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O Gráfico do Ciclo de Vida Módulo 10

O Gráfico do Ciclo de Vida - ULisboamcgomes/aulas/dinpop/Mod10/Slides.pdf · Ciclo de Vida por idades Pressuposto: homogeneidade de taxas vitais intra-idades Ciclo de vida ... Tartaruga

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O Gráfico do Ciclo de

Vida

Módulo 10

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Ciclo de Vida por idades

Pressuposto:

homogeneidade de taxas vitais

intra-idades

Ciclo de vida

i = 1 2 3 4

x = 1 2 3 4 0

Estádios

Idades

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Dificuldades com a idade

1. Nem sempre é possivel determinar a idade

2. Ciclos de vida complexos – e.g. reprodução sexuada + reprodução vegetativa

3. As taxas vitais estão melhor associadas a outras

variáveis (e.g. tamanho corporal ou o estádio de

desenvolvimento).

O crescimento por vezes é muito plástico e indivds com idade igual têm tamanho muito diferente.

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Divisão do Ciclo de Vida

1. Indivíduos do mesmo estádio devem ter taxas demográficas mto parecidas. 2. Os estádios são exclusivos e exaustivos

Critérios para a divisão do CV

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O gráfico do ciclo de vida (GCV)

Representação do ciclo de vida dividido em estádios

O Gráfico do Ciclo de Vida

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2 Exemplos

1 2 3

3 Estádios Estádios 2 e 3

reproduzem-se Recém-nascidos

entram no estádio 1 nódulos

Arcos

1 2 3

Os indivíduos permanecem no mesmo estádio quando se avança de t para t+1

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Outro exemplo

5 Estádios Estádio 5 tem reprodução sexuada Estádio 4 tem reprodução vegetativa

1

2

3

45

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Regras para o GCV

1. Associar cada estádio a um nódulo. Numerar os nódulos i = 1, 2 ... s. 2. Desenhar um arco, a unir o nódulo i ao nódulo j se indivíduos no estádio i podem contribuir com indivíduos (por crescimento ou reprodução) para o estádio j no intervalo de projecção (t, t+1).

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Nomenclatura

1 2 3 4

Trajectória - sequência de arcos seguindo a direcção das

setas

Comprimento de uma trajectória - número de arcos que a

trajectória tem

Loop - trajectória que termina e acaba no mesmo nódulo

Auto-loop - loop de comprimento 1, ligando um nódulo a si

próprio

Trajectoria de

comprimento 3

Loop de

comprimento 3

Autoloop

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O GCV e a matriz de projecção

Cada GCV origina uma matriz de projecção

Lefkovitch (1965)

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Arcos do GCV: a 1ª regra

1 2 3 4

Identificar o arco que vai do nódulo j para i por aij

aij = Núm indivs de j que transitam para (ou nascem em) i, por indivíduo de j, durante o intervalo (t, t+1).

a14 a13

a44

a21 a32 a43

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Elementos da matriz: a 2ª regra

A matriz de projecção é quadrada Dimensão = número de nódulos do GCV

O elemento da coluna j, linha i, é o próprio aij

1 2 3 4

a14a13

a44

a21 a32 a43

a14a13

a44

a21 a32 a43

4443

32

21

1413

00

000

000

00

aa

a

a

aa

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2 exemplos

1 2 3

00

00

0

32

21

1312

a

a

aa

A

a13 a12

a21 a32

1 2 3

3332

2221

131211

0

0

aa

aa

aaa

A

a12 a13

a21 a32

a11 a22 a33

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Outro exemplo

1

2

3

45

0000

000

000

0000

0000

54

4342

3431

21

15

a

aa

aa

a

a

A

a15

a21

a31

a34

a42

a43

a54

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Comparação de definições (sobrevivência )

Probabilidade de que 1 indivíduo no estádio i, no instante t, sobreviva e esteja no estádio i+1 no census de t+1

Pi

aij = Núm indivs de j que transitam para i, por indivíduo de j, durante (t, t+1).

aij generaliza a transição de i para i+1 para: de i para j

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Comparação de definições (Reprodução )

Número filhas viáveis duma fêmea no estádio i, produzidas durante o intervalo de projecção (t, t+1).

