Taxonomia

• Visa classificar em grupos de acordo com propriedades físicas e químicas comuns

• Vírus no mesmo grupo frequentemente tem propriedades biológicas semelhantes:– Replicação– Doença não! (cuidado!)– Transmissão

Classificação definida pelo:

Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV)

ICTVdB - The Universal Virus Database(acesso fácil na Internet)

International Committee onTaxonomy of Viruses

Classificação viral Estrutura (morfologia): Forma Tamanho Simetria Envelope Estrutura do genoma

Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos

Relações antigênicas Propriedades biológicas Estratégias de replicação Gama de hospedeiros Modo de transmissão Patogenicidade

Taxonomia

Ordem: ... viralesFamília ... viridaeSubfamília ... virinaeEspécie/Gênero: ... virus

Seis ordens estabelecidas até o presente (ICTV):

Caudovirales bacteriófagos com cauda

Herpesvirales vírus herpes de eucariotos

Mononegavirales RNA não segmentado polaridade negativa - plantas e animais .

Nidovirales RNA polaridade positiva de vertebrados.

Picornavirales pequenos vírus RNA que infectam plantas, insetos e animais.

Tymovirales RNA de fita simples; infectam plantas.

Ordens

Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentados, polaridade positiva: Arteriviridae

AstroviridaeCaliciviridaeCoronaviridaeFlaviviridaeHepeviridaePicornaviridaeTogaviridae

Vírus da arterite equinaVírus da PRRSVírus elevador da lactato dehidrogenase

Grupo IV: RNA (+) fsOrdem: NidoviralesFamília: Família: ARTERIVIRIDAE

Astrovírus

• Família Astroviridae• 28-35 nm, aparência de estrêla com 5 - 6 pontas • RNA fs+ ~7 kb, poli-A em 3’ , sem cap em 5’ • 3 ORFs (overlap 70 nt entre ORF1a (protease) e ORF1b (RdRP) • Dois gêneros:

» Mamastrovirus: gatos, suinos, ovelhas, etc» Aviastrovirus: aves

Família ASTROVIRIDAEGênero: Astrovírus

- RNA fs, nús 20-30 nm- encontrados em fezes - associados a diarréias

Família Caliciviridae

• RNA fita simples, nús, polaridade positiva • Gêneros:• Sapovírus • Norovírus • São as mais importantes causas de

gastroenterite viral em humanos. • Geralmente causam gastroenterites leves em Geralmente causam gastroenterites leves em

animais jovens de várias espécies . animais jovens de várias espécies .

Ordem Nidovirales Família Coronaviridae

- Pleomórficos, envelopados- peplômeros espaçados- RNA fs positiva (+) Gêneros: Coronavírus; Torovírus

Coronavírus humano (resfriados)Bronquite Infecciosa das Aves Peritonite Infecciosa dos felinos

FAMÍLIA FLAVIVIRIDAEFAMÍLIA FLAVIVIRIDAE

- Flavi = amarelo - globulares (50 nm)- RNA fs positiva - nucleocapsídeo icosaédrico- envelopados

-Gêneros: Flavivírus Febre Amarela, Dengue 1,2,3,4

Pestivírus Peste Suína Clássica,BVD, BDO

Hepacivirus: Hepatite C (!!!)

Hepeviridae

• Gênero Hepevírus=> Vírus da hepatite E• - Não envelopado, fs, +, 7200 nt,• - Com cap, poliadenilado• Genoma: 5´ UTR- três ORFs - 3´UTR• -

Família Picornaviridae

- Pico = pequeno - simetria icosaédrica (20-30 nm)- RNA (+) fs - não envelopados

- Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A) Enterovírus (Polio, Coxsackie, Entero) Rinovírus (resfriados) Aftovírus (Febre Aftosa)

-

Família Togaviridae

- Grupo IV : RNA fs (+)

- envelopados- pleomórficos (70 nm)- RNA fs positiva

-Gêneros: Alfavírus (n= 27): infectam várias espécies -Causam arboviroses: -ex: Encefalites equinas este, oeste, venezuelana

Rubivírus: Vírus da Rubéola (não é arbovirose!)

