Departamento de Genética Humana

Testes GenéticosUnidade de

Genética Molecular

A Unidade de Genética Molecular (UMO) do Departamento de Genéti-

ca Humana (DGH) do INSA, IP, tem como principal missão a realiza-

ção de testes genéticos de base molecular (testes de diagnóstico,

pré-sintomáticos, preditivos e de rastreio populacional) no âmbito de

diferentes doenças genéticas no período pré-natal e pós-natal, de pa-

tologias com componente genética de susceptibilidade e de farmaco-

genética. Os resultados destes testes, conjugados com o aconselha-

mento genético, contribuem diretamente para a prevenção da doença

genética no contexto familiar e da saúde pública.

A UMO tem como princípios orientadores o rigor técnico e científi-

co, a melhoria contínua e a acreditação de ensaios, os quais se re-

fletem na prestação de serviços de qualidade disponibilizados aos

seus clientes/utentes. Os serviços e testes genéticos realizados as-

sentam, de forma continuada, em critérios de exigência e actividades

que compreendem, nomeadamente:

Qualificação técnica e científica dos recursos humanos.

Participação anual em programas internacionais de avaliação externa da

qualidade , como entidade avaliada e como prestadora de assessoria téc-

nica.

Prosseguir com a acreditação, pela norma ISO 15189, para todos os testes

genéticos disponibilizados à comunidade.

Validação dos resultados dos ensaios recorrendo a diferentes metodolo-

gias, à validação por mais do que um técnico, à avaliação global integrada

de diversos resultados para a mesma amostra ou à realização da análise

em amostras duplicadas.

Colaboração com as unidades de investigação do DGH, visando a melho-

ria da prestação de serviços, a produção científica, o desenvolvimento

tecnológico e a concepção/implementação de novos testes genéticos.

Participação em actividades de formação de recursos humanos (alunos de

instituições de ensino públicas e privadas, associações de doentes, cursos

de pós-graduação, cursos profissionalizantes).

Funções de laboratório nacional de referência visando a integração em

centros de referência para doenças genéticas raras.

Testes genéticos realizados na UMO:

Alfa-Talassémia, pesq. deleções/inserções: caso índex; caso familiarAlfa-Talassémia (não delecional): caso índexAlfa-Talassémia (não delecional): caso familiarBeta talassémia: diagnóstico pré-natal (DPN)Beta talassémia - caso familiarBeta talassémia - mutações frequentes: caso índex, nível I Beta talassémia, pesq. deleções/inserções: caso índex; caso familiarBeta talassémia, pesq. de mutações raras: caso índex - nível IIDrepanocitose: caso índex; caso familiarDrepanocitose: diagnóstico pré-natal Haplotipo do agrupamento génico da beta globinaHemoglobinopatia (variantes de Hb): caso índexHemoglobinopatia (variantes de Hb): diagnóstico pré-natal Hemoglobinopatia (variantes de Hb): caso familiar

3601234643346453446034459344563605734457343253432634391344633446534464

De�ciência em 21-OH (pesq. mut. freq.:CYP21A2 ): c. índex, nível IDe�ciência em 21-OH (pesq. mut. fam. CYP21A2 ): caso familiar De�ciência em 21-OH (pesquisa mutações em CYP21A2 ): DPNDef. em 21-OH (sequenciação CYP21A2 ): caso índex, nível IIDisgenesia gonadal, pesquisa mut. no gene SRY: caso índexDisgenesia gonadal, pesquisa mut. no gene SRY: caso familiarHipogonadismo Hipogonadotró�co (gene GnRHR ): caso índexHipogonadismo Hipogonadotró�co (gene GnRHR ): caso familiarHipogonadismo Hipog. (sínd. Kallmann – gene KALL-1 ): caso índexHipogonadismo Hipog. (sínd Kallmann – gene KALL-1 ):caso familiarHipoplasia supra-renal congénita (NROB1/DAX1 ): caso índexHipoplasia supra-renal congénita (NROB1/DAX1 ): caso familiarInsensibilidade androgénios, pesq. mutações gene AR : caso índexInsensibilidade androgénios, pesq. mutações gene AR : caso familiarSíndrome de Turner, pesq. sequências cromossoma Y: caso índexSíndrome de Turner, pesq. sequências cromossoma Y: caso familiar

34575345773611236113343553435836201345653456334565362033620234382343833437334374

Pesquisa das mutações H63D,C282Y e S65C: caso índex; c. familiarPesquisa das mutações H63D e S65C: caso índex; caso familiarPesquisa das mutações H63D e C282Y: caso índex; caso familiar

