A Embrapa desenvolveu um programa para a identificao e retirada de vetores. Alm disso recupera e envia sequncias similares dos bancos de dados. SisGen. VecScreen tambm uma opo e est disponvel no site do NCBI.Blast o programa de busca de similaridades mais conhecido, disponvel no domnio do NCBI e existente em cinco formas bsicas.- nucleotide blast: faz a busca no banco de dados de sequencias de nucleotdeos com o nucleotdeo desconhecido;- protein blast: faz a busca no banco de dados de protenas usando a protena em questo.- blastx: busca na database de protenas usando uma sequncia de nucleotdeos traduzida- tblastn: busca a sequncia traduzida atravs da protena- tblastx: busca de similaridade entre sequncias traduzidasNa pesquisa mais comum, com o nucleotide blast, normal aparecer mltiplas sequncias ou a situao inversa em que no aparecem similaridades. Geralmente tambm uma parte da sequncia apresenta similaridade com outras provenientes dos bancos de dados. Isso indica domnios conservados entre famlias gnicas ou origem evolutiva comum.Identificada a similaridade, anota-se as bases de incio e fim assim como sua funo hipottica.O Blast ainda capaz de identificar e recuperar fases abertas de leitura (ORF-open reading frame), que mostra os peptdeos que poderiam ser codificados pelo segmento se a regio correspondesse a um gene. Uso do ORF finder no site do NCBI.Caso no hajam similaridades encontradas que ajudem no reconhecimento da funo biolgica da sequncia, outros programas de bioinformtica podem ser usados, eles identificaro outras informaes que podem ajudar.Exemplos dessas informaes so os consensos ativadores ou repressores da transcrio, que se localizam na regio promotora.Signal scan: pode caracterizar essas regies promotoras. Ajuda o biolgo molecular a determinar que fator de transcrio eucaritico existe na sequncia sob investigao. Mais til pra identificar sequncias em mamferos devido a ter mais informaoes para esse grupo. Elementos no encontrados em sua database podem ser adicionados. Usa tanto elementos de sequncia de caracterizao bioquimica, tanto quanto elementos derivados de sequncia consenso. Usa: TFD: The transcription factors database.TRANSFAC:dados de fatores de transcrio, sequncias consenso e alguns genes reguladores.PLACE: banco de dados de sequncias reguladoras do DNA de plantas vasculares.H ainda programas que podem fazer anlise estrutural, como calcular a curvatura da sequncia estudada e seu dobramento.Bend.it: prediz a curvatura das sequncias de DNAModel.it: constroi uma mlecula de DNA em 3DAps finalizadas as anotaes, as sequncias caracterizadas podem ser enviadas aos bancos de DNA ou protenas a forma de envio e o depsito depende de cada banco de dados. Essas informaes podem ser ainda atualizadas, entretanto apenas pelo usurio o qual as primeiro depositou.FORMATOS:- GenBank: aqruivos neste formato apresentam anotaes detalhadas com observaes do depositante. Isso facilita ligar os dados informaes complementares, como bibliografia.- FASTA: disponibiliza a sequncia sem anotaes extras, muito utilizada para uso em programas de bioinfrmatica, como no processo de desenho de primers para a amplificao de regies especficas do genoma.