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Il microbiota intes/nale e il sistema immunitario Annamaria Castellazzi Dipar/mento di Scienze Clinco-chirurgiche, Diagnos/che e pediatriche Università degli Studi di Pavia Vice-Presidente Board scien/fico - Fondazione Is/tuto Danone Milano, 16 o+obre 2015

Il microbiota intesnale e il sistema immunitario€¦ · Microbiota termine che ha sos7tuito microflora La comunità di microbi che vive nel trao gastrointes7nale di un individuo

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Ilmicrobiotaintes/naleeilsistemaimmunitario

AnnamariaCastellazzi

Dipar/mentodiScienzeClinco-chirurgiche,Diagnos/cheepediatriche

UniversitàdegliStudidiPaviaVice-PresidenteBoardscien/fico-FondazioneIs/tutoDanone

Milano,16o+obre2015

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Microbiotaterminechehasos7tuitomicrofloraLacomunitàdimicrobicheviveneltra+ogastrointes7nalediun

individuo.

IlterminecomprendemembrideiBacteria,Archaea,Eukaryaeilorovirus.

Microbiomaindical’insiemedeigenidelmicrobiota

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Imicrorganismisonosempresta7presen7nell’intes7noa+raversotu+al’evoluzione

dell’uomo

un ruolo significativo in questa stretta relazione tra l’ambiente uomo e l’ambiente microbico

• Ley RE, Turnbaugh PJ, Klein S, Gordon JI. Microbial ecology: human gutmicrobesassociatedwithobesity.Nature.2006Dec21;444(7122):1022-3

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1926-Descrizionenarra7vadeiprimieroidellamicrobiologiadaLeeuwenhoek(Del[,1632)aSpallanzani,Pasteur,KochfinoaPaulHerlich.Lanostrarelazioneconimicrobisembravapiùunaguerracheunrapportodimutualismobenefico

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Microbiomaintes/naleX150voltegenomaumano

Genomaumano

3milionigeni

•  È cos7tuito da circa 1014 baLeri (500-1000 speciediverse) ed un genoma che è oltre 150 volte quelloumano.

•  Svolgenumerosefunzionidinamiche:

1)  Protezionecontrol’aggressionedeipatogeniambientali.

2)Funzionimetaboliche:fontedienergiatramitelafermentazione.

3)SviluppodelsistemaimmunitarioinnatoedadaLa/voemantenimentodellatolleranzaimmunitaria.

Ilmicrobiotaintes/naleèunecosistemacomplessoedinamico

QinJetal.Ahumangutmicrobialgenecatalogueestablishedbymetagenomicsequencing.Nature2010

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Qualèilvantaggiobiologicodellapresenzadiunmicrobiomapar7colarmentericcoalivello

gastrointes7nale?

•  Ilgenomamicrobicopuòcontenereinformazionicodificatenonsviluppatedall’uomodurantel’evoluzione

•  Immagazzinamentoenerge7codapolisaccaridiintrodogconladieta

•  Regolazionedellaproduzionedivitamine(BeK)•  Produzionediacidigrassiacortacatena(SCFA)

•  Resistenzaallacolonizzazionedipotenzialipatogeni•  Degradazionidixeno-bio7ci•  S7moliposi7visullecelluledell’immunitàinnatae

acquisita

Va

ntagginutriziona

li

V

antagginei

meccanism

ididife

sa

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In utero il sistema immune fetale non incontra quasi alcun antigene

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Alla nascita il sistema immune del neonato sano

è naïve

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durante la vita post-natale, l’esposizione agli antigeni

promuove l’espansione del sistema immune

lo sviluppo del sistema immune è basato

sull’

esperienza

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modificazioni flora batterica nei primi giorni di vita

Bifidobatteri - Bacteroides

Clostridi

2-4 gg

neonato intestino sterile alla nascita

dopo 48h 108–109 batteri/gr di feci (E.coli e

Streptococchi della flora fecale materna)

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Sviluppodinamicodelmicrobiotaintes7nale

Determinazionedelmicrobiotainiziasindalla

nascita

Lacolonizzazione iniziaalmomentodelparto.FaLori materni :an7bio7ci intrapartum,7po parto (eutocico vscesareo)A l l a L a m e n t o :esclusivo al seno, misto,ar7ficiale.

