Rede speciesLink Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas: A integração do...

Rede speciesLink

Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas:A integração do Species Analyst e SinBiota

Vanderlei Perez CanhosAlexandre Marino

Centro de Referência em Informação Ambiental, CrIA

Amazon Basin Biodiversity Information Facility

O principal objetivo

do projeto

speciesLink foi o de

desenvolver um

sistema de buscas

distribuído

integrando diversas

coleções biológicas

e tornando seus

dados primários

disponíveis através

da Internet.

speciesLinkSistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas

http://splink.cria.org.br

peixes: 3

herbários: 4 microrganismos: 3

ácaros: 2

inventário: SinBiota

Distribuição geográfica das coleções participantes

Coleções do Estado de São Paulo Coleções do Estado de São Paulo – Fase I (2 anos)– Fase I (2 anos)

Suporte às coleçõesSuporte às coleções

• Provendo equipamentos e infraestrutura de rede

• Auxiliando na escolha do software de gerenciamento

• Auxiliando no treinamento e na importação de dados

Protocolo e Esquema de DadosProtocolo e Esquema de Dados

• Protocolo DiGIR (Distributed Generic Information Retrieval)

Potencial para ter aceitação global

• Componentes DiGIR (Portal Java & Provedor PHP)

Desenvolvimento colaborativo

• DarwinCore v.2

Cobre o conteúdo comum a todos os grupos taxonômicos contemplando todos os dados básicos (identificação taxonômica, localização e data da coleta)

Interface de Interface de Busca SimplesBusca Simples

speciesLink site

Camada de apresentação

speciesLink site

Camada de apresentação

Portal DiGIR(Java)

Portal DiGIR(Java)Perl

Perl

Conectividade baixa ou instável

Conectividade rápida e estável

DadosCliente SOAP

Sistema deGerenciamento

da Coleção

SQL

Coleção C

Repositóriode Dados

DadosCliente SOAP

Sistema deGerenciamento

da Coleção

SQL

Coleção B

Repositóriode Dados

DadosProvedor

PHP

Sistema deGerenciamento

da Coleção

SQL

Coleção A

PostgresProvedor

PHP

SOAP Server

SQL

Servidor Regional

Arquitetura do Arquitetura do SistemaSistema

Servidor Regional

Servidor Regional

Servidor Regional

Servidor Regional

Representação da redeRepresentação da rede

speciesLink site

Camada de apresentação

speciesLink site

Camada de apresentação

Portal DiGIR(Java)

Portal DiGIR(Java)Perl

Perl

Conectividade baixa ou instável

Conectividade rápida e estável

DadosCliente SOAP

Sistema deGerenciamento

da Coleção

SQL

Coleção C

Repositóriode Dados

DadosCliente SOAP

Sistema deGerenciamento

da Coleção

SQL

Coleção B

Repositório deDados

PostgresProvedor

PHP

Servidor SOAP

SQL

Servidor Regional

DadosProvedor

PHP

Sistema deGerenciamento

da Coleção

SQL

Coleção A

Arquitetura do Arquitetura do SistemaSistema

Software para migrar dadosSoftware para migrar dados

• Independente de plataforma (java)

• Conecta-se a qualquer banco de dados acessível via JDBC(também suporta arquivos texto)

• Oferece controle completo sobre os dados

• Baixo tráfego de rede

• Possibilidade de filtrar dados sensíveis usando expressões regulares

Resultado de busca simplesResultado de busca simples

speciesLink speciesLink – Fase II (+2 anos)– Fase II (+2 anos)

~40 coleções conectadas~40 coleções conectadas

~940.000 registros on-line~940.000 registros on-line

Março/2006Março/2006

JBRJ

FUTUROFUTURO

JBRJ

Rede Paranaense

Rede Capixaba

Gracias!Gracias!

http://splink.cria.org.br

vcanhos@cria.org.br

marino@cria.org.br