5. 358010 Microbiologia Ambiental (1)

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    MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL 358010

    PROTOCOLO DE PRÁCTICA

    Nombre de curso Microbiología Ambiental

    Código de curso 358010

    Créditos del curso 3Valor de esta actividadpráctica

    150 Puntos ( 60 puntos calificados por virtual, 90puntos calificados por tutor de Laboratorio)

    Nombre del director decurso Jorge Alejandro Rodríguez Palacios

    Correo institucional deldirector del curso

    [email protected]

    Contacto del director decurso

    Teléfono fijo y teléfono celular

    CEAD al que pertenece ZCBOY- CEAD Tunja

    Espacio donde se debedesarrollar la práctica

    Laboratorios CEAD o convenios

    Objetivos de la práctica

    - Normas de Bioseguridad en el Laboratorio

    Entender las normas de bioseguridad necesariaspara el trabajo en laboratorio.Identificar los implementos de protecciónpersonal.

    - Técnicas de aislamiento de microorganismosManipulación de microorganismos en medios decultivo.Recuento de Microorganismos por medio dediluciones.

    -Técnicas de tinciónColoración de Gram ( Bacterias)Tinción de Azul de lactofenol (Hongos)

    - Técnicas de interés en Ingeniería AmbientalFiltración por membrana para coliformes fecalesy E.coli

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    Justificación de lapráctica

    El estudiante pondrá en práctica los conocimientosadquiridos en el curso, reforzando los temas vistos enel aula virtual, destrezas y habilidades para lamanipulación de materiales, equipos, reactivos ymicroorganismos.

    Competencias adesarrollar

    El estudiante desarrolla destrezas y habilidades para lamanipulación de materiales, equipos, reactivos ymicroorganismos en el laboratorio.

    Duración de la práctica. 8 horas

    Mecanismo mediante elcual se evaluará lapráctica:

    A través de la rúbrica de evaluación la cual vaadjunta al final del presente protocolo, debe ser lamisma del aula virtual

    METODOLOGÍA

    El componente práctico del curso de Microbiología Ambiental está dividido en dosfases, la primera denominada Actividad 3 Experimentación I, que hace referencia ala fase que desarrollará cada estudiante de manera individual en el campus virtualy será calificado por el tutor virtual.

    La segunda fase de la práctica hace referencia a la actividad 4 experimentación II,que será guiada por el tutor de práctica en los distintos laboratorios de la rednacional de laboratorios.

     A continuación se relaciona la guía de la fase II actividad 4 experimentación II, parael tutor de práctica y los estudiantes.

    PRACTICA FASE II ACTIVIDAD 4 EXPERIMENTACIÓN II (Laboratorio)

    Los estudiantes deben consultar por su cuenta propia y basada en las referenciasbibliográficas entregadas en el curso la información necesaria para las siguientesprácticas. El tutor práctico guiará y despejará las dudas a los estudiantes en ellaboratorio

    PRACTICA 1- BIOSEGURIDAD EN EL LABORATORIO

    Los laboratorios de microbiología están regidos por normas de seguridad e higieneque deben cumplirse a cabalidad para garantizar la protección contra infeccionesde los estudiantes u otro personal que labora en estas instalaciones, así comogarantizar la calidad de las técnicas y la confiabilidad de los resultados.

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    Los estudiantes deberán identificar las normas de bioseguridad en el laboratorio unavez ingresen al mismo.

    El tutor práctico dará una breve explicación sobre las normas con las que cuentanen el laboratorio donde se esté desarrollando la práctica.

    REFERENCIAS BIBLIOGRAFICASBENSON, HAROLD J. Microbiological applications: Laboratory Manual in GeneralMicrobiology. McGraw  – Hill. U.S.A. 1998.COLLINS, C. H. and M LYNE, PATRICIA. Traducción del inglés por José MaríaTarazonaVilas. Métodos microbiológicos. Editorial ACRIBIA, S. A. ZARAGOZA (España).1989.OMS – Organización Mundial de la Salud. Manual de bioseguridad en el laboratorio.Ginebra. 2005.