Fi

aij = Núm indivs que nascem em i, por indivíduo de j, durante (t, t+1).

aij refere-se a qquer sexo e inclui clones Os descendentes podem aparecer em qquer i

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Metodologia geral

Divisão do CV

Construção do GCV

Construção da matriz generalizada de projecção (MGP)

Ciclo de vida 1 2 3 4

1 2 3

00

00

0

32

21

1312

a

a

aa

A

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Regras sobre o intervalo de

projecção

O intervalo de projecção (t, t+1) é sempre constante Duração intervalo projecção Duração do menor estádio

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As regras de projecção

aplicam-se

sN

N

N

...

2

1Dados:

, A

tNANt 1

tnt NANn

é o primeiro autovalor de A

DEE é o correspondente autovector

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Atribuição de valores aos aij

Seguir as transições dos indivíduos entre estádios de t para t+1, mas ...

Alguns indivíduos não mudam de estádio

Um estádio pode ter continuidade em 2 (ou +) estádios diferentes

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t t+1

N 1 N 1

N 2 N 2

N 3 N 3

N 4 N 4

m11

m21 mij = Núm indivíduos que passou de j para i (em t, t+1)

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Organização dos dados

1 2 3 4

Total 10 30 20 16

1 3

2 4 15

3 8 12

4 1 3 4

Mortes 3 6 5 12

Estádios (j) em t

Estádios (i) em t+1

m21 m33

ijjj

ij

ijmmm

ma

...21

indivíduos de j que passaram para i =

total de indivíduos em j no instante t

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Exemplificação numérica 1 2 3 4

Total 10 30 20 16

1 3

2 4 15

3 8 12

4 1 3 4

Mortes 3 6 5 12

3.010

311 a 5.0

30

1522 a

Etc.

25.015.003.00

06.027.00

005.04.0

0003.0

A

4.0

10

421 a

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Várias transições

ijt mM

t t+1 t+2 t+3 Mt Mt+1 Mt+2

M = Mt + Mt+1 + Mt+2

ijjj

ij

ijmmm

ma

...21

Usar A partir de M

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Fertilidade

1 2 3 4

1 402

3

4

Estádios parentais em t

Estádios receptores em t+1

1 2 3 4

Total 10 30 20 16

1 3

2 4 15

3 8 12

4 1 3 4

Mortes 3 6 5 12

Fertilidade em (t, t+1)

16

405.2

25.015.003.00

06.027.00

005.04.0

5.2003.0

A

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Situação frequente

Tartaruga marinha

Caretta caretta

Duração do

Estádio Estádio (anos) Sobrevivência Fertilidade

Ovos 1 0.6747 0

Juvenis pequenos 7 0.7857 0

Juvenis grandes 8 0.6758 0

Subadultos 6 0.7425 0

Adultos >30 0.8091 179.4

aij

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Adaptações da definição de aij

aij = Núm indivs de j que transitam para i, por indivíduo de j, durante (t, t+1).

aij = Probab de um indiv “estar pronto para transitar” de j para i x Probab de sobreviver durante (t, t+1).

“Estar pronto para transitar” = ter vivido número mínimo de unidades de tempo em i

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Probab de um indiv ter vivido n-1 unidades tempo dentro do estádio j

n = número de unidades de tempo em que o estádio é dividido

S = taxa de sobrevivência por unidade tempo, dentro do estádio j

Probabilidade de estar pronto para transitar para

fora do estádio j

n

n

jS

SSF

1

1 1

SFa jij Probab de estar pronto para transitar para fora de j e sobreviver durante (t, t+1)

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000

0000

0000

00000

00000

0000

532,6

42,5

65

2

1

21

PMM

PM

FF

P

P

FF

Heterogeneidade espacial

Matriz de Leslie

Matriz de Leslie

1 2 3

4 5 6