatornarosdadosreutilizáveiséapossibilidadedeosencontrar.Deveserfácilencontrarosdadoseosmetadadostantoparahumanoscomoparacomputadores.Adescobertaautomáticaefiáveldeconjuntosdedadoseserviçosdependedeidentificadorespersistenteslegíveispormáquinas(PIDs)edemetadados.
Accessible:Os(meta)dadosdevemserrecuperáveispeloseuidentificadorutilizandoumprotocolodecomunicaçõespadronizadoeaberto,possivelmenteincluindoautenticaçãoeautorização.Alémdisso,osmetadadosdevemestardisponíveismesmoquandoosdadosjánãoestão.
Interoperable:Osdadosdevempodersercombinadoseusadoscomoutrosdadosouferramentas.Oformatodosdadosdeveserabertoeinterpretávelporváriasferramentas,incluindooutrosregistosdedados.Oconceitodeinteroperabilidadeaplica-setantoaosdadoscomoaosmetadados.Porexemplo,os(meta)dadosdevemusarvocabuláriosquesigamosprincípiosFAIR.
Re-usable:Emúltimainstância,FAIRtemoobjetivodeotimizarareutilizaçãodosdados.Paraisso,osmetadadoseosdadosdevemestarbemdescritosparaquepossamserreplicadose/oucombinadosemdiferentescontextos.Alémdisso,areutilizaçãodos(meta)dadosdeveestardeclaradaatravésde(uma)licença(s)clara(s)eacessível(eis).
Aocontráriodeiniciativassimilaresqueseconcentramnoinvestigador,osprincípiosFAIRdãoênfaseaoaumentodacapacidadedasmáquinasautomaticamenteencontraremeusaremosdadosouqualquerobjetodigital,alémdeapoiarasuareutilizaçãoporpessoas.OsprincípiosFAIRsãoprincípiosorientadores,nãonormas.OsFAIRdescrevemqualidadesoucomportamentosnecessáriosparatornarosdadosreutilizáveisaomáximo.(ex.,descrição,citação).Estasqualidadespodemseratingidasatravésdediferentesnormas.
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
16
https://www.force11.org/group/fairgroup/fairprinciples
Publicaçãodedados
AmaioriadosinvestigadoresestámaisoumenosfamiliarizadacomapublicaçãoemAcessoAbertodeartigosdeinvestigaçãoedelivros(vercapítulo5).Maisrecentemente,epelasrazõesmencionadasacima,apublicaçãodedadosganhouumaatençãocrescente.Cadavezmaisfinanciadoresesperamqueosdadosproduzidosemprojetosdeinvestigaçãoquefinanciamfiquemlocalizáveis,acessíveisetãoabertosquantopossível.
Existemváriasformasdetornarosdadosdeinvestigaçãoacessíveis,incluindo(Wikipedia):
Publicarosdadoscomomaterialsuplementarassociadoaumartigodeinvestigação,geralmentecomosficheirosdedadosdisponíveisjuntodoartigonositedaeditora.
Inserirosdadosnumsitedisponívelpublicamente,comosficheirosdisponíveisparadownload.
Depositarosdadosnumrepositórioquetenhasidodesenvolvidoparaapoiarapublicaçãodedados,ex.,Dataverse,Dryad),Figshare,Zenodo.
Existeumgrandenúmeroderepositóriosgeraisoudedomíniosespecíficosquepodemfornecerapoioadicionalaosinvestigadoresnoprocessodedepósitodosseusdados.
Publicarumartigodedadossobreoconjuntodedados,quepodeserpublicadocomopreprint,numarevistacientífica,ounumarevistadedadosqueédedicadaaartigosdedados.Osdadospodemseralojadosnarevistaouseparadamentenumrepositóriodedados.ExemplosderevistasdedadosincluemScientificData(daSpringerNature)eDataScienceJournal(daCODATA).Paraumarevisãoabrangentedasrevistasdedados,verCandelaetal.
OCESSDAERICExperttourguideonDataManagementforneceumavisãogeraldosprósecontrasdediferentesviasdepublicaçãodedados.Porvezes,oseufinanciadorououtraentidadeexternarequerequeuseumrepositórioespecífico.Setiverliberdadedeescolha,podeconsideraraordemdepreferêncianasrecomendaçõesdoOpenAIRE:
1. Useumarquivodedadosexternoouumrepositóriojáestabelecidoparaasuaáreadeinvestigaçãoparapreservarosdadosdeacordocomospadrõesreconhecidosnasuadisciplinaoudomíniodeinvestigação.
2. Sedisponível,useumrepositórioinstitucionaldedadosdeinvestigação,ouosrecursosdegestãodedadosestabelecidospeloseugrupodeinvestigação.
3. UseumrepositóriodedadosgratuitotalcomoDataverse,Dryad,figshareouZenodo.4. Procureoutrosrepositóriosdedadosemre3data.Nãoexisteumfiltroúniconore3dataquecubraosprincípiosFAIR,mas
considereasseguintesopçõesdefiltrosparaoajudaraencontrarrepositórioscompatíveiscomosprincípiosFAIR:categoriasdeacesso,licençasdeusodosdados,repositóriosdedadosconfiáveis(comcertificadooucomadesãoexplícitaapadrõesdearquivo)eseorepositórioatribuiumidentificadorpersistente(PID)aosdados.Outroaspetoaconsideraréseorepositóriosuportaversionamento.
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
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https://en.wikipedia.org/wiki/Data_publishinghttps://en.wikipedia.org/wiki/Research_articlehttps://en.wikipedia.org/wiki/Dataversehttps://en.wikipedia.org/wiki/Dryad_(repositoryhttps://en.wikipedia.org/wiki/Figsharehttps://en.wikipedia.org/wiki/Zenodohttps://www.nature.com/sdata/http://www.codata.org/publications/data-science-journalhttps://doi.org/10.1002%2Fasi.23358https://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/6.-Archive-Publish/Data-publishing-routeshttps://www.openaire.eu/opendatapilot-repository-guidehttps://dataverse.org/https://datadryad.org/pages/faq#depositing-costhttps://figshare.com/https://zenodo.org/https://www.re3data.org/
Deveconsiderarondedepositarepublicarosseusdadoslogonoseuplanodegestãodedados.OCESSDAoferecealgumasquestõespráticas,queserecomendaconsiderar.Porexemplo:Quedadosemetadadosassociados,documentaçãoecódigoserãodepositados?Quantotempoénecessárioconservarosdados?Porquantotempoosdadosdevempermanecerreutilizáveis?Comovãoestardisponíveisosdados?Quecategoriadeacessovaiescolher?ParamaisquestõesvejaAdaptyourDMP:part6.Poroutrolado,nãoseesqueçadeverificarseorepositórioqueescolheupreencheosrequisitosdasuainvestigaçãoedoseufinanciador.Algunsrepositóriosobtiveramcertificação,talcomoCoreTrustSeal,quecertificaosrepositórioscomoconfiáveisequepreenchemosrequisitosdeCoreTrustworthyDataRepositories.Valeapenamencionarquealgunsrepositóriosdisciplinaresdeáreasespecíficaspodemaceitarapenasdadoscomaltaqualidadecompotencialdereutilizaçãoequepodemserpartilhadospublicamente.
Umavezqueexistemváriosformasdepublicarosseusdados,devenotarqueparaumconjuntodedados"contar"comoumapublicação,deveseguirumprocessodepublicaçãosimilaraodeumartigo(Braseetal.,2009)edeveser:
Devidamentedocumentadocommetadados;
Revistoquantoàqualidade,ex.conteúdodoestudo,metodologia,relevância,consistêncialegaledocumentaçãodemateriais;
Pesquisávelelocalizávelemcatálogos(oubasesdedados);
Citávelemartigos.
Citaçãodedados
Serviçosdecitaçãodedadosajudamascomunidadesdeinvestigaçãoaencontrar,identificarecitardadosdeinvestigação(efrequentementeoutrosobjetosdeinvestigação)comconfiança.NormalmenteistoenvolveacriaçãoeatribuiçãodeDigitalObjectIdentifiers(DOIs),edosmetadadosqueosacompanhamatravésdeserviçoscomoDataCite(https://www.datacite.org),epodeserintegradonosfluxosdetrabalhoepadrõesdeinvestigação.Esteéumcampoemergente,eenvolveaspetoscomotransmitiraoseditoresderevistascientíficasaimportânciadacitaçãodedadosapropriadanosartigos,bemcomopermitirqueosartigoscientíficossejamligadosaquaisquerdadossubjacentesquelhederamorigem.Atravésdisto,osdadoscitáveistornam-secontribuiçõeslegítimasparaoprocessodecomunicaçãoacadémica,epodemajudarapavimentarocaminhoparanovasmétricasemodelosdepublicaçãoquereconheçamepremeiemapartilhadedados.
