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Biologia molecular

Investiga as interações entre os diversos sistemas celulares, especialmente entre DNA, RNA e proteínas.

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Biologia molecularPossibilita a caracterização de

diversos genes em nível de sequência e regulação com relativa segurança;

Em microbiologia de alimentos os métodos moleculares vêm substituindo os fenotípicos, como forma de confirmar a proximidade entre cepas envolvidas em um surto.

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Biologia molecular

Identificação de agentes patogênicos mais rápida, em relação aos testes microbiológicos;

Fornece resultados seguros;

Possibilita a tipificação de espécies.

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Biologia molecular

Importante subsídio ao monitoramento microbiano em sistemas de APPCC PCR

Pesquisas indicam as técnicas da biologia molecular como importante recurso no controle de qualidade em estabelecimentos frigoríficos.

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Biologia molecularÉ um campo ainda em

desenvolvimento em nível de pesquisa;

Técnicas vem se aperfeiçoado cada vez mais;

Desafio tornar a técnica viável à rotina laboratorial.

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Imagem: http://dgp.cnpq.br/buscaoperacional

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Imagem: www.cpa.vet.ufg.br/web

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Métodos de análise• Reação em Cadeia da Polimerase (PCR);

• PCR em tempo real;

• Western Blot;

• Polimorfismo do Comprimento dos Fragmentos de Restrição (RFLP);

• Eletroforese em Gel de Campo Pulsado (PFGE).

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Reação em Cadeia da Polimerase (PCR)

Sequências de DNA ou RNA específicos enzimaticamente ampliadas;

Altamente sensível;Alto investimento em equipamentos e

reagentes;Sem padronização e regulamentação

oficial quanto às técnicas.

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Reação em Cadeia da Polimerase (PCR)

Utiliza-se uma enzima termoestável que em presença dos primers e dos nucleotídeos que compõem uma molécula de DNA amplificam a região de interesse.

Ciclos repetidos em termocicladoras; Separação e visualização do material

genético em géis de agarose ou poliacrilamida.

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PCR em Tempo RealÉ uma técnica variante do PCR

convencional que permite quantificar a expressão gênica;

• Associa o PCR a um sistema de detecção e quantificação da fluorescência produzida durante os ciclos.

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PCR em Tempo RealVantagens:

Facilidade de quantificação;Maior sensibilidade,

reprodutibilidade e precisão;Rapidez;Melhor controle da qualidade no

processo;Menor risco de contaminação.

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Western BlotMétodo semi-quantitativo altamente

específico;Indicado para análise de poteínas insolúveis:

Extração das proteínas;Separação eletroforética em gel em

condições desnaturantes;Eletrotransferência das proteínas;Reações imunoquímicas de detecção de

enzimas.

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Western Blot

Detecção de encefalopatia enspongiforme bovina;

Proteína protease-resistente do príon PrPSc.

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Polimorfismo do Comprimento dos Fragmentos de Restrição (RFLP)

• Técnica se baseia no corte do DNA por enzimas de restrição que produzem fragmentos de comprimentos diferentes;

• Os fragmentos são separados em gel de agarose por eletroforese e transferidos para uma membrana de nylon ou poliacrilamida onde é realizada a hibridização com sonda marcada com fluorocromo ou material radioativo.

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Polimorfismo do Comprimento dos Fragmentos de Restrição (RFLP)

As enzimas de restrição reconhecem seqüências específicas do DNA e clivam a fita em fragmentos mais curtos.

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Polimorfismo do Comprimento dos Fragmentos de Restrição (RFLP)

Utilização:Genotipagem;

Estudos epidemiológicos;

Identificação microorganismos ;

Diagnóstico laboratorial.

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Polimorfismo do Comprimento dos Fragmentos de Restrição (RFLP)

Principais limitações para o emprego da técnica:

Técnica laboriosa não é passível de automatização;

Requer alta quantidade e qualidade de DNA;

Uso de várias enzimas gerando padrões altamente complexos e de difícil interpretação.

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Eletroforese em Gel de Campo Pulsado (PFGE)

Muito utilizado para análises epidemiológicas de bactérias patogênicas;

É uma derivação do método convencional da eletroforese:Mudança repetida da orientação do

campo elétrico;Fragmentos maiores de DNA.

