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LA GENETICA UNA HERRAMIENTA PARA EL MEJORAMIENTO. Ponencia presentada en el III Simposium Internacional de Investigaciones sobre Camélidos Sudamericanos.
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LA GENETICA UNA HERRAMIENTA PARA EL MEJORAMIENTO
Alan Cruz Camacho
Centro de Mejoramiento Genético
San Simón S.A.
Productividad: Fibra de Alpaca
Calidad:•Diámetro de la fibra (micras)
Cantidad:* Peso del vellón (Libras)
Densidad
Longitud
Qué producir?Qué animales reproducir?
Fibra de buena calidad en buena cantidad.(Diámetro, peso, rizo, tipo, uniformidad, persistencia)
Alpacas con características genéticas deseables
50%
50%
100%
Aporte de la carga genética del padre: 50%Aporte de la carga genética de la madre: 50%
Hijo 1: 100% Hijo 2: 100%
SON IGUALES????????
Los padres segregan el 50% de su carga genética, pero no siempre el mismo 50% .
Es por ello que los hermanos son diferentes.
Valorizando nuestros genes…
S/. 9.00
S/. 3.30
S/. 0.70
S/. 6.40
Mejoramiento
•Cruces : Pacovicuña•Inseminación Artificial y Transferencia de embriones•Genética Molecular•Genética Cuantitativa•Selección Asistida por Marcadores
S/. 14.00
GENETICA MOLECULAR* Secuenciar el Genoma de la alpaca
Construcción de Mapas
Mapas físicosCon ayuda de marcadores molecular localizar donde está o están los genes que controlan el carácter deseado.
Mapas funcionalesConocer como actúa el gen, inhiben o expresan el carácter.
Mapeo comparadoHacer un mapeo comparado con el Bovino, humano y ratón para ver en otras especies como actúan esos genes.
2003 Chimpance, 2006 Macaco.
2003-2004: Gallus gallus , resolución 6.63 X
2004: Cánidos: perro, coyote y lobo
2004-2009: Bos taurus , resolución 6.2 y 7.1 X
2007: Equus caballus, Resolución 6.8 X
Actual: iniciado el 2001: Sus scrofa (pig) 6.0X
Ensambles completados; conejo, elefante, armadillo, gato, oveja, cerdo de guinea,
BUSCAMOS UN GEN O VARIOS GENES
Ejemplo de Genes mayores encontrados en otras especies.Species Trait Gene Reference
Cattle Muscle hypertrophy MST 72-75
Coat colour MC1R 76
White Coat Colour KITLG 23
Fish Odour in milk FMO3 77
Chicken Albinism TYR 78
Plumage colour MC1R 79
Dominant white plumage colour PMEL17 80
Dog Narcolepsy HCRTR2 81
Coat colour MC1R 82
Goat Lack of horns, intersexuality Non-coding region * 83
Horse Coat colour MC1R 84
ASP 85
MATP 86
White colour, megacolon EDNRB 87-89
Pig Malignant hyperthemia RYR1 21
Dominant white colour, haematopoiesis KIT 22, 90, 91
Hypercholesterolaemia LDLR 92
Coat colour MC1R 93, 94
Intestinal Escherichia Coli aherence FUT1 95
Glycogen content in skeletal muscle PRKAG3 24
Sheep Fertility, ovulation rate BMP15 96
BMPR1B 97
ROA
Muscle hypertrophy Regulatory mutation * 98, 99
Caracteres deseables en otras especies
Mas de 10 regiones cromosómicas (Cabras) y mas de 2500 genes aproximadamente (Alpacas). Varios genes aditivos de pequeño efecto
Especie Parámetro productivo Control
Vacuno de leche
Producción de leche por día
Poligénico
Ovino de leche Producción de leche por día
Poligénico
Caprino de leche
Producción de leche por día
Poligénico
Aves Puesta de huevos Poligénico
Conejos Prolificidad Poligénico
Cerdos Prolificidad Poligénico
Vacuno, ovino, conejo, cerdo, aves
Índice de conversión, ganancia de peso
Poligénico
Camélidos Diámetro de fibra ?????????
Cuando el carácter es poligénico, y aun no hemos localizado física ni funcionalmente los genes, es necesario hacer uso de la aplicabilidad matemática.
PREDECIR LOS VALORES GENETICOS
Métodos estadísticos
Modelos lineales mixtosy= Vector de observación
b= Vector de niveles de efectos fijos
u= Vector de niveles de efectos aleatorios
X= Matriz de diseño de efectos fijos
Z= Matriz de diseño de efectos aleatorios
e= Error residual
GA = Valores Genéticos Aditivos
A = Coeficientes de la matriz de parentesco
= Varianza aditiva
GENETICA CUANTITATIVA
PREDECIR LOS VALORES GENETICOS
Métodos Bayesianos
Inferencia de los valores genéticos de la distribución marginal posterior
MCMC =Cadenas de Markov, Método de Montecarlo
Números aleatorios
y | b, u, σ2 ~ N(Xb+ Zu, Iσ2)
DATOS
•Pedi
grí
•Reg
istro
s de
prod
ucció
n
SELECCIÓN ASISTIDA POR MARCADORES
Integrar la información provista por marcadores moleculares a los criterios clásicos de selección.
Propósito: acortar el tiempo de evaluación de los animales, ya que con la construcción de paneles con Marcadores Moleculares se estimaría el valor genético en animales jóvenes.
cDNA microarray Principio
NHGRI
Síntesis de Oligos (Affymetrix)
SNP chip assay
CONCLUSION
Prueba Genómica
Selección
Basada en: Marcadores moleculares
Pedigrí y registros de producción
Nivel de confianza
Menor al 60% 99%
Valor genético???
ALPACAS ELITE PROBADAS
CLONACION SOMATICA
INSEMINACION ARTIFICIAL
CLONACION EMBRIONARIA
TRANSFERENCIA DE EMBRIONES
INYECCION PRO NUCLEAR
Gracias…