Comopassoinicialemdireçãoàsboaspráticasparaacitaçãodedados,oDataCitationSynthesisGroupdaFORCE11apresentouaJointDeclarationofDataCitationPrinciples,direcionadotantoparainvestigadorescomoparafornecedoresdeserviçosdedados.Aoaderiraestesprincípios,osrepositóriosdedadosgeralmenteoferecemaosinvestigadoresumareferênciaquepodemusaraoreferir-seaumdeterminadoconjuntodedados.
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
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https://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-Tour-Guide-on-Data-Management/6.-Archive-Publish/Adapt-your-DMP-part-6https://doi.org/10.3233/ISU-2009-0595https://www.datacite.orghttps://doi.org/10.25490/a97f-egyk
Empacotamentodedados
Pacotesdedadossãorecipientesparaadescriçãoepartilhadosficheirosdedadosacompanhantes,egeralmenteincluemumficheirodemetadadosdescrevendoascaracterísticasecontextodeumconjuntodedados.Istopodeincluiraspetoscomoinformaçãodacriação,proveniência,tamanho,formato,definiçõesdaárea,bemcomoquaisquerficheiroscontextuaisrelevantes,comoscriptsdecriaçãodedadosoudocumentaçãotextual.DoDataPackagingGuide:
Osdadossãoeternos:osconjuntosdedadossobrevivemaoseupropósitooriginal.Limitaçõesdosdadospodemseróbviasnoseucontextooriginal,talcomoumcatálogodebiblioteca,maspodemnãoserevidentesquandoosdadossãoseparadosdaaplicaçãoemqueforamcriados.
Osdadosnãosãosuficientesporsipróprios:Informaçãosobreocontextoeproveniênciadosdados--comoeporqueforamcriados,queobjetosdomundorealeconceitosrepresentam,asrestriçõesdevalores--énecessáriaparaajudarosconsumidoresainterpretá-losdeformaresponsável.
Estruturarmetadadossobreconjuntosdedadosdeumafor,mapadronizadaelegívelpormáquinasencorajaapromoção,partilha,ereutilizaçãodosdados.
Partilhardadossensíveisedadosproprietários
Comumplanodegestãodedadosapropriadomuitosdadossensíveiseproprietáriospodemserpartilhados,reutilizados,etornadosFAIR.Osmetadadospodemquasesempreserpartilhados.Asorientaçõeseboaspráticasparapartilhadedadossensíveissãonecessariamenteespecíficosdecadaregiãodevidoadiferentesregulamentações(verporexemploUKDS’CompanionmaterialforManagingandSharingResearchDatahandbook).AInternationalAssociationforSocialScienceInformationServicesandTechnologytemumalistadeorientaçõesinternacionaisemgestãodedadosqueéumbompontodepartida.Existemváriasabordagenseiniciativasparaajudarosinvestigadoresaalcançaresteobjetivo.AferramentaDMPonlinedoDCCincluiváriosmodelosparaosfinanciadores.OCESSDAExpertTourGuideonDataManagementforneceinformaçãoeexemplospráticosdecomopartilhardadospessoaisesobrequestõesdedireitosdeautorebasesdedadosnospaíseseuropeus.OTourGuideofereceaindaumavisãogeraldoimpactodoRGPDqueharmonizaalegislaçãorelativaaosdadospessoaisnaEuropa(Maiode2018),eforneceumavisãoatualizadasobreadiversidadedeproteçãodedadosnaUE.
Intermediáriosdedados
Intermediáriosdedados(databrokers)sãoentidadesespecializadaseindependentesqueagemcomoadministradoresdedadosparadadossensíveis.Osinvestigadorespodemtransferirosseusdadossensíveiseajurisdiçãosobreoacessoaessesdadosparaointermediário.Istoéespecialmentecomumnosdadosaoníveldopacienteemestudosclínicos.Osintermediáriosfornecemumnívelde
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
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https://github.com/saverkamp/beyond-open-data/blob/master/DataGuide.mdhttps://www.ukdataservice.ac.uk/manage-data/handbookhttp://www.iassistdata.org/resources/data-management/best-practiceshttp://www.dcc.ac.uk/dmponlinehttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Ethics-and-data-protectionhttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Processing-personal-data/Diversity-in-data-protectionhttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Processing-personal-data/Diversity-in-data-protection
independêncianaavaliaçãodequaispedidosdedadossãocientificamenteválidosenãoirãoviolaraprivacidadedosparticipantesnainvestigação.ExemplosdeintermediáriosdedadosincluemoProjetoYODA,ClinicalStudyDataRequest.com,NationalSleepResearchResourceeSupportingOpenAccessforResearchers(SOAR).
Portaisdeanálise
Portaisdeanálisessãoplataformasquepermitemanálisededadosaprovadasempermitiracessocompleto(visualizaçãooudownload)oucontrolarondeequemtemacesso.Algunsintermediáriosdedadostambémusamestesportaisdeanálise.Osportaisdeanálisecontrolamqueconjuntosdedadosadicionaispodemseragrupadoscomosdadossensíveis,bemcomoqueanálisespodemserexecutadasparaassegurarqueasinformaçõespessoaisnãosãoreveladasduranteareanálise.ExemplosdeportaisdeanálisevirtuaisincluemProjectDataSphere,Vivli,RAIRD,Corpuscle,eINESS.
Osinvestigadoresdeciênciassociaiseoutrosinvestigadorescomdadossensíveisusamumportaldeanálisedelocalizaçãosingularqueapenaspermiteoacessodeformacontrolada.Osinvestigadoresaprovadospodemacederaosdadosinsitu,numasalasegura,parapropósitoscientíficos.Noentanto,osmetadadosquedescrevemosdadosdevemestardisponíveisabertamenteecumprirosprincípiosFAIR.
Dadosanonimizadosesintéticos
Muitosconjuntosdedadoscontendoinformaçãoprivadadosparticipantespodemserpartilhadosassimqueosconjuntosdedadosforemanonimizados(MétodoSafeHarbour)ouumespecialistativerdeterminadoqueoconjuntodedadosnãopermiteaidentificaçãoindividual(MétodoExpertDetermination).ConsulteoseuConselhodeÉticaemInvestigação/ConselhodeRevisãoInstitucionalparasabermaissobrecomoprocederdestaformacomosseusdados.TambémrecomendamosoCESSDAExpertTourGuideonDataManagement,queforneceinformaçãoeexemplospráticossobrecomopartilhardadospessoais.Noentanto,algunsconjuntosdedadosnãopodemseranonimizadosepartilhadosdeformasegura.Osinvestigadorespodemaindaassimmelhoraraaberturadainvestigaçãonestetipodedadosaocriarepartilhardadossintéticos.Osdadossintéticostêmumaestrutura,conteúdo,edistribuiçãosimilaresaosdadosreaisevisamatingira"validadeanalítica":aanáliseestatísticaobteráosmesmosresultadosparaosdadossintéticoscomoparaosdadosreais.ODepartamentodeCensosdosEstadosUnidos,porexemplo,usadadossintéticoseportaisdeanáliseemcombinaçãocomapermissãodereutilizaçãodedadosaltamentesensíveis.
DataTags
DataTagséumaestruturaquepermiteavaliaçõesassistidasporcomputadorderestriçõeslegais,contratuaisepolíticasqueregemasdecisõessobreapartilhadedados.OsistemaDataTagsperguntaaoutilizadorumasériedequestõesparaextrairaspropriedadesprincipaisdeumdadoconjuntodedadoseaplicaregrasinferidasparadeterminarqueleis,contratos,eboaspráticassãoaplicáveis.OresultadoéumconjuntodeDataTagsrecomendadas,ouetiquetassimpleseicónicasquerepresentamumapolíticadedadoslegívelporhumanoseacionávelpormáquinas,eumalicençaqueéfabricadaparaumconjuntodedadosespecífico.OsistemadeDataTagstemsidodesenhadoparaserintegradocomosoftwaresderepositóriosdedados,efuncionarátambémcomoferramentaindependente.DataTagsestáaserdesenvolvidonaUniversidadedeHarvard.NaEuropa,aDANSestáatrabalharemajustarDataTagsàlegislaçãoEuropeia/RegulamentoGeraldeProteçãodeDados(RGPD)(cf.DANSRGPDDataTags).
