CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS - ufrgs.br · NOMENCLATURA DOS VÍRUS Universidade...

Preview:

Citation preview

CLASSIFICAÇÃO E

NOMENCLATURA DOS VÍRUS

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Ciências Básicas da Saúde

Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia

Disciplina de Virologia Básica

Equipe de Virologia ICBS/UFRGS

LABVIR

CLASSIFICAÇÃO E NOMENCLATURA DOS VÍRUS

ICTV, 2013

http://www.ictvonline.org/index.asp

Classificação definida pelo:

Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV)

ICTVdB - The Universal Virus Database

International Committee on

Taxonomy of Viruses

Taxonomia

Ordem

Família

Subfamília

Gênero

...virales

...viridae

...virinae

...virus

Mononegavirales

Paramyxoviridae

Paramyxovirinae

Morbillivirus

vírus da cinomose canina Espécie

Exemplos:

1. Família Poxviridae, sub-família Chordopoxvirinae, gênero Orthopoxvirus, vírus vaccínia.

2. Família Herpesviridae, sub-família Alphaherpesvirinae, gênero Simplexvirus,

herpes vírus humano 2 (vírus do herpes simples 2).

Como se escreve?

No uso vernacular informal, deve-se substituir o uso de "ph" por "f" e o

do "y" por "i", e deve-se usar assento quando apropriado.

Por exemplo: alfaherpesvírus, paramixovírus, aftovírus.

Fonte: Cornelia Büchen- Osmond, ICTV

Família

Características estruturais;

Morfológicas;

Genéticas;

Biológicas em comum.

Família Herpesviridae

Possuem vírions grandes;

Com envelope contendo várias glicoproteínas;

Capsídeo icosaédrico;

Uma camada protéica – denominada tegumento – entre o

capsídeo e o envelope;

DNA de fita dupla linear;

Capazes de estabelecer latência.

Família

Subfamília

Gêneros

Espécies

BoHV-1 BoHV-5 SuHV-1

Herpesviridae

Alphaherpesvirinae Betaherpesvirinae Gammaherpesvirinae

Simplexvirus Varicellovirus

“Espécie de vírus é uma classe politética de vírus

que constitui uma linhagem replicativa e ocupa

um nicho ecológico particular”

“A classificação em subespécies, cepas, variantes e

isolados não existe de forma oficial, embora sua

importância seja reconhecida para o diagnóstico,

para estudos biológicos e moleculares e também

para a produção de vacinas.”

O termo isolado (ou amostra) refere-se a um vírus

que foi obtido por isolamento de uma

determinada fonte de infecção (animal infectado).

O termo cepa é utilizado para designar amostras de

vírus que já foram bem caracterizadas e sobre as

quais já se possui certo conhecimento.

Classificação viral

Estrutura (morfologia): Forma

Tamanho

Simetria

Envelope

Estrutura do genoma

Propriedades físicas : Sensibilidade a agentes físicos e químicos

Relações antigênicas

Propriedades biológicas Estratégias de replicação

Gama de hospedeiros

Modo de transmissão

Patogenicidade

A classificação em espécies, embora

não regulamentada pelo ICTV, segue

os seguintes critérios:

• a) homologia da sequência;

• b) hospedeiros;

• c) tropismo de tecido e células;

• d) patogenicidade;

• e) forma de transmissão;

• f) propriedades físico-químicas;

• g) propriedades antigênicas.

Uma outra classificação prática, não oficial:

• Respiratórios: vírus que penetram no hospedeiro por inalação e

produzem infecção e doença primariamente no trato respiratório.

Ex: rinovírus, calicivírus;

• Entéricos: vírus que penetram pela via oral e replicam no trato

intestinal. Ex: coronavírus, rotavírus;

• Arbovírus: vírus que replicam e são transmitidos por vetores

artrópodos. Ex: vírus da encefalites eqüinas leste e oeste;

• Vírus oncogênicos: vírus com potencial para induzir

transformação celular e tumores nos hospedeiros. Ex: retrovírus,

papilomavírus.

