METODOLOGIA DE COLETA DE PUBLICAÇÕES CIENTÍFICAS PELA FIOCRUZ

Para recuperação das publicações científicas da Fiocruz, o Observatório em

Ciência, Tecnologia e Inovação em Saúde desenvolveu uma metodologia própria e

específica para esta análise. Esta foi dividida em quatro etapas, conforme abaixo:

1) Seleção das bases de dados e elaboração da estratégia de

busca

Para recuperação das publicações científicas foram utilizadas três bases de

dados disponíveis no Portal Capes: Web of Science (Clarivate Analytics), Scopus

(Elsevier) e SciELO. A estratégia usada em cada uma das bases foi a seguinte:

Web of Science (WoS): a busca foi feita em campo específico para

recuperação de publicações através da instituição de afiliação do autor “OG=

Organização Consolidada”, disponível na seção de busca avançada. Neste campo

buscou-se pelos termos “Center for Technological Development in Health (CDTS) OR

Fundação Oswaldo Cruz”. Além dessa lista consolidada pela WoS, utilizou-se uma

lista de referência já previamente compilada pelo Observatório. Estas foram inseridas

no campo “OO=Organização”. No anexo 1 são detalhados todos os termos.

Scopus: a busca foi feita no campo de afiliação dos autores (AFFIL). Neste

utilizou-se a lista de referência já previamente compilada pelo Observatório (a mesma

utilizada na WoS) e a lista consolidada de organizações disponível na WoS.

SciELO: a busca foi feita no campo “OG=Organização”, utilizando-se a lista

consolidada de organizações disponível na WoS e a lista de referência compilada

pelo Observatório.

É importante salientar que a lista de palavras-chaves relativas à instituição foi

redundante no intuito de aumentar a sensibilidade da estratégia de busca.

2

2) Download dos registros, importação para o software e

validação da estratégia de busca

Uma primeira coleta foi realizada no ano passado, referente ao período de

2012 a maio de 2018. Esta coleta foi mantida e apenas uma nova busca para

recuperar as publicações científicas do ano de 2010, 2011 e 2018 completo foi feita.

As publicações recuperadas em cada uma das três bases, das duas coletas,

foram inseridas no software Vantage Point® utilizando filtros específicos, e reunidas

por meio da função “data fusion”. Após junção das três bases de todo o período 2010-

2018, o universo de análise continha 26.465 publicações.

3) Eliminação de duplicatas e harmonização dos registros

Para organização do banco de dados, foi necessário remover as publicações

em duplicidade. Inicialmente, as duplicatas foram removidas utilizando-se como

critério os campos DOI, título, revista e ano. Registros com esses quatro campos

idênticos foram removidos e apenas um registro foi mantido.

Observou-se que havia diferenças na padronização dos campos indexados

nas três bases, isso porque campos como instituições e agência de fomento são ato-

preenchíveis e não possuem um padrão formal, sendo assim uma harmonização

manual para padronização destes campos foi feita. Foram harmonizados os seguintes

campos:

- Títulos das publicações (padronização do idioma e forma de escrita);

- País de filiação dos autores (traduzido para o idioma português);

- Agências de Fomento (padronização)

3

- Key words dos autores (agrupamento das palavras iguais)

- Instituição (padronização dos diferentes nomes atribuídos a uma mesma

instituição).

O campo instituição foi o mais complexo, uma vez que as formas de

denominar uma mesma instituição pode variar. Além dos algoritmos que o software

utiliza para grupamento, foi feita uma harmonização manual das instituições contidas

no banco de dados, para que fosse possível a identificação das colaborações e

parcerias da Fiocruz. Inicialmente foram identificadas 62.323 instituições e ao final da

harmonização, foram incluídas 11.413 na análise.

