Currã culo do sistema de currã-culos lattes (luiz carlos jãºnior alcã¢ntara)

16/04/2015 Currículo do Sistema de Currículos Lattes (Luiz Carlos Júnior Alcântara)

http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4768977H7 1/47

Endereço Profissional Fundação Oswaldo Cruz, Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz BA, LaboratórioAvançado de Saúde Pública. Rua Waldemar Falcão, 121Candeal40295001 Salvador, BA BrasilTelefone: (71) 31762255Fax: (71) 31762300URL da Homepage: http://www.bahia.fiocruz.br

1998 2002 Doutorado em Biologia Celular e Molecular (Conceito CAPES 7). Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil. Título: Estudo do polimorfismo genético dos vírus linfotrópicos de células Thumanas do tipo 1 e 2 (HTLV1 e HTLV2) em Salvador, Bahia, Brasil e emtribos indígenas brasileiras, Ano de obtenção: 2002. Orientador: Bernardo Galvão Castro Filho.

Nome Luiz Carlos Júnior AlcântaraNome em citações bibliográficas ALCANTARA, L. C. J.;Alcantara, Luiz Carlos Junior;Alcantara, Luiz Carlos

Júnior;Junior Alcântara, Luiz Carlos;Alcântara, Luiz C.J.;Alcantara, LuizC.J.;Alcantara, Luiz Carlos;Alcantara, Luiz Carlos J.;Alcantara, Luiz C.J.;Alcantara, Luis;ALCANTARA, LUIZ C J;ALCANTARA, LCJunior;ALCANTARA;ALCANTARA, LC;ALCANTARA, L. C.;LUIZ CARLOS JÚNIOR,ALCÂNTARA

Luiz Carlos Júnior AlcântaraBolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq Nível 2

Endereço para acessar este CV: http://lattes.cnpq.br/7428560072021675Última atualização do currículo em 10/11/2014

Pesquisador Titular do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia Computacional (LHGB)do Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz (CPqGM) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) emSalvador, Bahia, Brasil. Professor Visitante bolsista da Bioquímica e Bioinformática da UniversidadeEstadual de Feira de Santana (UEFS). Possui graduação em Farmácia pela Universidade Federal deOuro Preto (1992), mestrado em Bioquímica pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto daUniversidade de São Paulo (1994) e doutorado em Biologia Celular e Molecular pela FundaçãoOswaldo Cruz (2002). Possui também 2 pósdoutorados, sendo o último realizado no InstitutoNacional do Cancer, no Instituto Nacional de Saúde dos EUA. Tem experiência na área de BiologiaMolecular e Bioinformática dos Retrovírus Humanos (HIV e HTLV), atuando principalmente nosseguintes temas: Epidemiologia molecular e evolução dos retrovírus humanos, Polimorfismos nosgenes dos hospedeiros dos retrovírus humanos, Correlações clínicoepidemiológicas nasretroviroses humanas, Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para estudo dosgenes dos retrovírus humanos/hospedeiros. Atua também como vice coordenador do curso de PósGraduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ. É professordo quadro permanente deste curso, bem como do curso de Pós Graduação em Patologia Humana eExperimental da FIOCRUZ/UFBA. PESQUISADOR EM PRODUTIVIDADE E PESQUISA DO CNPQ NÍVEL 2 (Texto informado pelo autor)

Identificação

Endereço

Formação acadêmica/titulação

http://lattes.cnpq.br/6926501999438658

http://www.bahia.fiocruz.br/



Bolsista do(a): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico eTecnológico, CNPq, Brasil. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Microbiologia / Subárea: BiologiaCelular e Molecular / Especialidade: Biologia Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: GenéticaMolecular e de Microorganismos / Especialidade: Epidemiologia Molecular. Grande Área: Ciências Biológicas / Área: Genética / Subárea: GenéticaMolecular e de Microorganismos.

1992 1994 Mestrado em Bioquímica. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo. Título: Expressão em E. coli, purificação e caracterização parcial do domínioligante de calmodulina da miosinaV de cérebro de galinha,Ano de Obtenção:1996.Orientador: Roy Edward Larson.Bolsista do(a): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de NívelSuperior, CAPES, Brasil. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: BiologiaMolecular / Especialidade: Bioquímica.

1987 1992 Graduação em Farmácia. Universidade Federal de Ouro Preto, UFOP, Brasil.

1983 1985 Curso técnico/profissionalizante em Contabilidade. Escola Estadual Maurício Augusto Azevedo.

2009 2011 PósDoutorado. Vaccine Branch/National Cancer Institute/National Institutes of Health. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: Bioquímicados Microorganismos / Especialidade: Vacina.

2005 2006 PósDoutorado. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz/Fundação Oswaldo Cruz /BA, FIOCRUZ,Brasil. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB,Brasil.

2002 2004 PósDoutorado. Nelson Mandela Medical School Durban,NMMS,África do Sul. Bolsista do(a): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia, FAPESB,Brasil. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea:Epidemiologia / Especialidade: Filogenia dos Retrovírus Humanos.

2006 2006 Estagio:Desenvolver software HTLV Subtyping Tool. (Carga horária: 160h). University of Oxford.

2005 2005 Estágio:aperfeiçoamento no Banco de dados HIVBase. (Carga horária: 96h). Universidade da FlóridaGainesvilleFlórida.

2002 2002 Estágio: epidemiologia molecular do HTLV na África. (Carga horária: 720h). Nelson Mandela Medical SchoolDurban.

2000 2000 Estágio:Ferramentas de bioinformática em virologia. (Carga horária: 240h). Rega Institut Universidade Católica de Leuven.

Vínculo institucional2013 Atual Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor e

Pósdoutorado

Formação Complementar

Atuação Profissional

Universidade Estadual de Feira de Santana, UEFS, Brasil.




Atividades03/2006 Atual Direção e administração, Fundação Oswaldo Cruz/CPqGM, .

Cargo ou funçãoPesquisador do Laboratório de Hematologia, Genética e BiologiaComputacional.

03/2005 Atual Ensino, Patologia Experimental, Nível: PósGraduaçãoDisciplinas ministradasBioinformática na Biologia Molecular

01/2004 Atual Treinamentos ministrados , Laboratório Avançado de Saúde Pública BACentro de Pesquisa Gonçalo Moniz, .Treinamentos ministradosEstudos Avançados em Bioinformática e Análises Evolutivas Virais (14 a 19 deJunho/2004)Segundo Workshop Brasileiro em Evolução Viral e Epidemiologia Molecular(HIV e HTLV) (08 a 13 de novembro/2004)Treinamento para a Utilização da Database HIVBase (15 a 18 denovembro/2005)

01/2004 Atual Outras atividades técnicocientíficas , Laboratório Avançado de SaúdePública BA Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz, .Atividade realizadaImplantação e Coordenação do Laboratório de Bioinformática doLASP/CPqGM/FIOCRUZ.

4/2002 Atual Pesquisa e desenvolvimento , Laboratório Avançado de Saúde Pública, .Linhas de pesquisa BioinformáticaEpidemiologia Molecular de Retrovirus Humano (HTLV1 e HIV1)Alterações Genéticas dos Hospedeiros do HIV1 e do HTLV1

Pesquisador, Carga horária: 20Outras informações Professor e Tutor de Bioquímica e Bioinformática (cursos de Farmácia e

Medicina)

Vínculo institucional2009 2011 Vínculo: Colaborador, Enquadramento Funcional: Posdoctoral Fellow, Carga

horária: 40

Vínculo institucional2008 Atual Vínculo: , Enquadramento Funcional: Pesquisador Titular, Carga horária: 40Outras informações Pesquisador ViceChefe do Laboratório de Hematologia, Genética e Biologia

Computacional (LHGB) do CPqGM/FIOCRUZ

Vínculo institucional2002 2007 Vínculo: Bolsista, Enquadramento Funcional: Pesquisador, Carga horária: 40Outras informações Atua como pesquisador em Biologia molecular, Bioquímica, Epidemiologia

molecular e Bioinformática aplicada aos retrovírus humanos (HIV1, HTLV1,HTLV2). Atua também como professor/orientador colaborador no Curso dePósGraduação Strictu Senso em Biotecologia em Saúde e MedicinaInvestigativa.

Vínculo institucional2002 2007 Vínculo: Professor Visitante, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto,

Carga horária: 20

National Institute Of Health, NIH, Estados Unidos.

Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Brasil.

Laboratório Avançado de Saúde PúblicaCentro de Pesq. Gonçalo Moniz FIOCRUZ, LASP,Brasil.

Faculdade de Tecnologia e Ciências, FTC, Brasil.



Atividades2/2002 7/2007 Ensino, Farmacia, Nível: Graduação

Disciplinas ministradasBioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, Bioquímica Clínica e Bioinformática

Atividades01/2002 1/2013 Ensino, Medicina, Nível: Graduação

Disciplinas ministradasBioinformáticaBioquímica

01/2002 1/2013 Ensino, Medicina e saúde humana, Nível: PósGraduaçãoDisciplinas ministradasSeminários em retrovirologia

Outras informações Professor de Bioquímica Básica, Bioquímica Metabólica, bioquímica Clínica eBioinformática no Curso de Farmácia.

Vínculo institucional2000 2013 Vínculo: Professor, Enquadramento Funcional: Professor Adjunto, Carga

horária: 40Outras informações Atuou como professor nas disciplinas, Bioquímica Básica, Bioquímica

Metabólica, Bioinformática, Seminários Interdisciplinares, Bioquímica Médicae Biofunção 1 nos cursos de Odontologia, Biomedicina e Medicina, nossistemas de ensino clássico e PBL. Atuou também como orientadorcolaborador do curso de pósgraduação strictu senso em Medicina e SaúdeHumana.

Vínculo institucional1994 1995 Vínculo: Empregatício, Enquadramento Funcional: Farmacêutico Hospitalar do

Hospital do Aparel, Carga horária: 40, Regime: Dedicação exclusiva.Outras informações Trabalhou durante os seis primeiros meses no Hospital do Aparelho

Locomotor Sarah em Brasília e posteriormente foi transferido para a filial deSalvadorBahia

Atividades9/1994 12/1995 Direção e administração, Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotor de

Salvador, Lider do Serviço de Farmácia Hospitalar.Cargo ou funçãoLider do Setor de Farmácia Hospitalar e Clínica.

9/1994 12/1995 Serviços técnicos especializados , Rede Sarah de Hospitais do AparelhoLocomotor de Salvador, Setor de Farmácia Hospitalar.Serviço realizadoImplantação do Serviço de Farmácia Hospitalar e Farmácia Clínica.

9/1994 12/1995 Conselhos, Comissões e Consultoria, Rede Sarah de Hospitais do AparelhoLocomotor de Salvador, Laboratório de Análises Clínicas do Hospital SarahSalvador.Cargo ou funçãoMembro da Comissão de Controle das Infecções Hospitalares.

1/1995 3/1995 Treinamentos ministrados , Rede Sarah de Hospitais do Aparelho Locomotorde Salvador, Enfermarias do Hospital Sarah Salvador.Treinamentos ministradosTreinamento ao Corpo de Enfermagem e Médico sobre a Biologia Molecular,Imunologia e Patogenia do HTLVI; Treinamento em Prevenção das interaçõesMedicamentosas no Hospital.

1. BioinformáticaObjetivo: Estudar a evolução dos retrovírus humanos (HIV1 e HTLV1):

Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública, EBMSP, Brasil.

Associação das Pioneiras Sociais, APS, Brasil.

Linhas de pesquisa



utilizando técnicas de biologia molecular, bioquímica e bioinformática;Desenvolver programas de bioinformática dando suporte aos estudos dasinfecções virais. .

2. Epidemiologia Molecular de Retrovirus Humano (HTLV1 e HIV1)Objetivo: Monitorar a infecção do HIV e do HTLV1 nos estudos sobrepolimorfismo viral e do hospedeiro, infecção recente, resistência aosantirretrovirais e transmissão maternofetal; 2) Desenvolver projetos devacinas antiHIV1 e antiHTLV1; 3) Elaborar um algoritmo de resgateterapêutico para subsidiar a terapia antirretroviral a ser estabelecida nosserviços clínicos do SUS..

3. Alterações Genéticas dos Hospedeiros do HIV1 e do HTLV1Objetivo: Monitoramento da infecção do HIV e do HTLV1 nos estudos sobrepolimorfismo viral e do hospedeiro, infecção recente, resistência aosantirretrovirais e transmissão maternofetal; Desenvolvimento de vacinasantiHIV1 e antiHTLV1; 3) Eelaboração de um algoritmo de resgateterapêutico para subsidiar a terapia antirretroviral a ser estabelecida nosserviços clínicos do SUS..

2014 2014 2o Workshop Internacional de Bioinformática sobre Evolução Viral eEpidemiologia Molecular 2014Descrição: A Filogenia molecular e genética populacional são técnicasestabelecidas com importância para a compreensão de epidemias e dinâmicasvirais. Por exemplo, a análise filogenética tem sido utilizada até o momentopara explicar a origem do HIV1 e HIV2 e suas epidemias em humanos, paraestudar a epidemiologia molecular da gripe em aves selvagens e suasconexões com pandemias humanas, assim como estudar a epidemiologiamolecular de muitos outros vírus. Muitos dos trabalhos envolvendo estastécnicas estão sendo publicados em revistas internacionais de alto impacto.Novos métodos de mineração de dados estão se tornando cada vez maisimportantes para organizar e explorar a enorme quantidade de dados desequências de vírus que foi gerado nos últimos anos. Por exemplo, amineração de dados é extremamente importante para o estudo das respostasàs terapias antivirais. Além disso, a combinação da mineração de dados comanálises filogenéticas permitem uma melhor compreensão do comportamentodos diversos vírus. A utilização destes métodos já foi aplicada ao estudo demutações de resistência às drogas e tais técnicas podem ser aplicadas amuitos outros campos de pesquisa de vírus. 2. Detalhes sobre o Workshop OWorkshop Internacional sobre a utilização da Bioinformática para estudos deEvolução e Epidemiologia Molecular dos vírus foi organizado nos últimos 17anos pela Profa. AnneMieke Vandamme, do Laboratório de Virologia Clínica eEpidemiologia da Katholieke Universiteit Leuven (Rega Institut), Bélgica, edesde 2003 viaja ao redor do globo(http://regaweb.med.kuleuven.be/workshop). Este workshop está dividido emtrês módulos: Básico, análises filogenéticas avançadas e Mineração de Dados.Os módulos serão realizados simultaneamente e os alunos (máximo de 20 pormódulo) só poderão candidatarse a um dos módulos. Todos os módulosconterão aulas teóricas e práticas (cerca de 50/50). Haverá também temporeservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão depôster, pa. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / AnneMiekeVandamme Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico eTecnológico Auxílio financeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento dePessoal de Nível Superior Auxílio financeiro.