Comofoireferidoanteriormente,oderradeiroobjetivodapartilhadedadosdasuainvestigaçãoétorná-losreutilizáveisaomáximo.Paraatingiresseobjetivo,antesdepartilharosdadosteráqueosgerirdeacordocomasboaspráticas.Istoinclui,entreoutrascoisas,documentaçãoeescolhadeformatosdeficheirosabertoselicenças.PodelermaissobreesteassuntonoCapítulo2.4:InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDadosbemcomonoCapítulo2.6:LicençasAbertaseFormatosdeFicheiros.
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
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http://yoda.yale.edu/https://www.clinicalstudydatarequest.com/https://sleepdata.org/https://dcri.org/our-approach/data-sharing/https://www.projectdatasphere.org/projectdatasphere/html/homehttp://vivli.org/http://raird.no/http://clarino.uib.no/korpuskel/pagehttp://clarino.uib.no/iness/pagehttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/5.-Protect/Ethics-and-data-protectionhttps://census.gov/content/dam/Census/programs-surveys/sipp/methodology/SSBdescribe_nontechnical.pdfhttps://datatags.org/https://www.eugdpr.org/https://zingtree.com/host.php?style=buttons&tree_id=442670046&persist_names=Restart&persist_node_ids=58#58
MateriaisAbertos
Alémdapartilhadosdados,aaberturadainvestigaçãodependedapartilhademateriais.Osmateriaisqueosinvestigadoresusamsãoespecíficosparacadadisciplinaeporvezesexclusivosdeumlaboratório.Abaixoencontraráexemplosdemateriaisquepodepartilhar,apesardesempredeverconsultaroscolegasdasuaáreadeconhecimentosobrequerepositóriossãoutilizados.Quandotivermateriais,dados,epublicaçõesdomesmoprojetodeinvestigaçãopartilhadosemdiferentesrepositórios,assegure-sedefazerreferênciacruzadacomumaligaçãoeumidentificadorúnicoparaquepossamserfacilmentelocalizados.
Reagentes
Umreagenteéumasubstância,compostooumisturaquepodeseradicionadoaumsistemadeformaacriarumareaçãoquímicaououtra.OsreagentespodemserdepositadosemrepositórioscomoAddgene,TheBloomingtonDrosophilaStockCenter,eATCCparatorná-losfacilmenteacessíveisporoutrosinvestigadores.Atribua-lhesumalicençaparaquepossamserreutilizadosporoutrosinvestigadores.
Protocolos
Umprotocolodescreveumregistoformalouoficialdeobservaçõescientíficasexperimentaisnumformatoestruturado.Depositeprotocolosvirtuaisparacitação,adaptação,ereutilizaçãousandoProtocols.io.
Notebooks,containers,software,ehardware
Asanálisesreprodutíveissãofacilitadaspelousodeprogramaçãodocumentada,tecnologiadecontainers,evirtualização.Alémdepartilharoseucódigoeosseusdados,tambémpodepartilharosseusnotebooksJupyter,imagensDocker,ououtrosmateriaisdeanáliseoudependênciasdesoftware.Partilhenotebooksatravésdeserviçosabertoscomomybinderquepermitevisualizaçãopúblicaeexecuçãodetodoonotebookemrecursospartilhados.ContainersenotebookspodemserpartilhadoscomRockerouCodeOcean.SoftwareehardwareusadosnasuainvestigaçãodevemserpartilhadosseguindoasboaspráticasparadocumentaçãocomofoidefinidonoCapítulo2.3.OsprotocolosapenasparaleituradevemserdepositadosnoregistodasuaáreadoconhecimentostalcomoClinicalTrials.goveSocialScienceRegistry](https://www.socialscienceregistry.org/)ouemumregistogeralcomoOpenScienceFramework.Váriasrevistascientíficas,comoaTrials,aJMIRResearchProtocols,ouaBio-Protocol,irãopublicaroseuprotocolo.Asboaspráticasparaapublicaçãoemacessoabertodoseuprotocolosãoasmesmasqueparapublicaroseurelatórioemacessoaberto(verCapítulo2.5).
Perguntas,obstáculos,eequívocoscomuns
P:"Ésuficientedisponibilizarosmeusdadosemacessoaberto?"
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
21
https://www.addgene.org/https://bdsc.indiana.edu/https://www.atcc.org/https://www.protocols.io/https://www.protocols.io/http://mybinder.orghttps://arxiv.org/abs/1710.03675https://codeocean.com/https://clinicaltrials.gov/https://osf.io/https://trialsjournal.biomedcentral.com/https://www.researchprotocols.org/https://bio-protocol.org/
R:"Não—aaberturaéumacondiçãonecessáriamasnãosuficienteparaareutilizaçãomáxima.Osdadosalémdeseremabertos,têmdeserFAIR."
P:"Oquesignificam/implicamosprincípiosFAIRparadiferentespartesinteressadas/públicos?"
R:"Esseéumexcelenteassuntoparadiscussão!"
Obstáculo:OsInvestigadorespodemsentir-sehesitantesapartilharosseusdadosporquetêmmedoqueoutrososreutilizemantesqueelespossamextrairomáximousopossíveldosseusdados,ouqueoutrospossamnãoentendercompletamenteosdadoseosqueutilizemdeformaincorreta.
(sugerido)R:Podepublicarosseusdadosetorná-losacessíveisatravésdemetadados,masatribua-lhesumperíododeembargoparaseassegurarquepublicao(s)seu(s)artigo(s)primeiro.
P:"TornarosmeusdadosFAIRconstituitrabalhoextra?"
R:"Nãonecessariamente!TornarosdadosFAIRnãoéresponsabilidadesódosinvestigadorescomoindivíduosmasdetodoogrupo.Amelhorformadeassegurar-sequeosseusdadossãoFAIRécriarumPlanodeGestãodeDadoseplaneartudodeantemão.Durantearecolhadosdadoseoprocessamentodosdadossigaosnormasdasuaáreadeconhecimentoeasmedidasrecomendadasporumrepositório.
P:"Euqueropartilharosmeusdados.Quelicençadevoatribuir-lhes?"
R:"Essaéumaboapergunta.Emprimeirolugarpense:queméoproprietáriodosdados?Umfinanciadordeinvestigaçãoouainstituiçãoparaquemtrabalha?Depois,pensenaautoridade.Aplicaralicençaadequadaaosseusdadosécrucialparaostornarreutilizáveis.Paramaisinformaçãosobrelicenças,veja6.LicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiros.
P:"Eunãopossotornarosmeusdadosdisponíveisdiretamente—sãomuitograndesparapartilhardeformaconveniente/têmrestriçõesrelacionadascomquestõesdeprivacidade.Comodevoproceder?"
R:"Deveconversarcomespecialistasemrepositóriosdasuaáreadoconhecimentosobrecomofornecerinstruçõessuficienteparatornarosseusdadoslocalizáveiseacessíveis."
Resultadosdaaprendizagem
1. Compreenderascaracterísticasdedadosabertos,emespecialosprincípiosFAIR.
2. Ficarfamiliarizadocomalgunsargumentosafavorecontraosdadosabertos.
3. SercapazdediferenciareabordardadossensíveisedadosFAIR;estasduascategoriasnãosãonecessariamenteincompatíveis.
4. Sercapazdetransformarumconjuntodedadosdeformaaquefiquepreparadoparapartilhadeformaaberta(formatosnãoproprietários),cumpraospadrõesdosprincípiosFAIR,esejadesenhadosparaaacessibilidade,transparênciaereutilizaçãomaximizadaatravésdofornecimentodemetadadossuficientes.