Azoospermia obstrutiva, pesq. de mut. mais freq. no gene CFTR : caso índexPesquisa de microdeleções em AZF, cromossoma Y: caso índexPesquisa de microdeleções em AZF, cromossoma Y: caso familiarPesquisa seq. cromos. Y (ex. homens 46,XX; cromos. Y anormal): c. índexPesquisa de sequências do cromossoma Y: caso familiar

Doseamento da elastase pancreática fecalFibrose quística (pesq. mutações mais frequentes): caso índex, nível 1 Fibrose quística (pesquisa de mutações raras): caso índex, nível 2Fibrose quística (análise da restante seq. codi�cante):c. índex, nível 3 Fibrose quística: diagnóstico pré-natal Fibrose quística: caso familiar

3433834572345733625636257

345603433536179361803434234341

361903449434493

Hemoglobinopatias

Hemocromatose Hereditária (Gene HFE )

Patologias do desenvolvimento sexual

Infertilidade masculina

Fibrose Quística (Gene CFTR )

Cód. SNS*

Cód. SNS*

Cód. SNS*

Cód. SNS*

Cód. SNS*

AC

AC

AC

DGH UMO-IM01_01

A UMO, no âmbito da sua política de desenvolvimento, inovação e quali-

dade, tem em fase de optimização e de validação diversos pacotes de

testes genéticos baseados na Sequenciação de Nova Geração (NGS).

Entidades organizadoras de programas de avaliação externa da qualidade em

que a UMO participa: EMQN (The European Molecular Genetics Quality Network);

CF-network (Cystic Fibrosis European Network); UK-NEQAS (United Kingdom

National External Quality Assessment Service); ECAT (External Quality Control

Organisation for Assays and Tests in Thrombosis and Haemostasis).

Ensaio acreditado pelo IPAC no âmbito da Norma ISO 15189

http://www.ipac.pt/pesquisa/ficha_15189.asp?ID=E0015

Contactos:

Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Tel.: 217 519 200Departamento de Genética Humana, Tel.: 217 526 413

Unidade de Genética MolecularAv. Padre Cruz, 1649-016 LISBOA e-mail: cgh@insa.min-saude.ptTel.: 217 519 233 l Fax: 21 752 6410

www.insa.pt

AC

A realização de testes genéticos está definida na Lei 12/2005 – Diário da República, I Série-A, Nº 18, de 26/01/2005.

Departamento de Genética Humana

Cancro da mama, pesq. deleções em BRCA1/BRCA2 : caso índexCancro da mama, pesq. deleções BRCA1/BRCA2 : caso familiarCancro da mama, pesquisa de mut. fundadora BRCA2 : caso índexCancro da mama, pesquisa de mut. fundadora BRCA2 : caso familiarCancro da mama, pesq. mutações em BRCA1: caso índexCancro da mama, pesq. mutações em BRCA1: caso familiarCancro da mama, pesq. mutações em BRCA2 : caso índexCancro da mama, pesq. mutações em BRCA2 : caso familiarCancro hereditário do cólon sem polipose (HNPCC), pesq. deleções em MLH1 e MSH2: caso índex e caso familiarHNPCC, pesquisa de mutações no gene MLH1: caso índexHNPCC, pesquisa de mutações no gene MLH1: caso familiarHNPCC, pesquisa de mutações no gene MSH2 : caso índexHNPCC, pesquisa de mutações no gene MSH2 : caso familiarHNPCC, pesquisa de mutações no gene MSH6 : caso índexHNPCC, pesquisa de mutações no gene MSH6 : caso familiarPolipose adenomatosa do cólon, pesq. mut.em MUTYH : caso índexPolipose adenomatosa do cólon, pesq. mut.em MUTYH : c. familiarPolipose adenomatosa do cólon, MUTYH : p.G382D e p.Y165CPolipose adenomatosa familiar - FAP, pesq.mut. em APC : caso índexPolipose adenomatosa familiar.- FAP, pesq.mut. em APC : caso fam.Síndrome de Li-Fraumeni, pesq. de mut. em p53 : caso índex

34603346043434734346361933435034352343513430134302343103431234311343153431634553361143455534305343073430634364343673436136309

3437034497

360593606036061360623454334544345473454834844

346373463834398343993606836069362643463534633343943439534855

Trombose e Hemostase

Oncobiologia

Síndrome de Peutz-Jeghers – pesq. de mut. em LKB1: caso índexSíndrome de Peutz-Jeghers – pesq. de mut. em LKB1: caso familiarTumores com instabilidade de microssatélites, pesquisa da mutação p.V600E no gene BRAFTumores, pesquisa de instabilidade de microssatélitesTumores, pesquisa de instabilidade de microssat. (marcador BAT26)

