Upload
others
View
7
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
KEANEKARAGAMAN HAYATI SUMATERA UTARA:
MATERI AJAR DAN PENELITIANNYA
Prof. Dr. rer. nat. Binari Manurung, M.Si
WEBINAR HPPBI CABANG SUMATERA UTARA
Medan 29.08.2020
INDONESIA-(SUMATERA UTARA)“PUSAT KEANEKARAGAMAN HAYATI DUNIA”
(Ekosistem, Spesies, Gen)
- Ekosistem Pertanian/Hortikultura
- Ekosistem Hutan (Alami & Buatan)
- Ekosistem Mangrove
- Ekosistem Perkebunan (Sawit, Karet, Kakao)
- Ekosistem Perairan (Sungai, Danau, Estuari, Marine)
Mora et al. (2014)
Perkiraan Jumlah Spesies Flora dan Fauna Pada Planet Bumi
Takson JumlahJenis
Rangkingdi Dunia
Rangkingdi Asia
Negara Rangkingdi atasnya
1. Mamalia2. Burung/Unggas
3. Amfibi
4. Reptilia5. Kupu-kupu6. Angiospermae
5151519
270
± 6001212000
14
5
317
11
1
312
-Kolombia, Peru,Brazil.Brazil, Kolombia,Ekuador, Meksiko.
Meksiko, Australia.-Brazil, Kolombia,Cina, Meksiko,Australia, AfrikaSelatan
Sumber: McNeely, J.A. et al. (1990)
Tabel 1. Posisi Keanekaragamn Hayati Indonesia Pada Tingkat Dunia dan Asia
Kelompok PulauTerpilih
Jenis dan JumlahBurung Mamalia Reptil Tumbuhan
1. Sumatera2. Jawa3. Kalimantan4. Sulawesi5. Nusa Tenggara6. Maluku7. Irian Jaya
462362420289242210602
1941332101144169125
2171732541177798223
8206309005201503801030
Tabel 2. Kekayaan Jenis Flora dan Fauna dari Tujuh Pulau Utama di Indonesia
Sumber: KLH-RI (1992)
Ekosistem Hutan: Hutan Wisata dan Taman Hutan Raya SibolangitKekayaan Spesies Floranya – minimal 71 Spesies -48 Family (Manurung et al.,2009)
Cinnamomum sp. Terminalia copelandii Sindora bruggemanii Antidesma montanum Bauhinia purpurea
Aulerites moluccana Quercus sundaica Buschoffia javanica Durio zibethinus Pterocymbium sp.
Artocarpus elasticus Coryota mitisParkia rexbughii Lancium domesticumParaserinthes sp.
Pinus merkussi Coffea arabica Cordyline fructiosaPithecellobium sp.
Calamus sp.
Amorphophallustitanum
Ekosistem Pertanian (Tanaman Padi)
13
1. Keanekaragaman Jenis Auchenorrhyncha (Hemiptera)
1. Sogatella furcifera2. Nephotettix virescens
3. Cofana spectra4. Nephotettix nigropictus
5. Maiestas dorsalis
6. Siphanta sp7. Nilaparvata lugens8. Nisia nervosa9. Thaia sp.10. Empoascanara sp.
No Nama Gulma Daerah SamplingTobasa Samosir Taput
1. Eichornia crassipes + + ++
2. Cyperus rotundus L ++ ++ ++++
3. Leersia hexandra + + +++
4. Alternanthera sessilis - - ++
5. Commelina diffusa + + -
6. Imperata cilindrica - - +++
7. Agerantum conyzoides + + +++
8. Gynura crepidioides + + +++
9. Kylinga monocepala + + +
10 Marsilea crenata + - ++
11 Panicum repens ++ + -12 Bidens pilosa + - ++13 Fimbristylis dichotoma ++ + +++
14 Limnocharis flava - - ++
15 Fimbristylis littoralis ++ ++ ++++
Keanekaragaman Jenis Gulma di Ekosistem Pertanian (Sawah)
(Silaban, 2017)
2. Hutan Lindung dan Kebun Sawit: 59 Jenis Kupu-kupu (Sipahutar et al, 2020)
JENIS KUPU-KUPU Papilionidae
Graphium doson Papilio memnon Papilio aristolochiae
Papilio neptunus Pieridae
Ancistroides sp Koruthaialos Acytolepis puspa Arophala antimuta
Cirrochroa tyche
Nymphalidae
Charaxes bernardus
Idea iasonia
Bactrocera dorsalis compleks
Ekosistem Tanaman Hortikultura
(Daulay, 2010)
Fitoplankton Danau Toba (30 taksa)
Zooplankton khas DT
Cerodaphnia sp
Synedra
Staurastrum
Ekosistem Perairan; Danau Toba
Sungai Asahan
Ikan : 22 SpeciesJenis-jenis Dominan
-Neolissochilus sumatranus
(endemik Sungai Asahan)
-Tor soro
-Tor douronensis
-Tor tambroides
(Barus, 2016)
Danau TobaIkan: 14 Spesies
Jenis-jenis Ikan:
-Tilapia mossambica
-Aplocheilus panchax
-Lebistes reticulatus
-Osphronemus goramy
-Trichogaster trichhopterus
-Channa striata
-Clarias batrachus
-Cyprinus carpio
-Oreochromis sp.