InetàadultaMicrobiotaelevatainter-individualità

E ’ u n i c o e dirripe7bile perogniindividuo.Compos i z i onere l a/vamentestabile con7nueinfluenze da partedi numerosi fa+oriambientali comea l i m e n t a z i o n e ,an7bio7ci,stresses7ledivita.

Infanziaedadolescenza:grandivariazionidelmicrobiotadeterminatedall’alimentazione,dallosviluppodelsistemaimmunitario,

sviluppopuberale,s7ledivita.

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LANUTRIZIONEèunodeiFATTORIchemaggiormenteinfluiscesuicambiamen/significa/vi

delmicrobiotaneiprimi3annidivita

1°shiZ 2°shiZ 3°shiZ

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Colonizzazioneintes7nale:laLematernovslaLeinformula

In neona7 alla+a7 al senoLa,obacillieBifidoba,erial1°mesedivita, neona7 a l l a+a7 conformula,p r e d o m i n a n z a d iEn t e r oba c t e r i a c ee e dEnterococchi.

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Effe+obifidogenodella+ematerno:ilruolodeglioligosaccaridi

• EFFETTOBIFIDOGENO:glioligosaccaridi sonoresisten7aiprocessi diges7vi nel tra+o gastrointes7nale superiore,arrivano integri nel colon dove subiscono il processo diFERMENTAZIONE SELETTIVA principalmente da parte deiBIFIDOBATTERI (Bifidobacterium longum, infan9s ebifidum) cos/tuendone il principale substrato energe/coperlasopravvivenzaelaproliferazioneeconproduzionediacidigrassiacatenacorta(SCFA).

SCFA(acidoace7co,bu7rratoepropionato):1. Principale substrato energe7co per gli enteroci7,favorendoiltrofismodellamucosaintes7nale.2. S7molano la maturazione ed il corre+o funzionamentodei linfoci7 T regolatori, contribuendo allo sviluppo ed ilmantenimentodellatolleranzaimmunologica.

Smithetal.TheMicrobialMetabolites,ShortChainFaGyAcidsRegulateColonicTregcellHomeostasis.Science2013

[email protected])[email protected])[email protected])

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Lacolonizzazioneintes/nalenellosviluppodellatolleranzaimmunologica

•  La colonizzazione intes7nale precoce è importanteperlosviluppoedilmantenimentodellaTOLLERANZAIMMUNOLOGICA,cheasuavoltaènecessariaper laprevenzionedipatologieimmuno-mediate.

•  Il mancato sviluppo della tolleranza immunologicanei primi mesi di vita e/o la perdita della tolleranzaimmunologicanelleepochesuccessivepredispongonoallacomparsadimala^eallergicheoautoimmuni.

•  SPECIFICI BATTERI possono contribuire in modo significa7vo allosviluppodellatolleranzaimmunologica:- Bacteroides fragilis e Clostridia: favoriscono la proliferazione dilinfoci/Tregolatorinellalaminapropriadellamucosaintes7nale.

Walkeretal.Breastmilk,microbiota,andintesLnalimmunehomeostasis.PedaitricRESEARCH.2015;77(1):220-228.

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ColonizzazionenoncorreLaèassociataarischiodisviluppodipatologie

ColonizzazioneconE.ColieC.difficilisassociataaeczemaederma/teatopica.

BambiniallergicihannomenoBifidoba,eriepiùStaphylococcusaureus.

SoggegobesihannomicrobiotaconmaggiorconcentrazionediFirmicuteserapportosbilanciatotraFirmicuteseBacteroides(da3:1a35:1)

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TOLLERANZA

Th1 Th2

Th2

Batteri commensali

Antigeni alimentari

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Treg Th2

Th1

Th3TGF-b

IL-10

Microbiotaintes/nale

Th1

CD

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GALT

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EubiosieDisbiosi

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Ilfuturodell’immunitàmucosale

volume11number7july2010natureimmunology

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Mantenereilnostrointes/nocomeunpratoall’inglese

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Grazie per l’attenzione!!!!