4) Limpeza final e geração dos indicadores

A harmonização das publicações foi finalizada com a exclusão de publicações

que não possuíam pelo menos um autor afiliado à Fiocruz. Como a estratégia de

busca utilizada teve caráter abrangente, havia a possibilidade de inclusão de

instituições que não faziam parte do universo de análise. Ao final, foram consideradas

18.832 publicações referente ao período de 2010 a 2018, estas são apresentadas no

dashboard.

4

ANEXO 1

Lista de referência compilada pelo Observatório

(“Aggeu Magalhaes” OR “Bio Manguinhos” OR “Biomanguinhos” OR “Bio-

Manguinhos” OR “Biomanguinlios” OR “Carlos Chagas” OR “Centro de Criação de

Animais de Laboratório” OR “Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde” OR

“Ctr Desenvolvimento Tecnol Saude” OR “Escola Nacional de Saude Publica” OR

“Escola Nacl Salude Publ” OR “Escola Nacl Saude Publ” OR “Escola Nacl Saude

Publica” OR “Escola Natl Saude Publ” OR “Evandro Chagas” OR “Evandro Chagoas”

OR “Far Manguinhos” OR “Farmanguinhos” OR “Fernades Figueira” OR “Fernandes

Figueira” OR “FICORUZ” OR “FIO CRUZ” OR “FIO-CRUZ” “Fiocntz” OR FIOCUZ OR

“Fundação Oswaldo Cruz” OR “Fiocruz” OR “Fundacao Fiocruz” OR “FlOCRUZ” OR

“Goncalo Moniz” OR “Gonçalo Moniz” OR “Helio Fraga” OR “Inst Oswald Cruz” OR

“Inst Oswaldo Fdn” OR “Inst Tecnol Imunobiol” OR “Instituto de Comunicação e

Informação Científica e Tecnológica em Saúde” OR “Instituto de Ciência e Tecnologia

em Biomodelos” OR “Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos” OR “Instituto

Nacional de Controle de Qualidade em Saúde” OR “Joaquim Venancio” OR “Leonidas

& Maria Deane” OR “Leonidas & Maria Deane” OR “Leônidas e Maria Deane” OR

“Leonidas Maria Deane” OR “Osaldo Cruz” OR “Osawaldo Cruz” OR “Osqaldo Cruz”

OR “Osvaldo Cruz” OR “Osvaldo Cruz” OR “Oswald Cruz” OR “Oswald Cruz” OR

“Oswald Cruz” OR “OSWALD CRUZ” OR “Oswaldo” OR “Oswaldo Crus” OR

“OSWALDO CRUS” OR “Oswaldo Crusz” OR “Oswaldo Cruz” OR “Oswaldo Curz” OR

“OSWALDO CURZ” OR “Oswalo Cruz” OR “OSWCRU” OR “Owaldo Cruz” OR

“Owaldo Cruz” OR “Programa Comp Cient Qswald Cruz” OR “Rene Rachou” OR

“René Rachou” OR “Sergio Arouca” OR INCQS OR CECAL OR CPqAM OR CPqGM

OR CPqLMD OR CPqRR OR CESTEH OR CPqRR)