5. Saberadiferençaentredadosembrutoseprocessados(oulimpos),eaimportânciadasetiquetasdasversões.
6. Conhecerformatosdeficheirosfrequentementeutilizadosepadrõesdacomunidadeparaamáximareutilização.
7. Sercapazderedigirumplanodegestãodedados.
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
22
Leituraadicional
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Candelaetal.(2015).Datajournals:Asurvey.doi.org/10.1002/asi.23358
CESSDATrainingWorkingGroup(2017-2018a).CESSDADataManagementExpertGuide.Bergen,Norway:CESSDAERIC.cessda.eu/DMGuide
CESSDATrainingWorkingGroup(2017-2018b).CESSDADataManagementExpertGuide:Citingyourdata.Bergen,Norway:CESSDAERIC.cessda.eu/DMGuide/citingdata
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Force11(n.y.).GuidingprinciplesforFindable,Accessible,Interoperable,andRe-usabledatapublishingVersionB1.0.force11.org/fairprinciples
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KratzandStrasser(2015).MakingDataCount.doi.org/10.1038/sdata.2015.39
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Wilkinsonetal.(2016).TheFAIRGuidingPrinciplesforscientificdatamanagementandstewardship.doi.org/10.1038/sdata.2016.18
Wilkinsonetal.(2918).AdesignframeworkandexemplarmetricsforFAIRness.doi.org/10.1038/sdata.2018.118
Iniciativaseprojetos
DANSGDPRDataTags.zingtree.com
FAIRMetrics.fairmetrics.org
GOFAIRInitiative.go-fair.org
TheFAIRDataPrinciplesexplained.go-fair.org
5★OPENDATA.5stardata.info
2.2-DadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos
23
https://github.com/saverkamp/beyond-open-data/blob/master/DataGuide.mdhttps://doi.org/10.3233/ISU-170824https://doi.org/10.3233/ISU-2009-0595https://doi.org/10.1002/asi.23358https://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Managementhttps://www.cessda.eu/Research-Infrastructure/Training/Expert-tour-guide-on-Data-Management/6.-Archive-Publish/Publishing-with-CESSDA-archives/Citing-your-datahttps://doi.org/10.25504/FAIRsharing.WWI10Uhttps://www.force11.org/fairprincipleshttps://doi.org/10.3389/fnins.2013.00009https://www.nature.com/articles/sdata201539https://doi.org/10.7717/peerj.175https://doi.org/10.1038/sdata.2016.18https://doi.org/10.1038/sdata.2018.118https://zingtree.com/host.php?style=buttons&tree_id=442670046&persist_names=Restart&persist_node_ids=58#58http://fairmetrics.org/https://www.go-fair.org/https://www.go-fair.org/fair-principles/http://5stardata.info/en/
3.SoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto
Oqueé?
Osoftwareabertousadonainvestigaçãoousoftwaredecódigoabertousadonainvestigaçãorefere-seaousoedesenvolvimentodesoftwareparaanálise,simulação,visualização,etc.,ondeocódigofonteestádisponível.Adicionalmente,deacordocomaDefiniçãodeCódigoAberto,osoftwaredecódigoabertodeveserdistribuídonaformadecódigofontee/oudeformacompilada(comocódigoabertodisponívelnosegundocaso),edeveráserpartilhadosobumalicençaquepermitemodificação,derivações,eredistribuição.
Fundamentação
Ainvestigaçãoatualdependedesoftwareeotrabalhorealizadoapartirdessabase-ouasuareprodução-necessitadoacessoàtotalidadedocódigofontepordetrásdessesoftware(Barnes,2010;Morinetal.,2012;Inceetal.,2012;Prinsetal.2015;Lowndesetal.,2018).ComorefereBuckheiteDonoho,parafraseandoJonClaerbout,‘‘Anarticleaboutacomputationalresultisadvertising,notscholarship.Theactualscholarshipisthefullsoftwareenvironment,codeanddata,thatproducedtheresult’’(Buckheit&Donoho,1995).Oacessoabertoaocódigofontenosoftwareusadonainvestigaçãotambémajudaamelhoraroimpactodessainvestigação(Vandewalle,2012).
Apartilhadosoftwareusadonainvestigação(quersejadenaturezacomputacionalouquedependadeumaanálise/interpretaçãoproduzidaporumsoftware)éumacondiçãonecessária,emboranãosuficiente,paraareprodutibilidade.Istoédevidoàambiguidadeinevitávelquesurgequandotentamosdescreverdetalhadamenteumsoftwareatravésdelinguagemnatural,porexemplo,numartigo(Inceetal.,2012).Alémdisso,muitosprogramasdesoftware(senãomesmotodos)podemconteralgunserrosnãodetetadosinicialmente(Soergel,2015),peloquemesmoumadescrição“perfeita”dosoftwarenãopermitiriadarcontadetodososresultados.
Adicionalmenteàreprodutibilidade,apartilhalivredesoftwarepermiteaosprogramadoresseremreconhecidospelosseusesforçosaolongodasuacarreira,queratravésdecitaçõesdiretas(Smithetal.,2016)queratravésdapublicaçãodemeta-artigosdecódigoemrevistascomooJournalofOpenResearchSoftwareouJournalofOpenSourceSoftware(Smithetal.,2018).NeilChueHongmantémumalistaderevistasdeváriasáreasespecíficasquepublicamartigosdesoftware.
Objetivosdeaprendizagem
1. Conhecerascaracterísticasdosoftwareaberto;compreenderosargumentoséticos,legais,económicosedeimpactonainvestigação,afavorecontraosoftwareabertoecompreendermelhorosrequisitosdequalidadedocódigoaberto.
2.3-SoftwareAbertonaInvestigação
24
https://opensource.org/osdhttp://openresearchsoftware.metajnl.comhttp://joss.theoj.orghttps://www.software.ac.uk/which-journals-should-i-publish-my-software
2. Aprenderausarosoftwareabertojáexistenteeaatribuí-lo(citá-lo)apropriadamente.
3. Aprenderausarferramentaseserviçoshabituaisparapartilharabertamenteoscódigosdeinvestigação.
4. Sercapazdeescolheralicençaapropriadaparaoseusoftware,ecompreenderasdiferençasentrelicençaspermissivasenãopermissivas.
Componentes-chave
Conhecimento
Hádiferentestiposdeplataformasquesuportamapartilhaabertaeacolaboraçãoemsoftware,investigaçãoououtros.Emprimeirolugar,podeusaraseguintelistadeverificaçãoparaavaliarograudeaberturadosoftwareusadonainvestigação:
Osoftwareestádisponívelparaserdescarregadoeinstalado?
Osoftwarepodeserfacilmenteinstaladoemdiferentesplataformas?
Osoftwaretemcondiçõesparaasuautilização?
Ocódigofonteestádisponívelparapoderserinspecionado?
Ohistorialcompletodocódigofonteestádisponívelparaserinspecionadoatravésdeumaversãodisponívelpublicamente?
Asdependênciasdosoftware(softwareehardware)estãodescritasapropriadamente?Estasdependênciaexigemapenasumesforçomínimorazoávelparaseremobtidaseusadas?
EstasqualidadesestãorelacionadasesãoconstruídasapartirdaOpenSourceDefinition.
OGitéumaferramentapopularquepermiteocontrolodeversões:gestãoerevisãodemudançasnumapeçadesoftwareemparticular.ServiçoscomooGitHub,GitLab,Bitbucket,eoutros,proporcionamuminterfaceparaaferramentabemcomoserviçosdearmazenamentoremotoquepodemserusadosparamanter,partilharecolaborarsoftwareusadoeminvestigação.Estaplataformaestábastantedivulgadae,apesardesernecessárioumprocessodeaprendizagem,jáprovousermuitovaliosaparaestabelecerumfluxodeinvestigaçãoreprodutível.
TerosoftwaredeinvestigaçãonoGitHubésóaprimeiraparte;éigualmenteimportanteterumidentificadoroficialepermanenteassociado,talcomoumDOI.HáváriasformasdeassociarumDOIaumrepositórioGitHub.AformamaisfáciléusaroZenodo(umrepositóriogratuito,abertoegenéricocriadopeloOpenAIREepeloCERN)pararealizaraatribuição,apesardeexistiremoutrosrepositóriosparaarquivarsoftwareeobterumDOI,talcomooFigshare.OZenodointegra-secomoGitHubdeformaaarquivarosoftwareeprovidenciarumDOIquandoosprogramadoreslançaremformalmenteumaversãonoGitHub.
Qualquersoftwarepartilhadopublicamentenãoéverdadeiramentesoftwaredecódigoabertoanãoserquesejaacompanhadodeumalicençaadequada,umavezque,pordefeito,osdireitosdeautordosoftware(juntamentecomqualqueroutrotipodetrabalhocriativo)pertencemaosseuscriadores,oquesignificaquemaisninguémpodeusar,copiar,distribuiroumodificar(choosealicense.com).(Serealmentepretendepartilharoseucódigosemqualquertipoderestrições,podetorná-lodedomíniopúblico.)Emalternativa,deveráescolherumalicençaapropriadaparaoseusoftwarebaseadonoquedesejarqueasoutraspessoasfaçamcomoseucódigo(ounoquedesejarimpedir);owebsitechoosealicense.orgéumrecursoútilparasaberasdiferençasentreasváriaslicenças,apesardenãoincluirtodasaslicençasdecódigoabertodisponíveisoumaispopulares.Quandoselecionarumalicença,coloqueotexto-editadoparaincluironomedo(s)autor(es)eoano-norepositóriodesoftwarecomoficheirodetextosimplesintituladoLICENSE.