Doenças do Prião Humano (Creutzfeldt-Jakob (DCJ); Gerstmann--Straussler-Scheinker (GSS); Insónia Familiar Fatal ( IFF )) Imunode�ciência com hiper IgM: caso índexImunode�ciência com hiper IgM: diagnóstico pré-natalImunode�ciência com hiper IgM: estudo de familiarSíndrome de Berardinelli-Seip ou lipodistro�a congénita generalizada (gene AGPAT2 ): Diagnóstico pré-natalSíndrome de Berardinelli-Seip ou lipodistro�a congénita generalizada, pesquisa de mutações no gene AGPAT2 : caso index Síndrome de Berardinelli-Seip ou lipodistro�a congénita generalizada, pesquisa de mutações no gene AGPAT2 : caso familiarSínd. de Berardinelli-Seip ou lipodistro�a congénita generalizada, pesquisa da deleção dos exões 3 e 4: gene AGPAT2 : caso index e fam.Síndrome de Okihiro - pesquisa de mutações no gene SALL4Síndrome oculocerebrorrenal de Lowe: caso índexSíndrome oculocerebrorrenal de Lowe: diagnóstico pré-natalExtração de DNA (diferentes tecidos: vilosidades, líquido amniótico)Extração de DNA automática (500 µL sangue periférico/medular)

34329

34377343793437836276

36277

36278

36279

3628934386343883420134202

Cód. SNS*

Cód. SNS*

Hemo�lia A (def. factor VIII, pesq. de inversões): caso índexHemof.ilia A (def. de factor VIII, pesq. mut. gene F8 ): caso índexHemof.ilia A (def. de factor VIII, pesq. mut. gene F8 ): DPNHemo�lia A (de�ciência de factor VIII ): caso familiarHemo�lia A (de�ciência de factor VIII – pesq. de inversões): DPN nível 1Hemo�lia B (de�ciência de factor IX ): caso índexHemo�lia B (de�ciência de factor IX ): DPNHemo�lia B (de�ciência de factor IX ): caso familiarDe�ciência em anti-trombina III: caso índexDe�ciência em anti-trombina III: caso familiarDe�ciência em factor VII: caso índexDe�ciência em factor VII: DPNDe�ciência em factor VII: caso familiarDe�ciência em factor XI: caso índexDe�ciência em factor XI: caso familiarDe�ciência em proteína C, pesquisa mutações gene PROC : c. índex De�ciência em proteína C, pesquisa mutações gene PROC : DPNDe�ciência em proteína C, pesq. mut. gene PROC : caso familiarDe�ciência em proteína S: caso índexDe�ciência em proteína S: diagnóstico pré-natal De�ciência em proteína S: caso familiarFactor genético predisponente para trombose – PAI 1: variante 4GFactor genético predisponente pa trombose – MTHFR : 677T e 1298CFactor genético predisponente para trombose – Factor V LeidenFactor genético predisponente para trombose – gene AT3, pesquisa mutações: Cambridge Ala384Ser, Ser82Asn

Factores genéticos predisponentes pa trombose – protrombina, F2 :20210AFactores genéticos predisponentes pa trombose – FV Leiden; Variantes: MTHFR : 677T e 1298C, PAI1: 4G e F2 :20210A

Síndrome de Li-Fraumeni, pesq. de mut. em p53 : caso familiar36287

AC

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Malignidade Hematológica

362903629136314

3465036316

Avaliação pós-transplante medular por marcadores moleculares: quanti�-cação de quimerismoAvaliação pré-transplante medular por marc. molec: dador / receptorLeucemia aguda, pesq. gene fusão CBFB-MYH11:doença mínima residualLeucemia aguda, pesquisa gene de fusão CBFB-MYH11 no diagnósticoLeuc. aguda, pesq. gene fusão ETV6-RUNX1: doença mínima residualLeucemia aguda, pesquisa gene de fusão ETV6-RUNX1 no diagnósticoLeuc. aguda, pesquisa gene fusão MLL-AF9: doença mínima residualLeuc. aguda, pesquisa gene de fusão MLL-AF9 no diagnósticoLeuc. aguda, pesq. gene fusão PML-RARA: doença mínima residualLeuc. aguda, pesquisa gene de fusão PML-RARA no diagnósticoLeucemia mielóide crónica - quanti�cação de transcritos BCR/ABLLeucemia, pesquisa de gene de fusão BCR-ABL1 no diagnósticoLeucemia, pesquisa gene fusão BCR-ABL1: doença mínima residualLeuc. aguda, pesq. gene fusão RUNX1-RUNX1T1: doença mín. residualLeuc. aguda, pesquisa gene fusão RUNX1-RUNX1T1 no diagnósticoLeuc. aguda, pesq. gene fusão TCF3-PBX1: doença mínima residualLeuc. aguda, pesquisa de gene de fusão TCF3-PBX1 no diagnósticoLinfoma de células B, pesquisa genes de fusão BCL2/IGH (regiões MBR e mcr) ou BCL1/IGH (região MTC)Neoplasma mieloproliferativo, pesquisa da mutação JAK2 :V617FNeoplasia mieloproliferativa, pesq. de mutações no exão 12 no gene JAK2Rabdomiosarcoma alveolar, pesquisa gene de fusão PAX3/FKHRSarcoma de Ewing, pesquisa de gene de fusão EWS/FLI1Síndrome hipereosinofílico, pesq. transcrito de fusão FIP1L1-PDGFRaTumor desmoplásico de células redondas pequenas, pesquisa do gene de fusão EWS/WT1