ANEXO 2

Lista de Siglas

ABRRI Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran

ACCA Asociación para la Conservación de la Cuenca Amazónica

AECID Agência Espanhola de Cooperação Internacional para o

Desenvolvimento

AFIP Associação Fundo de Incentivo à Pesquisa

AFSSAPS Agence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de Santé

AFSSET Agence française de sécurité sanitaire de l'environnement et du travail

AMRF Advanced Medical Research Foundation

BDFFP Biological Dynamics of Forest Fragments Project

BMBF Bundesministerium für Bildung und Forschung

BRC Imperial NIHR Biomedical Research Centre

CABI Centre for Agriculture and Biosciences International England

CAPES Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior

CBMSO Centro de Biología Molecular Severo Ochoa Madrid

CBPF Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas

CCBR CCBR Brasil Centro de Pesquisas e Análises Clínicas

CCCI Centre for Chronic Conditions and Injuries

CDC Centers for Disease Control and Prevention

CDI Children's Discovery and Innovation Institute

CDMPR Congresionally Directed Medical Research Programs

CEITEC Central European Institute of Technology

CEPEM Centro de Pesquisa em Medicina Tropical de Rondonia

CESAT Centro de Referência em Saúde do Trabalhador da Bahia

CETEM Centro de Tecnologia Mineral

CETENE Centro de Tecnologias Estratégicas do Nordeste

CETESB Companhia Ambiental do Estado de São Paulo

6

CFDA Council of Fashion Designers of America

CGF Canadian Geological Foundation

CIBERBBN CIBER de Bioingeniería

CIBERDEM Centro de Investigación Biomédica en Diabetes y Enfermedades

Metabólicas Asociadas

CIBEREHD Centro de Investigacion en Red en enfermedades hepáticas y

digestivas

CIBERER Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras

Madrid

CIBERES Centro de Investigación Biomedica en Red

CIBERESP Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y

Salud Pública

CIBERNED Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades

Neurodegenerativas

CIBEROBN Centro de Investigación Biomédica en Red de la Fisiopatología de

la Obesidad y la Nutrición

CIBERSAM Centro de Investigación Biomédica en Red Salud Mental

CIBIO Centro de Investigacao em Biodiversidade e Recursos Genéticos

CIEE Centro Integrado Empresa Escola

CIHR Canadian Institutes of Health Research

CIRAD French Agricultural Research Centre for International Development

CIRC Centre International de Recherche sur le Cancer

CMRI Children's Medical Research Institute

CNAG Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica

CNEN Comissão Nacional de Energia Nuclear Comissão Nacional de Energia

Nuclear

CNPEM Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais Campinas

CNPq Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico

7

COFORD National Council for Forest Research and Development

CONAE Comisión Nacional de Actividades Espaciales

CRCL Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon

CRG Centre for Genomic Regulation Barcelona

CSIC Conselho Superior de Investigações Científicas

CSIR Council of Scientific and Industrial Research

CSS Mendel Institute

CSTI Council for Science

CWRU Case Western Reserve University

DCEG Division of Cancer Epidemiology and Genetics

DFAT Department of Foreign Affairs and Trade

DFID Department for International Development

DOST Department of Science and Technology

DSIT Department of Science

EDCTP European & Developing Countries Clinical Trials Partnership

EGU European Geosciences Union

EPSRC Engineering and Physical Sciences Research Council

ERDF European Regional Development Fund

ERS European Respiratory Society

FACEPE Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de

Pernambuco

FAPAC Fundação de Amparo a pesquisa no estado do Acre

FAPDF Fundação de Apoio à Pesquisa do Distrito Federal

FAPEAL Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoas

FAPEAM Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas

FAPEG Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás

FAPEMA Fundação de Amparo à Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e

Tecnológico do Maranhão

8

FAPEMAT Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Mato Grosso

FAPEMIG Fundação de Amparo à Pesquisa de Minas Gerais

FAPEPE Fundação de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Extensão de Itajubá