2.3-SoftwareAbertonaInvestigação
25
https://opensource.org/osdhttps://guides.github.com/activities/citable-code/https://choosealicense.com/no-permission/https://choosealicense.com/licenses/#unlicensehttps://choosealicense.comhttps://opensource.org/licenses
Apesardeapartilhadesoftwareemqualquerformatosermelhorquenãoopartilhar,oseusoftwareterámaisimpactoeserámaisfacilmenteusadoporoutros–eatémesmoporsinofuturo!-seincluirdocumentação.Estadocumentaçãopodeincluircomentáriosúteisnocódigoqueexpliquemoporquêdeterfeitoalgo(emvezdeapenasoquefoifeito,queporsijáéevidente),umficheiroREADMEquedescrevaoqueosoftwarefazequedêinformaçãoútil(ex.:comoinstalar,comocitar,comoexecutar,dependênciasimportantes),tutoriais/exemplose/oudocumentaçãoAPI(quepoderáserautomaticamentegeradaatravésdecomentárioscorretamenteformatadosnocódigo).
Asbarreirasmaiscomunsàreutilizaçãoereprodutibilidadesãoainexistênciaouinacessibilidadededependências,oudocumentaçãoinsuficientesobreoambientecomputacional.Umahipóteseparalidarcomestasbarreirasépartilharoseucódigojuntamentecomoambientecomputacionalusandoatecnologiadecontentores.Oscontentoresempacotamocódigocomasrespetivasdependênciaseambientecomputacional,deformaaqueoutrospossammaisfacilmenteexecutarasuaanálise.ORocker,Binder,eoCodeOceansãoexemplodeimplementaçãodecontentoresnainvestigação.
Quandousarumsoftware–querotenhaescritoououtrapessoaotenhafeitoeotenhadisponibilizado–arespetivacitaçãoapropriadaéimportanteparaefeitosdereprodutibilidade(discutidonoCapítulo2.4;emresumo,aversãousadapoderámudarosseusresultadosouasuainterpretação)ecomoreconhecimentoaosprogramadoresdosoftware(Niemeyer2016,Smith2016).Adecisãodequandocitarosoftwareésuacomoinvestigador,masrecomendamosumacitaçãosemprequeosoftwaretenhacontribuídoparaosseusresultados,interpretaçãoouconclusões.AmelhorformadetornaroseucódigofacilmentecitáveléusaraintegraçãoGitHub-ZenododescritaanteriormenteeprovidenciaroDOIresultantenumsítioóbviotalcomooREADMEdosoftware,incluindotalvezumasugestãodeformatodereferenciação.Semprequereferenciarumsoftwaredeveráincluirnomínimoo(s)nome(s)do(s)autor(es),otítulodosoftware,onúmerodaversãoeoidentificador/localizadorúnico(Smith2016).SeusarsoftwaredeoutrapessoaeesteproporcionaumDOI,poderáfacilmenteusá-loparaidentificareapontarparaosoftware;seosautoresnãoarquivaramosoftware,entãodeveráincluiroURLdolocalondeosoftwarepodeserencontradoeonúmerodaversãoou,porexemplo,umregistodemudançasnoficheiro(commithash).
Adicionalmente,háconceitosmaiscomplicadosqueincluemtestesautomáticoseintegraçãocontinuadesoftware,empacotamentodosoftwareemformatosbinários,egovernaçãoegestãodeprojetosdocódigoabertocomváriosparticipantes(ex.:códigosdeconduta,guiasparacontribuição).AlgunsdestestópicossãodescritosporScopatzandHuff(2015).Wilsonetal.(2017)tambémprovidenciamumguiapráticodeboaspráticasdecomputaçãocientíficaqueincluiconselhosespecíficosparaodesenvolvimentodesoftwareusadoeminvestigação.
2.3-SoftwareAbertonaInvestigação
26
https://arxiv.org/abs/1710.03675https://mybinder.readthedocs.io/en/latest/https://codeocean.com/
HardwaredeCódigoAberto
Osprincípiosdecódigoabertodescritosanteriormenteestendem-seaohardware.Osinvestigadoresusammuitasvezesinstrumentosouhardwareproprietáriosnasuainvestigaçãoequenãosãogratuitamenteacessíveis,reutilizáveisouadaptáveis.Ohardwarecientíficoincluitudodesdeferramentasdesequenciamentoemicroscópiosatéequipamentoespecialpararealizaçãodetesteseaceleradoresdepartículas.AcomunidadeHardwaredeCiênciaAberta(OScHeminglês),porexemplo,estáaincentivarparaqueomovimentodecódigoabertoincluainstrumentoscientíficos,hardwareeinfraestruturasdeinvestigaçãoatravésdoseuGlobalOpenScienceHardwareRoadmap.
Competências
CriarumrepositórionoGitHubepermitiraintegraçãocomoZenodo.UseosoftwareMintcomoferramentaanalíticaparaaprimeiraversãodosoftware.
Escolherumalicençadesoftwareusando,porexemplo,choosealicenseouOpenSourceInitiative.
Criardocumentaçãoparaumpacotedesoftware,incluindoumficheiroREADME,comentárioseexemplos..
Referenciarapropriadamenteosoftwareusadonumartigo.
Questões,obstáculoseequívocoscomuns
Q:“Nãopossopartilharomeusoftware–estámuitoconfuso/nãotemumaboadocumentação/nãodeixeibonscomentários!”
R:Oscriadoresdesoftwareusadoeminvestigaçãoportodoomundoidentificam-secomestesentimento–aspessoasraramentesentemqueoseucódigoestá“pronto”paraserpartilhadopublicamenteouqueestá“terminado”.Contudo,comorefereBarnes(2010),“ifyourcodeisgoodenoughtodothejob,thenitisgoodenoughtorelease—andreleasingitwillhelpyourresearchandyourfield.”Poroutraspalavras,sesesentesuficientementeconfortávelcomoseusoftwareparapublicarumestudoouumrelatóriocomosresultados,entãoo
2.3-SoftwareAbertonaInvestigação
27
http://openhardware.science/global-open-science-hardware-roadmap/https://choosealicense.comhttps://opensource.org/licenses
códigoestásuficientementedesenvolvidoparaserpartilhadocomosseuscolegas(poroutrolado,senãosesenteconfortávelem
partilharoseucódigo,entãotalvezprecisedesermaisdesenvolvidooutestadoantesdeserusadonumapublicação).Adicionalmente,partilharoseucódigoirápermitirqueoutrosomelhoremeconstruamalgoapartirdele,permitindoumimpactoeinovaçãoaindamaior(ecitaçõesparasi!).
Q:"Esealguémseapropriadocódigoqueeupartilheieusa-oparafinsnefastos,ouafirmaqueoescreveu?"
A:Aseleçãodeumalicençaapropriadaparaoseusoftwareajudá-lo-áaproteger-sedequalquerusodessesoftwareporoutraspessoas;porexemplo,alicençacomumLicençaMITincluilimitaçõesderesponsabilidadeeestabelecequenãoseproporcionanenhumagarantia.Sealguémtentarreclamaraautoriadoseusoftwarequedisponibilizou,podeassinalarasmarcasdetempo(timestamps)noseurepositórioouversõesarquivadascomoprovadoseutrabalhoanterior.
Q:Seeupartilharomeucódigonumrepositórioonlinesereiinundado(a)depedidosdeapoioaoutilizador.”
R:Apesardeospotenciaisutilizadorespoderempedir-lheajuda,querporemailouviarepositórioonline,nãotemqualquerobrigaçãodeprovidenciarajudaseescolhernãoofazerousenãopuder.Umalicençaapropriadapodeatéproporcionar-lheproteçãolegalparaisso(ex.:cláusuladeexclusãodegarantiadaLicençaMIT).
Equívococomum:colocarsimplesmenteocódigoonlinetorna-osoftwaredecódigoaberto.Defacto,anãoserquesejaacompanhadodeumalicençaquedêpermissãoparaqueoutrosousem,copiem,modifiqueme/oudistribuam,entãoo(s)criador(es)retem(êm)osdireitosdeautorexclusivos.Osoftwareprecisadeseracompanhadodeumalicençadecódigoabertoparaquesejaconsideradosoftwaredecódigoaberto.
