KEGG: Enciclopédia de

Genes e Genomas de Kyoto

Talles Eduardo Ferreira

Maciel

Orientadora: Juliana Lopes R. Fietto

Propósito do KEGGPropósito do KEGGÉ a representação computacional completa da célula, do organismo, e da

biosfera, o que permitirá a predição (dos altos níveis de complexidade) dos processos celulares e dos comportamentos dos organismos a partir de informações moleculares e genômicas.

...como parte dos projetos de pesquisa dos laboratórios Kanehisa no Centro de Bioinformática da Universidade de Kyoto e do Centro do Genoma Humano da Universidade de Tóquio.

Quando e como surgiu?

Interface inicial do KEGGInterface inicial do KEGG

1º Categoria

2º Categoria

3º Categoria

4º Categoria

5º Categoria

Composição do KEGG

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PESQUISA POR ORGANISMOS

T

TE

Leishmania vs. Canis familaris

624 genes ortólogos

Para este exemplo foi encontrado 491 ortólogos.

KEGG pode ser utilizado para as seguintes finalidades:

• Inferir funções de genes.• Inferir funções de proteínas.• Classificar genes com base na rota metabólica. • Inferir funções de sistemas altamente complexos.• Pesquisa de genes ortólogos.• Integração de bancos de dados.• Elucidar vias metabólicas de genes.• Estudar enzimas.• Estudar drogas.• Estudar as estruturas químicas, assim como as

propriedades físico-química dos compostos.

ConclusãoConclusão Kegg tem a função de armazenar conhecimentos atuais sobre

sistemas biológicos no que se refere a vias de interações moleculares ou genes.

Mantêm um catálogo de genes para os genomas seqüenciados e providencia anotações consistentes e padronizadas.

Kegg é um banco de dados bastante completo que integra áreas como química, biológia, bioquímica, farmacologia, dentre outras.

Possui boa integração com inúmeros outros bancos de dados de interesse biológico (como o NCBI por exemplo).

A interface é amigável, mas pode ser melhorada principalmente com padronização das páginas e adição de informações de ajuda ao usuário.

Providencia novas informações biotecnológicas que pode ser usadas para predição de sistemas biológicos e projeto de novos experimentos.