FAPEPI Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Piauí

FAPERGS Fundação de Amparo à Pesquisa do Rio Grande do Sul

FAPERJ Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro

FAPERN Fundação de Amparo à Pesquisa do Rio Grande do Norte

FAPERO Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Rondônia

FAPERP Fundação de Apoio à Pesquisa e Extensão de São Jose do Rio

Preto

FAPES Fundação Estadual de Amparo à Pesquisa do Estado do Espírito

Santo

FAPESB Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado da Bahia

FAPESC Fundação de Amparo à Pesquisa e Inovação do Estado de Santa

Catarina

FAPESP Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo

FAPESPA Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa

FAPESPA Fundação Amazônia de Amparo a Estudos e Pesquisas

FAPESQ Fundação de Apoio à Pesquisa do Estado da Paraíba

FAPITEC Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Sergipe

FCT Fundação para a Ciência e a Tecnologia

FENORTE Fundação Estadual Norte Fluminense

FGTB Global Fund Tuberculosis Brasil

FIC Fogarty International Center

FINATEC Fundação de Empreendimentos Científicos e Tecnológicos

FINEP Financiadora de Estudos e Projetos

FIPE Fundação Instituto de Pesquisas Econômicas

FNI Field Neurosciences Institute

9

FNIH Foundation for the National Institutes of Health

FRISBI French Infrastructure for Integrated Structural Biology

FRQS Fonds de Recherche du Québec Santé

FUNDECT Fundação de Apoio ao Desenvolvimento do Ensino

FUNTAC Fundação de Tecnologia do Estado do Acre

FUNTTEL Fundo para o Desenvolvimento Tecnológico das Telecomunicações

GCRC General Clinical Research Center

HCPA Hospital de Clínicas de Porto Alegre

I.E.S. Instituto de Enseñanza Secundaria

i3S Instituto de Investigação e Inovação em Saúde

IATS Instituto de Avaliação de Tecnologia em Saúde

IBAMA Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais

Renováveis

IBGE Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística

IBioBA MPSP

IBMP Instituto de Biologia Molecular do Paraná

IBNnet Instituto Brasileiro de NeuroCiências

ICESP Instituto do Câncer do Estado de São Paulo

ICGEB International Centre for Genetic Engineering

ICMBio Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade

ICMR Indian Council of Medical Research

ICTS Institute of Clinical and Translational Sciences

IDCR International Development Research Centre

IDSOG Infectious Diseases Society for Obstetrics and Gynecology

IEAPM Instituto de Estudos do Mar Almirante Paulo Moreira

IEN Nuclear Engineering Instituteian Nuclear Energy Commission

IEPA Instituto de Pesquisas Científicas e Tecnológicas Do Amapá

IFAC Instituto Federal de Educação

10

IFAL Instituto Federal de Alagoas

IFAM Instituto Federal do Amazonas

IFARHU Instituto para la Formacion de Recursos Humanos

IFBA Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia da Bahia

IFCE Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Ceará

IFEPE Instituto Federal de Educação Pernambuco

IFES Instituto Federal do Espírito Santo

IFGO Instituto Federal de Educação Goiás

IFMA Instituto Federal de Educação Ciência e Tecnologia do Maranhão

IFMG Instituto Federal de Ciência e Tecnologia de Minas Gerais

IFMS Instituto Federal de Mato Grosso do Sul

IFOM International Foundations of Medicine

IFPE Instituto Federal de Educação

IFPI Instituto Federal de Pernambuco

IFPR Instituto Federal do Paraná

IFRO Instituto Federal de Rondônia

IFRS Instituto Federal do Rio Grande do Sul

IICAR CONICET Instituto de Ciências Agrarias de Rosario

IINFACTS Institute of Research and Advanced Training in Health Sciences and

Technologies

IME Instituto Militar de Engenharia Rio de Janeiro

IMIP Instituto de Medicina Integral Professor Fernando Figueira Pernambuco

IMPA Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia

INAGEMP Instituto Nacional de Genética Médica Populacional

INAU National Institute of Science and Technology in Wetlands

