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1 Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência Filogenética 1. Introdução 2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição 3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas 4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas

Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência ......3 Sober, E. 1988. Reconstructing the Past.The MIT Press. Systematics is the branch of evolutionary biology that

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Page 1: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência ......3 Sober, E. 1988. Reconstructing the Past.The MIT Press. Systematics is the branch of evolutionary biology that

1

Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas

Page 2: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência ......3 Sober, E. 1988. Reconstructing the Past.The MIT Press. Systematics is the branch of evolutionary biology that

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

Objetivo: Compreender que a sistemática biológica é uma ciência histórica, comparativa e inferencial.

Page 3: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência ......3 Sober, E. 1988. Reconstructing the Past.The MIT Press. Systematics is the branch of evolutionary biology that

3Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

Systematics is the branch of evolutionarybiology that aims to recover thegenealogical relationships underlyingorganic diversity.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo objetivo é recuperar as relações genealógicas subjacentes à diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

Page 4: Introdução à Sistemática Molecular Métodos de Inferência ......3 Sober, E. 1988. Reconstructing the Past.The MIT Press. Systematics is the branch of evolutionary biology that

4Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia

evolutiva cujo objetivo é recuperar as

relações genealógicas subjacentes à

diversidade orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

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5Arhat Abzhanov

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61. Sistemática biológica

Introdução

TempoEspaço

Diversidade

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EspaEspaççooTem

po

Tem

po

Descendência com modificação

1. Sistemática biológica

Introdução

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EspaEspaççoo

Tem

po

Tem

po

Descendência com modificação

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva cujo

objetivo é recuperar as relações genealógicas

subjacentes à diversidade orgânica

1. Sistemática biológica

Introdução

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C. crassirostris

C. pallidaG. fortis

C. parvulus

G. magnirostris

G. conirostris

G. scandens

C. pauper

C. heliobates

C. olivacea

Ancestral comum

Introdução

1. Sistemática biológica

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10Sober, E. 1988. Reconstructing the Past. The MIT Press.

A sistemática é o ramo da biologia evolutiva

cujo objetivo é recuperar as relações

genealógicas subjacentes à diversidade

orgânica.

Introdução

1. Sistemática biológica

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11

G. magnirostris

G. fortis

G. fuliginosa

G. scandens C. pallida

C. heliobatesG. conirostris C. crassirostris

C. parvulus C. pauper

C. olivacea T. obscura

Introdução

1. Sistemática biológica

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

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132. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

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A G

TC

2. Preservação e destruição da informação

Introdução

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População descendente População descendente

Sequênciasdescendentes

AA

CCTT

População ancestral

Sequência ancestral

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AC — ATGAACGT — CAA CGC — T — C

ACTGAACGTAACGC

ACTGA — T — GAC — GGTA A — G CGC

A AC ∗ AT TG GG ∗ AA AG ∗ CG GT ∗ CA AG ∗ AC CG GC C

Sequência ancestral

Sequênciadescendente 1

Sequênciadescendente 2

Sequênciasobservadas

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172. Preservação e destruição da informação

Introdução

Preservação − destruição da informação

A G

TC

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

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EspaEspaççooTem

po

Tem

po

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203. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

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213. Padrão e processo

Introdução

Dados de distribuição de caracteres

Suposições sobre processos

Padrão filogenético+ →

Dados de distribuição de caracteres

Métodos deinferência

Padrão filogenético+ →

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Histórica Comparativa Inferencial

A sistemática biológica éuma ciência

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233. Padrão e processo

Introdução

Matriz de caracteres alinhadosEvolução (não-observável)

CGACTTG

CCACATG

DADOS DE SEQUÊNCIAS

GC TAA

Análise filogenética

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Introdução

1. Sistemática biológica

2. Preservação e destruição da informação

3. Padrão e processo

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Introdução à Sistemática Molecular

Métodos de Inferência Filogenética

1. Introdução

2. Módulo I. Dinâmica mutacional e modelos de substituição

3. Módulo II. Reconstrução de árvores filogenéticas

4. Módulo III. Inferência em árvores filogenéticas