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UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO FACULDADE DE CIÊNCIAS FARMACÊUTICAS DE RIBEIRÃO PRE TO
Caracterização molecular da actina do Apicomplexa Neospora
caninum
Luciana Baroni
Ribeirão Preto 2012
UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO FACULDADE DE CIÊNCIAS FARMACÊUTICAS DE RIBEIRÃO PRE TO
Caracterização molecular da actina do Apicomplexa Neospora
caninum
Dissertação de Mestrado Apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Biociências Aplicadas à Farmácia para obtenção do Título de Mestre em Ciências Área de Concentração: Biociências Aplicadas à Farmácia. Orientada: Luciana Baroni Orientadora: Ana Patrícia Yatsuda Natsui
Versão corrigida da Dissertação de Mestrado apresentada ao Programa de Pós- Graduação em Biociências Aplicadas à Farmácia em 22/10/2012. A versão original encontra-se disponível na Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto/USP.
Ribeirão Preto 2012
AUTORIZO A REPRODUÇÃO E DIVULGAÇÃO TOTAL OU PARCIAL DESTE TRABALHO, POR QUALQUER MEIO CONVENCIONAL OU ELETRÔNICO, PARA FINS DE ESTUDO E PESQUISA, DESDE QUE CITADA A FONTE.
Baroni, Luciana
Caracterização molecular da actina do Apicomplexa Neospora
caninum, 2012.
73p. : il. ; 30 cm
Dissertação de Mestrado, apresentada à Faculdade de Ciências
Farmacêuticas de Ribeirão Preto/USP – Área de Concentração:
Biociências Aplicadas à Farmácia.
Orientadora: Yatsuda, Ana Patrícia
1. Neospora caninum. 2. Apicomplexa. 3. Actina.
FOLHA DE APROVAÇÃO
Autora: Luciana Baroni Título : Caracterização molecular da actina do Apicomplexa Neospora caninum
Dissertação de Mestrado apresentada ao Programa de Pós Graduação em Biociências Aplicadas à Farmácia para obtenção do Título de Mestre em Ciências Área de Concentração: Biociências Aplicadas à Farmácia. Orientadora: Ana Patrícia Yatsuda Natsui
Aprovado em:
Banca Examinadora
Prof.Dr._____________________________________________________________
Instituição:___________________________Assinatura:_______________________
Prof.Dr._____________________________________________________________
Instituição:___________________________Assinatura:_______________________
Prof.Dr._____________________________________________________________
Instituição:___________________________Assinatura:_______________________
Aos meus pais,
Arnaldo e Neide,
e ao meu irmão, Leandro,
pelo grande incentivo.
AGRADECIMENTOS
À Profa. Dra. Ana Patrícia Yatsuda Natsui pela excelente orientação, pela confiança,
pela oportunidade de realizar esse trabalho e pelo incentivo.
À Profa. Dra. Maria Cristina Nonato e ao Prof. Dr. Sérgio Akira Uyemura pelas
valiosas dicas que engrandeceram este trabalho.
Aos docentes do Programa de Biociências Aplicadas à Farmácia pelos
ensinamentos durante as disciplinas.
Ao Maarten Altelaar, Ph.D e Albert Heck, Ph.D do Biomolecular Mass Spectrometry
and Proteomics Group da Universidade de Utrecht pelas análises de espectrometria
de massas.
À funcionária técnica do laboratório de Parasitologia Molecular da FCFRP-USP
Maraísa Palhão Verri por todo o auxílio e por levar tanta alegria ao laboratório.
Ao Laboratório de Bioquímica da FCFRP-USP pelo uso da ultracentrífuga e,
principalmente, às funcionárias técnicas Ana Cristina Morseli Polizello, Ana Elisa
Caleiro Seixas Azzolini e Ieda Maria Razaboni Prado pelo auxílio.
À colega e doutoranda Letícia Pollo de Oliveira pela gentileza de analisar as
amostras de espectrometria de massas e, principalmente, pelo apoio e amizade
dentro e fora do laboratório.
Ao colega e doutorando Luiz Miguel Pereira (o Buda) pela valiosa ferramenta
pGEM/pET e pelos inúmeros auxílios durante a execução do trabalho, além dos
momentos de descontração e amizade.
À colega Aline Bononi (iniciação científica) pela espontaneidade e pelos momentos
divertidos no laboratório.
À Coordenação de Aperfeiçoamento de Nível Pessoal de Nível Superior (CAPES)
pela bolsa de mestrado.
À amiga Ana Beatriz Barbosa dos Santos por todos esses anos de amizade e,
principalmente, pela companhia durante o período de mestrado.
À todas as pessoas que fizeram parte da minha vida e, de alguma maneira,
colaboraram para esse trabalho.
Meu mais profundo agradecimento.
“Se eu vi mais longe, foi por estar de pé sobre ombros de gigantes.”
Isaac Newton
SUMÁRIO
Resumo Abstract Resumen Lista de Figuras Lista de Tabelas Lista de Abreviaturas e Siglas
i ii
iii iv vi
vii
1 INTRODUÇÃO ......................................................................................................1 1.1 Ciclo de vida.......................................................................................................2 1.2 O ciclo de invasão dos Apicomplexas ................................................................3 1.2.1 O modelo de motilidade por deslizamento dos Apicomplexas ........................4 1.3 Actina .................................................................................................................6 1.3.1 Actina nos parasitas Apicomplexas.................................................................8 1.3.2 Drogas com interferências na dinâmica da actina...........................................9 1.3.3 Actina em Neospora caninum e justificativa ...................................................10 2. OBJETIVOS....................................... .................................................................11 2.1 Gerais ...............................................................................................................11 2.2 Específicos .......................................................................................................11 3. MATERIAL E MÉTODOS .............................. .....................................................12 3.1 Manutenção do Parasita: cultura in vitro e purificação dos taquizoítas de N. caninum .........................................................................................................12 3.2 Seleção e análise da sequência NcAct .............................................................12 3.3 Clonagem .........................................................................................................13 3.3.1 Delineamento de oligonucleotídeos (primers) ................................................14 3.3.2 Clonagem da sequência NcAct-base ............................................................14 3.3.2.1 Isolamento do RNA total..............................................................................14 3.3.2.2 Síntese de cDNA.........................................................................................15 3.3.2.3 Reação de Polimerase em cadeia (PCR) ...................................................15 3.3.2.4 Ligação em vetor de clonagem e transformação em célula eletrocompetente ....................................................................................................16 3.3.3 Clonagem da sequência Ncct201-310 ............................................................................................. 16 3.3.3.1 Reação de polimerase em cadeia (PCR) ....................................................16 3.3.3.2 Ligação em vetor de clonagem e transformação em células eletrocompetentes ...................................................................................................17 3.3.3.3 Obtenção da sequência NcAct201-310 e do plasmídeo de Expressão .............................................................................................................17 3.3.3.4 Reação de ligação do vetor expressão com a sequência NcAct201-310.................................................................................................................................................................18 3.3.4 Purificação dos plasmídeos (minipreps).........................................................19 3.3.5 Eletroforese em gel de agarose .....................................................................20 3.3.6 Purificação em gel de agarose .......................................................................20 3.3.7 Preparação de células eletrocompetentes .....................................................21 3.3.8 Transformação em cepas de E. coli eletrocompetentes.................................21 3.4 Expressão, análise e purificação da proteína recombinante His-NcAct201-310 .......................................................................................................................................................22
3.4.1 Extração total .................................................................................................22 3.4.2 Extração solúvel e insolúvel