INBEQMeDI Instituto Nacional de Biotecnologia Estrutural e Química

Medicinal em Doenças Infecciosas

INC Instituto Nacional de Cardiologia

11

INCA Instituto Nacional de Câncer

INEA Instituto Estadual Do Ambiente

INPE Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais

INPer Istituto Nacional de Perinatología

INPI Instituto Nacional da Propriedade Industrial

INRA Institut National de la Recherche Agronomique

INSERM Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale

INSS Instituto Nacional do Seguro Social

IPN Instituto Politécnico Nacional

IPPH Institute of Population and Public Health

ISMMS Icahn School of Medicine at Mount Sinai

ISPUP Instituto de Saúde Pública

ITMAT Institute for Translational Medicine and Therapeutics

IVIC Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas

KFF Kettering Family Foundation

KRIBB Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology

LICR Ludwig Institute of Cancer Research

LNLS Laboratório Nacional de Luz Síncrotron

MASSIVE Multi:modal Australian ScienceS Imaging and Visualisation

Environment

MCT Ministério da Ciência e Tecnologia

MDEIE Ministère du Développement Économique de l'Innovation et de

l'Exportation

MECD Ministerio de Educación

MEST Ministry of Education

MRC Medical Research Council

MVZ Museum of Vertebrate Zoology

NBCR National Biomedical Computation Resource

12

NCMRR National Center for Medical Rehabilitation Research

NHRI National Health Research Institutes

NIAAA National Institute On Alcohol Abuse And Alcoholism

NIDA Architectural League of New York National Institute on Drug Abuse

NIDCR National Institute of Dental and Craniofacial Research

NIIST National Institute for Interdisciplinary Science and Technology

NINS National Institutes of Natural Sciences

NORAD Norwegian Agency for Development Cooperation

NSBRI National Space Biomedical Research Institute

NSERC Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada

NST National Research Council of Science and Technology

NWO Netherlands Organisation for Scientific Research

PDVI Pediatric Dengue Vaccine Initiative

PEPFAR President's Emergency Plan for AIDS Relief

RSF Robert Schalkenbach Foundation

SAMRC South African Medical Research Council

SECTEC Secretaria Estado Ciência

SEDES Secretaria de Estado do Desenvolvimento Econômico e Social

STRIDE Southeastern Transportation Research

UCPel Universidade Católicas Pelotas

UCSAL Universidade Católica do Salvador

UdelaR Universidade da República

UEA Universidade do Estado do Amazonas

UEAP Universidade do Estado do Amapá

UECE State University of Ceará

UEFS Universidade Estadual de Feira de Santana

UEGO Universidade Estadual Goias

UEL Universidade Estadual de Londrina

13

UEL Universidade Estadual de Londrina

UEM Universidade Estadual de Maringá

UEMA Universidade Estadual do Maranhão

UEMASUL Universidade Estadual da Região Tocantina Maranhão

UEMG Universidade Estadual de Minas Gerais

UEMS Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul

UEMT Universidade Estado Mato Grosso

UENF Universidade Estadual do Norte Fluminense

UEPA Universidade Estadual do Pará

UEPB Universidade Estadual da Paraíba

UEPE Universidade Estadual de Pernambuco

UEPG Universidade Estadual de Ponta Grossa

UEPI Universidade Estadual do Piauí

UEPR Universidade Estadual do Paraná

UERGS Universidade Estadual do Rio Grande do Sul

UERJ Universidade do Estado do Rio de Janeiro

UESB Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

UESBA Universidade do Estado da Bahia

UESC Universidade do Estado de Santa Catarina

UESPI Universidade Estadual Piauí

UEVC Universidade Estadual Vitoria da Conquista

UEZO Universidade Estadual Zona Oeste

UFABC Universidade Federal do ABC

UFAL Universidade Federal de Alagoas

UFAM Universidade Federal de Amazonas

UFAP Universidade Federal do Amapá

UFB Universidade Federal de Uberlândia

UFBA Universidade Federal da Bahia

14

UFC Universidade Federal do Ceará

UFCG Universidade Federal de Campina Grande PB

