GenômicaGenômicaÉ a caracterização de genomas É a caracterização de genomas inteiros. Tenta compreender a inteiros. Tenta compreender a organização molecular e as organização molecular e as

informações que ela trazinformações que ela traz

GenômicaGenômica

Genômica estrutural:Genômica estrutural: caracteriza a caracteriza a natureza física dos genomas. É o natureza física dos genomas. É o sequenciamento de DNA.sequenciamento de DNA.

Genômica funcional:Genômica funcional: caracteriza o caracteriza o transcriptoma, ou seja toda a gama de transcriptoma, ou seja toda a gama de transcritos produzidos por um transcritos produzidos por um determinado organismo (compara cDNA determinado organismo (compara cDNA com o DNA).com o DNA).

Proteoma:Proteoma: caracteriza toda a gama de caracteriza toda a gama de proteínas codificadas proteínas codificadas

Projetos genômicos: aplicações Projetos genômicos: aplicações práticaspráticas

Compreensão dos princípios do Compreensão dos princípios do designdesign dos organismos dos organismos

Descoberta de novos genesDescoberta de novos genes Descoberta do controle gênico de Descoberta do controle gênico de

doençasdoenças Elucidação dos processos evolutivosElucidação dos processos evolutivos Elaboração de técnicas de Elaboração de técnicas de

diagnósticos de doenças diagnósticos de doenças

Visão geral da genômica Visão geral da genômica estruturalestrutural

Mapa cromossômico em níveis crescentes de resolução

Marcadores genéticos Marcadores genéticos e como são obtidose como são obtidos

Fazendo uma biblioteca de Fazendo uma biblioteca de DNADNA

Animação do CDAnimação do CD

Avaliando polimorfismosAvaliando polimorfismos

A coleta do DNAA coleta do DNA

A coleta e a extração do DNAA coleta e a extração do DNAhttp://learn.genetics.utah.edu/content/labs/http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/extraction/extraction/

Fazendo gel de eletroforeseFazendo gel de eletroforesehttp://learn.genetics.utah.edu/content/labs/gel/http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/gel/http://br.youtube.com/watch?v=qMxQ-http://br.youtube.com/watch?v=qMxQ-65qYDk&feature=related65qYDk&feature=related

DNA figerprint DNA figerprint http://br.youtube.com/watch?http://br.youtube.com/watch?v=PSwlCk_Z02c&NR=1v=PSwlCk_Z02c&NR=1

Fazendo cópias de uma Fazendo cópias de uma sequencia de DNAsequencia de DNA

Clonagem em plasmídeoClonagem em plasmídeohttp://br.youtube.com/watch?http://br.youtube.com/watch?

v=acKWdNj936o&NR=1v=acKWdNj936o&NR=1

PCR - PCR - síntese enzimática in vitro de milhões de cópias de um segmento específico de DNA, através de amplificação em ciclos, na presença da enzima DNA polimerase

http://br.youtube.com/watch?v=_YgXcJ4n-http://br.youtube.com/watch?v=_YgXcJ4n-kQ&feature=relatedkQ&feature=related

E para se divertir aprendendo...E para se divertir aprendendo...

http://www.youtube.com/watch?v=gNNI19l1LW8http://www.youtube.com/watch?v=gNNI19l1LW8

Avaliação de polimorfismosAvaliação de polimorfismos DNA figerprint DNA figerprint http://br.youtube.com/watch?http://br.youtube.com/watch?

v=PSwlCk_Z02c&NR=1v=PSwlCk_Z02c&NR=1

RAPD (RAPD (Random Amplification of Polymorphic DNARandom Amplification of Polymorphic DNA = DNA = DNA polimórfico amplificado aleatoriamente) é basicamente uma polimórfico amplificado aleatoriamente) é basicamente uma variação do protocolo da PCR com duas características distintas: variação do protocolo da PCR com duas características distintas: utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua par de “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é aleatóriaseqüência alvo é aleatória

SSLP (SSLP (Simple Sequence Length Polymorphism Simple Sequence Length Polymorphism = polimorfismos de = polimorfismos de comprimento de sequencias curtas)comprimento de sequencias curtas)– Minisatélites (repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)Minisatélites (repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)– Microsatélites (repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu Microsatélites (repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu

complemento GT)complemento GT) RFLP (RFLP (Restriction Fragment Length PolymorphismRestriction Fragment Length Polymorphism) - ) - Envolve a

clivagem do DNA por enzimas de restrição, a separação por eletroforese, em gel de agarose ou poliacrilamida, dos fragmentos gerados na clivagem e sua visualização em forma de bandas. PCR e RFLP são muito utilizados nas pesquisas de variabilidade genética de populações

SSLP - MinisatélitesSSLP - Minisatélites(repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)(repetições em tendem (VNTR) de ~25pb)

Aplicação forense de Aplicação forense de polimorfismo como polimorfismo como

minisatélites minisatélites

SSLP – MicrosatélitesSSLP – Microsatélites(repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT)(repetições de 1 a 4pb sendo a mais comum CA e seu complemento GT)

RAPDRAPD(utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de (utiliza uma sequência iniciadora única e pequena ao invés de um par de “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é “primers” e esta tem seqüência arbitrária, portanto sua seqüência alvo é

aleatória)aleatória)

Sequenciamento do DNASequenciamento do DNA

O método DideoxiO método Dideoxi http://br.youtube.com/watch?http://br.youtube.com/watch?

v=f1ifyEJ2Gjs&NR=1v=f1ifyEJ2Gjs&NR=1

Sequenciamento automático com Sequenciamento automático com corantes fluorescentescorantes fluorescentes http://http://brbr..youtubeyoutube..com/watchcom/watch??

v=oYpllbI0qF8&feature=relatedv=oYpllbI0qF8&feature=related http://br.youtube.com/watch?v=ezAefHhvechttp://br.youtube.com/watch?v=ezAefHhvec

MM