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Investigação de Escherichia coli O157:H7 no Estado do Rio Grande do

Sul, BrasilObjetivo: Investigar E.coli O157:H7 em amostras de carne moída coletadas no comércio do Rio Grande do Sul.Materiais e métodos: Isolou-se a bactéria por meio de enriquecimento seletivo e depois caracterizou-se o genótipo e o fenótipo através do PCR Multiplex.

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Aplicação da técnica de PCR na detecção de Yersinia enterocolitica em

suínos abatidos sem inspeçãoObjetivo: Avaliar a contaminação de carcaças e tonsilas

de suínos por Y. enterocolitica e comparar a análise microbiológica com a técnica de PCR

Resultados: Pela microbiologia não se detectou Y. enterocolitica e através de PCR detectou-se a bactéria em 40% das carcaças e em 43% das tonsilas

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Aplicação da técnica de PCR na detecção de Yersinia enterocolitica em suínos abatidos sem inspeção

Conclusão:A PCR apresentou-se como técnica mais eficaz, econômica e rápida;PCR é um importante recurso para o controle de qualidade da carne suína.

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Coliformes fecais, estafilococos coagulase positiva (ECP), Salmonella spp. e

Campylobacter spp. em linguiça frescal

Objetivo: Verificar a qualidade microbiológica de

linguiças frescais de carne de frango, mista e de carne suína, fabricadas artesanalmente e sob

inspeção, no município de Jaboticabal – SP, Brasil.

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Coliformes fecais, estafilococos coagulase positiva (ECP), Salmonella spp. e

Campylobacter spp. em linguiça frescalResultados: As amostras positivas de E. coli analisadas

pelos testes de PCR Multiplex não revelaram presença

de E. coli O:157, O:111 e O:113Conclusão: A ausência destes microrganismos em lingüiça frescal pode ser explicada pelo pH, quantidade de sal e nitritos e erro nos meios utilizados para contagem.

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Detecção de adulterações em produtos alimentares contendo leite e/ou proteínas lácteasCaracterísticas da produção de leite de cabra e

ovelhas:Flutuações sazionais quanto a presença no

mercado;Preço mais elevado comparativamente ao leite

de vaca;Alterações quanto aos teores de alguns

constituintes.

Concentacões mais elevadas de ácido capróico (C6), caprílico (C8), cáprico (C10) e láurico (C12).

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Principal adulteração: adição do leite de vaca e proteínas lácteas ao leite de cabra e/ou ovelha para prerparação de queijo;

O consumo de produtos que contenham leite e este não seja declarado na rotulagem, poderá causar reações alérgicas, em indivíduos sensíveis a esse produto.

Detecção de adulterações em produtos alimentares contendo leite e/ou proteínas lácteas

Cabra, Ovelha ou

Vaca?

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Detecção de adulterações em produtos alimentares contendo leite e/ou proteínas lácteas

Métodos eletroforéticos.

Métodos imunológicos

Métodos cromatrográficos

Métodos moleculares

Espectometria em massa

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Métodos cromatrográficos: Cromatografia é uma técnica de separação de

misturas e identificação de seus componentes; A eluição da s1-caseína bovina ocorre mais tarde

que a das s1 caseínas caprina e ovina.

Métodos eletroforéticos: Baseado na mobilidade das proteínas sobre a ação

de uma carga elétrica; Permitem a diferenciação das proteínas do leite de

vaca do leite de ovelha e cabra, a partir da y-caseinas bovinas.

Detecção de adulterações em produtos alimentares contendo leite e/ou proteínas lácteas

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Métodos imunológicos: Relativa simplicidade dos ensaios enzimáticos e a elevada

sensibilidade, devido à especificidade das reações antígeno-anticorpo;

Detecção qualitativa e quantitativa de componentes alimentares e contaminantes.

Métodos moleculares: Técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) baseia-

se na análise de DNA, permitindo detectar e amplificar pequenos fragmentos de DNA.

Espectometria em massa Determina a massa molecular das proteínas do leite e

identificar variantes genéticas.

Detecção de adulterações em produtos alimentares contendo leite e/ou proteínas lácteas

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Detecção de adulterações em produtos alimentares contendo leite e/ou proteínas lácteas

Mais recentemente, com a técnica de PCR têm-se obtido resultados promissores. O

mesmo está acontecendo com a espectrometria de massa.