UFCSPA Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre

UFERSA Universidade Federal Rural do Semiárido

UFES Universidade Federal do Espírito Santo

UFF Universidade Federal Fluminense

UFFS Universidade Federal Fronteira Sul

UFGD Universidade Federal da Grande Dourados

UFGO Universidade Federal de Goiás

UFJF Universidade Federal de Juiz de Fora

UFLA Universidade Federal Lavras

UFMA Universidade Federal do Maranhão

UFMG Universidade Federal de Minas Gerais

UFMS Universidade Federal do Mato Grosso Do Sul

UFMT Universidade Federal do Mato Grosso

UFOBA Universidade Federal do Oeste Bahia

UFOP Universidade Federal de Ouro Preto

UFOPR Universidade Federal do Oeste do Pará

UFPA Universidade Federal do Pará

UFPB Universidade Federal da Paraíba

UFPel Universidade Federal de Pelotas

UFPI Universidade Federal do Piauí

UFPR Universidade Federal do Paraná

UFRAM Universidade Federal Rural da Amazônia

UFRB Universidade Federal do Recôncavo da Bahia

UFRGS Universidade Federal do Rio Grande do Sul

UFRJ Universidade Federal do Rio de Janeiro

UFRN Universidade Federal do Rio Grande do Norte

15

UFRO Universidade Federal de Rondônia

UFRPE Universidade Federal Rural de Pernambuco

UFRR Universidade Federal de Roraima

UFRRJ Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro

UFERSA Universidade Federal Rural do Semiárido

UFS Universidade Federal de Sergipe

UFSBA Universidade Federal do Sul da Bahia

UFSC Universidade Federal de Santa Catarina

UFSCAR Universidade Federal São Carlos

UFSJ Universidade Federal de São João del Rei

UFSM Universidade Federal de Santa Maria

UFTM Universidade Federal do Triângulo Mineiro

UFTO Universidade Federal de Tocantins

UFTPR Universidade Tecnológica Federal do Paraná

UFU Universidade Federal de Uberlândia

UFV Universidade Federal de Viçosa Minas Gerais

UFVJM Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri

ULBRA Universidade Luterana do Brasil

UMR Unité Mixte de Recherche France

UNB Universidade de Brasília

UNCISAL Universidade Estadual Ciências Saúde Alagoas

UNEAL Universidade Estadual de Alagoas

UNEB Universidade do Estado da Bahia

UNEMAT Universidade do Estado de Mato Groso

UNESA Universidade Estácio de Sá

UNESC Universidade do Extremo Sul Catarinense

UNESP Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho

UNESPAR Universidade do Estado do Paraná

16

UNFPA Fundo de População das Nações Unidas Global

UNIANDRADE Centro Universitário Campos de Andrade

UNIBH Centro Universitário de Belo Horizonte

UNIC Universidade de Cuiabá

UNICAMP Universidade de Campinas

UNICENTRO Universidade Estadual do Centro Oeste

UNIFAL Universidade Federal de Alfenas

UNIFAP Universidade Federal do Amapá

UNIFEB Fundação Educacional de Barretos

UNIFEI Universidade Federal de Itajubá

UNIFENAS Universidad José do Rosário Vellano

UNIFESP Universidade Federal de São Paulo

UNIFOA Centro Universitário de Volta Redonda

UNIFOR Universidade de Fortaleza

UNIFRAN Universidade de Franca

UNILA Universidade Federal da Integração Latino

UNILAB Universidade da Integração Internacional da Lusofonia Afro

UNIMONTES Universidade Estadual de Montes Claros

UNINOVE Universidade Nove de Julho

UNIOESTE Universidade Estadual do Centro

UNIPAC Universidade Presidente Antônio Carlos

UNIPAMPA Universidade Federal do Pampa

UNIR Universidade Federal de Rondônia

UNIRIO Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro

UNISC Universidade de Santa Cruz do Sul

UNISINOS Universidade do Vale Rio Sinos

UNISISNOS Universidade do Vale do Rio dos Sinos

UniSL Centro Universitário São Lucas

17

UNISUL Universidade do Sul de Santa Catarina

UNITAU Universidade de Taubaté

UNIUBE Universidade de Uberaba

Univale Universidade Vale do Rio Doce

UNIVALI Universidade do Vale do Itajaí

UNIVAP Universidade do Vale do Paraíba

UNIVASF Universidade Federal do Vale São Francisco

UPPMD United Parent's Project for Muscular Dystrophies

USPHS United States Public Health Service

WWF World Wild Foundation