2014 Atual Desenvolvimento de ferramenta didática para avaliação de fatores de risco eprevenção de agentes causadores de doenças sexualmente transmissíveis(HIV1/HTLV1)Descrição: EDITAL PPSUS: Este estudo objetiva desenvolver uma ferramenta

Projetos de pesquisa



web para avaliar a evolução do conhecimento de jovens e adolescentesresidentes em áreas de risco para as infecções causadas pelo HIV1 e HTLV1na cidade. O estudo caracterizarseá por ser uma coorte de intervençãoprospectiva, composta por 25 educadores, que irão participar das etapas deidentificação dos fatores de risco e avaliação do nível de conhecimento acercada infecção pelo HIV/HTLV. A execução do mesmo se dará no Centro dePesquisas Gonçalo Moniz (CPqGM) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) e nasedes do projeto parceiro Adolescente Aprendiz, situadas nos bairros do PauMiúdo e Rio Vermelho. Este estudo trará como contribuição nodesenvolvimento de um banco de dados e de um algoritmo capaz decontabilizar o número de acessos ao conteúdo disponibilizado pelaferramenta; e a organização estatística das informações provenientes domesmo. Além disso, prevêse a elaboração de material lúdico/didático(impressos e audiovisuais) a ser disponibilizado para ações de promoção dasaúde do Serviço Único de Saúde (SUS) e caracterização do nível deconhecimento acerca da infecção por retrovírus humanos em áreas de risco.Esperase também, propor novas medidas de promoção da saúde maisespecíficas para jovens e adolescentes residentes nessas áreas. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Carlos Brites Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / Marilda SouzaGonçalves Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2014 Atual INTERAÇÃO ENTRE OS PRODUTOS DAS ORFs I E IV DO HTLV1 COM ASPROTEÍNAS DO CITOESQUELETO MIOSINA Va E PAXILINA RESPECTIVAMENTEDescrição: Pela análise das estruturas primarias de p12I/p8I e da Paxilina,hipotetizase que não há interação física entre elas, entretanto a presença deregiões ricas em prolina em ambas as proteínas, e pelo fato da Paxilina serum dos componentes das adesões focais, sugere que elas participem docomplexo de polarização do citoesqueleto no momento do contato etransmissão do HTLV1 célulacélula. Como a Paxilina está mais expressa emindivíduos TSP/HAM, é possível que a expressão da proteína Tax, transativadorviral, interfira na expressão de Paxilina. Assim o estudo inicial da possívelinteração entre essas proteínas é importante para melhor compreensão dasignificância do aumento de expressão da Paxilina em indivíduos comTSP/HAM. Por outro lado, acreditase que a miosina Va esteja envolvida notráfego de p8I partindo de Golgi até a membrana plasmática. Considerandoque p8I exerce importante função na transmissibilidade viral, participandoativamente da sinapse virológica e da formação dos conduítes celulares, oestudo das interações proteicas que contemplam o mecanismo de transportedesta proteína, desde sua formação até seu sítio de atuação, podeestabelecer um ponto inicial para a elucidação desta via, além de sugerirpossíveis alvos terapêuticos para redução da infectividade, etransmissibilidade viral, e consequentemente, um controle da disseminaçãodo vírus nos indivíduos infectados. Assim, pretendemos avaliar a interaçãoentre os produtos das ORFs I e IV do HTLV1 com as proteínas docitoesqueleto Paxilina e Miosina Va, respectivamente. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Simone Kashima Integrante / Maria Fernanda CastroAmarante Integrante / Jaqueline Goesde Jesus Integrante / Marilda Souza Gonçalves Integrante / Maria EnilzaEspreafico Integrante.

2013 2013 WORKSHOP INTERNACIONAL DE BIOINFORMÁTICA SOBRE EVOLUÇÃO VIRALE EPIDEMIOLOGIADescrição: O workshop está dividido em dois módulos: Análises Básicas deBioinformática, Análises filogenéticas Avançadas. Os módulos serãorealizados simultaneamente e os alunos (máximo de 25 por módulo) sópodem candidatarse a um dos módulos. Todos os módulos contem aulasteóricas e práticas (cerca de 50 alunos num total). Possui também um tempo



reservado para os alunos apresentarem seus trabalhos em uma sessão depôster, para discutir e analisar os seus conjuntos de dados com os professorese discutir possíveis colaborações entre os alunos e professores. O curso terá aduração de cinco dias. Para nosso conhecimento, nenhum outro cursosemelhante é organizado mundialmente, contendo teoria e aplicaçõespráticas de técnicas de bioinformática, aplicados aos estudos de evoluçãoviral, e aberto a um fórum internacional de estudantes de mestrado edoutorado, jovens pesquisadores, e até mesmo aos pesquisadores seniores.Salientamos que não haverá custo de inscrição no Workshop, e das 50 vagas,80% serão destinadas preferencialmente a brasileiros e as vagas restantespara estrangeiros, tendo preferência inscritos da América Latina. Os alunosque participam deste workshop são convidados a submeter um resumo, eapresentam o seus trabalhos na forma de poster. Assim, estes alunos terão aoportunidade de discutir o trabalho de pesquisa que eles apresentaram comos professores e outros alunos. Depois da oficina, e tendo em consideração oscomentários e discussões recebidos no workshop sobre o seu trabalho, cadaaluno terá o seu resumo publicado na IGE (Infection, Genetics and Evolution,uma revista do grupo Elsevier que tem a Dra. AnneMieke Vandamme noEditorial Board) numa edição regular, mas inteiramente dedicado aoWorkshop, e também terá um tempo para melhorar a qualidade do seutrabalho, sendo então convidado a submeter um artigo, a esta mesma revistacientífica, que sempre publicou (dos workshops anteriores) e os trabalhos dosalunos apresentados na forma de poster durante o works. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / AnneMiekeVandamme Integrante / Tulio de Oliveira Integrante / Joana PaixãoMonteiro Cunha Integrante / Paula Carvalhal Lage von B. Ristow Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico eTecnológico Auxílio financeiro / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estadoda Bahia Auxílio financeiro.

2013 Atual The tale of two interlinked epidemics: The origin and clinical relationship ofthe African and Brazilian HIV1 and HTLV1 epidemicsDescrição: This project will use genomics and bioinformatics to further studythe origin of the Brazilian and South African Human Immunodeficiency virustype 1 (HIV1) and Human Tcell lymphotropic virus type 1 (HTLV1). Inaddition, it will study coinfected individuals, as there is growing evidencethat HIV1 and HTLV1 coinfection affects the course of the AIDS disease.This project is built on a longstanding collaboration between two Brazilianresearchers, Dr. Luiz Carlos Junior Alcantara from F CPqGM/FIOCRUZFoundation and Dr. Tulio de Oliveira from the Africa Centre for Health andPopulation Studies, Nelson Mandela School of Medicine. This partnership hasalready given rise to a number of peerreviewed publications, the graduationof postgraduate students and training workshops in Brazil. At present, thetwo researchers are cosupervising a PhD student from Brazil. This project, iffunded, will allow this successful collaboration to continue and a Brazilianresearcher (Dr. Tulio de Oliveira) living outside the country to continue tocontribute to local research and the training of postgraduate students inBrazil. Previous results of this collaboration: One of the reasons why webelieve that this exchange project will be successful is due to the previousresults that have been produced by this collaboration. The collaborators havebeen working together since 2001. During this time, Dr. Tulio de Oliveira hasbeen based in Durban and Cape Town, South Africa and in Oxford, the U.K.,whereas Dr. Luiz Carlos Alcantara has been based in Salvador, Brazil and inWashington, the U.S.A. They have made many exchange visits. They have alsoproduced many collaborative publications on the study of the origin of theHIV1 and HTLV1 epidemics in Brazil, which will be one of the topics to bestudied in this project. For example, they have shown that HTLV1 strains fromSouth Africa (sampled and produced during a visit by Dr. Alcantara to the Dr.de Oliveira group in 2005) are directe. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .



Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Tulio de Oliveira Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico eTecnológico Auxílio financeiro.

2012 2014 Avaliação da história epidemiológica da infecção pelo HIV1 no estado daBahia BrasilDescrição: Estudo de coorte transversal com amostragem de conveniência queavaliará amostras sanguíneas de pacientes, no período de 1 de Março de 2012à 31 de Setembro de 2012. A população do estudo será formado por pacientescom idade igual ou superior à 18 anos, sororeagentes para HIV1 sem uso deTerapia Antirretroviral (TARV), que após assinarem termo de consentimentolivre, respondam a questionário epidemiológico e permita a coleta de 10 mlde sangue para o estudo. A amostra para o estudo será obtida durante coletasanguínea, no Laboratório de Retrovírus do Hospital Universitário Prof. EdgardSantos e no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa,para realização de carga viral do HIV ou estudo das subpopulaçõeslinfocitárias. O questionário epidemiológico será preenchido pelo pesquisadore equipe, esse o documento conterá informações sobre identificação, data denascimento, gênero, data do diagnóstico do HIV1, uso de TARV, provávelforma de aquisição, orientação sexual e discordância sorológico dos parceirosatuais. Será descartado aleatoriamente 1 das amostras de pacientes comconcordância sorológica entre parceiros ou transmissão vertical. O projeto e otermo de consentimento livre e esclarecido será submetido, previamente aqualquer fase do estudo, ao Comitê de Ética em Pesquisa da FundaçãoGonçalo Muniz, do Hospital Universitário Prof. Edgard Santos e no CentroEspecializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa.A extração do DNA dasamostras usará o kit de extração QIAmp Blood Kit (Qiagen Inc., Valencia, CA,USA) segundo protocolo do fabricante. Os genes pol e env serão amplificadosatravés da Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Os produtos das PCRserão purificados e posteriormente sequenciados. Os objetivos são:Caracterizar a epidemiologia molecular do HIV1 na Bahia através de estudosevolutivos nos genótipos B, F e formas recombinantes BF, buscando inferir ahistória evolutiva deste retrovírus na nossa população. Estimar a taxaevolutiv. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Carlos Brites Integrante / Genoveffa Franchini Integrante / Erika Andrade Integrante /Marcio Oliveira Silva Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha Integrante.

2012 2013 Banco de Dados sobre o HTLV1/paciente infectadoSituação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: / Mestrado profissional: (1) / Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Tulio de Oliveira Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / Antonio Eduardo deAlbuquerqueJunior Integrante.

2012 Atual Implantação e Consolidação do Centro Integrado de Biodesenvolvimento daEscola Bahiana de Medicina e Saúde Pública no Parque Tecnológico da BahiaDescrição: Luiz Alcantara coordena um subprojeto, especificamente Utilizaçãodo HTLV2 Pseudotipado como Vetor Vacinal contra a Infecção pelo HTLV1 .O presente projeto faz parte do esforço da Secretaria de Ciência, Tecnologiae Inovação do Estado da Bahia SECTI, através do Parque Tecnológico daBahia, para implantação dos Laboratórios Compartilhados dos EquipamentosDinamizadores, que serão consolidados na segunda etapa do Parque. Nesteesforço, composto por dez plataformas agregadas que integram parceirospúblicos e privados operando em conjunto, tem como objetivo comum ofortalecimento da rede de pesquisa nas áreas de Biotecnologia e Saúde doEstado.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Maria Luisa CarvalhoSoliani Coordenador / Luiz Erlon Araujo Rodrigues Integrante.



2012 Atual Utilização do HTLV2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infecção peloHTLV1Descrição: O Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do tipo 1 (HTLV1) éconhecido por ser o agente etiológico de doenças de natureza neoplásica,como a Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL) (Yoshida et al.,1982). Além disso, a infecção pelo HTLV1 é endêmica em diferentes regiõesgeográficas do mundo, sendo Salvador a cidade brasileira com a mais altaprevalência entre a população geral, atingindo valores próximos a 1,8%(Dourado et al., 2003). As glicoproteínas do envelope viral são reconhecidasde maneira específica pelos receptores de linfócitos B (anticorpos demembrana), por anticorpos neutralizantes e por receptores de células T (TCR)de linfócitosT citotóxicos (CTL), o que proporciona posteriormente umaresposta imune protetora. Estas glicoproteínas poderiam representarimportantes . Para explorar as propriedades imunológicas em potencial doenvelope viral como candidato à vacina, pretendemos utilizar asglicoproteínas gp46 e gp21 do HTLV1, como um imunógeno. Há três anosfirmamos uma colaboração internacional com o grupo de vacinas do InstitutoNacional do Câncer, do Instituto Nacional de Saúde do Governo dos EUA(Vaccine Branch NCI/NIH), liderado pela Dra. Genoveffa Franchini, resultandono desenvolvimento de um vetor vacinal antiHTLV1. Este vetor foi baseadono HTLV2 atenuado, sendo desenhado por mim e construído pela GeneArt(USA). Este vetor foi cedido pela Dra Franchini para o CPqGM/FIOCRUZ, paramontagem do vetor recombinante, ensaios in vitro e exvivo e testesbioquímicos e imunológicos (a serem realizados no CPqGM/FIOCRUZ). Apósestes experimentos, os testes em modelo animal, utilizando coelhos serãorealizados utilizando coelhos e macacos no NCINIH. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1).

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Genoveffa Franchini Integrante / Maria Fernanda CastroAmarante Integrante / FernandaKhouri Barreto Integrante / Loianna Mascarenhas Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico Auxílio financeiro.

2012 Atual Caracterização de genomas completos do vírus da Leucemia de células T doadulto do tipo 1 (HTLV1) provenientes de pacientes com diferentes perfisclínicosDescrição: Embora o HTLV1 tenha sido convincentemente associado àLeucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATLL), é observado que a grandemaioria dos indivíduos infectados permanece assintomática (9598%). Aindanão se sabe por que isto ocorre, assim como não é conhecido os motivos pelosquais alguns indivíduos desenvolvem algum tipo de doença, seja ela denatureza neoplásica ou inflamatória, bem como os fatores que direcionam ocurso clínico ao longo da infecção. Acreditase que as diversas manifestaçõesclínicas possam ser influenciadas pelo tipo e magnitude da resposta imune dohospedeiro para os antígenos do HTLV1, bem como pelo local ou órgão noqual a reação inflamatória predominantemente acontece. Fatoresrelacionados às variantes genéticas do vírus e fatores referentes aohospedeiro também têm sido sugeridos. Alguns trabalhos ainda apontam quefatores ambientais, como idade, modo de transmissão e característicasétnicas (Gadelha et al., 2005; Miller et al., 1994; Vine et al., 2002; Sabouri etal., 2005) podem contribuir para a manifestação de doença em indivíduosinfectados. A análise de indivíduos, com diferentes status clínicos da doença,porém apresentando níveis semelhantes de carga proviral, demonstrou quecélulas de pacientes assintomáticos produzem menores níveis das citocinasinflamatórias: TNF (Fator de necrose tumoral ) e IFN (Interferon )(Nishimura et al., 2000), sugerindo que esta baixa produção seria importantepara a manutenção do estado assintomático, e que outros fatores, além dacarga proviral, também devem influenciar a sintomatologia da infecção(Furukawa et al, 2003). Visto isto, pretendemos estudar a diversidadegenética no genoma total do HTLV1 mais prevalente em cada grupo deindivíduos infectados: 10 com TSP/HAM, ATLL, 10 com dermatite infecciosa,



10 com dermatite infecciosa e TSP/HAM e 10 assintomáticos. Todos osindivíduos com idade superior a 45 anos e mediana da carga proviral de 1.500copias/106 PBMC.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo GalvaoCastro Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / MarcioRoberto T Nunes Integrante / Luis Felipe Ivanoff de Menezes Integrante.