Resultadosdeaprendizagem
1. Sercapazdepartilharsoftwareusandoalicençamaisapropriada(ouseja,querasferramentas,queralicença).
2. Sercapazdecarregar,atribuirversõeseregistarumalinhadecódigoatravésdeumidentificadorpermanente.
3. Sercapazdecitarsoftwareusadonumartigodeinvestigação.
Leituraadicional
Balasegarametal.(2017).Anopensourcepharmaroadmap.doi.org/10.1371/journal.pmed.1002276
Drydenetal.(2017).UpontheShouldersofGiants:Open-SourceHardwareandSoftwareinAnalyticalChemistry.doi.org/10.1021/acs.analchem.7b00485
Inceetal.(2012).Thecaseforopencomputerprograms.doi.org/10.1038/nature10836
2.3-SoftwareAbertonaInvestigação
28
https://choosealicense.com/licenses/mit/https://choosealicense.com/licenses/mit/https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1002276https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.analchem.7b00485https://doi.org/10.1038/nature10836
IskoujinaandRoberts(2015).Knowledgesharinginopensourcesoftwarecommunities:motivationsandmanagement.PDF
Jiménezetal.(2017).Foursimplerecommendationstoencouragebestpracticesinresearchsoftware.doi.org/10.12688/f1000research.11407.1
Martinez-TorresandDiaz-Fernandez(2013).Currentissuesandresearchtrendsonopen-sourcesoftwarecommunitiesPDF
Morinetal.(2012).ShiningLightintoBlackBoxes.PDF
Oishietal.(2018).PerspectivesonReproducibilityandSustainabilityofOpen-SourceScientificSoftwarefromSevenYearsoftheDedalusProject.arXiv:1801.08200v1[astro-ph.IM]
Scacchi(2010).TheFutureofResearchinFree/OpenSourceSoftwareDevelopment.PDF
Sandveetal.(2013).Tensimplerulesforreproduciblecomputationalresearchdoi.org/10.1371/journal.pcbi.1003285
Shamiretal.(2013).Practicesinsourcecodesharinginastrophysics.arXiv:1304.6780v1[astro-ph.IM]
Steinmacheretal.(2014).Asystematicliteraturereviewonthebarriersfacedbynewcomerstoopensourcesoftwareprojects.PDF
Stodden(2010).TheScientificMethodinPractice:ReproducibilityintheComputationalSciences.PDF
Vandewalle(2012).CodeSharingIsAssociatedwithResearchImpactinImageProcessing.PDF
2.3-SoftwareAbertonaInvestigação
29
https://pdfs.semanticscholar.org/f2a2/c5129cf5656af7acc7ffaf84c9c9bafe72c5.pdfhttps://doi.org/10.12688/f1000research.11407.1https://idus.us.es/xmlui/bitstream/handle/11441/32245/Current%20issues%20and%20research%20trends.pdf?sequence=1https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4203337/pdf/nihms588981.pdfhttps://arxiv.org/abs/1801.08200http://www.ics.uci.edu/~wscacchi/Papers/New/FoSER-Scacchi-2010.pdfhttps://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003285https://arxiv.org/abs/1304.6780http://igor.pro.br/publica/papers/IST_SysReview_PrePrint.pdfhttp://datascienceassn.org/sites/default/files/The%20Scientific%20Method%20in%20Practice%20-%20Reproducibility%20in%20the%20Computational%20Sciences.pdfhttps://infoscience.epfl.ch/record/206184/files/Vandewalle12.pdf
4.Investigaçãoreprodutíveleanálisededados
Oqueé?
Reprodutibilidadesignificaqueosdadosdainvestigaçãoeocódigosãodisponibilizadosdeformaaqueoutrospossamatingirosmesmosresultadosquesãodeclaradosemresultadoscientíficos(comoaspublicações).Estreitamenterelacionadoestáoconceitodereplicabilidade,oatoderepetirumametodologiacientíficaparaatingirconclusõessemelhantes.Estesconceitossãoelementoschavedainvestigaçãoempírica.
Melhorarareprodutibilidadelevaaummaiorrigorequalidadedosresultadoscientíficose,portanto,aumamaiorconfiançanaciência.Temhavidoumacrescentenecessidadeevontadedeexporosfluxosdetrabalhodeinvestigaçãodesdeoiníciodeumprojetoerecolhadedadosatéàinterpretaçãoerelatoderesultados.Essesdesenvolvimentosacarretamumconjuntodedesafios,incluindoacriaçãodefluxosdetrabalhodeinvestigaçãointegradosquepodemseradotadospeloscolaboradores,mantendoaltospadrõesdeintegridade.
Oconceitodereprodutibilidadeédiretamenteaplicadoaométodocientífico,apedraangulardaCiência,eparticularmenteaos5passosseguintes:
1. Formularahipótese
2. Desenharoestudo
3. Executaroestudoerecolherosdados
4. Analisarosdados
5. Relataroestudo
Cadaumdestespassosdeveserrelatadodeformaclara,fornecendodocumentaçãoclaraeaberta,tornandooestudotransparenteereprodutível.
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
30
Fundamentação
Fatoresdecarátergeraledominantepodemcontribuiraindamaisparaascausasdanão-reprodutibilidade,mastambémpodemimpulsionaraimplementaçãodemedidasespecíficasparalidarcomessascausas.Aculturaeoambienteemqueainvestigaçãotemlugarsãoimportantesfatoresdominantestop-down.Deumaperspetivabottom-up,aeducaçãoeformaçãopermanentedosinvestigadorespodeaumentaraconscientizaçãoedisseminarboaspráticas.
Emboraacompreensãodetodososfatoresquecontribuemparaareprodutibilidadesejaimportante,tambémpodeserdifícildecomporessesfatoresemetapasquepossamserimediatamenteadotadasporumprogramadeinvestigaçãoexistenteemelhorarimediatamenteasuareprodutibilidade.Umdosprimeirospassosadaréavaliarasituaçãoatualeacompanharamelhoriaàmedidaquesãodadospassosparaaumentaraindamaisareprodutibilidade.Algunsdosproblemascomunscomareprodutibilidadedainvestigaçãosãomostradosnafiguraseguinte.
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
31
Fonte:Reproducibilityandreliabilityofbiomedicalresearch:improvingresearchpractice.
Goodman,Fanelli,&Ioannidis(2016)notamquenaepidemiologia,biologiacomputacional,economiaetestesclínicos,areprodutibilidadeéfrequentementedefinidacomo:
theabilityofaresearchertoduplicatetheresultsofapriorstudyusingthesamematerialsaswereusedbytheoriginalinvestigator.Thatis,asecondresearchermightusethesamerawdatatobuildthesameanalysisfilesandimplementthesamestatisticalanalysisinanattempttoyieldthesameresults.
Istoédistintodereplicabilidade:
whichreferstotheabilityofaresearchertoduplicatetheresultsofapriorstudyifthesameproceduresarefollowedbutnewdataarecollected.
Umaformasimplesdepensarsobreistopodeserqueareprodutibilidadeéorientadaaosmétodos,enquantoareplicabilidadeéorientadaaosresultados.
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
32
https://acmedsci.ac.uk/viewFile/56314e40aac61.pdf
Areprodutibilidadepodeseravaliadaadiferentesníveis:aoníveldeumprojetoindividual(ex.,umartigo,umaexperiência,ummétodoouumconjuntodedados),uminvestigadorindividual,umlaboratórioougrupodeinvestigação,umainstituição,oumesmoumaáreadeinvestigação.Critériosepontosdeavaliaçãoligeiramentediferentespodemaplicar-seaessesdiferentesníveis.Porexemplo,umainstituiçãodefendeaspráticasdereprodutibilidadeseinstituirpolíticasquerecompensemosinvestigadoresquerealizeminvestigaçãoreprodutível.Poroutrolado,umcampodeinvestigaçãopodeserconsideradocomotendoumnívelmaiselevadodereprodutibilidadesedesenvolverrecursosmantidospelacomunidadequepromovamepermitampráticasdepesquisareproduzíveis,comorepositóriosdedadosounormativasparapartilhadedados.
Objectivosdeaprendizagem
Existemtrêsobjetivosprincipaisquetêmqueabordadosaqui:
1. Compreenderoimportanteimpactodecriarinvestigaçãoreprodutível.
2. Compreenderaconfiguraçãogeraldainvestigaçãoreprodutível(incluindoodesenhodefluxosdetrabalho,gestãodedadoserelatóriodinâmico).
3. Estarconscientedospassosindividuaisnoprocessodereprodutibilidade,bemcomoosrespetivosrecursosquepodemserutilizados.
Componentes-chave
Conhecimento
Segue-seumalistaindicativadeideiasaretersobrereprodutibilidade:
Oqueéa"crisedereprodutibilidade"easmeta-análisesdereprodutibilidade.
Princípiosdereprodutibilidade,integridadeeéticanainvestigação.
Quaissãoasopçõeseambientesdecomputaçãoquepermitemummeiocolaborativoereprodutível.
Fatoresqueafetamareprodutibilidadedainvestigação.
Documentaçãodeanálisededadosefluxosdetrabalhodeinvestigaçãoaberta.
