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HELTON FERNANDES DOS SANTOS LABVIR/ICBS/UFRGS CLASSIFICAÇÃO VIRAL

CLASSIFICAÇÃO VIRAL - ufrgs.br · H5N1: 565 casos em humanos e 311 vítimas fatais. ... Chicken anemia virusa Chicken anemia virusb Chicken anemia virus c Chicken gyrovirus 2 Swan

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H E L T O N F E R N A N D E S D O S S A N T O S

L A B V I R / I C B S / U F R G S

CLASSIFICAÇÃO VIRAL

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Taxonomia

Visa classificar em grupos de acordo com propriedades físicas e químicas comuns

Vírus no mesmo grupo frequentemente tem propriedades biológicas semelhantes: Replicação

Doença não! (cuidado!)

Transmissão

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Classificação definida pelo:

Comitê Internacional de Taxonomia de Vírus (ICTV)

ICTVdB - The Universal Virus Database

International Committee on

Taxonomy of Viruses

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Classificação dos vírus

ICTV, 2015

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Taxonomia

Ordem

Família

Subfamília

Gênero

...virales

...viridae

...virinae

...virus

Herpesvirales

Herpesviridae

Alphaherpesvirinae

Simplexvirus

Herpesvírus humano 1 Espécie

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Família: Herpesviridae,

Sub-família: Alphaherpesvirinae,

Gênero: Simplexvirus,

Espécie: herpes vírus humano 1

Como se escreve?

No uso vernacular informal, deve-se substituir o uso de "ph" por "f" e o do "y" por "i", e deve-se usar assento quando apropriado.

Por exemplo: alfaherpesvírus, paramixovírus, aftovírus.

Fonte: Cornelia Büchen- Osmond, ICTV

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“A classificação em subespécies, cepas, variantes e isolados não existe de forma oficial, embora sua importância seja reconhecida para o diagnóstico, para estudos biológicos e moleculares e também

para a produção de vacinas.”

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O termo isolado (ou amostra) refere-se a um vírus que foi obtido por isolamento de uma

determinada fonte de infecção.

O termo estripe é utilizado para designar amostras de vírus que já foram bem

caracterizadas e sobre as quais já se possui certo conhecimento.

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Uma outra classificação prática, não oficial:

Respiratórios: vírus que penetram no hospedeiro por inalação e produzem infecção e doença primariamente no trato respiratório. Ex: rinovírus, calicivírus;

Entéricos: vírus que penetram pela via oral e replicam no trato intestinal. Ex: coronavírus, rotavírus;

Arbovírus: vírus que replicam e são transmitidos por vetores artrópodos. Ex: vírus da encefalites eqüinas leste e oeste;

Vírus oncogênicos: vírus com potencial para induzir transformação celular e tumores nos hospedeiros. Ex: retrovírus, papilomavírus.

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DNA RNA

Fita simples

Fita dupla

Circular

+ ou -

Segmentado

Dupla fita segmentado

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Vírus DNA

com envelope sem envelope

Herpes

Hepadna

Irido

Pox

Adeno

Anelo

Parvo

Papiloma

Polioma

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Vírus RNA

com envelope sem envelope

Arena

Arteri

Astro

Borna

Bunya

Calici

Corona

Filo

Flavi

Ortomixo

Paramixo

Rhabdo

Toga

Picorna

Reo

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Famílias virais

Vírus com genoma RNA de sentido positivo (ssRNA+)

Vírus com genoma RNA de sentido negativo não-segmentado

Vírus com genoma RNA de sentido negativo segmentado

Vírus com genoma RNA de cadeia dupla

Vírus com genoma RNA que realizam transcrição reversa

Vírus com genoma DNA fita simples

Vírus com genoma DNA fita dupla

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Vírus com genoma RNA

de sentido positivo

Arteriviridae

Astroviridae

Caliciviridae

Hepeviridae

Coronaviridae

Picornaviridae

Flaviviridae

Togaviridae

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CORONAVIRIDAE

-E N V E L O P E L I P Í D I C O C O M P E P L Ô M E R O S Q U E P R O J E T A M E X T E R N A M E N T E ( A S P E C T O D E C O R O A ) .