2012 Atual IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DARSUPORTE AO CURSO DE PÓSGRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE EMEDICINA INTERNA DO CPQGMDescrição: Bioinformática é a coleção, organização e análise de grandesquantidades de dados biológicos utilizando uma rede de computadores ebancos de dados. Implica na análise de seqüências de genes e seus produtos(proteínas), mas o campo tem sido expandido para a gerência,processamento, análise e visualização de grandes quantidades de dadosgenômicos, proteômicos, triagem de drogas e química medicinal. Hoje abioinformática já é considerada uma ciência, que além de ser indispensávelao melhor entendimento da genética, da bioquímica, da imunologia, dabiologia celular e molecular e das outras ciências, vem se tornando uma áreacada vez mais independente. Procuramos, com a implantação de umlaboratório de bioinformática, criar uma infraestrutura que permita ao alunode mestrado e doutorado, do curso de pósgraduação em Biotecnologia emSaúde e Medicina Investigativa, ter a possibilidade de conhecer melhor estaciência, não só na disciplina Bioinformática, mas também nas outrasdisciplinas, podendo também contar com a estrutura necessária para procurardesenvolver ferramentas de bioinformática que lhes possam auxiliar emresponder questões importantes dos seus projetos. Será também possível,ensinando uma bioinformática mais completa a estes estudantes, fornecerrecursos e o treinamento em banco de dados e programas relacionados àestrutura macromolecular, permitindo a estes cientistas da área biológica oacesso a esta rica fonte de informações, desenho de tutoriais, etc. . Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2011 Atual Identificação de SNPs no genoma da Leptospira interrogans sorovarCopenhageni e possível associados ao desfecho clínico e SíndromeHemorrágica PulmonarDescrição: O estudo molecular de sequências do genoma completo da L.interrogans sorovar Copenhageni possibilita testar a hipótese de quemutações estejam associadas a diferentes desfechos e fenótipos clínicos.Além disso, é possível ainda identificar grupamentos filogenéticos de isoladoscom características epidemiológicas, como tempo e espaço, que tenhamassociação com um maior sucesso na transmissão de um determinado clone.Objetivo: Identificar polimorfismos genéticos associados ao desfecho clínicosda leptospirose e ao sucesso de transmissão em determinado tempo e espaço. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Luciane AmorimSantos Integrante / Albert Ko Integrante / Mitermayer Galvão dos Reis Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha Integrante.Financiador(es): National Institutes of Health Auxílio financeiro.

2010 2011 Identificação in silico de Retrovírus Endógenos Humanos usando a região LTRde PTLV1, PTLV2 e PTLV3Descrição: O HTLV1 foi o primeiro retrovírus humano descrito, seguido peloHTLV2 e HTLV3. Acreditase que HTLV1, HTLV2 e HTLV3 se originaramindependentemente e teriam emergido do contato entre humanos e primatasnãohumanos infectados com STLV. Durante o ciclo de replicação dessesretrovírus pode ocorrer a formação de retroelementos, os elementos com



repetições terminais longas. Estimase que mais de 40% do genoma humanoseja composto de retroelementos, sendo 8% de elementos LTR. Sugereseainda que os HERVs estão no genoma humano por um período deaproximadamente 30 milhões de anos, e alguns eventos de transposiçãoenvolvendoos podem ter modificado a expressão gênica celular, conferindoao hospedeiro uma vantagem seletiva. Esse estudo tem como objetivoidentificar a presença de isolados de HTLV1, HTLV2, HTLV3, STLV1, STLV2e STLV3 como retrovírus internos humanos. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Costa, GiselleCalasans Souza Integrante / Fernanda Khouri Barreto Integrante /Jaqueline Goes de Jesus Integrante / Aline Cristina Mota Miranda Integrante.

2010 2011 ESTUDO DA DIVERSIDADE DO HIV1 NA BAHIA BUSCA E ANÁLISE DE NOVASFORMAS RECOMBINANTES CIRCULANTES (CRF) DO HIVDescrição: Após quase três décadas do início da epidemia de AIDS, inúmerosesforços vêm sendo feitos no combate ao HIV, porém até o momento não sechegou à uma vacina capaz de prevenir a infecção ou medicamentos capazesde eliminar o vírus. A intensa variabilidade genética do HIV1 refletese nosurgimento de isolados virais com comportamentos biológicos diversos e estacaracterística representa o principal obstáculo para a eficiência dofuncionamento do sistema imune humano e para o desenvolvimento devacinas e terapias universais. Estudos anteriores realizados pelo nosso grupoindicaram uma grande diversidade de genótipos de HIV1 na Bahia e aprevalência de uma forma recombinante ainda não identificada, apresentandoo mesmo padrão genético, em cerca de 6% da população infectada. Oobjetivo deste trabalho é investigar a existência de uma nova formarecombinante circulante (CRF) do HIV1 na Bahia e a identificação depropriedades moleculares relacionadas com a adaptação e dispersão destasvariantes. Para tanto, será realizado o seqüenciamento do genoma total deisolados previamente caracterizados em dois genes virais: gag e env. Estasseqüências de DNA serão então submetidas às análises filogenéticas e derecombinação através de ferramentas de Bioinformática. Este estudo poderácontribuir para o melhor entendimento a respeito das propriedades evolutivasdo HIV, para vigilância da epidemia local de AIDS e para a escolha adequadade medidas de controle.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo GalvaoCastro Integrante / Luciane Amorim Santos Integrante / joana PaixãoMonteiro Integrante / Adriano Fernando Araujo Integrante.

2009 2014 O reverso genetico de pacientes infectados pelo HTLV1Descrição: As proteinas da ORF1 do HTLV1 (p12 e p8) provenientes de 140pacientes infectados pelo HTLV1 com diferentes status clinicos foramanalisadas quanto ao padrao mutagenico. As mutacoes estatisticamentesignificantes quanto a carga proviral e status clinicos foram criadas in vitroutilizando o vetor de expressao pMEp12p8. Estes vetores (mutantes e WT)foram utilizados para transfeccao de celulas 293TN (ensaios de expressao) eHeLa (ensaios de colocalizacao por microscopia confocal). Estas mutacoesforam utilizadas para criacao de lentivirus mutantes para ensaios deinfectividade e modelo animal utilizando macaco Rhesus.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Rego, FilipeFerreira de Almeida Integrante / Genoveffa Franchini Integrante / MariaFernanda CastroAmarante Integrante / Fernanda Khouri Integrante.Financiador(es): National Institutes of Health Auxílio financeiro.

2009 2013 Soroprevalência e subtipagem do vírus linfotrópico de células T humanas(HTLV) e avaliação da transmissão maternofetal em gestantes da região sulda BahiaDescrição: o projeto pretende: (1) conhecer a prevalência dos vírus HTLV e



CMV em gestantes na nossa região, a fim de conhecer o perfil da infecçãonessa população; (2) informar, conscientizar e alertar aos profissionais desaúde sobre a importância da realização da pesquisa dos vírus nas gestantes;(3) minimizar os riscos de infecção maternofetal, possibilitando queintervenções e medidas de educação em saúde sejam implementadas; (4)fornecer dados para elaborar projetos e políticas de saúde para essapopulação vulnerável.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo GalvaoCastro Integrante / Sandra Rocha Gadelha Coordenador / Filipe F A Rêgo Integrante / Melo, Marco Antônio Gomes Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2009 Atual Desenvolvimento de vacina antiHIV1 utilizando modelo animal e vetorcontendo regioes LTR do HTLV1Descrição: Os genes pol, gag e env do SIV1 foram inseridos no vetor pMAcontendo o gene GFP e as regioes 3' e 5' do HTLV1. A insercao foi realizadade maneira que os gene da GFP ficou sobre controle do LTR 5' e os genes doSIV sobre controle da regiao LTR 3' contendo o sinal de hipermetilacao. Estevetor foi utilizado para transfeccao de celulas 293T, 293TN e HeLa. Forammedidas a expressao de GFP, expressao dos produtos genicos gagpro e envdo SIV. Este vetor expressando porcoes conservadas de varios genes do SIVHIV sera utilizado em testes utilizando modelo animal (SIVmac251 macaquemodel).. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Genoveffa Franchini Coordenador.Financiador(es): National Institute Of Health Outra.

2008 2013 Contribuição de polimorfismos nas proteínas gp46, gp21 e HBZ, para amanifestação da HAM/TSP.Descrição: Embora o HTLV1 tenha sido convincentemente associado adoenças, a grande maioria dos indivíduos infectados permaneceassintomática (9598%). Ainda não se sabe por que isto ocorre, assim como,não é conhecido o motivo pelo qual alguns indivíduos desenvolvem umasíndrome neurológica, enquanto outros desenvolvem uma leucemia ou outraspatologias inflamatórias. Assim, as diversas manifestações clínicas podemdepender do tipo e magnitude da resposta imune do hospedeiro para osantígenos do HTLV1, bem como do local ou órgão no qual a reaçãoinflamatória predominantemente acontece. A avaliação das proteínas gp46,gp21 e HBZ, de isolados do HTLV1 provenientes de indivíduos com diversosestados de sintomatologia, neste estudo, poderá contribuir para oconhecimento da presença de polimorfismos nestas proteínas. Estasinvestigações interhospedeiros permitirão avaliar a dinâmica das variantesvirais correlacionando com o perfil clínico de cada paciente. Além disso, aoavaliar o mesmo indivíduo infectado, em diferentes tempos, é possívelanalisar o movimento das cepas do HTLV1 e o curso da infecção, além deestimar mudanças no tamanho da população viral efetiva, ao longo do tempo.Também é possível obter um maior entendimento HTLV1 quando comparandoa dinâmica da evolução do vírus com os dados clínicos do paciente. Justificase assim, a análise de proteínas virais e o estudo filodinâmico do vírus paracontribuir para o melhor entendimento do HTLV1 e sua relação com asmanifestações clinicas e progressão do paciente.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (1).

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Viviana Galazzi Integrante / Rego, Filipe Ferreira de Almeida Integrante / Miranda, AlineCristina Andrade Mota Integrante / GalvaoCastro, Bernardo Integrante /Fernanda Khouri Barreto Integrante.



2008 2012 Avaliação filodinâmica de isolados do HIV1 na transmissão maternofetalSituação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Marco Salemi Integrante / Luciane Amorim Santos Integrante / Adriano Fernando Araujo Integrante / Santos, Edson Integrante / Joana Paixão Monteiro Cunha Integrante.

2008 2011 EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DO HTLV EM MULHERES PORTADORAS DE HIV1E ANÁLISE DAS VARIAÇÕES GENÉTICAS DO HTLV1 EM DIFERENTESCOMPARTIMENTOS DO HOSPEDEIRODescrição: O HTLV1 é o agente etiológico da ATL, HAM/TSP e outrasperturbações inflamatórias. Alguns estudos tentam analisar as variações doHTLV1 em diferentes fluidos corpóreos e seu impacto sobre a infecção peloHTLV. A coinfecção HTLV/HIV1 é associada com graves manifestaçõesclínicas, imunodeficiência marcante e infecções oportunistas, bem comocomportamento de risco. Salvador, capital do Estado da Bahia, Brasil, tem amaior prevalência para o HTLV1 (1,74%) encontrada no país. Poucos estudosdescrevem esta coinfecção em Salvador e áreas vizinhas, e muito menosinvestigam como estes vírus circulam ou avaliam a relação entre eles. Paradescrever a epidemiologia molecular do HTLV1 e as características dacoinfecção HTLV/HIV1 em mulheres, nós realizamos um corte transversalenvolvendo 107 mulheres infectadas com HIV1 do centro de referência daDST/HIV/AIDS, localizado na cidade de Feira de Santana. Amostras daspacientes foram testadas por ELISA e a infecção pelo HTLV confirmadausando o WB e PCR. A análise filogenética foi realizada nas seqüências LTRdo HTLV para obter mais informações sobre a epidemiologia molecular e aorigem deste vírus na Bahia. Quatro das cinco amostras reativas no ELISAforam confirmadas como HTLV1 no WB e PCR e uma amostra confirmadacomo HTLV2. A soroprevalência da infecção pelo HTLV nestas mulheres foi de4,7%, menor que o esperado, provavelmente pela baixa prevalência dainfecção pelo HTLV esta área ou devido a medidas de controle de DST/AIDSimplementadas desde a realização do estudo anterior. A análise filogenéticada região LTR das quatro seqüências do HTLV1 revelou que todos os isoladosforam classificados como subgrupo Transcontinental do subtipo Cosmopolitae se agrupam no principal grupo latinoamericano, que possui um ancestralcomum com isolados da África do Sul, sugerindo uma introdução pósColombiana deste vírus na Bahia. A seqüência de HTLV2 foi classificada comosubtipo c, a variante brasileira do subtipo 2a. Também foi obs. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo GalvaoCastro Integrante / Filipe F A Rêgo Integrante / Vitor Uchoa Carvalho Integrante / Liliane Lins Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2008 2009 Desenvolvimento de uma ferramenta de rastreamento de mutações emárvores filogenéticas, para o estudo da evolução dos isolados do HIV1Descrição: O projeto de pesquisa tem como objetivo o desenvolvimento deuma nova ferramenta de bioinformática para auxiliar os pesquisadores eclínicos nos projetos de pesquisa visando um melhor conhecimento dasseqüências dos isolados do HIV1, podendo ser estendida posteriormentepara o estudo das seqüências de outros patógenos de importânciaepidemiológica no Brasil como o HTLV1, HCV, HBV, HPV, HHV8, vírus dadengue, Leishmania, Tripanossoma, etc. A nova ferramenta permitirá, de umaforma intuitiva e simples, rastrear mutações presentes nas seqüências destespatógenos (inicialmente, do HIV1) representandoas graficamente nosgrupamentos monofiléticos das árvores filogenéticas, reconstruídas conformeo protocolo de pesquisa do LASP. Cada mutação identificada nas seqüênciasserá avaliada quanto a sua relação com a resistência às drogas antiHIV/AIDSe procurarseá na estrutura da árvore, quando esta mutação ocorreu, a partirdo processo de especiação. Desta forma os pesquisadores e clínicos poderãoresponder várias questões importantes que não podem ser facilmente



inferidas com as ferramentas de bioinformática existentes, como porexemplo: (a) Quais mutações são responsáveis pela diferenciação entre duasseqüências ou entre um grupo delas, sejam de um mesmo cluster ou declusters diferentes; (b) Quais dessas mutações podem estar relacionadas comresistência a antiretrovirais, e quando (onde) essas mutações apareceram;(c) Quais dessas mutações induzem sítios de modificações póstraducionais,principalmente glicosilação, fosforilação e miristilação; (d) Quais dasmutações presentes numa seqüência estão em sítios com pressão seletivapositiva; (e) Se as mutações observadas na seqüência em estudo ocorreramfreqüentemente em outros clusters ou predominantemente apenas no seupróprio cluster. Assim, esta ferramenta permitirá rastrear uma mutação deinteresse ao longo da árvore filogenética de forma gráfica interativa,permitindo a extração de informações essenciais de forma r. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo GalvaoCastro Integrante / Diego Gervásio Frias Integrante.