Ambientesdeanálisereprodutíveis(virtualização).
AbordarosResearcherDegreesofFreedomWichertsetal.,2016.
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
33
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpsyg.2016.01832/full
Competências
Existemváriasdicaspráticasparaareprodutibilidadequedevemosteremcontaquandodefinimosascompetênciasespecíficasnecessáriasparaagarantir.AsboaspráticasemreprodutibilidadeutilizamaspráticasdaCiênciaAbertanogeral,masasuaintegraçãooferecebenefíciosaoinvestigadorindividual,querescolhapartilharasuainvestigaçãoounão.Arazãopelaqualintegrarasboaspráticasdareprodutibilidadebeneficiaoinvestigadorindividualéporqueestasmelhoramoplaneamento,aorganizaçãoeadocumentaçãodainvestigação.Embaixodescrevemosumexemplodeimplementaçãodereprodutibilidadenumfluxodetrabalhodeinvestigaçãocomreferênciasaestaspráticasnomanual.
1.Planeieareprodutibilidadeantesdecomeçar
Crieumplanodeestudoouprotocolo.
Comeceadocumentarnoiníciodoestudoescrevendoumplanodeestudoouprotocoloqueincluaodesenhoemétodosdoestudoproposto.UseumguiaderelatóriodoEquatorNetworkseaplicável.Registeasalteraçõesaoplanodeestudoouprotocolousandoumversãodecontrolo(referênciaaControlodeVersões).Calculeoalcanceoutamanhodaamostranecessáriaerelateestecálculonoseuprotocolo,poisestudoscompoucoalcancesãopropensosàirreprodutibilidade.
Escolhaferramentasemateriaisreprodutíveis
EscolhaanticorposquefuncionemusandoummotordepesquisadeanticorposcomoCiteAb.EviteairreprodutibilidadeatravésdelinhascelularesmalidentificadasescolhendoasqueestãoautenticadaspelaInternationalCellLineAuthenticationCommittee.Semprequepossível,escolhaferramentasdesoftwareehardwarenasquaisretenhaapropriedadedasuainvestigaçãoequepermitamaexportaçãodasuainvestigaçãoparaforadaplataformaparasuareutilização-vejaSoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto.
Estabeleçaumprojetoreprodutível
Centralizeeorganizeagestãodoseuprojetousandoumplataformaonline,umrepositóriocentral,oupastaparatodososficheirosdainvestigação.PodeusaroGitHubcomolocalparaarmazenartodososficheirosdoprojetoougerirtudousandoumnotebookcomoBenchling,Labguru,ouSciNote.Dentrodoprojetocentralizado,sigaasboaspráticasseparandoosseusdadosdocódigoempastasdiferentes.Torneosseusdadosnãotratadoscomoapenasdeleituraemantenha-osseparadosdosdadosprocessados-vejaDadoseMateriaisdeInvestigacaoAbertos.
Aogravarearquivarosseusficheirosdeinvestigação,useformatosenomesdeficheirosinformativosquepermitamareutilização.Osnomesdosficheirosdevemserlegíveisparamáquinasehumanos.(referênciaaGestãodeDados).Nasuaanáliseecódigodesoftwareusecaminhosrelativos.Eviteformatosdeficheirosproprietárioseuseformatosdeficheiroabertos-vejaLicenciamentoAbertoeFormatosdeFicheiros.
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
34
http://www.equator-network.org/https://www.citeab.com/http://iclac.org/https://benchling.com/https://www.labguru.com/https://scinote.net/
2.Mantenhaumregisto
Registo
Façaumpré-registodeinformaçãoimportantedodesenhoeanálisedoestudoparaaumentaratransparênciaecombateroviésdapublicaçãoderesultadosnegativos.FerramentasgratuitasquepodemajudarafazeroprimeiroregistoincluemAsPredicted,OpenScienceFramework,eRegisteredReports.EstudosclínicosdevemusarClinicaltrials.gov.
Controlodeversões
Registeasalteraçõesaosseusficheiros,especialmenteocódigodeanálise,usandoumcontrolodeversõesvejaSoftwareAbertoUsadonaInvestigaçãoeSoftwaredeCódigoAberto.
Documentação
Documentetudooquefoifeito,manualmente,numficheiroREADME.Crieumdicionáriodedados(tambémconhecidocomolivrodecódigo)paradescreverinformaçãoimportantesobreosseusdados.Paraumaintroduçãosimples,use:KarlBroman’sDataOrganizationmoduleeconsulteDadoseMateriaisdeInvestigacaoAbertos.
Programaçãodocumentada
ConsidereusarJupyterNotebooks,KnitR,Sweave,ououtrasabordagensdeprogramaçãodocumentadaparaintegraroseucódigocomasuanarrativaedocumentação.
3.Partilheelicencieasuainvestigação
Dados
Eviteficheirossuplementares,decidaporumlicençapermissivaaceitável,epartilheosseusdadosusandoumrepositório.SigaasboaspráticasdescritasnocapítuloDadoseMateriaisdeInvestigacaoAbertos.
Materiais
Partilheosseusmateriaisdeformaaquepossamserreutilizados.DepositeosreagentesemrepositórioscomoAddgene,TheBloomingtonDrosophilaStockCenter,eATCCparaostornarfacilmenteacessíveisaoutrosinvestigadores.Paramaisinformação,vejaasubsecçãoMateriaisAbertosdocapítuloDadoseMateriaisdeInvestigaçãoAbertos.
Software,notebooks,econtentores
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
35
https://aspredicted.org/https://osf.io/https://cos.io/rr/https://clinicaltrials.gov/http://kbroman.org/dataorg/pages/dictionary.htmlhttp://jupyter.org/https://yihui.name/knitr/https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200552056-Using-Sweave-and-knitrhttps://www.addgene.org/https://bdsc.indiana.edu/https://www.atcc.org/
Licencieoseucódigoparainformarcomoestepodeser(re)utilizado.Partilheosnotebookscomserviçoscomomybinderquepermitamavisualizaçãopúblicaeexecuçãodetodoonotebookemrecursospartilhados.PartilheoscontentoresounotebookscomserviçoscomoRockerouCodeOcean.SigaasboaspráticasdescritasemSoftwareabertousadoeminvestigaçãoeSoftwaredecódigoaberto.
4.Reporteasuainvestigaçãodeformatransparente
Reporteepubliqueosseusmétodoseintervençõesdeformaexplícitaetransparenteecompletaparapermitirsuareplicação.AsdirectrizesdeEquatorNetwork,ferramentascomoProtocols.io,ouprocessoscomoRegisteredReportspodemajudá-loareportardeformareprodutível.Lembre-sedepublicarosresultadosnasuaplataformapúblicaderegisto(talcomoClinicalTrials.govouSocialScienceRegistry)atéumanoapósterminaroseuestudosejaqualforanaturezaoudireçãodosseusresultados.
Questões,obstáculos,eequívocoscomuns
P:"Tudoestánoartigo,qualquerpessoapodereproduziristoapartirdali!"
R:Esteéumdosequívocosmaiscomuns.Mesmoumadescriçãoextremamentedetalhadadosmétodosefluxosdetrabalhousadosparaatingiroresultadofinal,namaioriadoscasosnãoserásuficienteparaoreproduzir.Istopodedever-seaváriosaspetos,incluindoambientescomputacionaisdiferentes,versõesdesoftwarediferentes,viésimplícitosquenãoforamdefinidosdeformaclara,etc.
P:"Nãotenhotempoparaaprendereestabelecerumfluxodetrabalhoreprodutível"
R:Alémdeumnúmerosignificativodeserviçosonlinedisponíveislivrementequepodemsercombinadosefacilitaraconfiguraçãodeumfluxodetrabalho,gastartempoeesforçoaafazê-loaumentanãosóavalidadecientíficadosresultadosfinais,mastambémminimizaráotemponecessárioparaarepetiçãoouextensãoemestudosfuturos.
P:"Terminologiasquedescrevamareprodutibilidadesãodesafiantes."
R:VerBarba(2018)paraumadiscussãosobreterminologiadescrevendoreprodutibilidadeereplicabilidade.