    IMPORTANTE: LOS ESTUDIANTES DEBEN LEER Y CUMPLIR LAS NORMASDE LABORATORIO, EL INCUMPLIMIENTO DE LAS MISMAS ACARREARÁ LASANCIÓN DE LA NOTA PRÁCTICA.

    PRÁCTICA No. 2RECONOCIMIENTO DEL LABORATORIO Y MATERIALES DEMICROBIOLOGIA

    Realizar una descripción de los materiales que utilizarán en la práctica, esto incluye

    equipos y materiales de vidrio. Realizar un boceto de cada uno y una brevedescripción.

    PACTICA No 3MÉTODOS DE SIEMBRA  –PARTE ALa inoculación de medios de cultivo para la recuperación, mantenimiento y/oaislamiento de microorganismos, es un procedimiento fundamental e importante.Debe tenerse cuidado con las técnicas de siembra microbiana para evitar en lo

    posible la contaminación por otros microorganismos diferentes al deseado.MATERIALES1. Microorganismos previamente aislados ( Bacterias y hongos)2. Agar nutritivo en caja de Petri3. Agar PDA4. Asa redonda5. Gradilla6. Mechero

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    7. Incubadora8. Vinipel9. Marcador de vidrioPROCEDIMIENTO1. Desinfectar el área de trabajo, prender el mechero y preparar el material detrabajo.2. Abrir la caja de Petri y seguir el esquema para el aislamiento para el caso debacterias.

    3. Para el caso de Hongos tomar con el asa recta el microorganismo y por punciónsembrar en la caja de Petri con medio PDA.

    4. Incubar a 37° por 24 horas para bacterias y a 25° por 8 días para hongos.

    5. Terminado la siembra, marcar las cajas en el borde de la base de la caja yenvolverla en papel vinipel..6. Desinfectar el área de trabajo, apagar el mechero y entregar el material

    MÉTODOS DE SIEMBRA  –PARTE B

    En esta etapa los estudiantes utilizarán una de las técnicas de siembra más usadasen laboratorio, que permite el recuento de microorganismos en una muestra comoaguas, suelos etc. La técnica a realizar en este punto hace referencia a losrecuentos de microorganismos utilizando diluciones seriadas en base 10, donde sedispersa la población de microorganismos permitiendo conocer el númeroaproximado en una muestra.

    MATERIALES

    1. Muestra de suelo o agua residual.2. Frascos con solución salina 0.85% o agua peptonada al 0.1% (90 ml)

    3. Tubos tapa rosca con 9 ml de solución salina o agua peptonada al 0.1% (6

    tubos)

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    4. Cajas de Petri con agar Nutritivo, Chromocult o King B.( 6 cajas)5. Pipetas de vidrio o pipeta automática. ( 100 microlitros y 1000 microlitros)6. Rastrillos.

    PROCEDIMIENTO

    1. Pesar 10 gramos de la muestra, mezclarla con los 90 ml de solución salina oagua peptonada. 

    2. Realizar diluciones seriadas desde 10-1 hasta 10-6 3. Tomar las 6 cajas de Petri con agar y marcar 2 con dilución 102, 2 cajas con

    dilución 104, 2 cajas con dilución 106

    4. Sembrar por duplicado las diluciones 10-2 10-4 10-6 tomando 0,1 ml de cadadilución por superficie, con ayuda del rastrillo homogenizar la microgota sobre

    la superficie del agar sin romperlo. 

    5. Incubar por 24 horas a 37°C y realizar el recuento. 6. Realizar los cálculos donde se toman las diluciones donde se encuentrenentre 30 y 300 colonias para realizar el recuento, sacar promedio y aplicar la

    fórmula: Número de colonias x Factor de dilución x 10 (factor de corrección)

    El resultado es informado en UFC ( unidades formadoras de colonia)/ g o ml

    de la muestra. 

    PRACTICA 4. TECNICAS DE TINCIÓN

    Parte A Tinción de Gram para bacterias.