2008 2009 Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática para seleção deregiões protéicas potenciais, dos isolados brasileiros do HIV1, para darsuporte aos projetos de desenvolvimento de protótipos vacinais vinculados aoPNDST/AIDS, Ministério da SaúdeDescrição: Desenvolvimento de novas ferramentas de bioinformática de fácilmanuseio, gerando novos dados sobre as nossas sequências do HIV1, etreinamento dos investigadores que atuam na área de resistência do HIV1 àsdrogas antiretrovirais e na pesquisa de vacinas contra HIV1/AIDS,capacitandoos nos diversos aspectos teóricos e práticos de datamanagement e data mining das seqüências dos isolados brasileiros desteretrovírus, bem como nos aspectos práticos de designer , armazenamento,recuperação e análise dos dados genéticos, epidemiológicos e clínicosprovenientes dos bancos de dados locais e públicos. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Joana PaixãoMonteiro Cunha Integrante.

2007 2010 variabilidade genética dos isolados do HIV1 num grupo de mulheres ecrianças infectadas do Município de Feira de Santana/Bahia/ BrasilDescrição: A intensa variabilidade genética do HIV1 ao longo do tempo exigeestudos para compreender a dinâmica do seu advento em determinadacomunidade, seu padrão de transmissão e evolução, que permitamestabelecer uma estratégia eficaz de combate a tão sério problema de saúdepublica. No Brasil, os trabalhos com o genoma do HIV1 vêm sendodesenvolvidos desde a década passada para mapear a sua epidemiologiamolecular, nas diversas regiões do país, constatando a maior prevalência dosubtipo B, do C, do F e dos recombinantes B/F e outros. Estudos mais recentesna Bahia mostram um alto grau de diversidade genotípica neste Estado,decorrente da circulação de diversas formas de recombinantes. Constatasetambém uma elevada taxa de resistência aos antirretrovirais o que podefacilitar a difusão destas cepas para outras localidades. A difusão do HIV1para as cidades de médio e pequeno porte, o aumento da transmissãoheterossexual, afetando cada vez mais as mulheres mais jovens e pobresjustificaram este trabalho na cidade de Feira de Santana. Ela é a segundacidade mais importante do estado, abrangendo uma região de mais de1.000.000 de habitantes. É um entroncamento de três grandes rodoviasfederais, constituindose na porta de entrada de um grande fluxo migratóriode várias partes do país, tornandoa vulnerável a surtos de doençastransmissíveis. Já foram registrados no Centro de Referência para DST/AIDS,791 casos de pacientes soropositivos, sendo que 180 foram mulheres e 32foram crianças. Não há relato de nenhum estudo sobre a diversidade genéticado HIV1 nesta população, porém os resultados oriundos da população deSalvador podem refletir a realidade do Município de Feira de Santana, poiseste se localiza a 110 km de distância da capital. Assim, pretendemos comeste projeto: Verificar a freqüência e distribuição dos subtipos do HIV1, em



relação ao gene pol, na população estudada. Descrever a variabilidadegenética do gene pol dos novos isolados do HIV1 relacionada. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Luciane AmorimSantos Integrante / Adriano Fernando Araujo Integrante / Santos, Edson deSouza Integrante / Joana Paixão MonteiroCunha Integrante.

2007 2010 Utilização de códons pelos retrovírus humanos 'in silico"Descrição: Desenvolver uma nova ferramenta para analisar o comportamentodos diferentes transcritos dos genes do HIV1 e HTLV1, provenientes doGenBank, em relação a utilização de códons e disponibilidade de tRNA dacélula hospedeira. Considerando que as informações sobre o codon usage enúmero de cópias de genes para tRNA do Homo sapiens é conhecido, épossível inferir sobre a dinâmica evolutiva intracelular do HIV1. Assim, estasanálises contribuirão para o melhor entendimento a respeito da dinâmica e daadaptação viral. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Diego GervásioFrias Integrante / joana Paixão Monteiro Integrante.

2007 2009 Correlação entre Polimorfismos nas Regiões Promotora e Regulatórias doGene da GLUT1, Expressão e Exposição da Proteína na Membrana e oDesenvolvimento de TSP/HAM em Indivíduos infectados pelo HTLV1Descrição: A infecção pelo HTLV1 é endêmica em Salvador, onde aprevalência é de 1,8%. O desenvolvimento de manifestações clínicasassociadas ao HTLV1, como a doença neurológica paraparesia espásticatropical/mielopatia associada ao HTLV1 (TSP/HAM) ocorre em 24% dapopulação infectada e ainda não se sabe porque esta infecção permaneceassintomática na maioria dos portadores. Recentemente foi demonstrado quea glicoproteína transportadora de glicose do tipo 1 (GLUT1) funciona comoreceptor para a infecção do linfócitoT CD4+ e que sua expressão aumenta asusceptibilidade ao HTLV1. Tem sido demonstrado que polimorfismos em umúnico nucleotídeo (SNPs) nas regiões promotora e regulatórias do gene daGLUT1 estão associados à susceptibilidade a nefropatia diabética emdiferentes populações. Estes polimorfismos poderiam influenciar a expressãoda proteína GLUT1 na membrana celular e, no caso da infecção pelo HTLV1,poderiam facilitar a entrada do vírus na célula e a transmissão célulacélulado mesmo, levando a um aumento na carga proviral e, posteriormente, aodesenvolvimento de TSP/HAM. Entretanto, não existem estudos que avaliem aassociação entre os polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias dogene da GLUT1 e a infecção pelo HTVL1. O objetivo deste projeto é verificarpossíveis correlações entre polimorfismos nas regiões promotora eregulatórias do gene humano da GLUT1 com o desenvolvimento de TSP/HAM.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / BernardoGalvaoCastro Integrante / Sandra Rocha Gadelha Integrante / GiseleCalazans Costa Integrante / Gabriel Muricy Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2006 2011 Perfil da Saúde Bucal em pacientes infectados pelo HTLV1: Análise clínica,carga proviral e analise molecular do vírus na saliva.Descrição: Este estudo objetiva descrever o perfil bucal de carreadoresassintomáticos do HTLV1 e pacientes infectados e com HAM/TSP, parainvestigar a associação entre carga proviral na saliva e severidade de doençaperiodontal. Também pretendemos analisar as variações intrahospedeiro, dePBMCs e células na saliva destes indivíduos infectados.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Simone Kashima



Integrante / Bernardo Galvao Castro Integrante / Rochele Azevedo Integrante / Filipe F A Rêgo Integrante / Vitor Uchoa Carvalho Integrante /Liliane Lins Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2006 2010 Analise dos polimorfismos genotípicos do HIV1 e estudo in silico de comoestas mutações podem interferir na maquinaria de tradução da célulahospedeiraDescrição: A utilização do HMA como técnica de subtipagem tem sido eficazem áreas com índices elevados de infecção pelo HIV, pois além de ser rápidaé economicamente mais viável. Além disso, o estudo de duas regiõesgenômicas, tais como env e gag tem auxiliado na identificação de formasrecombinantes64. Entretanto, dado o crescente numero de formasrecombinantes circulantes e únicas sendo reportadas no país, se faznecessária uma reavaliação na eficiência deste método em detectar estasvariantes virais. Ainda que não seja completamente esclarecido que os váriosgrupos, subtipos e CRFs de HIV1 tenham diferenças biológicas, ao menos noque diz respeito à transmissibilidade e ao curso de progressão para AIDS,tornase claro que o conhecimento da prevalência e das mudanças temporaisna incidência dessas variantes em diferentes áreas geográficas, sejaimportante para auxiliar na avaliação da dinâmica de propagação da epidemiana região, podendo também ser útil para o desenho de vacinas adaptadasespecificamente para variantes do HIV circulantes em cada área e naatualização dos teste sorológicos de triagem. O alto polimorfismo do HIVrepresenta um dos principais obstáculos para o desenvolvimento de terapias evacinas antiHIV. O principal mecanismo de escape viral é a grandequantidade de substituições sinônimas, quando comparadas com assubstituições nãosinônimas (pressão seletiva positiva), nos diferentes genesdo HIV1, contribuindo para a alta diversidade viral nohospedeiro65Pretendemos assim, estimar a prevalência de subtipos genéticosde HIV1 no estado da Bahia; investigar a existência de eventos derecombinação entre isolados de HIV1 de diferentes subtipos com base nacaracterização dos genes gag e env e sua importância nesta população;verificar a existência de possíveis associações entre os subtipos de HIV1 evariáveis clínicas e sóciodemográficas; vvaliar a eficiência do Ensaio deMobilidade de Heteroduplexes (HMA) na determinação dos subtipos de HIV1em compar. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo GalvaoCastro Coordenador / joana Paixão Monteiro Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2006 2010 DIVERSIDADE MOLECULAR DO VÍRUS DA IMUNODEFICIENCIA HUMANA TIPO1 NO ESTADO DA BAHIADescrição: A análise de sequências genômicas é uma forma poderosa de seestudar a diversidade do HIV1 e sua expansão nas populações, além de sercrucial para dar suporte à vigilância epidemiológica e ao desenvolvimento deterapias e vacinas eficazes. Neste estudo foram geradas sequências dosgenes gag e env de 61 pacientes infectados em Salvador e do pol de 58 emFeira de Santana, Bahia, Brasil. A bioinformática foi utilizada para subtipar,genotipar as mutações de resistência, determinar a pressão seletiva epredizer o uso de coreceptor. Em Salvador, 92,6% das amostras foram dosubtipo B e 7,4% foram recombinantes BF1. Em Feira de Santana, 67,2%foram do subtipo B, 6,9% F1, 1,7% C e 24,1% BF1. Onze (19,0%) destesisolados apresentaram mutações de resistência. Pacientes infectados pelo Btinham em média 0,4 mutações de resistência e nenhuma mutação deste tipofoi observada em BF1. Com base na caracterização da alça V3 do B de 43amostras de Salvador, foram encontradas 18,2% de variantes brasileiras (B GWGR), 46,5% de GPGR e 34,9% de GXGX. O grupo de sequencias GPGRmostrou passar por maior pressão seletiva. O tempo médio de diagnósticopositivo foi de 13 anos para o B' e 9 anos para o B (GPGR + GXGX). Setenta eseis por cento destes vírus fazem uso do coreceptor CCR5, enquanto 24%



foram classificados como capazes de usar o CXCR4. Encontramos umaassociação entre o B e um maior tempo desde o diagnóstico. As prevalênciasde B' e de B/F1 em Salvador foram menores do que as encontradas emestudos anteriores na Bahia e no Brasil, por outro lado, em Feira de Santanafoi encontrada uma alta prevalência de B/F1.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Carlos Brites Integrante / Bernardo Galvao Castro Integrante / Luciane Amorim Santos Integrante / joana Paixão Monteiro Integrante / Adriano Fernando Araujo Integrante.Financiador(es): Ministério da Saúde Auxílio financeiro.

2006 2009 Caracterização Étnica/geográfica da população de Salvador e de Portadoresdo HIV1 e a Correlação entre o Índice de Ancestralidade Africana eVulnerabilidade ao HIV/AIDSSituação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Inês Dourado Integrante / Bernardo Galvão Castro Filho Coordenador / Flora MariaFernandes Integrante / Angelina Xavier Acosta Integrante / Geraldo ArgoloFerraro Integrante / Taís Bomfim Integrante / Kyoko Abe Sandes Integrante.Financiador(es): Ministério da Saúde Auxílio financeiro.

2005 2007 Avaliação das alterações no metabolismo ósseo e mineral de indivíduosportadores de retrovírus (HIV/HTLV) e correlações destas alterações compolimorfismos no promotor de IL6 e nos níveis de osteocalcinaDescrição: Visa avaliar as alterações do metabolismo ósseo e mineral deindividuos portadores de retrovírus e correlações dessas alterações compolimorfismos no promotor de IL6 e nos níveis de osteocalcina. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Doutorado: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo GalvãoCastro Filho Coordenador / Sandra Rocha Gadelha Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2003 2006 ESTUDO DOS DETERMINANTES DE RISCO PARA INFECÇÃO PELO HTLV EMDOADORES DE SANGUE DO ESTADO DA BAHIA E CARACTERIZAÇÃOGENOTÍPICA DOS ISOLADOS VIRAISDescrição: Objetivo: Caracterizar epidemiologicamente a infecção pelo HTLVem doadores de sangue do Estado da Bahia e analisar filogeneticamente osisolados virais. Material e métodos: entre 01/2000 e 12/2003 foramentrevistados 91 doadores infectados pelo HTLVI (casos) e 195 doadores nãoinfectados (controles), dos quais foram obtidas informações de ordemdemográfica, sócioeconômica, educacional, bem como relativas aocomportamento sexual, através de um questionário padronizado aplicado porum único entrevistador. Isolados virais de 25 doadores foram seqüenciados eanalisados filogeneticamente. Resultados: Na análise multivariada foramidentificados como fatores de risco independentes para infecção pelo HTLVsexo feminino, baixa renda familiar, DST prévia, uso inconsistente depreservativos e número de parceiros sexuais durante a vida. Observamosdiferenças significativas de comportamento sexual entre homens e mulheresinfectados. Todos os isolados virais analisados pertenciam ao subgrupotranscontinental, subgrupo cosmopolita. Pela primeira vez foi observado umisolado da África do Sul inserido no grupamento latinoamericano. Conclusão:Os resultados deste estudo revelam uma associação entre baixo nível sócioeconômico e práticas sexuais não seguras e infecção pelo HTLV. A menorprevalência observada confirma dados epidemiológicos recentes e pode serdecorrente de uma melhor triagem clínica, da redução da prevalência deinfecção pelo HTLV na população geral, ou de um efeito dilucional no universode doadores ocasionado pela exclusão definitiva ao longo dos anos dosdoadores infectados. Os dados da comparação entre homens e mulheres



reforçam a tese de que a principal via de transmissão de HTLVI no nossomeio seja a sexual. A análise filogenética demonstrou pela primeira vez que aÁfrica do Sul pode ter contribuído na introdução do HTLVI no Brasil.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo GalvaoCastro Coordenador / Sergio Araujo Pereira Integrante / Artur TrancosoLopo Queiróz Integrante / Flora Maria Fernandes Integrante / AugustoCesar Andrade Mota Integrante.Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia Auxíliofinanceiro.