Vírus com genoma RNA de fita simples não segmentado, com polaridade negativa Filoviridae

ParamixoviridaeRhabdoviridae

Família Filoviridae

- filamentosos (80-14 000 nm)- envelopados- RNA fs negativa

MarburgEbola

Família Paramyxoviridae

Duas sub-famílias:Paramyxovirinae:Respirovirus: Parainfluenza PI-1, PI-3,

Rubulavirus: PI-2,Cachumba Morbillivirus: Cinomose, Sarampo,

Morbilivírus das focas

Pneumovirinae: Pneumovirus: HRSV, BRSV, Metapneumovirus humano

Metapneumovírus aviário

Henipavirus: Hendra, Nipah

Gêneros: Lyssavirus: Raiva, Lagos Bat, Mokola, Obodhiang, Kotonkan

Vesiculovírus: Estomatite Vesicular Efemerovirus:

• forma de bala

• Simetria helicoidal

• RNA fs negativa

Família Rhabdoviridae

Vírus com genoma RNA de fita simples, segmentado, polaridade negativa (Baltimore Grupo V)

ArenaviridaeBornaviridaeBunyaviridaeOrthomyxoviridae

Família: Arenaviridae - Pleomórficos (globulares) 50-300 nm - Envelopados - Duas fitas simples de RNA (L e S) - Contem ribossomos - Usualmente são vírus latentes de roedores Gênero Arenavirus - Coriomeningite linfocítica - Febre Lassa

- Febres hemorrágicas: Argentina e Boliviana

LCMV-Lassa virus (Old World) complex:

Gbagroube virusIppy virusKodoko virusLassa virusLujo virusLuna virusLunk virusLymphocytic choriomeningitis virusMerino Walk virusMenekre virusMobala virusMopeia virus

Tacaribe virus (New World) complex:

Amapari virusChapare virusFlexal virusGuanarito virusJunin virusLatino virusMachupo virusOliveros virusParaná virusPichinde virusPirital virusSabiá virusTacaribe virusTamiami virusWhitewater Arroyo virus

Arenavírus: genoma de RNA segmentado, polaridade negativa (mas ambisenso!)Os dois segmentos são denominados “S” (Small) e “L” (Large), Codificam 4 proteínas em sentido ambisenso, muito particular:

Duas fitas de RNA sentido “ambíguo”, ou seja, parte do RNA codifica uma proteína (2), outra parte gera uma cópia de sentido positivo (mRNA) para produzir proteína viral.

Família: Bunyaviridae Ordem: Mononegavirales - Globulares (100nm) - Envelopados

- Três segmentos de RNA de fita simples, polaridade negativa

- Quatro gêneros: Bunyavirus (18 grupos antigênicos, 161 arbovírus, 4 ainda não agrupados; Cullicoides) Ex.: Capim, Melão, Ororoca, Tucunduba, Guaroa e muitos outros. Phlebovirus (8 grupos antigênicos, transmitidos por Phlebotomum). Nairovirus (6 grupos antigênicos, pelo menos 33 virus transmitidos por carrapatos). Hantavirus (pelo menos 6 vírus, não-arbo, transmitidos por roedores)

Orthomyxoviridae

- myxo = muco- pleomórficos- RNA fs (-) - nucleocapsídeo helicoidal, segmentado (C=7; A & B= 8) - envelopados

- Gênero: Influenza A,B,C> importante: A

Vírus com genoma RNA de fita dupla segmentado(Baltimore grupo III) Birnaviridae

Reoviridae

Família Birnaviridae

- sem envelope, icosaédricos- RNA bisegmentado

Gêneros: Aquabirnavirus; type species: Infectious pancreatic necrosis virus Avibirnavirus; type species: Infectious bursal disease virus Blosnavirus; type species: Blotched snakehead virus Entomobirnavirus; type species: Drosophila X virus

Família ReoviridaeFamília Reoviridae

- dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm)- RNA fita dupla - não envelopados

- Gêneros: Orthoreovírus Orbivírus Rotavírus

Os reovírus apresentam propriedades oncolíticas e tem sido testados como como anti-cancerígenos.

Sedoreovirinae: contém seis gêneros:

CardoreovirusMimoreovirusOrbivirusPhytoreovirusRotavirusSeadornavirus Spinareovirinae: contém nove gêneros: Aquareovirus Coltivirus Cypovirus Dinovernavirus Fijivirus Idnoreovirus Mycoreovirus Orthoreovirus Oryzavirus

Outro gênero não classificado:Crabreovirus[9]

Reoviridae: duas subfamílias:

Referência sobre reovírus e terapia anti-cancer:

Gene Therapy of Cancer Methods in Molecular Biology™ Volume 542, 2009, pp 607-634 Oncolytic Viral Therapy Using ReovirusChandini Thirukkumaran & Don G. Morris

Vírus RNA (+), com transcriptase reversa

Retroviridaevírus da leucemia felina

imunodeficiencia humana, bovina, felina, dos símios

Leucose dos bovinos e das aves

Visna/maedi, Artrite-encefalite caprina

Família Retroviridae- nucleocapsídeo icosaédrico - genoma diplóide, RNA fita simples, polaridade positiva - envelopados, frágeis - contém transcriptase reversa