    Para poder observar al microscopio los distintos tipos de microorganismos existen

    distintos tipos de coloraciones o tinciones que tienen afinidad con ciertas partes de

    la célula y permite diferenciarlas y observar algunos órganos de las células. Para el

    caso de bacterias la técnica más usada es la tinción de Gram, donde se permite

    clasificar las bacterias en Grampositivas (violetas) y Gramnegativas (Fucsias).

    MATERIALES

    1. Muestras de Microorganismos, ( practica aislamiento)

    2. Colorantes para tinción de Gram (Cristal violeta, lugol. Alcohol acetona,Fucsina de Gram)

    3. Aceite de inmersión

    4. Microscópio.

    5. Asas redondas

    PROCEDIMIENTO

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    1. Tomar las colonias de bacterias que los estudiantes sembraronanteriormente ( técnicas de aislamiento) y realizar un frotis en una lámina

    portaobjetos, colocando una gota de agua y con ayuda del asa redonda

    homogenizar para expandir el frotis en la lámina. 

    2. Dejar secar al aire libre la muestra, una vez se encuentre seca, fijar al calorla muestra en el mechero ( se coloca 3 veces rápidamente sobre el fuego la

    lámina) 3. Una vez se encuentra la muestra fijada se procede a colocarle varias gotas

    de cristal violeta, dejando por un minuto y luego lavar en el grifo (solo para

    quitar el exceso de colorante. 4. Colocar unas gotas de lugol, dejar por un minuto y lavar.  5. Colocar una gota de alcohol acetona, dejar por 15 minutos, lavar.  6. Colocar unas gotas de Fucsina de Gram, dejar por un minuto, lavar y dejar

    secar la muestra. 7. Una vez se encuentra seca la muestra agregar una gota de aceite de

    inmersión y observar en el microscópio en el objetivo de 100x. 8. Observar las morfologías ( bacilos, cocos, Grampositivos, Gramnegativos) 

    Parte B Tinción de Azul de Lactofenol para hongos.

    Para ver la morfología de los hongos filamentosos se utiliza la tinción de azul de

    lactofenol, la cual permite contrastar y ver las diferentes partes de un hongo ( hifa,

    conidios, septos, etc)

    MATERIALES

    1. Muestras de Microorganismos, ( practica aislamiento)

    2. Azul de lactofenol.

    3. Microscópio

    4. Cinta transparente.

    5. Asas rectas o agujas de disección.

    6. Láminas y laminillas.

    PROCEDIMIENTO

    1. Tome con una cinta o con las agujas de disección un trozo del hongo ( tomarmicelio, parte algodonosa) 

    2. En una lámina portaobjetos colocar una gota de azul de lactofenol. 

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    3. Si tomó la muestra con aguja de disección, ponerla en contacto sobre la gotae ir desglosando las hifas, colocarle una lámina portaobjetos, si utilizó la cinta

    transparente sólo debe colocarla sobre la gota sin necesidad de laminilla

    cubreobjetos. 

    4. Llevar al microscópio y observar en el objetivo de 40x.  5. Observar las estructuras y anotarlas para el informe.

    PRACTICA 5 ALGUNAS TECNICAS APLICADAS EN MICROBIOLOGÍAAMBIENTAL.

    La microbiología enfocada en la parte ambiental ha permitido diagnosticar eimplementar nuevas alternativas para el desarrollo agrícola, en el ámbito de laingeniería ambiental y la industria.

    Con los conocimientos adquiridos en el curso y teniendo un conocimiento básico dela microbiología, los estudiantes realizaran las siguientes pruebas que actualmentese utilizan a nivel mundial y específicamente en el país.

    INDICADORES DE CONTAMINACION DE AGUAS POTABLESLos indicadores de contaminación son utilizados para medir el grado decontaminación o afectación de cuerpos de agua, agua de consumo etc, en Colombiapara el caso de aguas potables la normatividad exige un valor de 0 unidadesformadoras de colonia en 100 ml de agua muestreada para el caso de coliformes

    totales como indicador.

    Para esta prueba si el laboratorio de su CEAD, UDR, CERES no tiene los elementosnecesarios para realizarla, deberán consultar cual es la normativa vigente y quéotros indicadores (microorganismos) se utilizan en el ámbito de contaminación deaguas.

