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Genética bacteriana Prof. Adj. Ary Fernandes Junior Departamento de Microbiologia e Imunologia IBB/UNESP ary@ibb.unesp.br

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Genética bacteriana

Prof. Adj. Ary Fernandes Junior

Departamento de Microbiologia e Imunologia

IBB/UNESP

[email protected]

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Genes pertencentes a uma determinada célula de um organismo podem ser inseridos e expressos em células de outro organismo.

Células geneticamente modificadas podem ser utilizadas para produzir uma grande variedade de produtos úteis.

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Replicação do DNA

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Replicação bidirecional de uma molécula circular de

DNA bacteriano

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Bactérias: Onde encontramos genes?????????

DNA Bacteriano, Plasmídios Replicons

DNA Fágico Transposons

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Variações Temporárias (Sem alterações no genoma) (Alterações Fenotípicas)

- Produção de beta galactosidase quando tem lactose no meio (regulação gênica)

Fisiológicas

-Serratia marcescens: 37º C – sem pigmento; 25º C – vermelhas,

-Bacillus sphaericus: 2% peptona (células vegetativas) 0,1% peptona (esporos)

- Azomonas x sacarose x cápsula

Morfológicas

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Variações Permanentes Com alterações no genoma)

(Alterações genotípicas)

DNA externo = DNA Exogenoto

-Transformação;

- Conjugação;

- Transdução

Mutação e Recombinação Genética

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Ahmed ety al. Nature Reviews Microbiology 6, 387-394 (May 2008)

A absorção de elementos genéticos móveis (fagos, plasmídeos de virulência, ilhas de patogenicidade), e perda de porções de DNA-cromossômico em linhagens distintas de E. coli, possibilitou surgimento de clones

de diferentes patotipos de E. coli associados a sintomas de doenças específicas. LEE - locus of enterocyte effacement; PAIs - pathogenicity island; pEAF - enteropathogenic E. coli adhesion

factor plasmid; pENT- enterotoxin-encoding plasmids; Stx - Shiga-toxin-encoding bacteriophage.

(ETEC – Enterotoxigênica E. coli)

(EIEC – Enteroinvasiva E. coli)

(UPEC-Uropatogênica E. coli)

(EPEC – Enteropatogênica E. coli)

(EHEC – Enterohemorrágica E. coli) (atualmente já se fala em STEC)

E. coli comensal

Plasmídeos Ilhas de patogenicidade

Outras E. coli -APEC -NMEC, -STEC, etc

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1. População de uma

bactéria em processo de

multiplicação

minutos , horas, dias, meses

tempo

2. Processo de crescimento e

divisão produzem naturalmente

células mutantes

3. População continua multiplicação,

e originando ocasionalmente, mais

células mutantes

Células são expostas a

um composto

antimicrobiano

Pressão seletiva

4. Células são mortas ou impedidas de

multiplicação pela antimicrobiano com

exceção dos mutantes resistentes ao

antimicrobiano específico.

5. Os mutantes continuam com o

crescimento na presença do

antimicrobiano e iniciam dispersão pelo

ambiente

Variação permanente resultante de Mutação

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Mutação cria variação

Mutação desfavorável é selecionada contra

Ocorre reprodução e mutação

Com a mutação favorável é provável que o mutante

sobreviva...

....e se reproduza

Variação permanente resultante de Mutação

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Variação permanente resultante de Recombinação Genética

1. Duas populações bacterianas A e B

crescem em um mesmo ambiente. A

espécie B é resistente a droga X.

2. Troca de DNA (elementos genéticos

móveis) ocorre entre células em baixa

frequência.

3. Células da espécie A recebem o gen de

resistência a droga X, presente no

elemento genético móvel da espécie B.

Pressão seletiva

Bactérias são

expostas a droga X. 4. Na presença da droga X, as células da

espécie A que receberam gen da

resistência da espécie B são capazes de

multiplicar-se enquanto que as células

originalmente sensíveis não multiplicam-

se.

