Solucionar de forma otimizada os problemas que exijam alto esforço computacional e assim assegurar...

MISSÃO

Solucionar de forma otimizada os problemas que exijam alto esforço computacional e assim assegurar a satisfação dos clientes

ROTEIRO

• Engenharia Genética• Genes

1 - Introdução

• Cenário Atual• Usuário

2 - Problema

• Concorrentes• Nossa Solução• Nossa Proposta

3 - Solução• Gereciamento• Hardware• Usabilidade• Andamento

4 - Projeto

US$ 300 bilhões

ENGENHARIA GENÉTICA

}

}

GENES

DNA

NECESSIDADE DA PESQUISA GENÉTICA

EXEMPLO : DIABETES

GENE DA INSULINA

PROBLEMA

GENE DA INSULINA

PROBLEMA:

INDENTIFICAÇÃO DE

GENES NO DNA

EXEMPLO : DIABETES

7000 cadeias (100 MB)

CENÁRIO ATUALATAACTCGGTATGTTGCTAG

TGGATAGACG]GACCATGGACATGACGACT...

7000 cadeias (100 MB)

ATAACTCGGT

7000 cadeias (100 MB)

CENÁRIO ATUAL

7000 cadeias (100 MB)

7000 cadeias (100 MB)

ATAACTCGGT

ATAACTCGGT

ATAACTCGGT

•Penalidade

2 min

•Pesquisa Cadeia 2

•Penalidade

4 min

•Pesquisa Cadeia 3

1 min

•Pesquisa Cadeia 1

ATAACTCGGT

ATAACTCGGT

ATAACTCGGT

CENÁRIO ATUAL

7000 cadeias (100 MB)

CENÁRIO ATUAL

GENBANK

7,5 GBBANCO PRIVAD

O

TATAACTCGGTTCGAGATCGTAGCTATCGACTGCATGCATCGACTAGCATATAACTCGGTGCATAACTCGGTCCGGATCGATGCATGCATCGATCGATGACTGACTGACTAGCATCGATGCTAGCATGCTAGCTAGCTGATGCATGCATCGATCGATCGATCGATCGACGATCGACGATGCATGCATGCATCGATCATAACTCGGTCGAGCTAGCTAGCAGCAGCATGCACGATACGGCACAAACATCGATCGAGACGGCCACGATCGATCGATCGTGCTGTCGATGTTT

CENÁRIO ATUAL

ATAACTCGGT

ATAACTCGGT

ATAACTCGGT

Blast

TATAACTCGGTTCGAGATCGTAGCTATCGACTGCATGCATCGACTAGCATATAACTCGGTGCATAACTCGGTCCGGATCGATGCATGCATCGATCGATGACTGACTGACTAGCATCGATGCTAGCATGCTAGCTAGCTGATGCATGCATCGATCGATCGATCGATCGACGATCGACGATGCATGCATGCATCGATCATAACTCGGTCGAGCTAGCTAGCAGCAGCATGCACGATACGGCACAAACATCGATCGAGACGGCCACGATCGATCGATCGTGCTGTCGATGTTT

ATAACTCGGT

CENÁRIO ATUAL

ATAACTCGGT

ATAACTCGGT ATAACTCGGT

ATAACTCGGT

Smith-Waterman7000

cadeias (100 MB)

7000 cadeias (100 MB)

CENÁRIO ATUAL

ALGUNS DIAS DEPOIS...

CENÁRIO ATUAL

7000 cadeias (100 MB)

MAIS ALGUNS DIAS...

CENÁRIO ATUAL

CENÁRIO ATUAL

O USUÁRIO

Interface simples Rápido Saída configurável Disponível na web Smith-Waterman Privacidade Compartilhamento

Web

NOSSA SOLUÇÃO

7000 cadeias (100 MB)

ATAACTCGGTATGTTGCTAG

TGGATAGACG]GACCATGGACATGACGACT...

7000 cadeias (100 MB)

ATAACTCGGT

NOSSA SOLUÇÃO

7,5 GBBANCO PRIVAD

O

NOSSA SOLUÇÃO

COMO OTIMIZAR O ALINHAMENTO

Smith-Waterman:Forte paralelismo

HARDWARE ESPECIALIZADO

ARQUITETURA

BD

WEB

FPGAs

CURVA DE VALOR - COMPARATIVO

0

1

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5

6

Busca On-LineServidores LocaisCube

PÚBLICO ALVO

Acesso LimitadoAcesso Ilimitado

Investidores

• Gereciamento• Hardware• Usabilidade

4 - Projeto

PROJETO

DÚVIDAS

AGRADECIMENTO

OBRIGADO!