    Materiales

    1.  Equipo de filtración por membrana (equipo millipore de plástico)

    2.  Membrana de nitrocelulosa de 0.45 micrometros para filtración.

    3.  Jeringa (para hacer vacío)4.  Cajas de Petri con agar Chromocult para coliformes.

    Procedimiento

    1. Tomar 100 ml de agua de la llave, la cual se inoculará con una asada

    de cultivo de E. coli, agitar muy bien. 

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    2. Colocar la muestra en la parte superior de la campana de filtración y

    con la ayuda de la jeringa realizar el vacío para permitir el paso del

    agua de un lado al otro. 

    3. Con unas pinzas estériles retirar la membrana y colocarla sobre el

    agar Chromocult, la parte de la cuadrícula debe ir mirando haciaarriba. 

    4. Incubar por 24 horas a 37° c y observar el número de colonias con las

    características típicas de E. coli   y coliformes totales (consultar la

    coloración en este medio, se encuentra por internet) 

    NOTA: SI NO CUENTAN CON LOS MATERIALES DEBEN CONSULTAR LANORMATIVIDAD Y CÓMO SE INFORMAN LOS RESULTADOS, DEBENREALIZAR LOS DIBUJOS CORRESPONDIENTES A LA ACTIVIDAD.

    PRODUCTOS A ENTREGAR

    Los estudiantes deben entregar   un informe de la práctica realizada con lassiguientes condiciones:

    El documento debe tener la estructura básica de un informe de laboratorio, unabreve introducción sobre la práctica, el procedimiento realizado, las fotografías obocetos de lo observado, conclusiones y referencias bibliográficas con normas APA.No debe exceder el número de 8 páginas, la forma de entrega deben coordinarlacon el tutor de práctica.

    EVALUACION

    # temevaluado

    Valoraciónbaja

    ValoraciónMedia

    ValoraciónAlta

    MáximoPuntaje

    1

    Desarrollo del

    Quiz

    El estudianteno presentóel desarrollodelaspreguntas

    El estudiantepresentó eldesarrollo delas preguntas,pero estascarecen deargumentos oprofundización.

    El estudiantepresentó eldesarrollo detodas las

    preguntas demaneraargumentada.

    10

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    Puntos =0 Puntos= 5 Puntos=10

    2

    Estructura delInforme

    El grupo notuvo en

    cuenta lasnormas

    básicas paraconstrucciónde informes

     Aunque eldocumento

    presenta unaestructura

    base, la mismacarece dealgunos

    elementos delcuerpo

    solicitados

    El documentopresenta una

    excelenteestructura

    10

    Puntos=0 Puntos= 5 Puntos= 10

    3

    Redacción yortografía

    Eldocumentopresenta

    deficienciasen redacción

    y erroresortográficos

    No hay erroresde ortografía yel documentopresenta una

    medianaarticulación de

    las ideas y laestructura delos párrafos

    La redacción esexcelente, lasideas están

    correlacionadasy el cuerpo del

    texto escoherente ensu totalidad.

    10

    Puntos= 0 Puntos= 5 Puntos= 10

    4

    Referencias

    Eldocumentono presentareferencias

    bibliográficas

    N.A

    El documentopresenta

    referenciasbibliográficassegún normas

     APA

    10

    Puntos= 0 N.A 10

    5

     Asistencia yparticipación al

    laboratorio

    El estudianteno asisitió allaboratorio

    en sutotalidad

    El estudianteasistió al

    laboratorio ylas sesiones

    programadas,pero noparticipó

    El estudianteasistió a las

    sesiones en sutotalidad yparticipó

    activamente

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    activamente enlas mísmas.

    Puntaje=0 Puntaje= 20 Puntos= 50

    Total de puntos posibles 90

    ACTIVIDADES DEL TUTOR PRÁCTICO

    METODOLOGÍA

    El tutor de práctica, debe entrar en contacto desde el inicio del períodoacadémico con el director de curso, con el objetivo de conformar la red detutores, la cual se trabajará desde los correos institucionales.

    En el laboratorio el tutor deberá garantizar que se cuenten con parte o latotalidad de los materiales descritos en la guía para desarrollar los puntos.