-Neolissochillus thienemanni (IHAN)
(Endemik Danau Toba)
(Barus, 2016)
Tilapia mossambica (Mujahir)
Neolissochillus thienemanni (Ihan)
(Sudibyo et al., 2008)
BURUNG-COLUMBIDAE Di SAMOSIR
Streptopelia spMacropygia spGeopilia sp
(Sugiarti, 2016)
Dendrochilum sp
Coelogyne rochussenii
Vanda sumatrana
Staurochilus fasciatus
Tumbuhan Khas Sumatera Utara-Kearifan Lokal (Hasairin, 2017)
Zanthoxylum acanthopodium(Andaliman) Balakka, Kimalaka
(Phyllanthus emblica) (Bangun-bangun)
Coleus ambonicus Dryobalanops aromatica(Phon Kapur)
Styrax sp(Kemenyan)
Donax cannaeformis (Bamban)
Citrus hystrix(Jeruk purut)
Cananga odorata(Kenanga)
PENELITIAN KEANEKARAGAMAN HAYATI
1. Pendekatan Klasik (Konvensional
(Berbasis Morfologi + Anatomi)2. Pendekatan Molekular
-DNA Barcoding
-DNA MetabarcodingFLORA (TUMBUHAN)
- Akar
- Batang
- Daun
- Bunga
FAUNA (HEWAN)
- KEPALA
- BADAN
- ANGGOTA GERAK
SERANGGA
- AEDAGUS
Gen BankNCBI
3. Artificial IntelligenceEx. – PlantNet
- iNaturalist
Trend : PENELITIAN KEANEKARAGAMAN HAYATIBERBASIS MOLEKULAR-DNA BARCODING
* Bapak DNA Barcoding:Paul D. N. Hebert: Director of the New Biodiversity Institute
of Ontario at University of Guelph in Canada
* Sejak tahun 2002
DNA Barcode: Teknik identifikasi organisme dengan menggunakan potongan gen (urutan pendek dari DNA)
Potongan gen ---- Marka Spesifik Spesies
1. COI, 16 S-rDNA, Cyt B ---- Mitokondria ---- HEWAN
2. ITS1, ITS2, 18 S-rDNA ----- Inti ---------- FUNGI
3. MatK ------------------- Kloroplast ----- TUMBUHAN
4. rbcL -------------------- Plastida ------- TUMBUHAN
Genom Mitokondria
HEWAN
DNA Sekuenser
Software: MEGA X
Gen Bank-NCBI
mt COI sequen: 448 bp
AGGAGGTAAAAGTCACAATCTCATATTATTTATTCGTGGGAA
AGCTATGTCTGGAGCTCCAATTATAATAGGTAAAAGTCAATT
TCCAAACCCCCCAATTATAATAGGTATTACTATAAAGAAAATT
ATAATAAATGCATGTGATGTAACAATAACATTATATATTTGATC
ATTGTTAATAAATGACCCAGGTTGTGCTAACTCAATTCGAAT
AATCATTCTTAGTATTATTCCTACTATTCCTGATCAAATTCCA
AATAAGAAATATAATGTACCAATGTCTTTATGATTTGTTGAAT
AAAATCATTTTTTCATTGGTTTATTAAGGTGTCTGAATAAAG
TAGTAAACTGTAAATTTACTTAAGGATTACATCCCCTTAATAA
AATTAGTTTTATAGTTTATAAAAATATTAAATTGCAAATTTAAA
GATGATAAATATCTAAGACTAT
Species Accession
Quer
y
Cover
Percent
Indentity
Nephotettix cincticeps COI
(MF716882.1
)
60%
92.47%
Nephotettix nigropictus
COI
(KX351394.1
)
60%
96.40%
HASIL BLAST THD BANK GEN NCBI
mt COI DNA: 689 pb
Species AccessionQuery Cover
Percent Indentity
Nephotettix cincticeps COI (KU258184.1) 99% 90,36%
Nephotettix nigropictus COI (MH052646.1) 92% 90,46%
Nephotettix virescens COI (MH052643.1) 94% 98,75%
TCAACAAATCATAAAGATATTGGTACATTATATTTTTTATTTG
GAATTTGATCAGGAATAGTAGGAATAATACTAAGAATAATTA
TTCGAATTGAATTAGCACAACCAGGATCATTTATTAATAAT
GACCAAATATATAATGTTATTGTTACATCACACGCATTTATT
ATAATTTTTTTTATAGTTATACCAATCATAATTGGAGGTTTT
GGTAATTGGCTATTACCTATTATAATTGGAGCTCCAGACAT
AGCATTCCCACGATTAAATAATATAAGATTTTGACTTTTACC
TCCATCATTAACATTACTTTTAATAAGATCTATCATTGAAATA
GGAGTGGGAACAGGTTGAACAGTATACCCCCCCCTTTCA
AGAAATATTGCTCATTCAGGTCCAAGAGTTGATATATCAAT
TTTTTCATTACATCTAGCAGGAATTTCATCAATTTTAGGAG
CGGTAAATTTTATTTCAACAGTCATTAATATACGACCTAAA
GGAATATATATAGACCGAACTCCTTTATTTGTATGATCTGTA
CTAATTACAGCTATTTTATTATTATTATCTTTACCTGTATTAG
CAGGAGCTATTACAATACTTCTTACAGATCGAAATATTAATA
CAACATTTTTTGATCCTGCAGGAGGGGGGGACCCAATTT
TATACCAACACTTATTTTGATTTTT
HASIL BLAST THD BANK GEN NCBI
(Madduppa, 2020)
DNA METABARCODING VS DNA BARCODING
DNA METABARCODING
DNA Lingkungan
Berbasis:
(Madduppa, 2020)
Tahapan DNA Metabarcoding-e DNA (Madduppa, 2020)
Bold SystemMBrave
TERIMAKASIH
DANKE
SCHOEN
HORAS