2003 2005 Correlações dos Polimorfismos Genéticos do HTLVI/II e da Resposta Imunedo Hospedeiro com a Infecção e/ou PatogêneseDescrição: Avaliar o genoma do HTLV1 e do hospedeiro,bem como daresposta imune,para melhor compreensão dos mecanismos biológicosenvolvidos na infecção e/ou patogenia viral. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (6) / Especialização: (1) / Mestradoacadêmico: (5) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo GalvaoCastro Coordenador / Angelina Xavier Acosta Integrante / Fernada Grazzi Integrante.Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico eTecnológico Auxílio financeiro.

2002 2005 Correlações do Polimorfismo Genético do HTLVI/II com o Polimorfismo dosgenes do Hospedeiro envolvidos no Desenvolvimento de Paraparesia EspáticaTropical/Mielopatia Associada (TSP/HAM) em SalvadorDescrição: Transferência de tecnologia para um núcleo emergente noNordeste do país; Estabelecer as correlações entre fatores virais e dohospedeiro assintomático e sintomático com TSP/HAM; Caracterizaçãomolecular do genoma proviral (TAX) dos indivíduos infectados; Anáilise dospolimorfismos destas regiões,relacionando os mesmos com a sintomatologiaTSP/HAM;Caracterização molecular dos genes do hospedeiro envolvido nomecanismo de transativação por Tax (NFKB,IKB,CREB,SRFp50,p65,p52,cRel,p16) em indivíduos infectados assintomáticos e com TSP/HAM,correlacionando estes resultados com as alterações genotípicas dohospedeiro.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Especialização: (1) / Doutorado: (2) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo GalvaoCastro Coordenador / Marilda Gonçalves Integrante.

2013 Atual Formação de uma rede de discussão e disseminação do conhecimento sobreas infecções pelo HIV1 e HTLV1, utilizando a educação como ferramenta deredução de novos casosDescrição: De acordo com Ministério da Saúde, em 2012, (Brasil, 2012) a faixaetária entre 1524 anos mantém uma tendência de aumento da prevalênciada infecção pelo HIV1, o que evidencia a vulnerabilidade desse grupo. Algunsaspectos da vulnerabilidade os atingem de maneira especial, dentre eles afalta de informação eficaz e barreiras materiais e culturais que limitam o seuacesso aos meios de proteção (AYRES,J. 1996). De acordo com o MS, tanto ainfecção pelo HIV quanto pelo HTLV devem ser considerados problema desaúde pública, sendo a educação o melhor caminho para prevenção epromoção da saúde. Objetivo Geral: Formar e capacitar uma rede deadolescentes e jovens vulneráveis, da região metropolitana de Salvador, paraatuarem como disseminadores do conhecimento sobre a infecção pelo HIV1 eHTLV1, visando a redução da incidência destas epidemias entre seus pares.Objetivos Específicos: 1. Habilitar educadores de escolas públicas e

Projetos de extensão



organizações sociais sobre os conhecimentos básicos das infecções pelo HIV1 e HTLVI; 2. Orientar na elaboração de um plano de ação, a ser executadopelos educadores, para a formação/capacitação de adolescentes e jovensmultiplicadores de informações sobre a prevenção das infecções pelo HIV1 eHTLV1; 3. Capacitar adolescentes e jovens em situação de vulnerabilidade,através da rede de educadores previamente habilitados (objetivo 1); 4.Difundir os conhecimentos sobre a prevenção destas infecções pelos jovensmultiplicadores entre seus pares; 5. Acompanhar periodicamente oaprendizado dos jovens e adolescentes sobre a infecção pelo HIV e HTLV1; 6.Estimular o desenvolvimento de um material lúdico/didático, por parte dosadolescentes/jovens, que foram alvo da formação educativa, para ser aplicadoa adolescentes e jovens em diferentes instituições/eventos voltados para essepúblico; 7. Proporcionar certificação profissionalizante da rede demultiplicadores em informações sobre prevenção das infecções pelo HIV1/HTLV1; 8. Desenvolver vídeos de todas as atividades teóricas decapacitação dos educadores, para serem disponibilizados no site doCPqGM/FIOCRUZ, pasra que estes possam fazer uso durante o processo detreinamento dos jovens e adolescentes; 9. Desenvolver vídeos de todas asatividades praticas laboratoriais que posteriormente serão utilizados noprocesso de capacitação dos educadores. 10. Disponibilizar estes vídeos nositio do CPqGM/FIOCRUZ, para serem utilizados pelos educadores durante oprocesso de capacitação dos jovens e adolescentes. . Situação: Em andamento; Natureza: Extensão. Alunos envolvidos: Graduação: (5) / Mestrado profissional: (5) / Doutorado:(4) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / de Oliveira, Tulio Integrante / Kashima, Simone Haddad Integrante / Marcio Oliveira Silva Integrante / Marilda Souza Gonçalves Integrante / Gilson Carlos Soares Integrante / Sandra do Valle Integrante / Alfredo Dorea Integrante.Financiador(es): Ministério da Saúde Auxílio financeiro.

2005 2008 Promoção de saúde por meio da pesquisa e educação em Monte Gordo: Umacomunidade carente da área rural do Estado da BahiaDescrição: Implantação de um laboratório de informática numa escola públicade área rural carente, visando fornecer fundamentos da informática aescolares de uma área rural com a finalidade de inclusão digital.. Situação: Em andamento; Natureza: Extensão.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Integrante / Bernardo GalvãoCastro Filho Coordenador.Financiador(es): Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz Fundação InstitutoOswaldo Cruz Cooperação / Fundação de apoio à pesquisa e extensão doestado da Bahia Auxílio financeiro.

2012 2014 IMPLANTAÇÃO DE UM LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA PARA DARSUPORTE AO CURSO DE PÓSGRADUAÇÃO EM BIOTECNOLOGIA EM SAÚDE EMEDICINA INTERNA DO CPQGMDescrição: Implantação de um laboratório de bioinformática noCPqGM/FIOCRUZ ligado ao curso de pós graduação em Biotecnologia emSaúde e Medicina Investigativa e para dar suporte às atividades de vigilânciamolecular dos patógenos de relevância na Saúde Pública, econsequentemente possibilitando a formação de parcerias entre este curso depós graduação e outros cursos de pós graduação no estado da Bahia. Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador.2010 Atual Desenvolvimento de um Banco de Dados para o HTLV1

Descrição: O presente trabalho propõe a construção de um repositório públicopara as sequências do HTLV1, similar à iniciativa do Banco de Dados deSequências do HIV de Los Alamos (http://www.hiv.lanl.gov/content/index) ede Stanford (http://hivdb.stanford.edu/) que constituem importantes fontes

Projetos de desenvolvimento



de informações sobre as sequências e indivíduos infectados para uso emestudos evolucionários e desenvolvimento de vacinas, dados epidemiológicos,caracterização da epidemiologia viral e de migração populacional. O nossoBanco de dados deverá se constituir numa referência mundial para o estudodo HTLV1, tendo em vista que se pretende adicionar o maior número deinformações sobre o vírus, seus aspectos epidemiológicos e fatoresambientais, para que se possam estabelecer melhores relações sobreinfecção, patogênese, origem e evolução, para isto, utilizaremos plataformaem Java chamada RegaDB: A Viral Data and Analysis ManagementEnvironment, que constituise como um banco de dados com ferramentas, quepode ser instalado e gerenciado localmente, para armazenar dados clínicos eepidemiológicos com o objetivo de apoiar clínicos e pesquisadores em seutrabalho. Com este projeto de desenvolvimento tecnológico e inovação,estaremos criando condições para que o núcleo de bioinformática doLASP/CPqGM/FIOCRUZ, sendo um dos laboratórios de referência embioinformática no Brasil, continue contribuindo para a seleção de candidatosvacinais, não só em relação ao HIV1/AIDS, mas também em relação ao HTLV1; para assim melhor analisar as seqüências geradas, padronizando ametodologia de análise . Situação: Em andamento; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo GalvaoCastro Integrante / Thessika Hialla Almeida Araújo Integrante / DustinEdwards Integrante / Leandro I SouzaBrito Integrante.

2007 2010 LASPHIV1ResTool: Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformáticapara análise de resistência do HIV1 aos antirretroviraisDescrição: No presente projeto, pretendemos desenvolver uma ferramenta debioinformática para análise de resistência do HIV1 aos antirretrovirais. Estaferramenta de fácil manuseio, estará disponível no site da unidade debioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ, Bioafrica e IOC/FIOCRUZ paradomínio público e é capaz de otimizar a análise de dados genômicos do HIV1.Esta ferramenta pode acessar um banco de dados com seqüências gênicaspreviamente armazenadas, extrair informações relativas a resistência aosantirretrovirais, comparar seqüências de HIV1 dos bancos de dados públicos,identificando mutações nos genes que codificam a transcriptase reversa e aprotease e associar esses dados a resistência a cada antirretroviral utilizadonas terapias antiHIV/AIDS. Adicionalmente, a ferramenta possibilitarálocalizar sitios póstraducionais e traçar um perfil de distribuição dasseqüências armazenadas no banco de dados local, tanto por resistência,quanto por sítios póstraducionais, para servirem de parâmetro decomparação com as seqüências submetidas pelos usuários da ferramenta. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento.

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Domingos RamonMoreau Integrante / José Carlos Couto Fernandez Integrante / JoanaPaixão MonteiroCunha Integrante.

2005 2006 Desenvolvimento e manutenção de um núcleo de referência emBioinformática para dar suporte e treinamento aos projetos desenvolvidospelo PNDST/AIDS,ministério da saúde (projeto dividido em duas fases)Descrição: capacitação do laboratório de bioinformática doLASP/CPqGM/FIOCRUZ (http://lasp.cpqgm.fiocruz.br) em núcleo de referênciaem bioinformática para dar suporte ao PNDST/AIDS do Ministério da Saúdena criação de um repositório de sequências genétias do HIV1;Ministrartreinamento específico em bioinformática a outros pesquisadores da rede etransferir esta tecnologia para outros núcleos emergentes de bioinformáticano Brasil. Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Domingos RamonMoreau Integrante / Filipe F A Rêgo Integrante / Luciane Amorim Santos Integrante / Saul Vislei Integrante / Aline Cristina Andrade MotaMiranda Integrante / Queiroz, Artur TL Integrante / Urpia, Caroline de Carvalho



Integrante / Carvalho, Chandra Mara Integrante / Joana Paixão MonteiroCunha Integrante.

2003 2005 Implantação de um Núcleo de Bioinformática para dar Suporte aoMonitoramento de agentes Biológicos Emergentes,HTLV e HIV (Resistente eIncidente):Implicações no Controle Antiretroviral e Desenvolvimento deVacinasDescrição: 1.Reforçar o nucleo de bioinformática do LASP/CPqGM/FIOCRUZ eEBMSP/FDC para dar suporte às seguintes atividades: Vigilância dopolimorfismo genotípico do HIV no âmbito do Programa Nacional deHIV/AIDS,principalmente em relação ao desenvolvimento de vacina eresistência antiretroviral; Sequenciar e analisar filogeneticamente osisolados de HTLVI e II circulantes no Brasil; Determinar as alteraçõespolimórficas nos genes em tax e LTR do HTLV1 que poderiam influenciar nodesenvolvimento de HAM/TSP. 2.Treinar pesquisadores em análise genética eevolutiva de patógenos humanos,com ênfase no HIV1 e HTLV1. 3.Avaliar ataxa de evolução viral através da substituição de nucleotídeos em sequênciasdos genes env e gag (HIV e HTLV),provenientes de isolados de um mesmoindivíduo, coletados em diferentes períodos. 4.Comparação filogenética dassequências dos genes env e gag do HIV1 circulantes na cidade de Salvador.5.Investigar o polimorfismo da região LTR do HIV1 dos subtipos nãoB,avaliando a presença dos sítios de ligação para os fatores transcricionais erelacionando com as características fenotípicas dos isolados e o perfilepidemiológico desses variantes na população. . Situação: Concluído; Natureza: Desenvolvimento. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Especialização: (1) / Mestradoacadêmico: (1) .

Integrantes: Luiz Carlos Júnior Alcântara Coordenador / Bernardo GalvaoCastro Integrante / Domingos Ramon Moreau Integrante / Aline CristinaAndrade MotaMiranda Integrante / de Oliveira, Tulio Integrante / Queiroz,Artur TL Integrante / Carvalho, Chandra Mara Integrante / Joana PaixãoMonteiro Cunha Integrante.

2009 Atual Periódico: The Scientific World Journal

2002 Atual Periódico: Memórias do Instituto Oswaldo Cruz2007 Atual Periódico: The Journal of Medical Virology2007 Atual Periódico: Emerging Infectious Diseases2008 Atual Periódico: AIDS Research and Human Retroviruses2008 Atual Periódico: Retrovirology Research and Treatment2011 Atual Periódico: PLoS Neglected Tropical Diseases (Online)2011 Atual Periódico: Plos One2010 Atual Periódico: Nucleic Acids Research2014 Atual Periódico: Journal of Virology (Print)2008 Atual Periódico: Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes (1999)2014 Atual Periódico: Journal of General Virology2014 Atual Periódico: PLoS Pathogens2009 Atual Periódico: Retrovirology (Auckland)2013 Atual Periódico: Bioinformatics2010 Atual Periódico: Virology Journal2009 Atual Periódico: AIDS (London)

Membro de corpo editorial

Revisor de periódico

Revisor de projeto de fomento



2008 Atual Projeto: Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico2008 Atual

Projeto: Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia 2009 AtualProjeto: Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

1. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea:Epidemiologia/Especialidade: Filogenia dos Retrovírus Humanos.

2. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: MedicinaPreventiva.

3. Grande área: Ciências da Saúde / Área: Saúde Coletiva / Subárea: SaúdePública.

4. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Bioquímica / Subárea: BioquímicaBásica e Metabólica.

5. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea:Bioinformática.

6. Grande área: Ciências Biológicas / Área: Biologia Geral / Subárea:Bioinformática/Especialidade: Epidemiologia Molecular de Retrovirus.

Inglês Compreende Bem, Fala Bem, Lê Bem, Escreve Bem.

2005 HTLV1 Travel Scholar, 12th International Conference on Human Retrovirology Montego Bay (Jamaica).

2005 Prêmio da IX Jornada Científica de Pósgraduação, FIOCRUZ.2005 (Melhor Painel) The Genetic Characteristic Study of the Brazilian HTLV1

Isolates Suggests the Pre and PostColumbian Origin of the Virus in thisCountry, 8º Simpósio Internacional Sobre HTLV.

2002 (Melhor Tese de Doutorado em Virologia no Brasil em 2002) Prêmio Helio GelliPereira no XIII Encontro Nacional de Virologia Setembro/2002., SociedadeBrasileira de Virologia Águas de Lindóia (SP).