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Asnotedearlier,amajorchallengeistoobtaincellularandmolecularbiomarkersforquan7ta7veprofilingoftheinnateandadap7veimmunesystems,includingbiomarkersofmucosa-associatedbarrierfunc7on.Giventhesmallquan77esofbiomaterialsavailablefromcertainbodysites,thisini7a7veshouldhelptoadvance‘miniaturizingtechnology’forquan7ta7vemeasurementsofcellsandbiofluids.Non-invasiveimaging-basedbiomarkersarealsoneeded.Goalsincludeiden7fyingnewhostandmicrobialbiomarkersandmediatorsofnutri7onalstatus,determiningthenutri7onalvalueofvariousfoods,andcharacterizingthefunc7onofthehumanadap7veandinnateimmunesystems(includingmucosalbarrierintegrityandmucosalimmunity)andthedynamicopera7onsofthemicrobiota.Thisinforma7onwouldbeusedfordemonstra7onprojectsthatrigorouslydefinenutri7onalhealthandtestpreven7veortherapeu7crecommenda7onsformicronutrientandmacronutrientconsump7on,forexampleinpregnantwomenandinfants/children,andtheireffectontheassemblyandopera7onsoftheimmunesystem.Themicrobiomecomponentcouldalsohelptodefineapreviouslyuncharacterizedaxisofhumangene7cevolu7on(ourmicrobiomeevolu7on),reflec7nginpartourchangingdietaryhabits.ItcouldalsoproducetestablehypothesesaboutunappreciatedaspectsofthepathophysiologyofWesterndiseases,andyieldnewmicrobiome-basedstrategiesfordiseasepreven7onortreatment.

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Cosac’èdinuovo

Qualitàdeglistudi:! Studipiùaccura7conceppibeniden7fica7! Studiconoutcomesbenprecisi

Studiincentra7sullefascedeboli:bambinieanzianiEpigenomica

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Duegrandiprogeg

Basa7sulsequenziamentosistema7codelDNAdelmicrobiotaumano

•  HumanmicrobiomeProject(HMP)USA•  MetagenomicsofHumanIntesLne(meta-HIT)Europa

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Consideratalanaturacomplessadelmicrobiomapuòesserecorre+ochevengastudiatodaunavastacomunitàscien7fica:

IlNIH'sHumanMicrobiomeProjectsidedicasopra+u+oall’iden7ficazionediqualiba+ericisonoedovevivononelcorpo,fornendounsetdellalorosequenzagene7ca.

IlMetaHIT(MetagenomicsoftheHumanIntes7nalTract)dellaCommissioneEuropea,sifocalizzasugliabitan7microbicidell’intes7noesucomepossanocontribuireall’obesitàeallepatologieinfiammatoriedell’intes7no(IBD).

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Qualcheconce+osucuirifle+ere

•  Numeroemassadeimicroorganismipresen7nelcorpoumano

•  Numerodispeciediversedimicroorganismi•  Numeroemassadellecelluleeucariotepresen7nelcorpoumano

•  Dimensionegenomicamicrorganismiecelluleumane•  Complessitàemergente

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corpo umano microbiota N.cellule 1013 1014 Massa 100% 2% N.geni 30000 >1000000 N.specie 1 >1000

Qualchenumerosucuirifle+ere

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MassamicrobitaMassadell’organismouomo

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PoolgenicomicrobiotaGenomaumano

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Questopuòesserevistocomeunadatononnega7vo.C’èunaforzaneinumeritantochealcunibiologiguardanoall’uomocomeun“superoganismo”cheèqualcosadipiùdellasommadellesuepar7.

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Themicrobialgutecosystem.Schema7crepresenta7onofthegutmicrobiome.Theolddefini7onofthehumanorganismopensthewaytothe“superorganism”,whichhousestheresidentgenomes,calledmicrobiomeandtherelatedmicroproteome...

FedericaDelChierico,PamelaVernocchi,LuigiBonizzi,RitaCarseg,AnnaMariaCastellazzi,BrunoDallapic...Early-lifegutmicrobiotaunderphysiologicalandpathologicalcondi/ons:Thecentralroleofcombinedmeta-omics-basedapproachesJournalofProteomicsVolume75,Issue1520124580-4587h+p://dx.doi.org/10.1016/j.jprot.2012.02.018

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PharmacologicalResearch63(2011)366–376

IF:4,436