Máquina de PCR

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Identificação molecular de peixes: o caso do Surubim (Pseudoplatystoma

spp.)O artigo trata da necessidade/importância do

desenvolvimento de meios de identificação das diferentes espécies de peixes, no caso o surubim (Pseudoplatystoma corruscans), bem como da utilização de tecnologias biomoleculares para identificação de fraudes na comercialização de híbridos de surubim como sendo este espécime puro;

A tecnologia utilizada para tal identificação foi a de Barcode Genético, que consiste na pesquisa de uma pequena sequência de DNA mitocondrial (gene COI).

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Identificação molecular de peixes: o caso do Surubim (Pseudoplatystoma

spp.) Experimento realizado na Escola de Veterinária da UFMG onde

foram analisados dois grupos de indivíduos: Hibrido de surubim, o cachapinta e o outro surubim puro (P. corruscans)

Hibrido: confirmou-se sua hibridez já que foi identificado o mtDNA de cachara (Pseudoplatystoma reticulatum).

Puro: identificou-se também o mtDNA de cachara, indicando assim que estes indivíduos não eram puros, ou seja, mas sim híbridos

Conclui-se que a utilização dos métodos biomoleculares são de grande ajuda na identificação de híbridos de surubim, na identificação de modos de cruzamentos interespecíficos e na identificação de possíveis fraudes como a venda de híbridos do surubim como sendo surubim puro

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Métodos diagnósticos para os patógenos alimentares: Campylobacter sp., Salmonella sp. e

Listeria monocytogenes

Os métodos moleculares são importantes para reduzir a frequência da transmissão destes patógenos aos consumidores.

As técnicas moleculares, em especial a PCR, tem melhorado a identificação dessas bactérias, reduzindo o tempo de cultivo e ampliando a confiabilidade das provas diagnósticas.

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Salmonella sp.Caracterização bioquímica;Sorotipagens;Suscetibilidade a antimicrobianos;Sorologia;PCR.

Métodos diagnósticos para os patógenos alimentares: Campylobacter sp., Salmonella sp. e

Listeria monocytogenes

Alta confiabilidadeLongo tempo

para identificação

Menor tempo de identificação

Traça perfil genético

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Métodos diagnósticos para os patógenos alimentares: Campylobacter sp., Salmonella sp. e

Listeria monocytogenesCampylobacter sp.

Isolamento do agente método mais utilizado

PCR elimina o tempo de incubação, isolamento e testes bioquímicos método mais rápido

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Métodos diagnósticos para os patógenos alimentares: Campylobacter sp., Salmonella sp. e

Listeria monocytogenesListeria monocytogenes:

Microbiologia tradicional diversos caldos seletivos de enriquecimento e ágares disponíveis para recuperação e multiplicação;

PCR eficiente na identificação do patógeno.

As técnicas de biologia molecular têm sido cada vez mais aplicadas na caracterização de L. monocytogenes.

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Métodos diagnósticos para os patógenos alimentares: Campylobacter sp., Salmonella sp. e

Listeria monocytogenes

Os microrganismos estudados são de grande importância quando nos referimos aos transtornos alimentares. Dessa forma fez-se necessário o uso de técnicas que apresentem um diagnóstico preciso e eficiente a fim de se evitar surtos de infecções, que envolvem grandes danos a saúde publica.

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ConclusãoAs indústria são responsáveis por assegurar a

autenticidade dos produtos de origem animal, para tanto necessitam ter à sua disposição métodos que possam dar respostas precisas em tempo real. A biologia molecular vem para facilitar estas análises, assim como dar diagnósticos precisos e de forma eficiente;

Os métodos moleculares vêm aos poucos substituindo as análises tradicionais, no entanto ainda serão necessárias pesquisas a fim de tornar esta tecnologia viável à rotina laboratorial.

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Arq. Inst. Biol., São Paulo, v.77, n.4, p.741-750, out./dez., 2010 MÉTODOS DIAGNÓSTICOS PARA OS PATÓGENOS ALIMENTARES: CAMPYLOBACTER SP., SALMONELLA SP. E LISTERIA MONOCYTOGENES R.B. de Andrade, T. Gemelli, L.P. Dall Onder, K. Cristina, T. de Brito, A.A.L. Barboza, B.G. de Brito Instituto de Pesquisa Veterinária “Desidério Finamor”,