1999 Fellowship Award, Nineth International Conference on Human Retrovirology:HTLV and Related Viruses Kagoshima Japão.

Áreas de atuação

Idiomas

Prêmios e títulos

Produções

Produção bibliográfica

Citações

SCOPUS

Artigos completos publicados em periódicos

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Ordenar por

Ordem Cronológica

MELLO, M. A. G. ; CONCEICAO, A. F. ; SOUSA, S. M. B. ; ALCANTARA, L. C. J. ; MARIN, L. J. ; RAIOL, M. ;BOASORTE, N. ; SANTOS, L. P. S. ; ALMEIDA, M. C. C. ; GALVAO, T. C. ; BASTOS, R. G. ; GONCALVES, N. L. ; GALVAOCASTRO, B. ; GADELHA, S. R. . HTLV1 in pregnant women from the Southern Bahia, Brazil: a neglected conditiondespite the high prevalence. Virology Journal , v. 11, p. 2834, 2014.

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http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcApp=PARTNER_APP&SrcAuth=LinksAMR&KeyUT=WOS:000319428600022&DestLinkType=CitingArticles&DestApp=ALL_WOS&UsrCustomerID=83e8e710a8e621f095e069bfe7c1e2bd


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ALCANTARA, L. C. J. ; SHINDO, N. ; VANDOREN, S. ; KASHIMA, S. ; COSTA, M. C. R. ; ANDRADE, T. ; ANDRADEFILHO, A. ; BITTENCOURT, A. ; DOURADO, I. ; COVAS, D. T. ; VANDAMME, AM. ; GALVÃOCASTRO, B. . Molecularepidemiology of human Tcell lymphotropic virus type I (HTLVI) in Northeast of Brazil. In: 10th InternationalConference on Human Retrovirology: HTLV and Related Viruses, 2001, Dublin. AIDS Research and HumanRetroviruses, 2001. v. 17. p. S33.

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ALCANTARA, L. C. J. ; SHINDO, N. ; VANDOREN, S. ; SALEMI, M. ; COSTA, M. C. R. ; KASHIMA, S. ; COVAS, D.T. ; TEVA, A. ; BRITO, I. ; VANDAMME, AM. ; GALVÃOCASTRO, B. . Human retroviruses (HIV and HTLV) in BrazilianIndians: Seroepidemiological study and molecular epidemiology of HTLVII isolates. In: 10th InternationalConference on Human Retrovirology: HTLV and Related Viruses, 2001, Dublin. AIDS Research and Humanretroviruses, 2001. v. 17. p. S41.

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ALCANTARA, L. C. J. ; SHINDO, N. ; VAN DOOREN, S. ; VANDAMME, A. M. ; SALEMI, M. ; KASHIMA, S. ; COSTA,M. C. R. ; COVAS, D. T. ; GALVÃOCASTRO, B. . Epidemiology and Molecular Characterization of HTLVI in Northeast ofBrazil.. In: VII European Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology, 2001, Leuven. The InfectiousDisease Review, 2001. v. 3. p. 146157.

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ALCANTARA, L. C. J. ; SHINDO, N. ; VANDOREN, S. ; KASHIMA, S. ; COSTA, M. C. R. ; SANTOS, F. L. N. ;ANDRADE, T. ; ANDRADE FILHO, A. ; BITTENCOURT, A. ; DOURADO, I. ; COVAS, D. T. ; VANDAMME, AM. ; GALVÃOCASTRO, B. . Molecular Epidemiology of Human T Cell Lymphotropic Virus Type I (HTLVI) in Northeast of Brazil. In: VISimpósio Internacional Sobre HTLV no Brasil, 2000, SalvadorBahia. VI Simpósio Internacional Sobre HTLV no Brasil Resumos, 2000. p. 25.

ALCANTARA, L. C. J. ; SHINDO, N. ; VANDOREN, S. ; SALEMI, M. ; COSTA, M. C. R. ; KASHIMA, S. ; COVAS, D.






























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ALCANTARA, L. C. J. ; SHINDO, N. ; VANDOREN, S. ; SALEMI, M. ; COSTA, M. C. R. ; KASHIMA, S. ; COVAS, D.T. ; ANDRADE, T. ; VANDAMME, AM. ; GALVÃOCASTRO, B. . Identification and molecular characterization of human Tlymphotropic virus type II (HTLVII) infection in Intravenous Drug users from SalvadorBahiaBrazil.. In: VI SimpósioInternacional sobre HTLV no Brasil, 2000, SalvadorBahia. VI Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil Resumos,2000. p. 41.

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ALCANTARA, L. C. J. ; SHINDO, N. ; GALVÃOCASTRO, B. . Human T cell lymphotropic virus type II (HTLVII)polymorphism in Brazil: a potencial new subtype. In: V Jornada Científica de PósGraduação. Fundação Oswaldo Cruz,1999, Rio de Janeiro. V Jornada Científica de PósGraduação. Fundação Oswaldo Cruz Anais, 1999. p. 319.

ALCANTARA, L. C. J. ; MACHADO, C. A. C. ; SHINDO, N. ; GALVÃOCASTRO, B. . Human Tcell lymphotropicvirus type II (HTLVII) polymorphism in Brazil. In: IX Encontro Nacional de Virologia, 1998, São LourençoMG. Virusreviews & Research, 1998. v. 3. p. 122.

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MARLENE, A.C. ; ORTIZCOSTA, S. ; CARVALHO, R. N. ; FONSECA, F. V. ; BRINN, L. S. ; ALCANTARA, L. C. J. ;LARSON, R. E. ; SORENSON, M. ; CAMERON, L. C. . Identification of brain myosin V (BM V) in four mammalian species(OX, PIG, GOAT, DOG). In: XXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1995,CaxambuMG. Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular Resumos, 1995. p. 168.

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LARSON, R. E. ; ESPREAFICO, E. M. ; MARTINS, A. R. ; COELHO, M. V. ; NASCIMENTO, A. A. C. ; MANI, F. ;COSTA, M. C. R. ; ALCANTARA, L. C. J. ; TAUHATA, S. B. ; BRINN, L. S. ; CAMERON, L. C. . Molecular characterizationand immunolocalization of brain myosinV, an unconventional actinbased motor. In: XXII Reunião Anual daSociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1994, CaxambuMG. Sociedade Brasileira de Bioquímica eBiologia Molecular Resumos, 1994. p. 140.

NASCIMENTO, A. A. C. ; CHENEY, R. E. ; ALCANTARA, L. C. J. ; COSTA, M. C. R. ; ESPREAFICO, E. M. ;MOOSEKER, M. S. ; LARSON, R. E. . Molecular dissection of brain myosinV: decapitation, tailsevering and neckisolation. In: 34rd Annual Meeting of the American Society for Cell Biology, 1994, New Orleans, Louisiana. MolecularBiology of the Cell (Supplement), 1994. v. 5. p. 276a.














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COSTA, M. C. R. ; ESPREAFICO, E. M. ; ALCANTARA, L. C. J. ; CHENEY, R. E. ; MOOSEKER, M. S. ; PAÇÓLARSON, M. L. ; LARSON, R. E. . Functional studies on chicken myosinV domains expressed in E.coli. In: XXII ReuniãoAnual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 1993, CaxambuMG. Sociedade Brasileira deBioquímica e Biologia Molecular Resumos, 1993. p. 115.

MARTINS, A. R. ; MANI, F. ; COSTA, M. C. R. ; ALCANTARA, L. C. J. ; BRINN, L. S. ; ESPREAFICO, E. M. ;LARSON, R. E. . Cellular and sub cellular immunolocalization of myosinV in rat brains during postnatal development.In: 33rd Annual Meeting of the American Society for Cell Biology, 1993, New Orleans, Louisiana. Molecular Biology ofthe Cell (Supplement), 1993. v. 4. p. 40a.

Apresentações de TrabalhoALCANTARA, L. C. J. . Epidemiological study of the human Tcell lymphotropic virus type I (HTLVI) in South

Africa: Molecular correlation between this virus in the African Continent and Salvador, the Brazilian City with thehighest African characteristics.. 2005. (Apresentação de Trabalho/Simpósio).

ALCANTARA, L. C. J. . The Transcontinental subgroup of HTLV1 introduced in Salvador, Bahia, Brazil, may haveoriginated in the south of the African continent.. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

ALCANTARA, L. C. J. . Mapping the genetic characteristics of the HIV1 strains in Brazil with the development ofthe viral bioinformatics laboratory at Salvador, Bahia, Brazil. 2004. (Apresentação de Trabalho/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Bioinformática. 2004. (Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra).

ALCANTARA, L. C. J. . Diversidade Filogenética do HTLVII no Brasil: Possível origem do vírus em SalvadorBA Apresentado na Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto SP. 2000. (Apresentação de Trabalho/Seminário).

Outras produções bibliográficasALCANTARA, L. C. J. . HTLV: Para Prevenir é Preciso se Informar. SalvadorBA: Faculdade de Tecnologia e

Ciências, 2005 (Cartilha).

Produção técnica

Programas de computador sem registroMOREAU, D. R. ; FERNANDEZ, J. C. C. ; OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, L. C. J. . HIV1RESTOOL. 2012.

ARAUJO, T.H.A. ; SOUZABRITO, L. I. ; Libin, P. ; Deforche, K. ; ALCANTARA, L. C. J. . HTLV1 MolecularEpidemiology database. 2011.

ALCANTARA, L. C. J. ; Deforche, K. ; Libin, P. ; OLIVEIRA, T. . Virus Genotyping Tools. 2009.

Produtos tecnológicosALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. . Desenvolvimento de um software para análise filogenética do HTLV1 on

line e de acesso livre. 2006.

Demais tipos de produção técnica

ALCANTARA, L. C. J. . Curso de Pos Graduação em Biotecnologia em Saúde E medicina Investigativa (PgBSMI).2014. (ViceCoordenador).

ALCANTARA, L. C. J. . Comité de Etica em Pesquisa. 2014. (Membro).



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ALCANTARA, L. C. J. . Curso de Pós Graduação em Patologia Humana e Experimental. 2014. (MembroPermanente).

ALCANTARA, L. C. J. . Algorítmos utilizados para alinhamento e edição de sequências de nucleotídeos eaminoácidos utilizando os programas ClustalX, BioEdit, Dambe, GenDoc, etc, no 14th International BioinformaticsWorkshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology. 2008. .

ALCANTARA, L. C. J. . Introduzione alle tecniche di bioinformatica per analisi epidemioligicomolecolari. 2007. .

ALCANTARA, L. C. J. . Radicais Livres em Patologia Humana. 2007. .

ALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. ; GALVAOCASTRO, B. . Capacitação em Bioinformática para pesquisa emHIVAIDS:. 2007. .

ALCANTARA, L. C. J. . Radicais Livres em Patoligia Humana (Formação em Oertomolecular). 2006. .

ALCANTARA, L. C. J. . Treinamento para utilização da Database HIVBae. 2005. .

ALCANTARA, L. C. J. . Bioquímica dos Radicais Livres em Patologia Humana. 2005. .

ALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. . The Bioinformatics Tools for viral sequence analysis. 2005. (Curso decurta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Alinhamento de sequência gênicas utilizando os programas DAMBE, BIOEDIT, CLUSTALXe GENEDOC, e análise filogenética utilizando os programas PHYLIP e TREEPUZZLE. 2004. .

ALCANTARA, L. C. J. ; FERNANDES, F. M. . Phylogenetic tree interpretation. 2004. (Curso de curta duraçãoministrado/Extensão).

ALCANTARA, L. C. J. . Aplicação da Bioinformática no Estudo Viral. 2004. (Curso de curta duraçãoministrado/Especialização).

ALCANTARA, L. C. J. . 10th International Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology AdvancedModule. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

ALCANTARA, L. C. J. . The Brazilian AIDS program data. 2004. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . HIV Data Management and Data Mining for Antiretroviral Drug Resistence Workshop.2004. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Métodos de Investigação da patogênese viral 4: análise filogenética. 2003. (Curso decurta duração ministrado/Especialização).

ALCANTARA, L. C. J. . Fologenia de Retrovirus. 2003. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . VIII EUROPEAN WORKSHOP ON VIRUS EVOLUTION AND MOLECULAR EPIDEMIOLOGY,LeuvenBélgica.. 2002. (Curso de curta duração ministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. ; OLIVEIRA, T. . Radicais Livres em Patologia Humana. 2002. (Curso de curta duraçãoministrado/Outra).

ALCANTARA, L. C. J. . Análise filogenética de Retrovírus. Realizado na Fundação Hemocentro de RibeirãoPretoSP. 2000. (Curso de curta duração ministrado/Especialização).

Demais trabalhosALCANTARA, L. C. J. . Development of the LASP HTLV1 Automed Subtyping Tool. 2006 (Cientista Visitante) .




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ALCANTARA, L. C. J. . Training in the HIVBase Database. 2005 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . Investigação das Mutações C282Y e H63D no gene da Hemocromatose HereditáriaClássica (HFE) em Recém Nascidos e em Portadores de Anemia Falciforme de Salvador Bahia. 2004 (Revisor deTese de Mestrado) .

ALCANTARA, L. C. J. . Trabalho experimental realizado no laboratório e unidade de bioinformática da Escola deMedicina da Universidade de NatalDurbanÁfrica do Sul. 2004 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . VIII European Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology. 2004 (ProfessorAssistente) .

ALCANTARA, L. C. J. . Training in the HTLV/HIV Bioinformatics Tools. 2002 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . Análise filogenética de retrovírus (Rega Instituto para Pesquisas Médicas, UniversidadeCatólica de Leuven, Bélgica). 2001 (Estágio) .

ALCANTARA, L. C. J. . Análise filogenética de retrovírus (Rega Instituto para Pesquisas Médicas, UniversidadeCatólica de Leuven, Bélgica). 2000 (Estágio no exterior (Coordenado pela Dra. AnneMieke Vandamme)) .

Bancas

Participação em bancas de trabalhos de conclusão

MestradoALCANTARA, L. C. J.; GADELHA, S. R.; MELO, P. R. S.; SANTOS, M. V. F. D. L.. Participação em banca de Raquel

Gois Bastos. Estudos de agentes infecciosos de transmissão vertical e epidemiologia molecular de retrovírus emgestantes do sul da Bahia. 2013. Dissertação (Mestrado em Biologia e Biotecnologia de Microrganismos) Universidade Estadual de Santa Cruz.

ADORNO, E. V.; SANDES, K. A.; ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Isabela Archanjo Nuñes.Expressão dos genes virais do HTLV1 tax e HBZ na Leucemis/linfoma de células T do adulto (ATL). 2013. Dissertação(Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz.

ALCANTARA, L. C. J.; KASHIMA, S.; CARBOLANTE, E. M. S. R.. Participação em banca de Katia Kaori Otaguiri.Estudo funcional de microRNAs na infecção pelo HTLV1. 2013. Dissertação (Mestrado em Biociências Aplicadas àFarmácia da FCFRPUSP) Universidade de São Paulo.

ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Nadja de Jesus Gonçalves dos Santos. Hemoglobina fetal emindivíduos com doença falciforme e persistência hereditária da hemoglobina fetal. 2011. Dissertação (Mestrado emBiotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Fundação Oswaldo Cruz.

ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de João Paulo Sena Chagas de Oliveira. Avaliação do PolimorfismoGenético em Isolados de Leishmania Amazonensis. 2006. Dissertação (Mestrado em Patologia) Centro de PesquisaGonçalo MonizFIOCRUZ.

ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Joana Paixão Monteiro. Caracterização Molecular e Biológica deIsolados do Subtipo C de HI1 circulantes no Brasil. 2006. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) Instituto Oswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz.

ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Hermes Pedreira da Silva Filho. Aplicabilidade dos Genes Pr´Se S do Vírus da Hepatite B (VHB) nos estudos de Diversidade Genômica. 2005. Dissertação (Mestrado em Patologia) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz Fundação Instituto Oswaldo Cruz.




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ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Andréa Bomura Rosato. Avaliação do Polimorfismo Genético deLeishmania viannia brasiliensis. 2004. Dissertação (Mestrado em Patologia) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz Fundação Instituto Oswaldo Cruz.

COLIN, D. D.; ALCANTARA, L. C. J.; TAVARES NETO, J.; ALVARENGA, R. M. P.. Participação em banca de DenizeDuizit Colin. Prevalência de Infecção por HTLVI/II em doadores de Sangue da Cidade de Rio Branco, Acre.. 2003.Dissertação (Mestrado em Medicina e Saúde) Curso de Mestrado Em Medicina e Saúde Ufba Governo do Acre.

SOUZA, C. L.; ALCANTARA, L. C. J.; BONFIM, M. G.; FONSECA, S. F.. Participação em banca de Cláudio LimaSouza. Investigação Molecular das Anormalidades Cromossômicas e dos Polimorfismos Gênicos da Glutationa STransferase em um Grupo de Portadores de Leucemia Mielóide Crônica (LMC) e Leucemia Mielóide Aguda (M3) deSalvadorBA.. 2003. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) Instituto Oswaldo Cruz FundaçãoOswaldo Cruz.

ALCANTARA, L. C. J.; FERNANDEZ, J. C. C.; VICENTE, A. C. P.. Participação em banca de Viviana Nilla OlavarriaGallazzi. Prevalência das mutações que conferem resistência aos antiretrovirais em um grupo de indivíduosinfectados pelo HIV1, em Salvador, Bahia. 2003. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) InstitutoOswaldo Cruz Fundação Oswaldo Cruz.

Teses de doutoradoALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Marcelo Magalhães Silva. Estudo de alterações genéticas

associadas à leucemia/linfoma das células T do adulto no Estado da Bahia. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologiaem Saúde e Medicina Investigativa) Fundação Oswaldo Cruz.

ALCANTARA, L. C. J.; FONSECA, B. A. L.; ALBERTO, F. L.; CASTRO, M. L. R. B.; COSTA, S. C. B.. Participação embanca de Andréa Mendonça Gusmão Cunha. Soroprevalência e Epidemiologia Molecular do Herpesvírus homano 8(HHV8) em Populações Brasileiras. 2005.

Qualificações de DoutoradoALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de André Luiz Barbosa Báfica. Influência de Polimorfismos dos

Receptores do Tipo Toll nas Leishmanioses. 2006. Exame de qualificação (Doutorando em Curso de PósGraduaçãoem Patologia) Centro de Pesquisa Gonçalo MonizFIOCRUZ.

ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Elisângela Vitória Adorno. Fatores Transcricionais,regiãopromotora dos genes gama e o sítio HS2LCR:análise da interação em portadores de anemia falciforme de SalvadorBahia. 2005. Exame de qualificação (Doutorando em Curso de PósGraduação em Patologia) Centro de PesquisasGonçalo Moniz Fundação Instituto Oswaldo Cruz.

Qualificações de MestradoALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Tamiris Tatiane Dias. Clonalidade do vírus da hepatite C (VHC)

e implicação na transmissão intrauterina e eliminação espontânea da infecção viral em recémnascidos. 2012.

ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Isabela Arcanjo Nunez. Expressão dos genes virais tax e HTLV1b ZIP factor (HBZ) na Leucemia/Linfoma de células T do adulto (ATL). 2012. Exame de qualificação (Mestrando emBiotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Fundação Oswaldo Cruz.

ALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Mariana Tomazini Pinto. Perfil de expressão gênica de linfócitosT CD4+ na infecção pelo HTLV1. 2011.

Trabalhos de conclusão de curso de graduaçãoALCANTARA, L. C. J.. Participação em banca de Patrícia de Souza Abreu.Contribuições de Análise de Sequências

de DNA à reconstrução Filogenética dos grandes Grupos de Anura. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduaçãoem Biologia) Universidade Federal da Bahia.




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ALCANTARA, L. C. J.; FERRARO, G. A.; VILAS BOAS, L.. Participação em banca de Chandra Mara Santana deCarvalho.Caracterização Molecular de Sequências Brasileiras de HIV1 através de uma nova Ferramenta deBioinformática. 2005. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biologia) Universidade Federal da Bahia.

Participação em bancas de comissões julgadoras

Concurso públicoALCANTARA, L. C. J.. Concurso público para professor em nível de assistente da disciplina Bioquímica, conforme

edital 007/2003 da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia Departamento de Química e Exatas, Jequié.. 2003.Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca examinadora de progressão de assistente para adjunto. 2003. UniversidadeEstadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca Examinadora de Progressão na carreira de auxiliar para assistente. 2003.Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca examinadora de progressão na carreira de auxiliar para assistente. 2003.Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

ALCANTARA, L. C. J.; RIBAS, L.; OLIVEIRA, S.. Concurso Público para Docente de Nível Superior, Classe Auxiliar,conforme edital 031/2001, para a disciplina Bioquímica da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Jequié,Bahia, em outubro/2001 (Membro da Comissão Organizadora).. 2001. Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia.

Outras participaçõesBESSA, T.; ALMEIDA, M. C. C.; ALCANTARA, L. C. J.. Banca de seleção de alunos de mestrado e doutorado para o

Curso de pós graduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ. 2013. Centro dePesquisas Gonçalo Moniz.

VERAS, P.; ALMEIDA, M. C. C.; ALCANTARA, L. C. J.. Seleção de alunos de mestrado e doutorado para o Cursode PósGraduação em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ. 2012. Centro dePesquisas Gonçalo Moniz.

ALCANTARA, L. C. J.. Banca de seleção para professor assistente da disciplina Virologia. 2005. FundaçãoBahiana para Desenvolvimento das Ciências.

Eventos

Participação em eventos, congressos, exposições e feiras

19th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2014.(Outra).

16th International Conference on Human Retrovirology: HTLV and Related Viruses. HTLV in Brazil. 2013.(Congresso).

I Simpósio de Genômica Funcional e Biologia Sistêmica de Microorgan.Métodos de Análises de Sequências. 2013.(Simpósio).




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2 BIO Reunião " A Bioinformática no Século 21". 2012. (Encontro).

Sessões Científicas. O reverso genético do HTLV1 em pacientes infectados. 2011. (Olimpíada).

I Simpósio Paulista de HTLV. 2010. (Simpósio).

16th International BioInformatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Phylodynamicsanalysis of HIV1 strains in MothertoChild. 2010. (Oficina).

Workshop on Viruses, Genes and Cancer. 2010. (Outra).

I Congresso de Saúde do Sudoeste da Bahia:" Avanços e Desafios". Aspectos Sóciodemográficoas eSoroprevalência do HTLV em gestantes do Sul da Bahia. 2009. (Congresso).

16 HIV Dynamics and Evolution.Choosing the most frequent codons in the host genes could not be an intelligentchoice for virus adaptation. 2009. (Seminário).


14th International Bio Informatics Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Avanços no estudoda Epidemiologia Molecular e Evolução dos Retrovírus Humanos no Brasil. 2008. (Simpósio).

13th HIV dynamics& Evolution. Epitope Mapping Viral sequences from Brazil for Vaccine Development. 2006.(Congresso).

Congresso da associação LatinoAmericana de Antropologia Biológica (a ser realizado). Tracing the posColumbian origin of the Brazilian HTLV1 strains using the viral and host genetic markers. 2006. (Congresso).

IX Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil.Molecular Epidemiology of HTLVI. 2006. (Simpósio).

12th International Bioinformatics workshop on virus evolution and molecular epidemiology.Professor. 2006.(Outra).

The AIDS Vaccine 2006 Conference.Mapping epitope candidates from HIV_ Brazilian sequences fpr vaccinedevelopment. 2006. (Outra).

8º Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil.The Genetic Characteristics Study of the Brazilian HTLV1isolates Suggests the Pre and Postocolombian Origin Of The Virus In This Country. 2005. (Simpósio).

VI Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS.Mapping the Genetic Characteristics of the Brazilian HIV1Strains Suggesting the Potential Epitope to Vaccine Candidate with the Development of the Viral BioinformaticsLaboratory at Salvador,Bahia,Brazil. 2005. (Simpósio).

VI Simpósio Brasileiro de Pesquisa em HIV/AIDS.The HIV1 Genetic Data Analysis is Essential for DevelopingBetter Treatment Strategies and for Selecting Strains for Vaccine Programs. 2005. (Simpósio).

VIII International Symposium abot HTLV1 in Brazil.Correlação Molecular entre Isolados de HTLVI Precedentesda África do Sul e de Salvador. 2005. (Simpósio).

V Mostra Científica e Cultural e III Jornada de Iniciação Científica/PIBIC.A Bioquímica do HTLV. 2005. (Oficina).

Educação em Transformação: Novas Metodologias e Formas de Avaliação II Fórum Pedagógico daFBDC/EBMSP.Utilização da Arte Dramática no Ensino de Bioquímica. 2005. (Oficina).

1º Seminário dos Centros Nacionais de Referência para Pesquisa e Assistência ao Paciente com HTLV.1ºSeminário dos Centros Nacionais de Referência para Pesquisa e Assistência ao Paciente com HTLV. 2004.(Seminário).



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Encontro SulAmericano de Pesquisadores do HTLVI/II.O Contexto do HTLV nos Países(Argentina,Chile,Peru,Colômbia,Venezuela e Brasil;Grupos de Trabalho (epidemiologia,PET/HAM,ATLL e outraspatologias;Virologia/Imunologia);Redação final do relatório. 2004. (Encontro).

Prata da Casa.Situação e Origem do HTLV1 em Salvador,cidade com maior prevalência no Brasil. 2004.(Encontro).

IV Mostra Científica e Cultural e II Jornada de Iniciação Científica.Mapeamento das características genéticasbrasileiras do HIV1 e do HTLV1 com a implantação do laboratório de bioinformática do LASP emSalvador,Bahia,Brasil. 2004. (Outra).

10th International Workshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology.Professor. 2004. (Outra).

Organização de eventos, congressos, exposições e feiras

ALCANTARA, L. C. J. ; SANTOS,L.A ; ARAUJO, T.H.A. ; REGO, F. F. A. ; OLIVEIRA, T. . 2º Workshop Internacionalde Bioinformática em Evolução e Biologia Molecular Viral. 2014. (Outro).

OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, LC . Bioinformatics in the Tropics Uganda 2014. 2014. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. ; RISTOW, P. ; OLIVEIRA, T. . 1º Workshop Internacional de Bioinformática em Evolução eBiologia Molecular Viral. 2013. (Outro).

OLIVEIRA, T. ; ALCANTARA, LUIZ C J . Bioinformatics in the tropics South Africa 2013. 2013. (Outro).

GALVAOCASTRO, B. ; ALCANTARA, L. C. J. . Bioinformatics capacity to HIV/AIDS research: datamanagement and data mining. 2007. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. . Training for database HIVBase use.. 2005. (Outro).

CASTRO FILHO, B. G. ; ALCANTARA, L. C. J. . Treinamento em bioinformática no Núcleo de Bioinformática paraestudo do HIV e HTLV no LASP/CPqGM/FIOCRUZ. 2004. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. ; GALVAOCASTRO, B. . Estudos Avançados em Bioinformática e Análises Genéticas eEvolutivas Virais. 2004. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. . Second Brazilian Workshop on virus Evolution and Molecular Epidemiology HIV andHTLV. 2004. (Outro).

ALCANTARA, L. C. J. . Course of Genic Therapy. 2004. (Outro).

GALVÃOCASTRO, B. ; ALCANTARA, L. C. J. ; BRÍGIDO, L. F. M. ; VANDAMME, A. M. . The First BrazilianWorkshop on Virus Evolution and Molecular Epidemiology. 2002. (Congresso).

ALCANTARA, L. C. J. . VI Simpósio Internacional sobre HTLV no Brasil. 2000. (Congresso).

Orientações

Orientações e supervisões em andamento

Dissertação de mestradoMurilo Freire Oliveira Araújo. Desenvolvimento de uma ferramenta de filotipagem para o Vírus Linfotrópico de








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CélulasT Humanas do Tipo 1 (HTLV1). Início: 2014. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e MedicinaInvestigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. (Orientador).

Vagner de Souza Fonseca. Desenvolvimento de uma ferramenta didática para avaliação de fatores de risco eprevenção de agentes causadores de doenças sexualmente transmissíveis: HIV1 e HTLV1. Início: 2014. Dissertação(Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, FundaçãoOswaldo Cruz. (Orientador).

Jaqueline Goes de Jesus. Avaliação da interação entre os produtos da ORF1 do HTLV1 com a proteína da célulahospedeira Paxilina.. Início: 2012. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. (Orientador).

Tese de doutoradoMaria Inés Valderrama Restovic. Desenvolvimento de uma Ferramenta de Filotipagem para o Vírus da Dengue.

Início: 2014. Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas GonçaloMoniz. (Orientador).

Adjile Edjide Roukiyath Amoussa. The origin of the HTLV1 in Brazil studying the connection between theWest and Southern Africa continent. Início: 2014. Tese (Doutorado em Patologia Humana) Universidade Federal daBahia, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Fernanda Khouri Barreto. Utilização do HTLV2 atenuado como vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV1.Início: 2013. Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas GonçaloMoniz. (Orientador).

Thessika Hialla Almeida Araújo. Caracterização de genomas completos do vírus linfotrópico de células T dotipo I (HTLV1) provenientes de pacientes com diferentes perfis clínicos. Início: 2012. Tese (Doutorado emBiotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo àPesquisa do Estado da Bahia. (Orientador).

Luciane Amorim Santos. Identificação de SNPs no genoma da Leptospira interrogans sorovar Copenhageni epossível associação ao desfecho clínico e Síndrome Hemorrágica Pulmonar. Início: 2011. Tese (Doutorado emBiotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. (Orientador).

FILIPE FERREIRA DE ALMEIDA REGO. Correlação entre análise in vitro das mutações na região LTR do HTLV1com diferentes perfis clínicos e carga proviral dos indivíduos infectados. Início: 2010. Tese (Doutorado emBiotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Coordenação deAperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Orientador).

Supervisão de pósdoutoradoMarcia Weber Carneiro. Utilização do HTLV2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV1.