34425

3605634415345843462234620346273462534409345883621934583344033441234582344183458534570

362503624634629345863630034587

Cód. SNS*

Outros Testes Genéticos

Polineuropatia Amiloidótica Familiar (PAF)

362903629136314

3465036316

Avaliação pós-transplante medular por marcadores moleculares: quanti�-cação de quimerismoAvaliação pré-transplante medular por marc. molec: dador / receptorLeucemia aguda, pesq. gene fusão CBFB-MYH11:doença mínima residualLeucemia aguda, pesquisa gene de fusão CBFB-MYH11 no diagnósticoLeuc. aguda, pesq. gene fusão ETV6-RUNX1: doença mínima residualLeucemia aguda, pesquisa gene de fusão ETV6-RUNX1 no diagnósticoLeuc. aguda, pesquisa gene fusão MLL-AF9: doença mínima residualLeuc. aguda, pesquisa gene de fusão MLL-AF9 no diagnósticoLeuc. aguda, pesq. gene fusão PML-RARA: doença mínima residualLeuc. aguda, pesquisa gene de fusão PML-RARA no diagnósticoLeucemia mielóide crónica - quanti�cação de transcritos BCR/ABLLeucemia, pesquisa de gene de fusão BCR-ABL1 no diagnósticoLeucemia, pesquisa gene fusão BCR-ABL1: doença mínima residualLeuc. aguda, pesq. gene fusão RUNX1-RUNX1T1: doença mín. residualLeuc. aguda, pesquisa gene fusão RUNX1-RUNX1T1 no diagnósticoLeuc. aguda, pesq. gene fusão TCF3-PBX1: doença mínima residualLeuc. aguda, pesquisa de gene de fusão TCF3-PBX1 no diagnósticoLinfoma de células B, pesquisa genes de fusão BCL2/IGH (regiões MBR e mcr) ou BCL1/IGH (região MTC)Neoplasma mieloproliferativo, pesquisa da mutação JAK2 :V617FNeoplasia mieloproliferativa, pesq. de mutações no exão 12 no gene JAK2Rabdomiosarcoma alveolar, pesquisa gene de fusão PAX3/FKHRSarcoma de Ewing, pesquisa de gene de fusão EWS/FLI1Síndrome hipereosinofílico, pesq. transcrito de fusão FIP1L1-PDGFRaTumor desmoplásico de células redondas pequenas, pesquisa do gene de fusão EWS/WT1

34425

3605634415345843462234620346273462534409345883621934583344033441234582344183458534570

362503624634629345863630034587

Amiloidose – PAF: pesquisa de mutações no gene TTRAmiloidose – PAF, tipo Andrade - pesquisa da mutação: p.V50M(anteriormente designada por: p.V30M ) no gene TTRAmiloidose – PAF (gene TTR): diagnóstico pré-natalAmiloidose – PAF, tipo Finlandesa - pesquisa da mutação: p.D274Y no gene GSN

3485334875

3634736014

Contaminação materna de amostras fetais: rastreio por marcadores polimór�cosDeterminação do sexo fetal – rastreio por marcadores do cromossoma YDoença de Norrie: caso índexDoença de Norrie: diagnóstico pré-natalDoença de Norrie: estudo de familiar

34668

34670343203432234321

Cód. SNS*

Cód. SNS*

Malignidade Hematológica (continuação)Cód. SNS*

E0015Exames Clínicos

* Código da Tabela do Serviço Nacional de Saúde disponível em:

http://dre.pt/pdf1sdip/2014/01/02000/0059700703.pdf

DGH UMO-IM01_01