Famílias virais

• Vírus com genoma RNA de sentido positivo

• Vírus com genoma RNA de sentido negativo não-segmentado

• Vírus com genoma RNA de sentido negativo segmentado

• Vírus com genoma RNA de cadeia dupla

• Vírus com genoma RNA que realizam transcrição reversa

• Vírus com genoma DNA fita simples

• Vírus com genoma DNA fita dupla

Vírus com genoma RNA

de sentido positivo

Arteriviridae

Astroviridae

Caliciviridae

Hepeviridae

Coronaviridae

Picornaviridae

Flaviviridae

Togaviridae

CORONAVIRIDAE

-Envelope lipídico com peplômeros que projetam externamente (aspecto de coroa).

-Entre os vírus RNA é o que apresenta o maior genoma (27 a 32kb).

-Em humanos está relacionado a resfriados comuns.

Coronavirus:

•Vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV)

•Coronavírus humano (HuCoV)

•Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV)

•Torovirus:

•Torovirus: EToV; BToV; SToV e HToV

ssRNA(+)

Coronavírus

Infecção respiratória

Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV): doença respiratória severa na Ásia.

PICORNAVIRIDAE

- Gêneros: Hepatovirus (Hepatite A)

Enterovirus (enterovírus bovino, suíno B e humanos A, B, C e D)

Rinovirus (resfriados)

Aphtovirus (Febre Aftosa)

ssRNA(+)

Família Picornaviridae

Aphtovirus (febre aftosa)

-

FEBRE AFTOSA – efeitos indiretos no meio ambiente

-

FLAVIVIRIDAE

-Gêneros: Flavivirus : vírus da febre amarela (YFV),

vírus da dengue 1,2,3,4

Pestivius: Vírus da diarreia viral bovina

tipos 1 e 2 (BVDV1 e BVDV2)

Vírus da peste suína clássica (CSFV)

Hepacivirus: Hepatite C

- Estão classificados vários agentes de doenças hemorrágicas e encefalites transmitidas por

mosquitos.

ssRNA(+)

Há 390 milhões de pessoas infectadas pelo vírus da febre de

dengue todos os anos, refere um novo estudo. As alterações

climáticas e a urbanização são os fatores importantes na

incidência futura da doença. (OMS, 2013)

Vírus da dengue

Vírus com genoma RNA de fita simples não

segmentado, com polaridade negativa

Filoviridae

Paramyxoviridae

Rhabdoviridae

FILOVIRIDAE

Gêneros:

– Ebolavirus: vírus Ebola. Os vírus dessa família causam doenças

hemorrágicas em humanos.

ssRNA(-)

Paramyxoviridae

Paramyxovirinae: Respirovirus: parainfluenza bovina tipo 3.

Morbillivirus: cinomose, sarampo.

Rubulavirus: vírus da caxumba.

Pneumovirinae: Pneumovirus:

Vírus sincicial respiratório bovino (BRSV)

Metapneumovirus humano

Metapneumovírus aviário

ssRNA(+)

- Associados principalmente a doenças respiratórias identificadas em

mamíferos e aves.

Gêneros: Lyssavirus: Raiva (RV)

Vesiculovirus: vírus da estomatite vesicular (VSV)

- Característica morfológica lembrando um projétil de arma de fogo.

Rhabdoviridae ssRNA(-)

Vírus com genoma RNA de fita simples

segmentado

Arenaviridae

Orthomyxoviridae

Bunyaviridae

ORTHOMYXOVIRIDAE

- myxo = muco

Glicoproteínas hemaglutinina (HA) e neuraminidase (NE)

- Gêneros:

-Influenzavirus A (FluAV)

-Influenzavirus B (FluBV)

-Influenzavirus C (FluCV)

Genoma segmentado : FluAV – 8 seg.

FluBV – 7 seg.

FluCV – 6 seg.

Vírus com genoma RNA de fita dupla

Reoviridae

Birnaviridae

REOVIRIDAE

- Dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm)

- Gêneros: Orthoreovirus

Orbivirus (língua Azul)

Rotavirus

dsRNA

PATOGÊNESE

Os rotavírus aderem ao

epitélio do trato GI

(mucosa jejunal)‏

Danos da

região apical das

vilosidades

* *

Enterotoxina viral NSP4

Aumento da Motilidade e

Diminuição da Absorção

Zuckerman A et al, eds. Principles and Practice of Clinical Virology. 2nd ed. Londres: John Wiley & Sons; 990:182.