- Três Gêneros: 1- Oncovírus Leucose bovina (bovine leukemia virus) HTLV (Human adult T cell leukemia virus)

2- Lentivirus: Vírus da imunodeficiência humana (HIV), Vírus da imunodeficiencia bovina (BIV), vírus da imunodeficiencia dos símios (SIV), vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV), vírus da anemia infecciosa equina (EIAV) 3- Spumavírus

Vírus com genoma DNA

VÍRUS DNA

PARVOVIRIDAE

PAPILLOMAVIRIDAE PAPOVAVIRIDAE

ADENOVIRIDAE

HERPESVIRIDAEHEPADNAVIRIDAE

POXVIRIDAE

CIRCOVIRIDAE

ANELLOVIRIDAE

Famílias de vírus com genoma DNA de fita simples

Circoviridae

Parvoviridae

circovírus suínos (e outros)

parvovírus canino

vírus da panleucopenia felina

parvovírus suíno

parvovírus humano (B19)

Vírus Torque Teno (TTV) e muitos outrosAnelloviridae

Anelloviridae

Vírus com genoma de DNA. 1,7 – 3KBFita simplesNão envelopadosMuito ubíquosAssociação como doenças? Ex: vírus Torque teno de diversas espécies

Família Circoviridae

- DNA fs 1,76 a 3,7 kilobases (TTV, TTMV, TTMDV)

- simetria icosaédrica- Ex: Circovírus dos suínos, Chicken Anemia, Vírus Torque teno (TTV) (humanos e muitos outros similares em diversas espécies)

PARVOVIRIDAE- DNA fita simples- não envelopados (15-25 nm)

3 gêneros: Parvovirus (MVM)Erythrovirus (B19)Dependovirus

Eritema infeccioso Parvovirose canina, suína

Famílias de vírus com genoma de DNA de fita dupla

Poxviridae

Herpesviridae

Adenoviridae

Papilomaviridae

Poliomaviridaepapilomavírus > 70adenovírus >40

Herpes simples

Varicela-zoster

poxvírus (em quase todas as espécies)

Epstein-Barr

PAPILOMAVIRIDAE

- DNA fita dupla circular - Sem envelope

- Vários associados a cânceres

Papilomavírus: - verrugas (>70) - condiloma acuminado

- NIC- epidermodisplasia verruciforme

Gêneros: AlphapapillomavirusBetapapillomavirusGammapapillomavirusDeltapapillomavirusEpsilonpapillomavirusEtapapillomavirusIotapapillomavirusKappapapillomavirusLambdapapillomavirusMupapillomavirusNupapillomavirusOmikronpapillomavirusPipapillomavirusThetapapillomavirusXipapillomavirusZetapapillomavirus

PAPILLOMAVIRIDAE

POLIOMAVIRIDAE

- DNA fita dupla circular - Sem envelope

- Importância em imunocomprometidos

Poliomavirus: BK, JC (leucoencefalopatiamultifocal progressiva)

ADENOVIRIDAE

- icosaédricos- não envelopados- DNA dupla fita linear- potencial oncogênico (inativam p53 e pRb)

Gêneros: - Mastadenovírus (em mamíferos) - Aviadenovírus (em aves)

- fita dupla parcial de DNA - envelopado, pleomórfico - transcrição reversa

2 gêneros: - Ortohepadnavirus: Hepatite B (humanos) - Avihepadnavirus (aves)

HEPADNAVIRIDAE

Ordem Herpesvirales Família Herpesviridae

• Subfamílias:• Alfaherpesvirinae (vírus do Herpes simples,

vírus da Varicela/Zoster)• Betaherpesvirinae (Citomegalovírus; CMV)

• Gamaherpesvirinae (vírus Epstein Barr; EBV)

Família Herpesviridae

• Subfamília:Betaherpesvirinae

– Cytomegalovirus HHV-5 – Muromegalovirus MCMV-1– Roseolovirus HHV-6

Família Herpesviridae

• Subfamília:Gammaherpesvirinae

– Lymphocryptovirus HHV-4 (vírus Epstein Barr, EBV)

– Rhadinovirus

Varíola Molusco contagiosoEctima dos ovinosVários outros poxvírus

POXVIRIDAE

- os maiores vírus conhecidos (~ 300 nm)- simetria complexa- DNA duplo (codifica > 100 prots)- multiplicação intracitoplásmica

Família Asfarviridae

• Gênero: Asfivírus: – Vírus da peste suína

Africana– Somente infecta suídeos– Interesse veterinário