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“Alteração brusca no material genético” “Alteração hereditária em uma sequência de bases do DNA”

Mutante

Natural (10-6 a 10-10 ) Adquirida ou Induzida (Agentes Físicos e Químicos)

MUTAÇÃO

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Klebsiella pneumoniae (Aspecto mucóide (molhado)

de colônias) Variação S R

Variação S (Smooth) R (Rough) em Klebsiella pneumoniae por mutação

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Modelo um passo (“one step”) (apenas um gen envolvido)

ex. estreptomicina

Modelo vários passos (“multi step”) (vários genes envolvidos)

ex. penicilina

Resistência à drogas antimicrobianas por mutação (Tipo Cromossômica)

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“Moléculas distintas de DNA são combinadas numa mesma molécula, graças a um processo físico de quebra e ligação

destas moléculas”

RECOMBINAÇÃO GENÉTICA: Doadora Receptora

DNA externo = DNA Exogenoto Destinos possíveis (??????)

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TRANSFORMAÇÃO (Griffith-1928) (Reversão Pneumocócica (R S) (Rough – Smooth)

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“Incorporação de DNA solúvel” (Lise ou Liberação Espontânea)

(Plasmídeos são passíveis de transferência também)

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Condições para ocorrer a transformação

DNA homólogo,

Dupla fita e PM elevado (105 a 107),

Meio sem DNAase

(DNA solúvel, Qualquer momento, Determinado estágio do

ciclo celular, Condições Especiais)

Bactéria Receptora em Estado de Competência Fisiológica

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Transformação

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CONJUGAÇÃO (Tatum e Lederberg - 1947 - E.coli)

“Transferência através de comunicação entre as duas bactérias”

(Unidirecional)

Pili (Gram negativa) Ponte de conjugação

(Gram positiva)

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Conjugação de Gram negativa

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Enterococcus faecalis pheromone-responsive conjugative system. Pheromone A released from the potential recipient cell (right) interacts with plasmid A in the potential donor cell (left)

to induce synthesis of aggregation substance. Attachment of aggregation substance to binding substance causes the cells to clump into visible aggregates. Once the pheromone-responsive plasmid A has transferred from donor to

recipient cell, synthesis of pheromone A is shut off.

Doadora Receptora

Conjugação de Gram positiva

Adaptado de Murray, B.E. (1998)

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Processo mediado por Plasmídeos (Ex. Plasmídeo R=Resistência à drogas, F=Fertilidadede, Virulência,

Metabólico, Col, Críptico, etc)

Obs. DNA cromossômico também pode ser transferido durante a conjugação.

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Plasmídeo R = Plasmídeo tipo conjugativo

Obs. Possivel perda do fator de resistência (“Cura”) (Repiques frequentes, uso de substâncias químicas, etc)

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TRANSDUÇÃO ( Zinder e Lederberg - 1952)

Transferência (DNA bacteriano e Plasmídios) ocorre por meio de um vírus (Bacteriófago)

Um fago infecta a célula bacteriana doadora

O DNA e proteínas do fago são produzidos, e o DNA bacteriano quebrado em fragmentos.

Ocasionalmente, durante a montagem do fago, fragmentos do DNA bacteriano são empacotados no capsídeo do fago. Então a célula doadora é lisada e as partículas de fago são liberados.

Um fago carreando o DNA bacteriano infecta a nova célula hospedeira, a célula receptora.

A recombinação pode ocorrer, produzindo uma célula recombinante com um genótipo diferente da célula doadora e da célula receptora.

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Ciclo Lítico (vírus virulento)

Ciclo Lisogênico (vírus temperado)

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Transposon Genes Saltadores, Elementos Móveis ou “Jumping genes”

Codificam Resistência a Drogas, Síntese de Toxinas e

Enzimas Degradantes.

Encontrados tanto em DNA cromossômico como em

Plasmídios

Tem sequência (de Inserção) que codifica enzima

Transposase (Transposição )

Interfere com sequência linear do gene

Mutação, Inativação ou Quebra;

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Interação entre DNA e Proteínas Reguladoras Regulam síntese de RNAm e Atividade de enzimas

específicas

Regulação da Expressão Gênica

Evitar síntese desnecessária de metabólitos, desperdício energético, acúmulo intracelular

de metabólitos tóxicos.

(Ex. Operon Lac em E.coli ( Operon indutível); Operon Trp de E. coli (Operon repressível)

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Operon Lac de E. coli (Operon indutível)

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Operon Lac de E. coli (Operon indutível)

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Operon Lac de E. coli (Operon indutível)

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Operon Trp de E. coli (Operon repressível)

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Operon Trp de E. coli (Operon repressível)

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Operon Trp de E. coli (Operon repressível)