    EL INFORME DE LABORATORIO SERÁ ENTREGADO AL TUTOR PRÁCTICO,EL TUTOR PRÁCTICO REALIZARÁ LA EVALUACIÓN CORRESPONDIENTE ALA PRÁCTICA, ÉL SERÁ EL ENCARGADO DE EVALUAR Y ENTREGAR LOSPUNTOS CORRESPONDIENTES A LA ACTIVIDAD AL DIRECTOR DEL CURSO,TENIENDO EN CUENTA LO DESCRITO EN LA RUBRICA DE CALIFICACIÓN.

    El tutor práctico deberá realizar un Quiz para evaluar los conocimientos adquiridosen la práctica. La metodología y las preguntas son de libre autonomía del tutor y

    deberán ceñirse a la rúbrica de calificación adjunta.

    1. Selección del sitio de práctica

    El tutor debe coordinar con su zona, CEAD, UDR, CCAV la disponibilidad delaboratorios.

    2. Aseguramiento logístico para el desarrollo de la práctica.El tutor práctico debe cerciorarse con el personal de laboratorio sobre ladisponibilidad de los materiales necesarios para la realización del mismo.

    3. Seguimiento de la prácticaEl tutor debe llevar a cabo el rol de orientador y verificar el desarrollo de lapráctica acorde a la guía suministrada y a la rúbrica de evaluación.

     Adicionalmente debe evaluar el proceso de aprendizaje de los estudiantespor medio del quiz, igualmente debe coordinar con los estudiantes larecepción del informe práctico, su calificación y retroalimentación.

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    4. EvaluaciónEl tutor realizará la evaluación de acuerdo a la rúbrica.

    PRODUCTOS A ENTREGAR

    El tutor de prácticas deberá elaborar un informe sobre el desarrollo de lasactividades del componente práctico el cual debe ser entregado al directorde curso. Dicho informe estará compuesto por los siguientes formatosdiligenciados

    Formato 1: Datos generales de la práctica

    CONTROL Y SEGUIMIENTO AL DESARROLLO

    DEL COMPONENTE PRÁCTICO  

    Nombre del tutor

    Correo del tutor

    Contacto deltutor

    Teléfono fijo y teléfono celular  

    CEAD al cualpertenece eltutor

    Curso

    Fecha derealización

    Día:_____ Mes: _______________ Año:_________

    Lugar donde se

    desarrolló lapráctica

    Temasabordados en lapráctica

    Materiales yequiposempleados en lapráctica

    Observaciones

    Costoaproximado

    Transporte: ________________________________________

    Materiales y equipos: ________________________________

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    Formato 2: registro de asistencia de los estudiantes a las actividades prácticas

    REGISTRO DE ASISTENCIA DE ESTUDIANTES

    A LAS ACTIVIDADES PRÁCTICAS  

    No NOMBRES APELLIDOS CODIGO FIRMA12345678910

    1112131415161718192021

    22232425

    Datos del tutor

    Nombre: _________________________________________

    Cédula: ____________ Firma: ________________________Correo:

     ___________________________________________Teléfono fijo: _____________ Celular: __________________

     AnexosEvidencias del desarrollo de la práctica (Fotografías)

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    Formato 3: Reporte de calificaciones obtenidas por los estudiantes

    REPORTE DE CAL IFICACIONES

    Curso: ________________________________  __________Código:__________________________ 

     _______________Título de la práctica:

     _______________________________ ________________________________  ________________

    CEAD: _______________________________  _________Fecha:

     _______________________________  _________Tutor:

     _______________________________  __________Firma: __________________ Cédula:

     ________________

    No

    Puntaje del tem de larúbrica de evaluación

    obtenido

    Justificación de lacalificaciónotorgada al

    trabajoNombres

    Apellidos

    Código

    1 2 3 4 5Total

    1

    2

    3

    4

    5

    67

    8

    9

    10

    11

    12

    1

    314

    15

    16

    Muchos éxtitos!!!!

    Si ustedes tienen más de5 ítems en la rúbrica de

    evaluación, deben

    colocar más columnas enesta parte

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