-E N T R E O S V Í R U S R N A É O Q U E A P R E S E N T A O M A I O R G E N O M A ( 2 7 A 3 2 K B ) .

-E M H U M A N O S E S T Á R E L A C I O N A D O A R E S F R I A D O S C O M U N S .

CORONAVIRUS:

•Coronavírus humano (HuCoV)

•Vírus da pneumonia asiática (SarsCoV)

•Síndrome Respiratória do Oriente Médio (MERS)

ssRNA(+)

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FLAVIVIRIDAE

-Gêneros: Flavivirus : vírus da febre amarela (YFV),

vírus da Dengue 1,2,3,4

Hepacivirus: Hepatite C

Pestivius: Vírus da diarreia viral bovina

tipos

Vírus da peste suína clássica

- Estão classificados vários agentes de doenças hemorrágicas e encefalites transmitidas por mosquitos.

ssRNA(+)

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Vírus com genoma RNA de fita simples não

segmentado, com polaridade negativa

Filoviridae

Paramyxoviridae

Rhabdoviridae

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Vírus RNA, da família Filoviridae e do gênero Filovirus;

Ebola e Marburgvírus;

Febre hemorrágica em humanos.

EBOLA

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Casos de Ebola

0

5000

10000

15000

20000

25000

1976 1979 94-96 2000-03 2007-08 2014

Mortes

Casos

603 [431]

34 [22] 464 [347]

725 [477] 445 [239]

15417 [5508]

CDC, nov. 2014

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Gêneros: Lyssavirus: Raiva (RV)

Vesiculovirus: vírus da estomatite vesicular (VSV)

- Característica morfológica lembrando um projétil de arma de fogo.

Rhabdoviridae ssRNA(-)

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RAIVA

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Vírus com genoma RNA de fita simples

segmentado

Arenaviridae

Orthomyxoviridae

Bunyaviridae

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ORTHOMYXOVIRIDAE

- myxo = muco

Glicoproteínas hemaglutinina (HA) e neuraminidase

(NE)

- Gêneros:

-Influenzavirus A (FluAV)

-Influenzavirus B (FluBV)

-Influenzavirus C (FluCV)

Genoma segmentado : FluAV – 8 seg.

FluBV – 7 seg. FluCV – 6 seg.

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Influenza Aviária

Doença viral altamente contagiosa que acomete muitas espécies de aves;

Vírus da influenza tipo A, pertencente à família Ortomoxyviridae;

A doença é motivo de preocupação porque a maioria dos pacientes tornaram-se gravemente doentes.

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Surto de Influenza Aviária na Europa:

Novembro de 2014: início em uma fazenda de perus da Alemanha; [H5N8]

Novos casos: Reino Unido [patos] e Holanda [frangos];

No Egito [H5N1], três óbitos em 2014;

Desde 2003: H5N1: 565 casos em humanos e 311 vítimas fatais.

H7N9: 432 casos em humanos e 22 mortes.

H5N6: 1º vítima fatal na China, 2014 WHO, 2014.

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Reservatórios: aves migratórias.

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Vírus com genoma RNA de fita dupla

Reoviridae

Birnaviridae

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REOVIRIDAE

- Dois capsídeos com simetria icosaédrica (20-30 nm)

- Gêneros: Orthoreovirus

Orbivirus (língua Azul)

Rotavirus

dsRNA

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PATOGÊNESE

Os rotavírus aderem ao

epitélio do trato GI

(mucosa jejunal)‏

Danos da

região apical das

vilosidades

* *

Enterotoxina viral

NSP4

Aumento da Motilidade

e Diminuição da

Absorção

Zuckerman A et al, eds. Principles and Practice of Clinical Virology. 2nd ed. Londres: John Wiley & Sons; 990:182.