Início: 2014. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior.

Iniciação científicaAline Dórea Luz Menezes. Caracterização molecular dos genomas completos do HTLV1 provenientes de pacientes

com diferentes perfis clínicos. Início: 2014 Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa daBahia. (Orientador).

Bruna de Sousa Carvalho Reis. Análise Funcional de Mutações na Glicoproteína de superfície do HTLV1. Início:2013 Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico.(Orientador).

Orientações de outra natureza







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Túlio de Paiva Nazareth Andrade de Oliveira. The tale of two interlinked epidemics: The origin and clinicalrelationship of the African and Brazilian HIV1 and HTLV1 epidemics. Início: 2013. Orientação de outra natureza.Nelson Mandela Medical School Durban,NMMS,África do Sul. Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico eTecnológico. (Orientador).

Orientações e supervisões concluídas

Dissertação de mestradoMarcio de Oliveira Silva. Avaliação da história epidemiológica da infecção pelo HIV1 no estado da Bahia

Brasil.. 2012. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) Centro de PesquisasGonçalo Moniz, . Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Sara Nunes Vaz. EVOLUÇÃO DOS VÍRUS HIV1 E HTLV1 EM CRIANÇAS E ADOLESCENTES COINFECTADOS EMSALVADORBAHIA. 2012. Dissertação (Mestrado em Medicina e Saúde (Curso Novo)) Universidade Federal da Bahia,. Coorientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Fernanda Khouri Barreto. Utilização do HTLV2 pseudotipado como vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV1. 2011. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Fundação Oswaldo Cruz,Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Thessika Hialla Almeida Araújo. DESENVOLVIMENTO DE UM BANCO DE DADOS (HTLV1 MOLECULAREPIDEMIOLOGY DATABASE) PARA DATAMINING E DATA MANAGEMENT DE SEQUÊNCIAS DO HTLV1. 2011. Dissertação(Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Fundação Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz.Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Domingos Ramon Moreau da Cunha. LASPHIV1RESToll: Desenvolvimento de uma ferramenta debioinformática a para análise de resistência do HIV1. 2010. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em saúde emedicina investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia.Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Luciane Amorim Santos. Uso de Ferramentas de Bioinformática para Estudos de Epidemiologia Molecular,Filogeografia e Filodinâmica Viral. 2010. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Fundação Oswaldo Cruz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Luiz CarlosJúnior Alcântara.

FILIPE FERREIRA DE ALMEIDA REGO. Mutações na Região LTR do HTLV e sua implicação na presença do vírus nasaliva e origem na Bahia. 2010. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia em Saude e Medicina Investigativa) Centrode Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Giselle Calazans de Souza Costa. Investigação das Correlações entre os Polimorfismos nas RegiõesPromotoras e Regulatórias do Gene Humano GLUT1,a Expressão e Exposição de Proteína na Membrana e oDesenvolvimento de TSP/HAM em Indivíduos Infectados por HTLV1. 2007. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia emSaúde e Medicina Investigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz/Fundação Oswaldo Cruz /BA, Fundação deAmparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

EDSON DE SOUZA SANTOS. ANÁLISE GENOTÍPICA DOS ISOLADOS DO HIV1 NA TRANSMISSÃO VERTICAL. 2007.Dissertação (Mestrado em Medicina e Saúde Humana) Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública, . Orientador:Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Aline Cristina Andrade Mota Miranda. Caracterização das mutações nos dominios imunodominantes daglicoproteina de superficie (gp46) do HTLV1 e sua contribuição para o padrão soroindeterminado no Western Blot..2007. Dissertação (Mestrado em Mestrado Acadêmico em Biotecnologia e Medicina Inv) Centro de PesquisasGonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Víctor José Uchôa Carvalho. Análise Clínica das Manifestações Orais e Investigação Laboratorial da SecreçãoSalivar em Pacientes Portadores de HTLV1 com Síndrome de SJÖGREN. 2006. Dissertação (Mestrado em Medicina esaúde humana) Escola Baiana de Medicina e Saúde Pública, . Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.









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Tese de doutoradoGiselle Calasans de Souza Costa. Investigação de mutações nos genes da CCR5 e da Langerina e sua

associação com a infecção pelo HIV1. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologia em saúde e medicina investigativa) Fundação Oswaldo Cruz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Luiz Carlos JúniorAlcântara.

Aline Cristina Andrade Mota Miranda. Estudo molecular de proteínas estruturais (gp21 e gp46) e regulatórias(HBZ) do HTLV1 em indivíduos com diferentes perfis clínicos. 2012. Tese (Doutorado em Biotecnologia em saúde emedicina investigativa) Laboratório Avançado de Saúde Pública Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz Fun, .Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Joana Paixão Monteiro. Análise da variabilidade genética do Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) Epidemiologia molecular no estado da Bahia. 2009. Tese (Doutorado em Biotecnologia em Saúde e MedicinaInvestigativa) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Luiz Carlos JúniorAlcântara.

Marco Antonio Gomes Mello. Soroprevalência e subtipagem do vírus linfotrópico de células T humanas (HTLV) eavaliação da transmissão maternofetal em gestantes da região sul da Bahia. 2009. Tese (Doutorado emBiotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa) Fundação Oswaldo Cruz, . Orientador: Luiz Carlos JúniorAlcântara.

Sandra Rocha Gadelha. Estudo do Polimorfismo nos Promotores de IL2, RIL2 e IL6 em Indivíduos Infectados como HTLV1, Sintomáticos e Assintomáticos, em Salvador, Bahia, Brasil. 2007. Tese (Doutorado em Patologia humana) Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ Salvador, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal deNível Superior. Coorientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Adriano Fernando da Silva Araújo. Análise proteômica e funcional da alça V3 da gp120 dos isolados do HIV1 deSalvadorBA e do domínio Nterminal do receptor de quimiocina CCR5 de pacientes infectados e não infectados.2007. Tese (Doutorado em Biotecnologia e Medicina Investigativa (CPqGM)) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz,Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Augusto César de Andrade Mota. Estudo de Casocontrole dos Determinantes de Risco da Infecção pelo HTLVem Doadores de Sangue no Estado da Bahia.. 2006. Tese (Doutorado em Medicina e Saúde Humana) Escola Baianade Medicina e Saúde Pública, . Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Sérgio de Araújo Pereira. Estudo do Polimorfismo Genetico da Região LTR dos Isolados do HTLV1 Provenientesde Indivíduos Infectados com o HTLV1, Sintomáticos e Assintomáticos, em Salvador, Bahia, Brasil. 2003. Tese(Doutorado em Biologia Celular e Molecular) Fundação Oswaldo Cruz, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoalde Nível Superior. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Supervisão de pósdoutoradoJoana Paixão Monteiro Cunha. 2009. Fundação Oswaldo Cruz, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da

Bahia. Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Diego Gervásio Frias. 2008. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, . Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Trabalho de conclusão de curso de graduaçãoChandra Mara de Carvalho. Mapeando as Características genéticas das sequências de HIV1 gene gag) no Brasil

com o desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador ,Bahia, Brasil. 2006. Trabalho deConclusão de Curso. (Graduação em biologia) Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ Salvador,Ministério da Saúde. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.







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Iniciação científicaMarielle de Freitas Guimarães. Análise Funcional de Mutações na glicoproteina de superfície do HTLV1. 2013.

Iniciação Científica Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico eTecnológico. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Stephane Fraga Tosta. Utilização do HTLV2 atenuado vomo vetor vacinal contra a infecção pelo HTLV1. 2013.Iniciação Científica Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia. Orientador: LuizCarlos Júnior Alcântara.

Luis Felipe Ivanoff de Menezes. Caracterização Molecular do Genoma Completo do HTLV1. 2012. IniciaçãoCientífica. (Graduando em Biomedicina) Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa daBahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Loianna Mascarenhas da Fonseca. UTILIZAÇÃO DO HTLV2 PSEUDOTIPADO COMO VETOR VACINAL CONTRA AINFECÇÃO PELO HTLV1. 2012. Iniciação Científica Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo àPesquisa da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Matheus Santos Rodrigues Silva. Correlação entre análise in vitro das mutações na região LTR do HTLV1 comdiferentes perfis clínicos e carga proviral dos indivíduos infectados. 2012. Iniciação Científica Escola Bahiana deMedicina e Saúde Pública, Fundação de Amparo à Pesquisa da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Ricardo dos Santos Almeida Nunes. AVALIAÇÃO DA HISTÓRIA EPIDEMIOLÓGICA DA INFECÇÃO PELO HIV1 NOESTADO DA BAHIA BRASIL. 2012. Iniciação Científica Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública, Fundação deAmparo à Pesquisa da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Erika Andrade Rocha. AVALIAÇÃO DA HISTÓRIA EPIDEMIOLÓGICA DA INFECÇÃO PELO HIV1 NO ESTADO DABAHIA BRASIL. 2012. Iniciação Científica Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação de Amparo à Pesquisa daBahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Fernanda Khouri Barreto. Caracterização Molecular da Glicoproteína de Superfície (gp46) do HTLV1 emindivíduos assintomáticos e com HAM/TSP. 2011. Iniciação Científica Fundação Oswaldo Cruz, Fundação de Amparoà Pesquisa da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Jaqueline Goes de Jesus. INVESTIGAÇÃO DE MUTAÇÕES NO GENE CODIFICANTE DA PROTEÍNA LANGERINA EMINDIVÍDUOS INFECTADOS PELO HIV1. 2010. Iniciação Científica Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz, Fundação deAmparo à Pesquisa da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Aline Cristina Andrade Mota Miranda. Mapeando as Características genéticas das sequências de HTLV1 noBrasil com o desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador, Bahia, Brasil. 2007. IniciaçãoCientífica. (Graduando em Biomedicina) Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ Salvador,Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Artur Trancoso Lopo de Queiroz. Mapeando as Características genéticas das sequências de HIV1 no Brasil como desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador ,Bahia, Brasil. 2007. Iniciação Científica.(Graduando em Biomedicina) Laboratorio Avancado de Saude Publica/CPqGM/FIOCRUZ Salvador, Ministério daSaúde. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Giselle Calazans de Souza Costa. Correlações do Polimorfismo Genético do Vírus Linfotrópico de Células THumanas do Tipo I (HTLVI) como o Polimorfismo dos genes do Hospedeiro Envolvidos no Desenvolvimento deHAM/TSP em, Salvador. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Biologia) Universidade Federal da Bahia.Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Vinícius Alencar Fernandes da Silva. Desenvolvimento de uma nova ferramenta de bioinformática para seleçãode regiões protéicas potenciais dos isolados brasileiros do HIV1, para dar suporte aos projetos de prótotipos vacinaisligados ao PNDST/AIDS, MS.. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) Escola Bahiana de Medicina eSaúde Pública, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Gabriel Muricy Cunha. Investigação da correlação entre polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias daproteína GLUT1.. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Biomedicina) Escola Bahiana de Medicina e SaúdePública. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.



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Saul Vislei Simões da Silva. Determinação de Polimorfismos nas regiões promotoras dos genes de IL2 ereceptor de IL2 em indivíduos infectados pelo Vírus Linfotrópico de CélulasT Humanas do Tipo I (HTLVI) e estudode correlação entre os polimorfismos detectados e o desenvolvimento de Paraparesia Espástica Tropical/MielopatiaAssociada ao HTLVI (TSP/HAM) . 2006. Iniciação Científica. (Graduando em farmácia) . Orientador: Luiz Carlos JúniorAlcântara.

Ricardo Durães de Carvalho. Correlação entre polimorfismos nas regiões promotora e regulatórias do gene daGLUT1, expressão e exposição da proteína na membrana e o desenvolvimento de TSP/HAM em indivíduos infectadospelo HTLVI. 2006. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) Instituto Mantenedor de Ensino Superior da Bahia.Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Maria Fernanda de Oliveira Barros. Estudo dos casos Taxdefectivos nos indivíduos HTLV1 positivos, comsorologia indeterminada no WesternBlot.. 2005. Iniciação Científica Centro de Pesquisa Gonçalo MonizFIOCRUZ,Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Chandra Mara Carvalho. Mapeando as Características genéticas das correntes de HIV1 e HTLV1 no Brasil como desenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador,Bahia,Brasil. 2005. Iniciação Científica.(Graduando em Biologia) Universidade Federal da Bahia. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Luciane Amorim Santos. Mapeando as Características genéticas das sequências de HIV1 no Brasil com odesenvolvimento do Laboratório de Bioinformática Viral em Salvador,Bahia,Brasil. 2005. Iniciação Científica.(Graduando em Biomedicina) Centro de Pesquisa Gonçalo MonizFIOCRUZ, Ministério da Saúde. Orientador: LuizCarlos Júnior Alcântara.

Fred Luciano Neves Santos. Impacto do HTLVI na origem e evolução da epidemia e na imunogênese da doença.1999. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Farmácia) Universidade Federal da Bahia, Conselho Nacional deDesenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

César Augusto Costa Machado. Diversidade filogenética do HTLVI no Brasil e correlações com as devidasmanifestações clínicas. 1998. 0 f. Iniciação Científica. (Graduando em Medicina) Escola Baiana de Medicina e SaúdePública, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Orientador: Luiz Carlos Júnior Alcântara.

Inovação

Projetos de pesquisa

Projeto de extensão

Outras informações relevantes

PESQUISADOR EM PRODUTIVIDADE E PESQUISA DO CNPQ ‐ NÍVEL 2 ATUAÇÃO ATUAL: 1 ‐ PesquisadorTitular do LHGB/CpQGM/FIOCRUZ, 2 ‐ Coordenador do Núcleo de bioinformática da Pós‐Graduaçãoem Biotecnologia em Saúde e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ, 3 ‐ ProfessorVisitante de Bioquímica e Bioinformática da UEFS, 4 ‐ Professor permanente/vice coordenadorNRD6 do curso de pós‐graduação em Biotecnologia e Medicina Investigativa do CPqGM/FIOCRUZ.5 ‐ Professor permanente do curso de pós‐graduação em Patologia humana e experimental daFIOCRUZ/UFBA, 6 ‐ Editor da revista Indexada "The Scientific World Journal" e Revisor ADHOC das Revistas indexadas PlosOne, PlosNTD, Journal of Medical Virology, Aids Research andHuman Retroviruses, Retrovirology, Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, Jornal of GeneralVirology etc; 7‐Organizador do evento seriado no Brasil: "Workshop Internacional deBioinformática em Evolução e Biologia Molecular Viral"; e 8‐ Professor do WorkshopInternacional de Bioinformática que é organizado anualmente em diferentes países pela Dra.Anne‐Mieke Vandamme do Rega Institute, Bélgica. ‐ Membro do Colegiado da Pós Graduação emBiotecnologia ‐ FIOCRUZ‐BA ‐ Membro do Conselho de Ética em Pesquisa ‐ FIOCRUZ‐BA ‐ Membro



da Comissão de Seleção de Iniciação Científica‐ FAPESB ‐ Membro da Comissão de Seleção deProjetos (PIBIC) ‐ FIOCRUZ

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