O ecossistema a unidade principal de estudo da ecologia e pode ser definido como um sistema composto pelos seres vivos (meio bitico) e o local onde eles vivem (meio abitico, onde esto inseridos todos os componentes no vivos do ecossistema como os minerais, as pedras, o clima, a prpria luz solar, e etc.) e todas as relaes destes com o meio e entre si.Para que se possa delimitar um sistema ecolgico ou ecossistema necessrio que haja quatro componentes principais: fatores biticos,que so os componentes bsicos do ecossistema; os seres auttrofos, geralmente as plantas verdes, capazes de produzir seu prprio alimento atravs da sntese de substncias inorgnicas simples; os consumidores, heterotrficos que no so capazes de produzir seu prprio alimento, ou seja, os animais que se alimentam das plantas ou de outros animais; e os decompositores, tambm heterotrficos, mas que se alimentam de matria morta.A totalidade destes organismos interagindo em um determinado local de forma a criar um ciclo de energia (do meio abitico para os seres auttrofos, destes para os hetertrofos e destes para o meio abitico novamente) caracterizando os nveis trficos da cadeia alimentar constitui um sistema ecolgico ou ecossistema, independentemente da dimenso do local onde ocorrem essas relaes.As dimenses de um ecossistema podem variar consideravelmente desde uma poa de gua at a totalidade do planeta terra que pode ser considerado como um imenso ecossistema composto por todos os ecossistemas existentes (ecosfera).Mas no se deve confundir ecossistema com bioma. O bioma geograficamente mais abrangente e predominantemente definido de acordo com um conjunto de vegetaes com caractersticas semelhantes alm de outros requisitos (como a Mata Atlntica).Entretanto, como o ecossistema pode ser considerado em grande escala, as definies ficam um pouco confusas. Mas, geralmente para grandes extenses de territrio (de dimenses regionais) usa-se a denominao bioma.Os ecossistemas so classificados de duas formas: em ecossistemas terrestres e ecossistemas aquticos. Ambos possuem o funcionamento parecido com apenas a diferena bvia da quantidade de gua entre um e outro o que faz com que comportem formas de vida completamente diferentes embora algumas possam compartilhar ou migrar de um meio para o outro. Aos locais onde os dois tipos de ecossistemas se encontram d-se o nome de wetlands, no termo em ingls, que podemos chamar de terras alagadas. So regies como o Pantanal Matogrossense e as regies alagadas da Amaznia.