Fonte: Simone Guadagnucci Morillo

Vírus com genoma RNA de simples diplóide

(que fazem transcrição reversa)

Retroviridae

Retroviridae

- Replicação viral complexa; integra seu provírus ao DNA da

célula: infectam o hospedeiro para o resto da vida.

- Associados a doenças tumorais e imunossupressivas.

Orthoretrovirinae

Alpharetrovirus: leucose aviária (ALV)

Gammaretrovirus: leucose felina (FeLV)

Deltateretrovirus: leucose bovina (VLB)

Lentivirus: anemia infecciosa equina (EIAV)

imunodeficiência felina (FIV)

imunodeficiência humana (HIV)

ssRNA (RT)

Imunodeficiência humana (HIV)

Vírus com genoma DNA fita simples

Circoviridae

Parvoviridae

CIRCOVIRIDAE

Menores vírus com genoma DNA

Gêneros:

ssDNA

Max. divergence 309, Clustal V (PAM250)

Goose circovirus

Porcine circovirus 1

Porcine circovirus 2

Bat cyclovirus

Cyclovirusa

Cyclovirus TN18

Chicken anemia virusa

Chicken anemia virusb

Chicken anemia virus

c

Chicken gyrovirus 2

Swan circovirus

genus Circovirus

genus Gyrovirus

genus ´Cyclovirus´

Avian gyrovirus 2

CIRCOVIRIDAE

Descoberta de um novo agente :

Girovírus das aves tipo 2

Discovery of a genome of a distant relative of chicken anemia virus reveals a

new member of the genus Gyrovirus.

Franciscus A. M. Rijsewijk, Helton F. dos Santos, Thais F. Teixeira,

Samuel P. Cibulski, Ana Paula M. Varela, Diogenes Dezen, Ana Cláudia

Franco, Paulo M. Roehe.

Publicado em: Archives of Virology, 2011

• DOI 10.1007/s00705-011-0971-6

PARVOVIRIDAE

Parvovirus: parvovírus canino tipos 1 e 2 (CPV-1; CPV-2),

vírus da panleucopenia felina (FPLV),

parvovírus suíno (PPV),

parvovírus bovino (BPV);

Erythrovirus: vírus B19 humano (aborto)

Dependovirus: vírus adeno-associado 2 (AAV).

ssDNA

Vírus com genoma DNA fita dupla

Papillomaviridae

Polyomaviridae

Adenoviridae

Hepadnaviridae

Herpesviridae

Poxviridae

Asfarviridae

PAPILOMAVIRIDAE

- Vários associados a cânceres

Papilomavírus: - Verrugas

- Epidermodisplasia verruciforme

Alphapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-32);

Betapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-5);

Gammapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-4)

Epsilonpapillomavirus: papilomavírus bovino tipo 5 (BPV-5);

dsDNA

- Transcrição reversa

2 gêneros:

- Ortohepadnavirus: hepatite B (HBV) - Humano

- Avihepadnavirus: vírus da hepatite B dos marrecos

(DHBV)

HEPADNAVIRIDAE

dsDNA (RT)

HERPESVIRIDAE

• Alfaherpesvirinae

– Simplexvirus: » Herpesvírus bovino tipo 2

» Vírus do herpes simplex humano tipo 1 e 2 (HSV-1 e HSV-2)

– Varicellovirus: » Vírus da rinotraqueíte bovina (BoHV-1)

» BoHV-5

» SuHV-1

– Mardivirus: » Vírus da doença de Marek

– Iltovirus: » Vírus da laringotraqueíte infecciosa das galinhas (ILTV)

dsDNA

Avipoxvirus: bouba aviária

Orthopoxvirus: Varíola

Parapoxvirus: ectima contagioso dos ovinos (ORFV)

Vários outros poxvírus

POXVIRIDAE

- Um dos maiores vírus conhecidos (~ 300 nm)

- simetria complexa (retangular ou ovoide)

dsDNA

Varíola Humana

(VARV)

CLASSIFICAÇÃO E

NOMENCLATURA DOS VÍRUS

Universidade Federal do Rio Grande do Sul

Instituto de Ciências Básicas da Saúde

Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia

Disciplina de Virologia Básica

Obrigado!

LABVIR