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
36
http://mybinder.orghttps://arxiv.org/abs/1710.03675https://codeocean.com/http://www.equator-network.org/https://www.protocols.io/https://cos.io/rr/https://www.socialscienceregistry.org/https://www.socialscienceregistry.org/
Resultadosdaaprendizagem
1. Compreenderanecessidadedainvestigaçãoreprodutíveleosuaracionalidade.
2. Sercapazdeestabelecerumfluxodetrabalhoreprodutívelnocontextodeumatarefaexemplo.
3. Conhecerferramentasquepodemapoiarainvestigaçãoreprodutível.
Leituraadicional
Buttonetal.(2013).Powerfailure:whysmallsamplesizeunderminesthereliabilityofneuroscience.doi.org/10.1038/nrn3475
KarlBroman(n.y.).DataOrganization.Choosegoodnamesforthings.kbroman.org
2.4-InvestigaçãoReprodutíveleAnálisedeDados
37
https://doi.org/10.1038/nrn3475http://kbroman.org/dataorg/pages/names.html
5.AcessoAbertoaPublicações
Oqueé?
OAcessoAbertosignificaquepublicaçõesresultantesdeinvestigaçãocomoartigoselivrospodemseracedidosemlinha,isentosdepagamentoporqualquerutilizador,semobstáculostécnicos(comooregistoobrigatórioouaidentificaçãoemplataformasespecíficas).Nomínimo,essaspublicaçõespodemserlidasemlinha,descarregadaseimpressas.Idealmente,devemserconcedidosdireitosadicionais,comoodireitoacopiar,distribuir,pesquisar,referenciar,rastreareextrairtextoedados.OAcessoAbertopodeserconcretizadoatravésdeduasviasprincipaisnãoexclusivas:
AcessoAbertoVerde(autoarquivo):Aversãopublicadaouomanuscritofinalrevistoporpares,quefoiaceiteparapublicação,édisponibilizadodeformalivreeabertapeloautor,ouporumseurepresentante,numrepositório.AlgunseditoresexigemqueoAcessoAbertosósejapermitidoapósumperíododeembargo.Esteperíododeembargopodedurarentreváriosmeseseváriosanos.Parapublicaçõesqueforamdepositadasnumrepositório,masqueestãosobembargo,normalmentepelomenososmetadadosestãoacessíveisdemodoaberto.
AcessoAbertoDourado(publicaçãoemAcessoAberto):OtrabalhopublicadoédisponibilizadoemAcessoAbertopeloeditorlogoquepublicado.Omodelodenegóciomaiscomumébaseadonopagamentofeitopelosautores(designadoAPCs-taxadeprocessamentodoartigo,ouBPCs-taxadeprocessamentodolivro).QuandoosconteúdosdoAcessoAbertosecombinamcomconteúdosquerequeremassinaturaouaquisição,particularmentenocasoderevistas,atasdeconferênciasouvolumeseditados,designa-seporAcessoAbertohíbrido.
Fundamentação
Umadasformasmaiscomunsdedivulgarosresultadosdeinvestigaçãoéescreverumtextoepublicá-lonumarevista,ematasdeconferênciasounumlivro.Durantemuitosanosestaspublicaçõesforamdisponibilizadasaopúblicomediantepagamentoatravésdeumaassinaturaoudeformaindividual.Contudo,noiníciodoséculoXXIsurgiuumnovomovimentocomumobjetivoclaro:tornartodososresultadosdeinvestigaçãodisponíveisparaopúblicosemquaisquerrestrições.EstemovimentoadotouonomedeAcessoAbertoeestabeleceuduasestratégiasiniciaisparaaobtençãodoresultadopretendido.Aprimeiraestratégiafoiadefornecerferramentaseassistênciaaosacadémicosparaodepósitodosseusartigoscomrevisãoporparesemrepositórioseletrónicosabertos.Asegundafoidesenvolverumanovageraçãoderevistasqueusamosdireitosdeautoreoutrosinstrumentosparagarantiroacessoabertopermanenteatodososartigosquepublicam.Comoresultadodaprimeiraestratégiadeparamo-noscomaspráticasdeautoarquivo:osinvestigadoresdepositamedivulgamosseusartigosemrepositóriosinstitucionaisoutemáticos.Ecomoresultadodasegundaestratégiaobserva-seacriaçãoderevistasdeacessoabertoqueprovidenciamoacessogratuitoaosleitoreseautorizamareutilizaçãodamaioriadosseusconteúdosquasesemrestrições.
ParaalémdestasduasestratégiasestabelecidasnaBudapestOpenAccessInitiativeem2002,assistiu-seaonascimentodenovosmétodosdedivulgação.Entreeles,encontra-seapublicaçãodepreprintsemrepositóriosinstitucionaiseemservidoresdepreprints.Ospreprintssãofrequentementeutilizadosnafísicaeemergemagoranasciênciasdavidaenoutroscampos.Ospreprintssãodocumentosquenãoforamrevistosporparesmasquesãoconsideradoscomoumapublicaçãocientíficacompletanumaetapainicial.Algunsservidoresdepreprintsincluemserviçosderevisãoporparesabertaetambémpossibilitamapublicaçãodenovasversõesdo
2.5-AcessoAbertoaPublicações
38
http://www.budapestopenaccessinitiative.org/read
documentoinicialapósarevisãoporpares.Seguindoestatendênciadeinclusãodeprocessosderevisãoporparesabertanosservidoresdepreprints,assiste-seaodesenvolvimentodenovasplataformasdepublicação,suportadaspelosfinanciadores,comoaWellcomeTrustouaBillandMelindaGatesFoundation.TambémaComissãoEuropeiaplaneialançarumaplataformadepublicaçãoparaosprojetosfinanciadosdoHorizonte2020.
Aescolhadeumarevistaoudeumaplataformadepublicaçãopodeafetaradisponibilidadeeaacessibilidadedosresultadosdeinvestigação.Existemváriasopçõesparaosinvestigadoresquandodecidemonde,quandoecomopublicarosseusresultados.Éfundamentalconhecertodasasimplicaçõesparaevitarproblemasfuturos.
Oaparecimentodemuitosmodelosdenegócioemtornodasrevistasdeacessoabertoapresentaumconjuntodemalentendidosedeincertezasparaosinvestigadoresnomomentodedecidirondepublicar.Alémdisso,asrevistasdesubscriçãodisponibilizammodelosindividuaisdeacessoaberto,oschamadosmodeloshíbridos,queacarretammaiorcomplexidadeàdecisãodeondeecomopublicar.
Quantoaoautoarquivo,osinvestigadoresficamconfusoscomosdiferentesrequisitosdefinidospeloseditoresnoqueserefereàversãodoartigoquepodemdepositarnumrepositórioequandoéqueestaversãopodeficardisponívelaopúblico.Esteatrasonapermissãodoacessopúblicoaotextocompletoéfrequentementedesignadoporperíododeembargoenãoéuniformeemtodasasrevistas.Asinstituiçõesquedisponibilizamumrepositórioaosseusinvestigadoresdevemfacilitaraspráticasdeautoarquivo,processandotodosestesrequisitosdepublicação.
Objetivosdeaprendizagem
1. Conhecerasdiferentesopçõesqueuminvestigadortemquandodecidepublicarumartigo,incluindorequisitosdefinanciamento.
2. Estaraptoadecidirseumartigopodeserpublicadoantesdarevisão,porexemplonumservidordepreprints.Osformandosaprenderãoadeterminarqueopçõesestãodisponíveisdeacordocomaspolíticasdasuadisciplina/revistaesepoderãoexistirconsequênciasqueprejudiquemapublicaçãofinalnumarevistacomrevisãoporpares.
3. Osformandosaprenderãoadistinguirasdiferençasentreaspolíticasderevisãoporparesdasrevistas,especialmentequandosesubmeteumdocumentojádisponívelnumaversãopreprint.Aprenderãoasdiferençasentreasrevistasdeacessoaberto,comoporexemplo,quaisasqueexigemumpagamentoparasubmissão/publicaçãoequelicençasutilizão.
4. Osformandosaprenderãoacercadasimplicaçõesdepublicaremrevistasdesubscriçãoparaumfuturoautoarquivonumrepositório,bemcomoosrequisitosdoseditoresemtermosdeversãoeembargo.Aprenderãoigualmentesobreasrevistasdeacessoabertohíbrido.
5. (optionaldependingonaudience)Osformandosaprenderãosobreasoportunidadesdoacessoabertoquandosepublicaemlivros,umavezqueestaéaviaprincipaldedivulgaçãoparaalgumasdisciplinas.
6. Osformandosaprenderãosobreosdiferentesmodelosdenegóciousadospelasrevistasdeacessoabertoesobreasoportunidadesdeobtençãodefinanciamento,quandonecessário,paraapoioàpublicação.
Componentes-chave
2.5-AcessoAbertoaPublicações
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https://wellcomeopenresearch.org/https://gatesopenresearch.org/https://ec.europa.eu/research/openscience/pdf/information_note_platform_public.pdf
Conhecimento
Repositórioseautoarquivo
Noiníciode2018maisde4.600repositóriosestavamdi