Fonte: Simone Guadagnucci Morillo

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Vírus com genoma RNA de fita dupla

segmentado

Retroviridae

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Retroviridae

- Replicação viral complexa; integra seu provírus ao DNA da célula: infectam o hospedeiro para o

resto da vida. - Associados a doenças tumorais e

imunossupressivas. Orthoretrovirinae

Alpharetrovirus: leucose aviária (ALV)

Gammaretrovirus: leucose felina (FeLV)

Deltateretrovirus: leucose bovina (VLB)

Lentivirus: anemia infecciosa equina (EIAV)

imunodeficiência felina (FIV)

imunodeficiência humana (HIV)

ssRNA (RT)

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Vírus com genoma DNA fita simples

Circoviridae

Parvoviridae

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CIRCOVIRIDAE

Menores vírus com genoma DNA

Gêneros:

ssDNA

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Max. divergence 309, Clustal V (PAM250)

Goose circovirus

Porcine circovirus 1

Porcine circovirus 2

Bat cyclovirus

Cyclovirusa

Cyclovirus TN18

Chicken anemia virusa

Chicken anemia virusb Chicken anemia virusc

Chicken gyrovirus 2

Swan circovirus

genus Circovirus

genus Gyrovirus

genus ´Cyclovirus´

Avian gyrovirus 2

CIRCOVIRIDAE

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PARVOVIRIDAE

Parvovirus: parvovírus canino tipos 1 e 2 (CPV-1; CPV-2),

vírus da panleucopenia felina (FPLV),

parvovírus suíno (PPV),

parvovírus bovino (BPV);

Erythrovirus: vírus B19 humano (aborto)

Dependovirus: vírus adeno-associado 2 (AAV).

ssDNA

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Vírus com genoma DNA fita dupla

Papillomaviridae

Polyomaviridae

Adenoviridae

Hepadnaviridae

Herpesviridae

Poxviridae

Asfarviridae

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PAPILOMAVIRIDAE

- Vários associados a cânceres

Papilomavírus: - verrugas

- epidermodisplasia verruciforme

Alphapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-32);

Betapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-5);

Gammapapillomavirus: vários papilomavírus humanos (protótipo: HPV-4)

Epsilonpapillomavirus: papilomavírus bovino tipo 5 (BPV-5);

dsDNA

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HERPESVIRIDAE

Alfaherpesvirinae

Simplexvirus:

• Herpesvírus bovino tipo 2

• Vírus do herpes simplex humano tipo 1 e 2 (HSV-1 e HSV-2)

Varicellovirus:

• Vírus da rinotraqueíte bovina (BoHV-1)

• BoHV-5

• SuHV-1

Mardivirus:

• Vírus da doença de Marek

Iltovirus:

• Vírus da laringotraqueíte infecciosa das galinhas (ILTV)

dsDNA

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HERPESVIRIDAE

Betaherpesvirinae

Cytomegalovirus

• Herpesvírus humano 5 (HHV-5)

Muromegalovirus

• Citomegalovírus do camundongo MCMV-1

Roseolovirus

• Herpesvírus humano 6 (HHV-6)

dsDNA

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Gammaherpesvirinae

Rhadinovirus • Herpesvírus bovino tipo 4 (BoHV4)

Macavirus

• Vírus da febre catarral maligna

HERPESVIRIDAE

dsDNA

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Avipoxvirus: bouba aviária

Orthopoxvirus: Varíola

Parapoxvirus: ectima contagioso dos ovinos

(ORFV)

Vários outros poxvírus

POXVIRIDAE

- Um dos maiores vírus conhecidos (~ 300 nm)

- simetria complexa (retangular ou ovoide)

dsDNA

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Varíola Humana

(VARV)

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